MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 16122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004347	TAA	2	6	171140	171145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_004347	GTG	2	6	171179	171184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_004347	GTT	2	6	171259	171264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_004347	GAAA	2	8	172289	172296	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
505	NC_004347	TAA	2	6	177235	177240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_004347	T	6	6	177259	177264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_004347	TGG	2	6	180419	180424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_004347	TGAG	2	8	183625	183632	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
509	NC_004347	T	6	6	187464	187469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_004347	GA	3	6	187473	187478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
511	NC_004347	TTAT	2	8	187497	187504	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_004347	A	6	6	187510	187515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_004347	ATG	2	6	188336	188341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_004347	TGT	2	6	188347	188352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
515	NC_004347	TCA	2	6	190120	190125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_004347	TCCCT	2	10	190133	190142	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
517	NC_004347	T	6	6	200088	200093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_004347	TGG	2	6	200184	200189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_004347	TTG	2	6	200266	200271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_004347	GTG	2	6	202326	202331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_004347	TAAA	2	8	202337	202344	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_004347	GTT	2	6	202357	202362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_004347	T	6	6	202361	202366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_004347	T	7	7	202368	202374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_004347	CAT	3	9	207176	207184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_004347	CCA	2	6	207197	207202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_004347	GGC	2	6	207208	207213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_004347	TAT	2	6	208453	208458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_004347	TAA	2	6	209123	209128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_004347	CAAAT	2	10	209296	209305	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
531	NC_004347	TGC	2	6	209369	209374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_004347	GAAAA	2	10	209379	209388	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
533	NC_004347	GCTG	2	8	209447	209454	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
534	NC_004347	A	6	6	209480	209485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_004347	CCA	2	6	209488	209493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_004347	GAA	2	6	209504	209509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_004347	AGCACC	2	12	209541	209552	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
538	NC_004347	GTG	2	6	209576	209581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_004347	GTA	2	6	209602	209607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_004347	AAGCGA	2	12	209643	209654	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
541	NC_004347	CGT	2	6	209721	209726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_004347	TTG	2	6	209874	209879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_004347	TGA	2	6	209938	209943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_004347	GGCT	2	8	209952	209959	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
545	NC_004347	TGG	2	6	209998	210003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
546	NC_004347	CTG	2	6	210028	210033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_004347	AG	3	6	210212	210217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_004347	TTC	2	6	210219	210224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_004347	CAGC	2	8	210418	210425	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
550	NC_004347	CAT	2	6	210522	210527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_004347	CAA	2	6	210579	210584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_004347	ATC	2	6	210665	210670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_004347	ACG	2	6	210675	210680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_004347	T	7	7	210686	210692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_004347	ATT	2	6	210708	210713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_004347	ATT	2	6	212093	212098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_004347	TAGTG	2	10	213032	213041	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
558	NC_004347	T	6	6	213102	213107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_004347	TGT	2	6	213122	213127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_004347	TTGA	2	8	213219	213226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
561	NC_004347	ATG	2	6	213325	213330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_004347	AAT	2	6	213360	213365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_004347	CCA	2	6	213367	213372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_004347	TGCCTA	2	12	213419	213430	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_004347	AG	3	6	213532	213537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_004347	AAAT	2	8	213560	213567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_004347	G	8	8	214694	214701	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
568	NC_004347	CCGC	2	8	214773	214780	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
569	NC_004347	CT	3	6	216113	216118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
570	NC_004347	ATAA	2	8	216136	216143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_004347	ATT	2	6	216172	216177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_004347	A	6	6	216324	216329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_004347	TGC	2	6	216349	216354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_004347	TCA	2	6	216411	216416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_004347	TGA	2	6	216431	216436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_004347	A	6	6	216452	216457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_004347	TG	3	6	216566	216571	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
578	NC_004347	TGA	2	6	216660	216665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_004347	TCT	2	6	216704	216709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_004347	TTC	2	6	216757	216762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_004347	ACA	2	6	216767	216772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_004347	GGC	2	6	216816	216821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_004347	GCA	2	6	216847	216852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_004347	GCG	2	6	216880	216885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_004347	CGA	2	6	217055	217060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_004347	GAT	2	6	217080	217085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_004347	GCA	2	6	217129	217134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_004347	GT	3	6	217182	217187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
589	NC_004347	GAA	2	6	217188	217193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_004347	GGA	2	6	217224	217229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_004347	AGA	2	6	217271	217276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_004347	CAG	2	6	217297	217302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_004347	G	6	6	217444	217449	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
594	NC_004347	GGA	2	6	217488	217493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_004347	GGC	2	6	217508	217513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_004347	GAA	2	6	217751	217756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_004347	TGC	2	6	217827	217832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_004347	GTC	2	6	217839	217844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_004347	TGG	2	6	217917	217922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_004347	GGA	2	6	217953	217958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
601	NC_004347	GAC	2	6	217966	217971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_004347	TCA	2	6	217978	217983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_004347	AC	3	6	218004	218009	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_004347	TCG	2	6	218071	218076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_004347	AC	3	6	218173	218178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
606	NC_004347	AAG	2	6	218209	218214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_004347	G	7	7	218232	218238	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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609	NC_004347	CCT	2	6	218314	218319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_004347	TGTT	2	8	218340	218347	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
611	NC_004347	CA	3	6	218355	218360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_004347	AGA	2	6	218373	218378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_004347	GGT	2	6	218441	218446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_004347	CCA	2	6	218463	218468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_004347	GCCT	2	8	218632	218639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
616	NC_004347	AGG	2	6	218647	218652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_004347	T	6	6	218737	218742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_004347	ATG	2	6	218788	218793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_004347	A	7	7	218814	218820	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_004347	AC	3	6	218832	218837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
622	NC_004347	TCT	2	6	218878	218883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_004347	GTA	2	6	219014	219019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_004347	TCA	2	6	219101	219106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_004347	TAG	2	6	219194	219199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_004347	GCGA	2	8	219202	219209	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
627	NC_004347	TGA	2	6	219305	219310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_004347	G	6	6	219351	219356	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
629	NC_004347	TCC	2	6	219361	219366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
630	NC_004347	CTGA	2	8	219381	219388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
631	NC_004347	GGA	2	6	219671	219676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_004347	TAC	2	6	219875	219880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_004347	CGG	2	6	219893	219898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_004347	CGTC	2	8	219906	219913	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
635	NC_004347	AAC	2	6	219925	219930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_004347	AGC	2	6	220015	220020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_004347	CAT	2	6	220021	220026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_004347	AAAG	2	8	220029	220036	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
639	NC_004347	AGTCG	2	10	220051	220060	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
640	NC_004347	ACC	2	6	220093	220098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
641	NC_004347	GA	3	6	220368	220373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
642	NC_004347	AGGCT	2	10	220380	220389	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
643	NC_004347	GCG	2	6	220393	220398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_004347	GGT	2	6	220417	220422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
645	NC_004347	GGTG	2	8	220424	220431	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
646	NC_004347	TGA	2	6	220467	220472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
647	NC_004347	AGT	2	6	220492	220497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
648	NC_004347	TCT	2	6	220520	220525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_004347	TAG	2	6	220537	220542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
650	NC_004347	GGT	2	6	220566	220571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
651	NC_004347	GA	3	6	220596	220601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
652	NC_004347	TGA	2	6	220665	220670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
653	NC_004347	CT	3	6	220677	220682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
654	NC_004347	ATTG	2	8	220799	220806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
655	NC_004347	CGG	2	6	220847	220852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
656	NC_004347	ATG	2	6	220923	220928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
657	NC_004347	GTC	2	6	221104	221109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
658	NC_004347	ACC	2	6	221118	221123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
659	NC_004347	TGG	2	6	221178	221183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
660	NC_004347	TCC	2	6	221204	221209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
661	NC_004347	GGA	2	6	221221	221226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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663	NC_004347	GGT	2	6	221341	221346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
664	NC_004347	CGG	2	6	221428	221433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
665	NC_004347	TCA	2	6	221456	221461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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669	NC_004347	GT	3	6	221789	221794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
670	NC_004347	TCC	2	6	221899	221904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
671	NC_004347	AAG	2	6	221947	221952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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673	NC_004347	AGC	2	6	222011	222016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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675	NC_004347	AG	3	6	222217	222222	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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681	NC_004347	AAC	2	6	222451	222456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
682	NC_004347	ATG	2	6	222597	222602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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721	NC_004347	T	8	8	232215	232222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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732	NC_004347	TGA	2	6	245352	245357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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735	NC_004347	GAA	2	6	245522	245527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
736	NC_004347	T	6	6	245540	245545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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754	NC_004347	AGA	2	6	259456	259461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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756	NC_004347	AAGCT	2	10	259844	259853	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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761	NC_004347	TGG	2	6	260165	260170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
762	NC_004347	TTA	2	6	260240	260245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
763	NC_004347	ATG	2	6	260293	260298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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766	NC_004347	GCAG	2	8	260370	260377	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
767	NC_004347	ATA	2	6	260467	260472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
768	NC_004347	GGAA	2	8	263340	263347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
769	NC_004347	T	6	6	263460	263465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
770	NC_004347	AT	3	6	263477	263482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
771	NC_004347	GTA	2	6	263563	263568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
772	NC_004347	A	7	7	263956	263962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
773	NC_004347	T	7	7	263977	263983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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