MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella oneidensis MR-1 chromosome

Total Repeats: 16122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_004347	GTACTT	2	12	2605810	2605821	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8502	NC_004347	TAA	2	6	2607850	2607855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_004347	A	6	6	2607854	2607859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_004347	GGT	2	6	2607870	2607875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8505	NC_004347	TTA	2	6	2607878	2607883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_004347	TTC	2	6	2608558	2608563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_004347	GAA	2	6	2612633	2612638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_004347	TGT	2	6	2612649	2612654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8509	NC_004347	AAC	2	6	2612660	2612665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8510	NC_004347	TGA	2	6	2612763	2612768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8511	NC_004347	ACTT	2	8	2612801	2612808	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8512	NC_004347	A	8	8	2612857	2612864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_004347	A	6	6	2613770	2613775	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_004347	T	6	6	2613802	2613807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_004347	TAC	2	6	2613873	2613878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8516	NC_004347	T	7	7	2613914	2613920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_004347	AAAAAC	2	12	2615426	2615437	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8518	NC_004347	GGT	2	6	2615450	2615455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_004347	T	7	7	2615455	2615461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_004347	GTTC	2	8	2615509	2615516	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8521	NC_004347	ATG	2	6	2615545	2615550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_004347	GCA	2	6	2615614	2615619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8523	NC_004347	TTGG	2	8	2615621	2615628	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_004347	AGCC	2	8	2615696	2615703	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8525	NC_004347	CTG	2	6	2615707	2615712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8526	NC_004347	AATT	2	8	2618723	2618730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_004347	TTAAA	2	10	2618743	2618752	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_004347	CTCA	2	8	2618821	2618828	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8529	NC_004347	TCA	2	6	2618855	2618860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8530	NC_004347	A	6	6	2618871	2618876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_004347	ACA	2	6	2618909	2618914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_004347	A	6	6	2620828	2620833	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8533	NC_004347	T	7	7	2620868	2620874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_004347	GTTC	2	8	2620930	2620937	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8535	NC_004347	ATG	2	6	2620966	2620971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_004347	GCA	2	6	2621046	2621051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_004347	CTC	2	6	2621739	2621744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8538	NC_004347	AC	3	6	2621781	2621786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8539	NC_004347	AAT	2	6	2621856	2621861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_004347	TCAT	2	8	2622441	2622448	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8541	NC_004347	TAA	2	6	2622456	2622461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_004347	TGA	2	6	2622973	2622978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_004347	CAAT	2	8	2623003	2623010	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8544	NC_004347	CGT	2	6	2625256	2625261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8545	NC_004347	CTG	2	6	2625278	2625283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8546	NC_004347	ATT	2	6	2625327	2625332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8547	NC_004347	TTG	2	6	2625334	2625339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_004347	CTAT	2	8	2625352	2625359	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8549	NC_004347	TTA	2	6	2625387	2625392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_004347	T	6	6	2625420	2625425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_004347	ATG	2	6	2625802	2625807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_004347	TTA	2	6	2625833	2625838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_004347	AATC	2	8	2625844	2625851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8554	NC_004347	A	7	7	2626367	2626373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_004347	GTT	2	6	2626391	2626396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_004347	ACT	2	6	2626469	2626474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8557	NC_004347	GGC	2	6	2626477	2626482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_004347	GAG	2	6	2626490	2626495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8559	NC_004347	CCA	2	6	2626571	2626576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8560	NC_004347	CCA	2	6	2626695	2626700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8561	NC_004347	CCA	2	6	2626897	2626902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8562	NC_004347	CTT	2	6	2626903	2626908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8563	NC_004347	TC	3	6	2626926	2626931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8564	NC_004347	TTTC	2	8	2626946	2626953	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8565	NC_004347	TTA	2	6	2626976	2626981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_004347	A	6	6	2627026	2627031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_004347	TAAG	2	8	2627072	2627079	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_004347	GGC	2	6	2627799	2627804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8569	NC_004347	AGC	2	6	2627856	2627861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8570	NC_004347	CA	3	6	2627862	2627867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8571	NC_004347	TTC	2	6	2629302	2629307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8572	NC_004347	TGA	2	6	2629310	2629315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8573	NC_004347	TCTAA	2	10	2629316	2629325	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8574	NC_004347	CAC	2	6	2629396	2629401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8575	NC_004347	GTTC	2	8	2629463	2629470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8576	NC_004347	ATG	2	6	2629499	2629504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8578	NC_004347	TGGC	2	8	2629587	2629594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8579	NC_004347	TGC	2	6	2629673	2629678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8580	NC_004347	CAG	2	6	2631797	2631802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8581	NC_004347	GAAA	2	8	2631827	2631834	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8582	NC_004347	AGT	2	6	2631847	2631852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8583	NC_004347	AATTA	2	10	2631869	2631878	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8584	NC_004347	CAA	2	6	2631954	2631959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8587	NC_004347	AAGC	2	8	2632088	2632095	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8588	NC_004347	TCT	2	6	2632100	2632105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8591	NC_004347	TGC	2	6	2632338	2632343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8593	NC_004347	GCT	2	6	2632560	2632565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8595	NC_004347	AGTTA	2	10	2632683	2632692	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8596	NC_004347	TCA	2	6	2632698	2632703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8598	NC_004347	CTC	2	6	2632785	2632790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8599	NC_004347	CGG	2	6	2632875	2632880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8600	NC_004347	TAAC	2	8	2632964	2632971	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8601	NC_004347	CGG	2	6	2632999	2633004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8602	NC_004347	CGG	2	6	2633106	2633111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_004347	CGG	2	6	2633227	2633232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8604	NC_004347	CGG	2	6	2633348	2633353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8605	NC_004347	ATC	2	6	2633514	2633519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8607	NC_004347	TGT	2	6	2635565	2635570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8608	NC_004347	ATA	2	6	2635591	2635596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8609	NC_004347	A	6	6	2640326	2640331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_004347	AAC	2	6	2642793	2642798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8611	NC_004347	GCA	2	6	2642802	2642807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8612	NC_004347	CAG	2	6	2642908	2642913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8613	NC_004347	AAT	2	6	2642983	2642988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_004347	AGA	2	6	2643003	2643008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_004347	AG	3	6	2643035	2643040	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8616	NC_004347	TATT	2	8	2644872	2644879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8617	NC_004347	ATAA	2	8	2644891	2644898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8618	NC_004347	TGTTA	2	10	2647145	2647154	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8619	NC_004347	ACA	2	6	2647215	2647220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8620	NC_004347	TTG	2	6	2647275	2647280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_004347	GTGTA	2	10	2647338	2647347	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8622	NC_004347	GCA	2	6	2647374	2647379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8624	NC_004347	AAG	2	6	2647401	2647406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_004347	T	7	7	2647472	2647478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8626	NC_004347	ATG	2	6	2647485	2647490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8627	NC_004347	AC	3	6	2647492	2647497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8628	NC_004347	TGG	2	6	2647545	2647550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_004347	ATCA	2	8	2647559	2647566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8631	NC_004347	ACAT	2	8	2647587	2647594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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