MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004337	TG	3	6	37	42	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004337	A	7	7	47	53	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004337	AGC	2	6	65	70	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004337	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_004337	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_004337	A	6	6	274	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004337	T	8	8	302	309	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004337	AAC	2	6	329	334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_004337	T	6	6	5070	5075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004337	GAA	2	6	5078	5083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004337	AAC	2	6	5162	5167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_004337	CGT	2	6	5168	5173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_004337	AT	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004337	CGC	2	6	5656	5661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_004337	A	7	7	6495	6501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004337	CAT	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004337	GCC	2	6	6759	6764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_004337	GTT	2	6	6813	6818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004337	AGA	2	6	6830	6835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004337	ATC	2	6	7057	7062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_004337	TGC	2	6	7077	7082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004337	GCTGCC	2	12	7105	7116	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_004337	CGC	2	6	7203	7208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_004337	GCC	2	6	7209	7214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_004337	GCCA	2	8	7226	7233	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_004337	TTA	2	6	7283	7288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004337	CAG	2	6	7386	7391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004337	AAT	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004337	GGA	2	6	7426	7431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004337	CG	3	6	7553	7558	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_004337	GCA	2	6	7663	7668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_004337	CGG	2	6	7700	7705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_004337	CG	3	6	7745	7750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_004337	CAA	2	6	7879	7884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_004337	TAA	2	6	7934	7939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004337	A	6	6	7945	7950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004337	GCAT	2	8	7955	7962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_004337	AAG	2	6	8018	8023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004337	TA	3	6	8024	8029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004337	CTGT	2	8	9239	9246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_004337	C	6	6	9899	9904	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_004337	G	6	6	9909	9914	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004337	ATC	3	9	10506	10514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_004337	GAAT	2	8	10515	10522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004337	AAT	2	6	10528	10533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004337	ATA	2	6	10569	10574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004337	GAAAAT	2	12	10612	10623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004337	CTG	2	6	11836	11841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_004337	AGA	2	6	11848	11853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004337	TCTTT	2	10	11867	11876	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_004337	TTA	2	6	11877	11882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004337	T	6	6	11886	11891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004337	ATTC	2	8	11911	11918	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_004337	A	6	6	11991	11996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004337	TGA	2	6	12014	12019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004337	TAG	2	6	12039	12044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004337	AGTG	2	8	12053	12060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004337	A	7	7	12068	12074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004337	ATG	2	6	12130	12135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004337	AT	3	6	12141	12146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004337	A	6	6	14160	14165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004337	CCG	2	6	15389	15394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_004337	CT	3	6	15556	15561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_004337	AGG	2	6	15613	15618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004337	GACA	2	8	15683	15690	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_004337	CGC	2	6	15703	15708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_004337	TAT	2	6	15709	15714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004337	CT	3	6	15719	15724	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_004337	T	6	6	15785	15790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004337	ATT	2	6	15800	15805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004337	ATT	2	6	15832	15837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004337	GAC	2	6	15838	15843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_004337	ATT	2	6	15851	15856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004337	ACA	2	6	15891	15896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_004337	AATT	2	8	15897	15904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004337	TAAT	2	8	15916	15923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004337	TTC	2	6	16024	16029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_004337	A	7	7	16040	16046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004337	ATT	2	6	16050	16055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004337	GAT	2	6	16080	16085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004337	GA	3	6	17359	17364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004337	ATT	2	6	18343	18348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004337	AATA	2	8	18387	18394	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004337	CTTC	2	8	18409	18416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_004337	AGT	2	6	18434	18439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004337	CAT	2	6	18473	18478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_004337	T	6	6	18532	18537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004337	ATG	2	6	18648	18653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004337	CAT	2	6	19401	19406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_004337	GCA	2	6	19426	19431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_004337	GAG	2	6	19450	19455	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004337	TA	3	6	19476	19481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004337	GT	3	6	19683	19688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004337	TC	3	6	19689	19694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_004337	AGC	2	6	19707	19712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_004337	A	7	7	19719	19725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004337	CTT	2	6	20097	20102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_004337	CAA	2	6	24681	24686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_004337	AGC	2	6	26664	26669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_004337	T	6	6	26706	26711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004337	GAA	2	6	26714	26719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004337	TCAT	2	8	27663	27670	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_004337	TCCC	2	8	27693	27700	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_004337	TGGC	2	8	27734	27741	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_004337	TAT	2	6	28638	28643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004337	ATTTA	2	10	28660	28669	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004337	TCT	2	6	28759	28764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_004337	TGT	2	6	28770	28775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004337	TCT	2	6	28835	28840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_004337	TGC	2	6	28841	28846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_004337	GAT	2	6	28871	28876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004337	CATG	2	8	28903	28910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_004337	ATA	2	6	28920	28925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004337	A	6	6	28927	28932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004337	GCC	2	6	28975	28980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_004337	TCG	2	6	28994	28999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_004337	TCA	2	6	29025	29030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_004337	AGTG	2	8	29053	29060	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004337	TGA	2	6	33530	33535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004337	T	9	9	33542	33550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004337	TGA	2	6	33587	33592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004337	AT	3	6	33644	33649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004337	TGT	2	6	34168	34173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004337	GGGC	2	8	37288	37295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_004337	GCG	2	6	38588	38593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_004337	ATTT	2	8	41388	41395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004337	GTTT	2	8	41405	41412	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004337	ATT	3	9	41436	41444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004337	TTA	2	6	41560	41565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004337	A	7	7	41593	41599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004337	ACC	2	6	41672	41677	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_004337	TTG	2	6	43388	43393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004337	A	7	7	45104	45110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004337	TAA	2	6	46557	46562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004337	TGTT	2	8	48985	48992	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004337	GCG	2	6	49009	49014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_004337	CAG	2	6	49041	49046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_004337	CAT	2	6	49066	49071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_004337	CGA	2	6	49084	49089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_004337	T	7	7	49120	49126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004337	CAA	2	6	54066	54071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_004337	CAT	2	6	56446	56451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_004337	GTG	2	6	56536	56541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004337	GT	3	6	56661	56666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004337	GCG	2	6	57567	57572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_004337	ACC	2	6	61229	61234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_004337	GTG	2	6	61256	61261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004337	T	8	8	61347	61354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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