MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_004337	TGC	2	6	3869352	3869357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17002	NC_004337	CCCGGC	2	12	3869388	3869399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17003	NC_004337	AC	3	6	3869433	3869438	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17004	NC_004337	GC	4	8	3869476	3869483	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17005	NC_004337	GGC	2	6	3869484	3869489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17006	NC_004337	GTT	2	6	3869529	3869534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_004337	GGC	2	6	3869542	3869547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17008	NC_004337	CTG	2	6	3869569	3869574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17009	NC_004337	GC	3	6	3869599	3869604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17010	NC_004337	AAC	2	6	3869674	3869679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17011	NC_004337	CTA	2	6	3869700	3869705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17012	NC_004337	CTG	2	6	3869722	3869727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17013	NC_004337	CGA	2	6	3869730	3869735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17014	NC_004337	T	6	6	3869743	3869748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17015	NC_004337	CTG	2	6	3869796	3869801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17016	NC_004337	GACT	2	8	3869891	3869898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17017	NC_004337	TGA	2	6	3869942	3869947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17018	NC_004337	CGA	2	6	3869955	3869960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17019	NC_004337	ACGT	2	8	3870020	3870027	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17020	NC_004337	CGTG	2	8	3870099	3870106	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17021	NC_004337	AGA	2	6	3870164	3870169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_004337	TAC	2	6	3870181	3870186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17023	NC_004337	GATGGC	2	12	3870250	3870261	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17024	NC_004337	TGG	2	6	3870313	3870318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17025	NC_004337	ACG	2	6	3870329	3870334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17026	NC_004337	TGCC	2	8	3870343	3870350	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17027	NC_004337	AG	3	6	3870373	3870378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17028	NC_004337	AGA	2	6	3870391	3870396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17029	NC_004337	TTA	2	6	3875089	3875094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17030	NC_004337	AT	3	6	3875114	3875119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17031	NC_004337	CGC	2	6	3875158	3875163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17032	NC_004337	AAG	2	6	3875171	3875176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17033	NC_004337	ATC	2	6	3875196	3875201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17034	NC_004337	ATC	2	6	3875233	3875238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17035	NC_004337	GGGC	2	8	3876621	3876628	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17036	NC_004337	CTT	2	6	3877361	3877366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17037	NC_004337	CCT	2	6	3877369	3877374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17038	NC_004337	T	7	7	3877422	3877428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17039	NC_004337	TGT	2	6	3877432	3877437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17040	NC_004337	T	7	7	3877440	3877446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17041	NC_004337	CAA	2	6	3877463	3877468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17042	NC_004337	TAC	2	6	3877479	3877484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17043	NC_004337	CG	4	8	3877489	3877496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17044	NC_004337	TCA	2	6	3877510	3877515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17045	NC_004337	TAC	2	6	3877522	3877527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17046	NC_004337	ATCG	2	8	3877546	3877553	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17047	NC_004337	AGA	2	6	3877565	3877570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17048	NC_004337	CGA	2	6	3879196	3879201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17049	NC_004337	GAGCA	2	10	3879278	3879287	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
17050	NC_004337	GGTAC	2	10	3879335	3879344	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17051	NC_004337	AGTGA	2	10	3879413	3879422	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17052	NC_004337	CCG	2	6	3879424	3879429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17053	NC_004337	CG	3	6	3879428	3879433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17054	NC_004337	GC	3	6	3879504	3879509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17055	NC_004337	ACC	2	6	3879577	3879582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17056	NC_004337	GGC	2	6	3879605	3879610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17057	NC_004337	GGGC	2	8	3879657	3879664	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17058	NC_004337	GCA	2	6	3879712	3879717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17059	NC_004337	GCA	3	9	3879719	3879727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17060	NC_004337	TGA	2	6	3879992	3879997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17061	NC_004337	GGC	2	6	3880075	3880080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17062	NC_004337	CGG	2	6	3880116	3880121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17063	NC_004337	CGG	2	6	3880130	3880135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17064	NC_004337	GAA	2	6	3880201	3880206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17065	NC_004337	CG	3	6	3880228	3880233	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17066	NC_004337	GC	3	6	3880322	3880327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17067	NC_004337	TAC	2	6	3880411	3880416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17068	NC_004337	GGC	2	6	3880425	3880430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17069	NC_004337	GGC	2	6	3880449	3880454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17070	NC_004337	AGGC	2	8	3880499	3880506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17071	NC_004337	TC	3	6	3880530	3880535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17072	NC_004337	ATG	2	6	3880589	3880594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17073	NC_004337	GGC	2	6	3880635	3880640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17074	NC_004337	CATT	2	8	3880698	3880705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17075	NC_004337	ACA	2	6	3880706	3880711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17076	NC_004337	AGA	2	6	3880746	3880751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17077	NC_004337	GGC	2	6	3880765	3880770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17078	NC_004337	CGA	2	6	3880812	3880817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17079	NC_004337	TCAC	2	8	3883383	3883390	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17080	NC_004337	TCA	2	6	3883393	3883398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17081	NC_004337	GGC	2	6	3885140	3885145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17082	NC_004337	TGC	2	6	3885166	3885171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17083	NC_004337	A	8	8	3885204	3885211	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17084	NC_004337	ACCTG	2	10	3885297	3885306	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17085	NC_004337	GCC	2	6	3885779	3885784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17086	NC_004337	TACT	2	8	3885849	3885856	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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17088	NC_004337	T	6	6	3888168	3888173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17089	NC_004337	CT	3	6	3888886	3888891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17090	NC_004337	T	6	6	3888891	3888896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17091	NC_004337	A	7	7	3888944	3888950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17092	NC_004337	T	8	8	3888953	3888960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17093	NC_004337	GTC	2	6	3889072	3889077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17094	NC_004337	GC	3	6	3890914	3890919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17095	NC_004337	ACC	2	6	3890991	3890996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17096	NC_004337	A	6	6	3891079	3891084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17097	NC_004337	GTT	2	6	3891102	3891107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17098	NC_004337	CGG	2	6	3891128	3891133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17099	NC_004337	GGC	2	6	3891159	3891164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17100	NC_004337	TGG	2	6	3891175	3891180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17101	NC_004337	ACT	2	6	3891220	3891225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17102	NC_004337	GCA	2	6	3891234	3891239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17103	NC_004337	CGT	2	6	3891258	3891263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17104	NC_004337	TTG	2	6	3891334	3891339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17105	NC_004337	CTA	2	6	3891371	3891376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17106	NC_004337	TGG	2	6	3891390	3891395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17107	NC_004337	CAA	2	6	3891574	3891579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17108	NC_004337	ACG	2	6	3892561	3892566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17109	NC_004337	ACATAA	2	12	3892635	3892646	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17110	NC_004337	CCA	2	6	3894403	3894408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17111	NC_004337	GGC	2	6	3894464	3894469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17112	NC_004337	CAA	2	6	3894575	3894580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17113	NC_004337	CCG	2	6	3894702	3894707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17114	NC_004337	GC	3	6	3894893	3894898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17115	NC_004337	TGG	2	6	3894916	3894921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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17117	NC_004337	TAC	2	6	3894990	3894995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17118	NC_004337	TGA	2	6	3895082	3895087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17119	NC_004337	TGA	2	6	3895133	3895138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17120	NC_004337	TCA	2	6	3895153	3895158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17121	NC_004337	ATG	2	6	3895221	3895226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17122	NC_004337	GCG	2	6	3895254	3895259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17123	NC_004337	GAC	2	6	3895266	3895271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17124	NC_004337	ATC	2	6	3895290	3895295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17125	NC_004337	CGC	2	6	3895300	3895305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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