MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_004337	TTC	2	6	3635129	3635134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16002	NC_004337	AAC	2	6	3635220	3635225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16003	NC_004337	CTTA	2	8	3635233	3635240	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16004	NC_004337	AT	3	6	3635247	3635252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16005	NC_004337	AAC	2	6	3635347	3635352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16006	NC_004337	AAT	2	6	3635371	3635376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_004337	TC	3	6	3636230	3636235	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16008	NC_004337	CG	3	6	3636238	3636243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16009	NC_004337	AGA	3	9	3636294	3636302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_004337	GTT	2	6	3636317	3636322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_004337	GCG	2	6	3636328	3636333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16012	NC_004337	CGG	2	6	3636361	3636366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_004337	CGC	3	9	3636371	3636379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16014	NC_004337	GTC	2	6	3636399	3636404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16015	NC_004337	TAT	2	6	3636497	3636502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16016	NC_004337	CT	3	6	3636621	3636626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16017	NC_004337	CG	3	6	3636710	3636715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16018	NC_004337	TGAA	2	8	3636724	3636731	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_004337	CGA	2	6	3636775	3636780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16020	NC_004337	TCG	2	6	3636834	3636839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16021	NC_004337	AGA	2	6	3636956	3636961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_004337	CCGAC	2	10	3637063	3637072	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16023	NC_004337	TGA	2	6	3637076	3637081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_004337	CCCAA	2	10	3637116	3637125	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
16025	NC_004337	TGC	2	6	3637135	3637140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16026	NC_004337	ATGT	2	8	3637146	3637153	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_004337	GCC	2	6	3637177	3637182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16028	NC_004337	A	7	7	3637232	3637238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_004337	TCGATA	2	12	3637315	3637326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16030	NC_004337	CAT	2	6	3638063	3638068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16031	NC_004337	GCA	2	6	3638088	3638093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16032	NC_004337	GCG	2	6	3638106	3638111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16033	NC_004337	TGAAAA	2	12	3638131	3638142	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_004337	ACA	2	6	3638143	3638148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16035	NC_004337	T	6	6	3638194	3638199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_004337	TAA	2	6	3638207	3638212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_004337	CCA	2	6	3638239	3638244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16038	NC_004337	CGA	2	6	3638288	3638293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16039	NC_004337	CAGC	2	8	3639972	3639979	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16040	NC_004337	CTG	2	6	3639990	3639995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_004337	AGG	2	6	3640016	3640021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_004337	T	7	7	3640101	3640107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_004337	TC	3	6	3640202	3640207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16044	NC_004337	TTGCC	2	10	3640209	3640218	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16045	NC_004337	ATG	2	6	3640264	3640269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_004337	TTG	2	6	3640280	3640285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_004337	CAT	2	6	3640338	3640343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16048	NC_004337	CCG	2	6	3640418	3640423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16049	NC_004337	ACGCC	2	10	3640456	3640465	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
16050	NC_004337	CTG	2	6	3640491	3640496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16051	NC_004337	GT	3	6	3640507	3640512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_004337	CTG	2	6	3640632	3640637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16053	NC_004337	GAA	2	6	3640661	3640666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_004337	TTA	2	6	3640739	3640744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16055	NC_004337	GAT	2	6	3640796	3640801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_004337	ATC	2	6	3640855	3640860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16057	NC_004337	A	6	6	3640892	3640897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16058	NC_004337	CTG	2	6	3640932	3640937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16059	NC_004337	CTG	2	6	3640968	3640973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16060	NC_004337	GACG	2	8	3640982	3640989	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16061	NC_004337	GGA	2	6	3641004	3641009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_004337	GAT	2	6	3641174	3641179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_004337	TGA	2	6	3641248	3641253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16064	NC_004337	TGA	2	6	3641260	3641265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16065	NC_004337	TGA	2	6	3641302	3641307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16066	NC_004337	CGA	2	6	3641344	3641349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16067	NC_004337	GAAGGG	2	12	3641350	3641361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16068	NC_004337	CAGT	2	8	3641421	3641428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16069	NC_004337	ACTG	2	8	3641435	3641442	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16070	NC_004337	AGT	2	6	3642090	3642095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16071	NC_004337	A	6	6	3642116	3642121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16072	NC_004337	TGG	2	6	3642262	3642267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_004337	CTG	2	6	3642448	3642453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16074	NC_004337	ACA	2	6	3642476	3642481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16075	NC_004337	GCG	2	6	3644547	3644552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16076	NC_004337	GCATC	2	10	3644619	3644628	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16077	NC_004337	TTTA	2	8	3644749	3644756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16078	NC_004337	AGA	2	6	3644808	3644813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_004337	A	6	6	3644927	3644932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_004337	AT	3	6	3646320	3646325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16081	NC_004337	CGC	2	6	3646364	3646369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16082	NC_004337	AAATCT	2	12	3646400	3646411	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16083	NC_004337	TTC	2	6	3648526	3648531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16084	NC_004337	CGG	2	6	3648560	3648565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16085	NC_004337	GCA	2	6	3650510	3650515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16086	NC_004337	TCA	2	6	3650587	3650592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16087	NC_004337	TAA	2	6	3652125	3652130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_004337	A	7	7	3652129	3652135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_004337	GAA	2	6	3652210	3652215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_004337	GGT	2	6	3652240	3652245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_004337	GTG	2	6	3652311	3652316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16092	NC_004337	G	7	7	3653647	3653653	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16093	NC_004337	ACA	2	6	3653681	3653686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16094	NC_004337	C	6	6	3655788	3655793	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16095	NC_004337	GCC	2	6	3655808	3655813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16096	NC_004337	AG	3	6	3655841	3655846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_004337	GCG	2	6	3655891	3655896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16098	NC_004337	CGG	3	9	3655921	3655929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16099	NC_004337	ACGT	2	8	3655934	3655941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16100	NC_004337	CTG	2	6	3655976	3655981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16101	NC_004337	CAA	2	6	3655999	3656004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16102	NC_004337	CGT	2	6	3656022	3656027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16103	NC_004337	CTG	2	6	3656064	3656069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16104	NC_004337	CTT	2	6	3656095	3656100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16105	NC_004337	GTCG	2	8	3656108	3656115	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16106	NC_004337	TCA	2	6	3656125	3656130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16107	NC_004337	GTA	2	6	3656261	3656266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_004337	GAGT	2	8	3656279	3656286	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16109	NC_004337	TGT	2	6	3656320	3656325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_004337	T	6	6	3656522	3656527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_004337	CCA	2	6	3656556	3656561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16112	NC_004337	ATC	2	6	3656627	3656632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_004337	GCC	2	6	3656645	3656650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16114	NC_004337	CCA	2	6	3656659	3656664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16115	NC_004337	ACC	2	6	3656936	3656941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16116	NC_004337	CTG	2	6	3656990	3656995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16117	NC_004337	CCG	2	6	3657007	3657012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16118	NC_004337	CGC	2	6	3657025	3657030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16119	NC_004337	TCG	2	6	3657051	3657056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16120	NC_004337	CGT	2	6	3657098	3657103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16121	NC_004337	CGCC	2	8	3657160	3657167	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16122	NC_004337	TTA	2	6	3657249	3657254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_004337	CTG	2	6	3657260	3657265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16124	NC_004337	CGC	2	6	3657266	3657271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16125	NC_004337	CGC	2	6	3657309	3657314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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16127	NC_004337	GCC	2	6	3657369	3657374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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