MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_004337	TCA	2	6	3477684	3477689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15502	NC_004337	GGC	2	6	3477729	3477734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15503	NC_004337	GTT	2	6	3477742	3477747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_004337	GA	3	6	3477758	3477763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_004337	TTG	2	6	3480205	3480210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_004337	T	7	7	3480242	3480248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_004337	CGA	3	9	3481627	3481635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15508	NC_004337	T	6	6	3481663	3481668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_004337	GTT	2	6	3481672	3481677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_004337	A	7	7	3481691	3481697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_004337	TGA	2	6	3481720	3481725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_004337	TTG	2	6	3486605	3486610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_004337	TA	3	6	3487741	3487746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_004337	A	6	6	3488514	3488519	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_004337	GCC	2	6	3488531	3488536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15516	NC_004337	ATC	3	9	3488547	3488555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15517	NC_004337	GCAG	2	8	3488563	3488570	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15518	NC_004337	GC	3	6	3488619	3488624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15519	NC_004337	TGC	2	6	3490036	3490041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15520	NC_004337	TTA	2	6	3490070	3490075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_004337	GAT	2	6	3490080	3490085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_004337	CTCGC	2	10	3490089	3490098	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15523	NC_004337	CAA	2	6	3490211	3490216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15524	NC_004337	ACC	2	6	3490640	3490645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15525	NC_004337	TAC	2	6	3492030	3492035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15526	NC_004337	CG	3	6	3492036	3492041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15527	NC_004337	AT	3	6	3494743	3494748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_004337	TAA	2	6	3495457	3495462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_004337	TCAAA	2	10	3495473	3495482	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15530	NC_004337	ATG	2	6	3495576	3495581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15531	NC_004337	TAAG	2	8	3495664	3495671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15532	NC_004337	AG	3	6	3498976	3498981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15533	NC_004337	AG	3	6	3499881	3499886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15534	NC_004337	TGC	2	6	3499922	3499927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15535	NC_004337	AAAT	2	8	3499945	3499952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15536	NC_004337	ATT	2	6	3499958	3499963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15537	NC_004337	CGT	2	6	3499978	3499983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15538	NC_004337	AGT	2	6	3501772	3501777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15539	NC_004337	T	6	6	3501785	3501790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_004337	ATA	2	6	3501954	3501959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_004337	T	6	6	3501989	3501994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_004337	CAA	2	6	3505893	3505898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15543	NC_004337	A	6	6	3505918	3505923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_004337	CAG	2	6	3505990	3505995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15545	NC_004337	ATT	2	6	3506024	3506029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_004337	CCT	2	6	3506588	3506593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15547	NC_004337	TGGC	2	8	3506599	3506606	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15548	NC_004337	GCCA	2	8	3506613	3506620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15549	NC_004337	ATG	2	6	3506671	3506676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_004337	ATT	2	6	3506695	3506700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_004337	GC	3	6	3506716	3506721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15552	NC_004337	CGC	2	6	3509034	3509039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15553	NC_004337	AACG	2	8	3509047	3509054	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15554	NC_004337	AAC	2	6	3509149	3509154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15555	NC_004337	TTAA	2	8	3509162	3509169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_004337	ATT	3	9	3509252	3509260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_004337	CA	3	6	3509275	3509280	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15558	NC_004337	TGT	2	6	3509321	3509326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_004337	ATT	2	6	3509329	3509334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15560	NC_004337	TC	3	6	3509338	3509343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15561	NC_004337	TTG	2	6	3509346	3509351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15562	NC_004337	ATC	2	6	3509356	3509361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15563	NC_004337	AAC	2	6	3509667	3509672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15564	NC_004337	T	6	6	3512283	3512288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_004337	ACA	2	6	3512414	3512419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15566	NC_004337	GAT	2	6	3516866	3516871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_004337	TAT	2	6	3516877	3516882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15568	NC_004337	TCCC	2	8	3517595	3517602	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15569	NC_004337	ATA	2	6	3517617	3517622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15570	NC_004337	AATTTA	2	12	3517638	3517649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15571	NC_004337	AAT	2	6	3517732	3517737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15572	NC_004337	GTG	2	6	3517759	3517764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15573	NC_004337	GTC	2	6	3517804	3517809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15574	NC_004337	ACTG	2	8	3519175	3519182	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15575	NC_004337	GCATC	2	10	3519189	3519198	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15576	NC_004337	GAG	2	6	3523798	3523803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15577	NC_004337	AGC	2	6	3523866	3523871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15578	NC_004337	A	6	6	3523913	3523918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15579	NC_004337	ATC	2	6	3524038	3524043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15580	NC_004337	TCA	2	6	3524060	3524065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15581	NC_004337	GAA	3	9	3524071	3524079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15582	NC_004337	TGA	2	6	3524099	3524104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15583	NC_004337	CGT	2	6	3524138	3524143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15584	NC_004337	GTT	2	6	3524153	3524158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15585	NC_004337	A	7	7	3524202	3524208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15586	NC_004337	ATTA	2	8	3524253	3524260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15587	NC_004337	A	8	8	3524269	3524276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15588	NC_004337	AGTGA	2	10	3524298	3524307	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15589	NC_004337	GTC	2	6	3524336	3524341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15590	NC_004337	TCGAC	2	10	3524346	3524355	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15591	NC_004337	CTG	2	6	3524377	3524382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15592	NC_004337	AAC	2	6	3524401	3524406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15593	NC_004337	ACC	2	6	3524449	3524454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15594	NC_004337	GGCA	2	8	3524472	3524479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15595	NC_004337	GCC	2	6	3524551	3524556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15596	NC_004337	GCA	2	6	3524559	3524564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15597	NC_004337	CAAC	2	8	3524567	3524574	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15598	NC_004337	ATC	2	6	3524702	3524707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15599	NC_004337	CTT	2	6	3524742	3524747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15600	NC_004337	TGG	2	6	3524777	3524782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15601	NC_004337	TGT	2	6	3524783	3524788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15602	NC_004337	CTG	2	6	3524839	3524844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15603	NC_004337	GAAGC	2	10	3524881	3524890	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15604	NC_004337	T	6	6	3524893	3524898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15605	NC_004337	CGC	2	6	3525034	3525039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15606	NC_004337	GCCA	2	8	3525055	3525062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15607	NC_004337	TCA	2	6	3525164	3525169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15608	NC_004337	GAA	2	6	3525184	3525189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15609	NC_004337	GGAT	2	8	3525242	3525249	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15610	NC_004337	GGC	2	6	3525321	3525326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15611	NC_004337	GCC	2	6	3525349	3525354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15612	NC_004337	AGCGA	2	10	3525385	3525394	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15613	NC_004337	TCA	2	6	3525396	3525401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15614	NC_004337	GGC	2	6	3525408	3525413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15615	NC_004337	TGC	2	6	3525428	3525433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15616	NC_004337	GCT	2	6	3525486	3525491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15617	NC_004337	CATG	2	8	3525640	3525647	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15618	NC_004337	GC	3	6	3525664	3525669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15619	NC_004337	GCC	2	6	3525739	3525744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15620	NC_004337	TGC	2	6	3525792	3525797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15621	NC_004337	GCA	2	6	3525835	3525840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15622	NC_004337	ACG	2	6	3525864	3525869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15623	NC_004337	AGC	2	6	3525981	3525986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15624	NC_004337	GTC	2	6	3526102	3526107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15625	NC_004337	GTG	2	6	3526167	3526172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15626	NC_004337	CTG	2	6	3526214	3526219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15628	NC_004337	GCC	2	6	3526301	3526306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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