MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_004337	TGC	2	6	3207085	3207090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14502	NC_004337	GCG	2	6	3207096	3207101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14503	NC_004337	AT	3	6	3207193	3207198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_004337	AGG	2	6	3207212	3207217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_004337	CGC	2	6	3207848	3207853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14506	NC_004337	AC	3	6	3207922	3207927	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14507	NC_004337	GCATC	2	10	3207953	3207962	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14508	NC_004337	CCG	2	6	3207979	3207984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14509	NC_004337	GCA	2	6	3208005	3208010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14510	NC_004337	CT	3	6	3208070	3208075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14511	NC_004337	CCA	2	6	3208077	3208082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14512	NC_004337	CGTC	2	8	3208228	3208235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14513	NC_004337	CGG	2	6	3208236	3208241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14514	NC_004337	CTG	2	6	3208249	3208254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14515	NC_004337	ATCA	2	8	3208285	3208292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14516	NC_004337	GCA	2	6	3208310	3208315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14517	NC_004337	GGCT	2	8	3208326	3208333	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14518	NC_004337	CCA	2	6	3208353	3208358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14519	NC_004337	CGC	2	6	3208390	3208395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14520	NC_004337	CCG	2	6	3208401	3208406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14521	NC_004337	CGC	2	6	3208609	3208614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14522	NC_004337	CTG	2	6	3208660	3208665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14523	NC_004337	GTTC	2	8	3208671	3208678	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14524	NC_004337	CG	3	6	3208786	3208791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14525	NC_004337	CAA	2	6	3208924	3208929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14526	NC_004337	AC	3	6	3208938	3208943	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14527	NC_004337	CAC	2	6	3208957	3208962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14528	NC_004337	GCA	2	6	3208967	3208972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14529	NC_004337	GCC	2	6	3208988	3208993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14530	NC_004337	TCA	2	6	3209013	3209018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14531	NC_004337	CAGC	2	8	3209062	3209069	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14532	NC_004337	CAC	2	6	3209077	3209082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14533	NC_004337	CCG	2	6	3209145	3209150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14534	NC_004337	AAT	2	6	3209241	3209246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_004337	GCG	2	6	3209260	3209265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14536	NC_004337	T	6	6	3209296	3209301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_004337	CGC	2	6	3209326	3209331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14538	NC_004337	TGT	2	6	3209358	3209363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_004337	GTT	2	6	3209546	3209551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_004337	CTT	2	6	3209554	3209559	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14541	NC_004337	ATT	2	6	3209718	3209723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_004337	GCA	2	6	3209745	3209750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14543	NC_004337	ATC	2	6	3209751	3209756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14544	NC_004337	AAC	2	6	3209788	3209793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14545	NC_004337	GAG	2	6	3210022	3210027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_004337	ACG	2	6	3211337	3211342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14547	NC_004337	ACG	2	6	3211363	3211368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14548	NC_004337	CAT	2	6	3211383	3211388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14549	NC_004337	AAC	2	6	3211402	3211407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14550	NC_004337	CA	3	6	3211436	3211441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14551	NC_004337	GCAT	2	8	3211445	3211452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14552	NC_004337	CAC	2	6	3211463	3211468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14553	NC_004337	ACC	3	9	3211498	3211506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14554	NC_004337	CTC	2	6	3211521	3211526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14555	NC_004337	GTA	2	6	3211533	3211538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_004337	T	6	6	3211568	3211573	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_004337	TCC	2	6	3211695	3211700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14558	NC_004337	TTTA	2	8	3211827	3211834	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_004337	A	6	6	3211895	3211900	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_004337	AC	3	6	3212900	3212905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14561	NC_004337	TGC	2	6	3212933	3212938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14562	NC_004337	CTG	2	6	3212978	3212983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14563	NC_004337	TC	3	6	3213054	3213059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14564	NC_004337	CGG	2	6	3216613	3216618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14565	NC_004337	GCC	2	6	3216631	3216636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14566	NC_004337	TAA	2	6	3218109	3218114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_004337	A	6	6	3218113	3218118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_004337	GAG	2	6	3218147	3218152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_004337	GAA	2	6	3218308	3218313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_004337	GAC	2	6	3218332	3218337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14571	NC_004337	TCT	2	6	3218365	3218370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14572	NC_004337	TGG	2	6	3218403	3218408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_004337	AT	3	6	3218409	3218414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_004337	ACG	2	6	3218540	3218545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14575	NC_004337	GGT	2	6	3218575	3218580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14576	NC_004337	ATG	2	6	3218624	3218629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14577	NC_004337	TGG	2	6	3218683	3218688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_004337	CAT	2	6	3218809	3218814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14579	NC_004337	AAAGC	2	10	3218819	3218828	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14580	NC_004337	ACG	2	6	3218858	3218863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14581	NC_004337	GAT	2	6	3219067	3219072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14582	NC_004337	TC	3	6	3219109	3219114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14583	NC_004337	ACC	2	6	3219164	3219169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14584	NC_004337	GGC	2	6	3219203	3219208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14585	NC_004337	TAA	2	6	3219305	3219310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14586	NC_004337	GCG	2	6	3221695	3221700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14587	NC_004337	ACC	2	6	3221774	3221779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14588	NC_004337	ATT	2	6	3221876	3221881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14589	NC_004337	TG	3	6	3224765	3224770	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14590	NC_004337	GAA	2	6	3224774	3224779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14591	NC_004337	T	6	6	3224830	3224835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_004337	CGC	2	6	3224948	3224953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14593	NC_004337	CCT	2	6	3226117	3226122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14594	NC_004337	ATG	2	6	3226703	3226708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_004337	TCTTT	2	10	3226719	3226728	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
14596	NC_004337	C	6	6	3226751	3226756	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14597	NC_004337	GAC	2	6	3227513	3227518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14598	NC_004337	TGAC	2	8	3228576	3228583	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14599	NC_004337	T	6	6	3228712	3228717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14600	NC_004337	AGC	2	6	3228762	3228767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14601	NC_004337	T	7	7	3228793	3228799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14602	NC_004337	ATTA	2	8	3229803	3229810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_004337	TGG	2	6	3229854	3229859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_004337	GCG	2	6	3230006	3230011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14605	NC_004337	GCG	3	9	3230044	3230052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14606	NC_004337	GC	3	6	3230067	3230072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14607	NC_004337	TAG	2	6	3230170	3230175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_004337	TAAA	2	8	3230199	3230206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_004337	CT	3	6	3230234	3230239	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14610	NC_004337	ACA	2	6	3230353	3230358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14611	NC_004337	T	6	6	3232234	3232239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_004337	AAC	2	6	3232243	3232248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14613	NC_004337	AGCT	2	8	3235198	3235205	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14614	NC_004337	A	7	7	3235292	3235298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_004337	GTC	2	6	3235352	3235357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14616	NC_004337	ATTC	2	8	3235473	3235480	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14617	NC_004337	T	10	10	3235561	3235570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14618	NC_004337	TAAC	2	8	3235585	3235592	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14619	NC_004337	GAT	2	6	3235611	3235616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_004337	TCG	2	6	3237003	3237008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14621	NC_004337	TA	3	6	3237011	3237016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_004337	A	6	6	3237018	3237023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14623	NC_004337	TCTG	2	8	3237679	3237686	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14624	NC_004337	TA	4	8	3237718	3237725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_004337	TCT	2	6	3237739	3237744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14626	NC_004337	TGC	2	6	3237774	3237779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14627	NC_004337	ATG	2	6	3237799	3237804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14629	NC_004337	TA	3	6	3238554	3238559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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