MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_004337	TAT	2	6	3086197	3086202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14002	NC_004337	T	6	6	3086247	3086252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14003	NC_004337	TGT	2	6	3087145	3087150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14004	NC_004337	GAT	2	6	3087152	3087157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14005	NC_004337	TCC	2	6	3087159	3087164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14006	NC_004337	TC	3	6	3087207	3087212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14007	NC_004337	ATA	2	6	3087232	3087237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14008	NC_004337	CGAT	2	8	3087246	3087253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14009	NC_004337	ATCG	2	8	3087276	3087283	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14010	NC_004337	TAA	3	9	3087290	3087298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14011	NC_004337	AC	3	6	3087323	3087328	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14012	NC_004337	AAC	2	6	3087346	3087351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14013	NC_004337	T	6	6	3087438	3087443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14014	NC_004337	CT	3	6	3090612	3090617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14015	NC_004337	ATG	2	6	3090630	3090635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14016	NC_004337	TCA	2	6	3090702	3090707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14017	NC_004337	GT	3	6	3093236	3093241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14018	NC_004337	AG	3	6	3093295	3093300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14019	NC_004337	AC	3	6	3093850	3093855	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14020	NC_004337	CATC	2	8	3094089	3094096	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14021	NC_004337	TCT	2	6	3094105	3094110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14022	NC_004337	T	6	6	3094125	3094130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14023	NC_004337	TTG	2	6	3094134	3094139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14024	NC_004337	ACC	2	6	3094155	3094160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14025	NC_004337	GCA	2	6	3094996	3095001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14027	NC_004337	TCAT	2	8	3095228	3095235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14028	NC_004337	TCA	2	6	3095252	3095257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14029	NC_004337	TGA	2	6	3095265	3095270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_004337	TGT	2	6	3095277	3095282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14031	NC_004337	CGTCAC	2	12	3096304	3096315	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14032	NC_004337	TTTCTC	2	12	3096338	3096349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_004337	AGG	2	6	3096373	3096378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_004337	TGA	2	6	3096626	3096631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_004337	ACC	2	6	3097089	3097094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14036	NC_004337	CAAAC	2	10	3099186	3099195	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14037	NC_004337	CAC	2	6	3099247	3099252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14038	NC_004337	AGA	2	6	3099258	3099263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14039	NC_004337	T	6	6	3099281	3099286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14040	NC_004337	TCT	2	6	3099368	3099373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14042	NC_004337	CTC	2	6	3099534	3099539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14043	NC_004337	C	7	7	3099543	3099549	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14044	NC_004337	TGAT	2	8	3099576	3099583	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14045	NC_004337	TGA	2	6	3099616	3099621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14047	NC_004337	AAT	2	6	3099705	3099710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14048	NC_004337	ACA	2	6	3099714	3099719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14049	NC_004337	TC	3	6	3100936	3100941	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14050	NC_004337	CTA	2	6	3100952	3100957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14051	NC_004337	GA	3	6	3101005	3101010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14052	NC_004337	AAAC	2	8	3101493	3101500	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14053	NC_004337	TAA	2	6	3101538	3101543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14054	NC_004337	AAT	2	6	3101576	3101581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14055	NC_004337	T	7	7	3101597	3101603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_004337	GA	3	6	3101639	3101644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14057	NC_004337	A	6	6	3101701	3101706	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14061	NC_004337	TCAG	2	8	3101863	3101870	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14062	NC_004337	GA	3	6	3103101	3103106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14063	NC_004337	A	8	8	3103106	3103113	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14064	NC_004337	GAT	2	6	3103120	3103125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14065	NC_004337	A	6	6	3103142	3103147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_004337	TGC	2	6	3103619	3103624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14068	NC_004337	T	7	7	3103662	3103668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_004337	T	6	6	3103670	3103675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14070	NC_004337	TAT	3	9	3103933	3103941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14072	NC_004337	A	8	8	3104035	3104042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_004337	TCT	2	6	3104679	3104684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14083	NC_004337	ATCAC	2	10	3105167	3105176	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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14087	NC_004337	TCAGAT	2	12	3105651	3105662	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14088	NC_004337	GCCA	2	8	3105738	3105745	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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14092	NC_004337	CAGC	2	8	3105871	3105878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14093	NC_004337	ATCAC	2	10	3105936	3105945	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14094	NC_004337	CAT	2	6	3106262	3106267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14098	NC_004337	TAC	2	6	3106730	3106735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14099	NC_004337	T	6	6	3106945	3106950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14100	NC_004337	TAA	2	6	3106965	3106970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14103	NC_004337	ATT	2	6	3107080	3107085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14104	NC_004337	GT	3	6	3107122	3107127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14105	NC_004337	ATAC	2	8	3107141	3107148	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14106	NC_004337	ATA	2	6	3107149	3107154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14107	NC_004337	GAT	2	6	3107190	3107195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14108	NC_004337	TTA	2	6	3107234	3107239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14109	NC_004337	TTA	2	6	3107276	3107281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14110	NC_004337	ATT	2	6	3107358	3107363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14111	NC_004337	AAT	2	6	3107383	3107388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14112	NC_004337	ATAA	2	8	3107445	3107452	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14113	NC_004337	A	6	6	3107456	3107461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14114	NC_004337	TAA	2	6	3107497	3107502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14115	NC_004337	AAG	2	6	3107607	3107612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_004337	GACA	2	8	3107647	3107654	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14117	NC_004337	GCA	2	6	3107734	3107739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14125	NC_004337	CAGC	2	8	3107993	3108000	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14126	NC_004337	CCAGCG	2	12	3108049	3108060	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14127	NC_004337	TGG	2	6	3108061	3108066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14129	NC_004337	GCC	2	6	3108230	3108235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14130	NC_004337	GA	3	6	3108240	3108245	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14131	NC_004337	GTTG	2	8	3108276	3108283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14132	NC_004337	TTG	2	6	3108311	3108316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14133	NC_004337	CGC	2	6	3108361	3108366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14157	NC_004337	TC	3	6	3111818	3111823	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14158	NC_004337	CATT	2	8	3112375	3112382	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14159	NC_004337	GCA	2	6	3112445	3112450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14162	NC_004337	CGC	2	6	3112573	3112578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14232	NC_004337	CCAC	2	8	3118119	3118126	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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14240	NC_004337	TAA	2	6	3118375	3118380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14242	NC_004337	AATA	2	8	3118405	3118412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14243	NC_004337	ATTA	2	8	3118415	3118422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14244	NC_004337	CTT	3	9	3118497	3118505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14246	NC_004337	TAAAT	2	10	3118516	3118525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14247	NC_004337	TCAT	2	8	3118527	3118534	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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14250	NC_004337	TA	3	6	3118622	3118627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14251	NC_004337	ATT	2	6	3118637	3118642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14252	NC_004337	ATTTT	2	10	3118646	3118655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14253	NC_004337	T	6	6	3118666	3118671	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14254	NC_004337	GTG	2	6	3118673	3118678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14497	NC_004337	G	6	6	3206931	3206936	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14498	NC_004337	AT	3	6	3206974	3206979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14499	NC_004337	TAAA	2	8	3206981	3206988	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14500	NC_004337	AATGAT	2	12	3206996	3207007	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

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