MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_004337	TTC	2	6	2727237	2727242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12502	NC_004337	TCC	2	6	2727500	2727505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12503	NC_004337	C	6	6	2727544	2727549	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12504	NC_004337	TGCG	2	8	2727632	2727639	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12505	NC_004337	GCT	2	6	2727690	2727695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_004337	CTT	2	6	2727715	2727720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_004337	TCC	2	6	2727764	2727769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12508	NC_004337	CTT	2	6	2727799	2727804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12509	NC_004337	CTG	2	6	2727858	2727863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12510	NC_004337	TCG	2	6	2727933	2727938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_004337	CAA	2	6	2727961	2727966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_004337	AGT	2	6	2728058	2728063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12513	NC_004337	AGC	2	6	2728124	2728129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_004337	GCC	2	6	2728171	2728176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12515	NC_004337	CA	3	6	2728325	2728330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12516	NC_004337	GAA	2	6	2729682	2729687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_004337	TTTTC	2	10	2731438	2731447	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12518	NC_004337	AAT	2	6	2731472	2731477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_004337	GAG	2	6	2731527	2731532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_004337	T	7	7	2735575	2735581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_004337	TCA	2	6	2735626	2735631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_004337	A	7	7	2735663	2735669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_004337	A	6	6	2735693	2735698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_004337	CA	3	6	2735739	2735744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12525	NC_004337	T	6	6	2736188	2736193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_004337	GTACT	2	10	2736218	2736227	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12527	NC_004337	AAAC	2	8	2736242	2736249	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12528	NC_004337	TCG	2	6	2736310	2736315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12529	NC_004337	G	6	6	2736359	2736364	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_004337	T	6	6	2736367	2736372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_004337	GAT	2	6	2737570	2737575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_004337	ATC	2	6	2737580	2737585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_004337	CTC	2	6	2739838	2739843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12534	NC_004337	TAAAG	2	10	2739870	2739879	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_004337	TTTA	2	8	2739904	2739911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_004337	AAAT	2	8	2740389	2740396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_004337	TGA	2	6	2740437	2740442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_004337	A	6	6	2740453	2740458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_004337	A	6	6	2740481	2740486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_004337	TGG	2	6	2740510	2740515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_004337	TAA	2	6	2741057	2741062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_004337	ATG	2	6	2741121	2741126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_004337	TGC	2	6	2741137	2741142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12544	NC_004337	A	7	7	2741182	2741188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_004337	CAG	2	6	2741200	2741205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12546	NC_004337	CAA	2	6	2741206	2741211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12548	NC_004337	GCA	2	6	2741256	2741261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12549	NC_004337	AGC	2	6	2741322	2741327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12550	NC_004337	CAT	2	6	2741416	2741421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12551	NC_004337	TCGC	2	8	2741507	2741514	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12552	NC_004337	CTG	2	6	2741534	2741539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12553	NC_004337	TGG	2	6	2741586	2741591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12554	NC_004337	ATG	2	6	2741622	2741627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_004337	CGA	2	6	2741651	2741656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12556	NC_004337	GAA	2	6	2741663	2741668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_004337	CTG	2	6	2741711	2741716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12558	NC_004337	GGCT	2	8	2741799	2741806	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12559	NC_004337	TGA	2	6	2741841	2741846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_004337	AT	3	6	2741905	2741910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_004337	TTGA	2	8	2741948	2741955	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_004337	GCG	2	6	2742012	2742017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_004337	ATG	2	6	2742039	2742044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_004337	GCA	2	6	2742064	2742069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12565	NC_004337	ACC	2	6	2742131	2742136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12566	NC_004337	AT	3	6	2742265	2742270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_004337	A	7	7	2742775	2742781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_004337	GCCA	2	8	2742784	2742791	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12569	NC_004337	CTT	2	6	2742803	2742808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12570	NC_004337	TC	3	6	2743211	2743216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12571	NC_004337	GCC	2	6	2743994	2743999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12572	NC_004337	GGT	2	6	2744015	2744020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_004337	ACC	2	6	2744574	2744579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12574	NC_004337	TG	3	6	2744847	2744852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_004337	AAC	2	6	2744858	2744863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12582	NC_004337	ATT	2	6	2748635	2748640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_004337	T	7	7	2749261	2749267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12584	NC_004337	TTA	2	6	2749291	2749296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12588	NC_004337	T	6	6	2751998	2752003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12590	NC_004337	TAT	2	6	2752079	2752084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_004337	AATCA	2	10	2752132	2752141	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12592	NC_004337	A	6	6	2752511	2752516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_004337	T	6	6	2752534	2752539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_004337	CAA	2	6	2753277	2753282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12595	NC_004337	CAA	2	6	2753288	2753293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12596	NC_004337	ATA	2	6	2753294	2753299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12599	NC_004337	GAT	2	6	2753418	2753423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12603	NC_004337	CGG	2	6	2753964	2753969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12605	NC_004337	ACG	2	6	2754225	2754230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12608	NC_004337	CT	3	6	2754270	2754275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12609	NC_004337	AG	3	6	2754306	2754311	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_004337	CCTG	2	8	2754341	2754348	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12611	NC_004337	GTCC	2	8	2754394	2754401	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12612	NC_004337	GACT	2	8	2754424	2754431	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12613	NC_004337	GTA	2	6	2754438	2754443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12616	NC_004337	CAGC	2	8	2755973	2755980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12617	NC_004337	CCA	2	6	2755995	2756000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12618	NC_004337	CGG	2	6	2756010	2756015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12619	NC_004337	TTA	2	6	2756024	2756029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_004337	TAG	2	6	2756042	2756047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12623	NC_004337	ATC	2	6	2756875	2756880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12625	NC_004337	T	6	6	2758174	2758179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12626	NC_004337	TGA	2	6	2758202	2758207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_004337	ACC	2	6	2758261	2758266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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