MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_004337	GCA	2	6	2538793	2538798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_004337	ATC	2	6	2538867	2538872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_004337	CAG	2	6	2538878	2538883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_004337	GC	3	6	2538944	2538949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11505	NC_004337	CAT	2	6	2540868	2540873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11506	NC_004337	TA	3	6	2540906	2540911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_004337	TTG	2	6	2540968	2540973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_004337	TCC	2	6	2541099	2541104	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11509	NC_004337	CA	3	6	2541106	2541111	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11510	NC_004337	GGA	2	6	2541117	2541122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11511	NC_004337	TGC	2	6	2541998	2542003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_004337	GCT	2	6	2542042	2542047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11513	NC_004337	CAT	2	6	2542053	2542058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11514	NC_004337	CTG	2	6	2542080	2542085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_004337	CTG	2	6	2545433	2545438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11516	NC_004337	GCG	2	6	2545506	2545511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_004337	TAA	2	6	2545521	2545526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_004337	CAGT	2	8	2545533	2545540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11519	NC_004337	TCC	2	6	2546484	2546489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11520	NC_004337	TTG	2	6	2546521	2546526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_004337	T	6	6	2546543	2546548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11522	NC_004337	CGG	2	6	2546554	2546559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_004337	TGAAA	2	10	2548189	2548198	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_004337	CGT	2	6	2548224	2548229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11525	NC_004337	CGATA	2	10	2548241	2548250	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11526	NC_004337	TAT	2	6	2548266	2548271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_004337	ACG	2	6	2550100	2550105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_004337	GCT	2	6	2550121	2550126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_004337	GGC	2	6	2550173	2550178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_004337	ACG	2	6	2550228	2550233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_004337	GCG	2	6	2550305	2550310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11532	NC_004337	TGA	2	6	2550411	2550416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11533	NC_004337	CCG	2	6	2550427	2550432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11534	NC_004337	CTT	2	6	2550448	2550453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_004337	TGC	2	6	2550585	2550590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11536	NC_004337	GCA	2	6	2550619	2550624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11537	NC_004337	TGA	2	6	2550670	2550675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_004337	CG	3	6	2550805	2550810	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11539	NC_004337	ATC	2	6	2550899	2550904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_004337	CTG	2	6	2550962	2550967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_004337	TGTC	2	8	2551007	2551014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11542	NC_004337	TGA	2	6	2551017	2551022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_004337	ATG	2	6	2551116	2551121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_004337	CCT	2	6	2552340	2552345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11545	NC_004337	CAG	2	6	2552415	2552420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_004337	T	6	6	2552492	2552497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11547	NC_004337	TAA	2	6	2552532	2552537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11548	NC_004337	TGATAG	2	12	2552561	2552572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_004337	GCTG	2	8	2552591	2552598	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11550	NC_004337	TAT	2	6	2552675	2552680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_004337	AAG	2	6	2552719	2552724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_004337	A	8	8	2552754	2552761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_004337	CACT	2	8	2552780	2552787	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11554	NC_004337	CACT	2	8	2552803	2552810	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11555	NC_004337	TAA	2	6	2552834	2552839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_004337	ATA	2	6	2552850	2552855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11557	NC_004337	CGG	2	6	2552889	2552894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_004337	GCA	2	6	2552952	2552957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11559	NC_004337	AAAAC	2	10	2553097	2553106	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11560	NC_004337	GCTTC	2	10	2553126	2553135	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11561	NC_004337	ACG	2	6	2553166	2553171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_004337	CAGAC	2	10	2553300	2553309	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
11563	NC_004337	CAG	2	6	2553316	2553321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_004337	AGC	2	6	2553325	2553330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_004337	ACG	2	6	2553360	2553365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_004337	CAG	2	6	2553368	2553373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11567	NC_004337	CGC	2	6	2553405	2553410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11568	NC_004337	AC	3	6	2553474	2553479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11569	NC_004337	ACTT	2	8	2553491	2553498	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11570	NC_004337	TAAT	2	8	2554446	2554453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_004337	A	8	8	2554476	2554483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_004337	CCG	2	6	2554485	2554490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11573	NC_004337	TTA	2	6	2554523	2554528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_004337	GGC	2	6	2554550	2554555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11575	NC_004337	AAT	2	6	2554598	2554603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11576	NC_004337	TGA	2	6	2554616	2554621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_004337	TAA	2	6	2554624	2554629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_004337	AT	3	6	2554662	2554667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_004337	A	6	6	2554686	2554691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_004337	GGAATC	2	12	2554734	2554745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11581	NC_004337	CTT	3	9	2554773	2554781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11582	NC_004337	TCC	2	6	2554782	2554787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11583	NC_004337	CTT	2	6	2554796	2554801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11584	NC_004337	GCA	2	6	2554847	2554852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11585	NC_004337	A	7	7	2554891	2554897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_004337	ATT	2	6	2554945	2554950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_004337	ACAGA	2	10	2554980	2554989	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11588	NC_004337	ATA	2	6	2554993	2554998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_004337	A	6	6	2555708	2555713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_004337	G	6	6	2555714	2555719	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11591	NC_004337	AAAG	2	8	2556277	2556284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_004337	GACAA	2	10	2556333	2556342	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11593	NC_004337	GC	4	8	2556714	2556721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11594	NC_004337	GAG	2	6	2556722	2556727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_004337	TGT	2	6	2556960	2556965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_004337	T	7	7	2557048	2557054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_004337	ATA	2	6	2557119	2557124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_004337	T	6	6	2557131	2557136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_004337	ATTA	2	8	2557156	2557163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_004337	AT	3	6	2557166	2557171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_004337	TAT	2	6	2557248	2557253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_004337	AAAT	2	8	2557257	2557264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_004337	GAA	2	6	2557356	2557361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_004337	TGA	2	6	2557389	2557394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_004337	TGA	3	9	2557452	2557460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_004337	TGTGA	2	10	2557751	2557760	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_004337	TG	3	6	2557764	2557769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_004337	TGA	2	6	2557780	2557785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_004337	TCA	2	6	2557786	2557791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_004337	AATG	2	8	2557798	2557805	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_004337	GAA	2	6	2560826	2560831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_004337	TAT	2	6	2561126	2561131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_004337	TAA	2	6	2561202	2561207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_004337	ATA	2	6	2561225	2561230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_004337	T	6	6	2561252	2561257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11616	NC_004337	A	6	6	2561274	2561279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_004337	TTA	2	6	2561297	2561302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_004337	ACC	2	6	2561350	2561355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11619	NC_004337	GAA	2	6	2561357	2561362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11620	NC_004337	TTCT	2	8	2561381	2561388	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11621	NC_004337	T	6	6	2561388	2561393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_004337	TCT	2	6	2561419	2561424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11623	NC_004337	GTTCT	2	10	2561432	2561441	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11624	NC_004337	GGTTTT	2	12	2561442	2561453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_004337	T	6	6	2561450	2561455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_004337	TTTTTA	2	12	2561458	2561469	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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