MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_004337	CGG	2	6	2436782	2436787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11002	NC_004337	AGAAAA	2	12	2438926	2438937	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11003	NC_004337	TTCC	2	8	2438953	2438960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11004	NC_004337	A	6	6	2438985	2438990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11005	NC_004337	GCG	2	6	2439047	2439052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11006	NC_004337	GCCCT	2	10	2441104	2441113	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11007	NC_004337	TCTG	2	8	2442048	2442055	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11008	NC_004337	A	6	6	2442163	2442168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_004337	ATT	2	6	2442925	2442930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_004337	CAG	2	6	2444803	2444808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11011	NC_004337	AG	3	6	2444807	2444812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_004337	GAA	2	6	2444816	2444821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11013	NC_004337	GAG	2	6	2448259	2448264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_004337	TC	3	6	2448278	2448283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11015	NC_004337	TGG	2	6	2448371	2448376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11016	NC_004337	ATG	2	6	2448386	2448391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_004337	GCG	2	6	2451918	2451923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11018	NC_004337	CGC	2	6	2452004	2452009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11019	NC_004337	TTG	2	6	2455609	2455614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_004337	TCC	2	6	2456567	2456572	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11021	NC_004337	AAT	2	6	2456586	2456591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_004337	CGG	2	6	2456594	2456599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_004337	CG	3	6	2456637	2456642	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11024	NC_004337	GTGA	2	8	2456643	2456650	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_004337	CGAT	2	8	2456669	2456676	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11026	NC_004337	GCA	2	6	2457286	2457291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_004337	AGC	2	6	2457300	2457305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11028	NC_004337	TG	3	6	2459964	2459969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_004337	ACG	2	6	2459995	2460000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_004337	AAC	2	6	2460102	2460107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11031	NC_004337	TTTG	2	8	2460146	2460153	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_004337	CACG	2	8	2460169	2460176	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11033	NC_004337	GGCA	2	8	2460203	2460210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11034	NC_004337	TTG	2	6	2460213	2460218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_004337	TCA	2	6	2460253	2460258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_004337	TGAT	2	8	2460385	2460392	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_004337	CGT	2	6	2460482	2460487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_004337	GAAACA	2	12	2460556	2460567	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11039	NC_004337	TGG	2	6	2460575	2460580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_004337	TCA	2	6	2460622	2460627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_004337	AAC	2	6	2460630	2460635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_004337	TGGCA	2	10	2460658	2460667	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11043	NC_004337	GGCA	2	8	2460690	2460697	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11044	NC_004337	AC	3	6	2460743	2460748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11045	NC_004337	CCAG	2	8	2460772	2460779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11046	NC_004337	TCA	2	6	2460793	2460798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11047	NC_004337	T	6	6	2460829	2460834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_004337	GGA	2	6	2460850	2460855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_004337	GCA	2	6	2460875	2460880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_004337	TGA	2	6	2460902	2460907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_004337	ACC	2	6	2460955	2460960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11052	NC_004337	TTG	2	6	2460991	2460996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_004337	ACG	2	6	2461042	2461047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11054	NC_004337	CAG	2	6	2461073	2461078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_004337	ATCA	2	8	2461119	2461126	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11056	NC_004337	GCC	2	6	2461191	2461196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11057	NC_004337	CAT	2	6	2461271	2461276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11058	NC_004337	GT	3	6	2461300	2461305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_004337	CTG	2	6	2461375	2461380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11060	NC_004337	TGT	2	6	2461420	2461425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_004337	ATG	2	6	2461551	2461556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_004337	CTC	2	6	2461571	2461576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11063	NC_004337	GAGT	2	8	2461872	2461879	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_004337	CGAC	2	8	2461917	2461924	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11065	NC_004337	GCC	2	6	2461964	2461969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11066	NC_004337	A	7	7	2462017	2462023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_004337	CAT	2	6	2462063	2462068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11068	NC_004337	ACCTG	2	10	2462082	2462091	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11069	NC_004337	GTTCT	2	10	2462147	2462156	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11070	NC_004337	GT	3	6	2462280	2462285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_004337	CCA	2	6	2462358	2462363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11072	NC_004337	ATG	2	6	2462431	2462436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11073	NC_004337	CGCC	2	8	2462441	2462448	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11074	NC_004337	TAG	2	6	2462454	2462459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11076	NC_004337	T	7	7	2462474	2462480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_004337	CGC	2	6	2462490	2462495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11078	NC_004337	TCA	2	6	2462507	2462512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_004337	TAGT	2	8	2462531	2462538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11080	NC_004337	ATC	2	6	2462611	2462616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11082	NC_004337	CGA	2	6	2462664	2462669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_004337	TCT	2	6	2462855	2462860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11084	NC_004337	TTTA	2	8	2462968	2462975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_004337	CTGG	2	8	2463016	2463023	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11086	NC_004337	GTC	2	6	2463088	2463093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11090	NC_004337	AATTT	2	10	2464007	2464016	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11091	NC_004337	TAAT	2	8	2464039	2464046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11092	NC_004337	AT	3	6	2464045	2464050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_004337	AGA	2	6	2464055	2464060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_004337	CAT	2	6	2464814	2464819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11097	NC_004337	A	6	6	2464885	2464890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11098	NC_004337	AAT	2	6	2464904	2464909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11099	NC_004337	A	6	6	2464925	2464930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11100	NC_004337	AATAT	2	10	2464976	2464985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11101	NC_004337	CCTG	2	8	2465027	2465034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11102	NC_004337	ATT	2	6	2465035	2465040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_004337	TAT	2	6	2465056	2465061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11104	NC_004337	TAA	2	6	2465068	2465073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11105	NC_004337	ATT	2	6	2465097	2465102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11106	NC_004337	AGA	2	6	2465143	2465148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_004337	GAAT	2	8	2465158	2465165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_004337	TTTA	2	8	2465177	2465184	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11109	NC_004337	TAG	2	6	2465205	2465210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_004337	TTTC	2	8	2465808	2465815	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11111	NC_004337	AGAA	2	8	2465828	2465835	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_004337	T	6	6	2465883	2465888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_004337	A	7	7	2469445	2469451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11114	NC_004337	TAAA	2	8	2469452	2469459	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11115	NC_004337	T	7	7	2469489	2469495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11116	NC_004337	AGA	2	6	2469549	2469554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_004337	AAGAA	2	10	2469555	2469564	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_004337	CGTA	2	8	2469592	2469599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11119	NC_004337	TGC	2	6	2469966	2469971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11120	NC_004337	GTT	2	6	2469976	2469981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11121	NC_004337	A	6	6	2470110	2470115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11123	NC_004337	AGT	2	6	2471673	2471678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11124	NC_004337	TTGC	2	8	2471686	2471693	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11125	NC_004337	C	6	6	2471845	2471850	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11126	NC_004337	TAAA	2	8	2471892	2471899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11127	NC_004337	T	6	6	2471906	2471911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11128	NC_004337	AT	4	8	2471933	2471940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11130	NC_004337	TCAA	2	8	2471988	2471995	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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