MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_004337	GCC	2	6	2212678	2212683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10002	NC_004337	CGC	2	6	2212700	2212705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10003	NC_004337	TGC	2	6	2212710	2212715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_004337	TTTGA	2	10	2212982	2212991	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_004337	CAA	2	6	2213523	2213528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_004337	ATCA	2	8	2213529	2213536	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10007	NC_004337	TTA	2	6	2213616	2213621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_004337	CCTTAC	2	12	2213640	2213651	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
10009	NC_004337	TTG	2	6	2213677	2213682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_004337	CAC	2	6	2213723	2213728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10011	NC_004337	GGT	2	6	2213827	2213832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_004337	TTCG	2	8	2213838	2213845	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10013	NC_004337	GTG	2	6	2213870	2213875	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_004337	TAAA	2	8	2213892	2213899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_004337	CAG	2	6	2213914	2213919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_004337	T	8	8	2213920	2213927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_004337	AAC	2	6	2213965	2213970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10018	NC_004337	TA	3	6	2220615	2220620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_004337	CAC	2	6	2221293	2221298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10020	NC_004337	AGGA	2	8	2221316	2221323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_004337	ATGGAA	2	12	2221330	2221341	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_004337	CAT	2	6	2221366	2221371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_004337	GCA	2	6	2221391	2221396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_004337	CCA	2	6	2221401	2221406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10025	NC_004337	TAAA	2	8	2221417	2221424	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10026	NC_004337	CGG	2	6	2221904	2221909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10027	NC_004337	GCC	2	6	2221924	2221929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10028	NC_004337	TTC	2	6	2221946	2221951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10029	NC_004337	GC	3	6	2221960	2221965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10030	NC_004337	CGC	2	6	2222001	2222006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10031	NC_004337	GC	3	6	2222033	2222038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10032	NC_004337	ATC	2	6	2222039	2222044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_004337	CTG	2	6	2222074	2222079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10034	NC_004337	CAT	2	6	2222836	2222841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_004337	ACAT	2	8	2225667	2225674	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10036	NC_004337	CTTT	2	8	2225688	2225695	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10037	NC_004337	AAAAT	2	10	2225752	2225761	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_004337	T	7	7	2225852	2225858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_004337	TC	3	6	2225953	2225958	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10040	NC_004337	TTGCC	2	10	2225960	2225969	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10041	NC_004337	ATG	2	6	2226015	2226020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_004337	TTG	2	6	2226031	2226036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_004337	CAT	2	6	2226089	2226094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_004337	CCG	2	6	2226169	2226174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10045	NC_004337	ACGCC	2	10	2226207	2226216	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10046	NC_004337	CTG	2	6	2226242	2226247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10047	NC_004337	GT	3	6	2226258	2226263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_004337	CTG	2	6	2226383	2226388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_004337	GAA	2	6	2226412	2226417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_004337	TTA	2	6	2226490	2226495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_004337	GAT	2	6	2226547	2226552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_004337	ATC	2	6	2226606	2226611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10053	NC_004337	A	6	6	2226643	2226648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_004337	CTG	2	6	2226683	2226688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10055	NC_004337	CTG	2	6	2226719	2226724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10056	NC_004337	GACG	2	8	2226733	2226740	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10057	NC_004337	GGA	2	6	2226755	2226760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_004337	GAT	2	6	2226925	2226930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_004337	TGA	2	6	2226999	2227004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_004337	TGA	2	6	2227011	2227016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_004337	CGA	2	6	2227095	2227100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10062	NC_004337	GAAGGG	2	12	2227101	2227112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_004337	CAGT	2	8	2227172	2227179	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10064	NC_004337	ACTG	2	8	2227186	2227193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10065	NC_004337	A	6	6	2227214	2227219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_004337	CG	3	6	2227351	2227356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10067	NC_004337	CGA	2	6	2227378	2227383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_004337	GAT	2	6	2227421	2227426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_004337	CGA	2	6	2227440	2227445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_004337	CGA	2	6	2227450	2227455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10071	NC_004337	AGG	2	6	2227573	2227578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_004337	GCA	2	6	2227903	2227908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10073	NC_004337	CGT	2	6	2227920	2227925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10074	NC_004337	TTTTTC	2	12	2227934	2227945	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10075	NC_004337	GCA	2	6	2228952	2228957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10076	NC_004337	TAAC	2	8	2229066	2229073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10077	NC_004337	T	7	7	2229129	2229135	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_004337	TTA	2	6	2229206	2229211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_004337	TTA	2	6	2229253	2229258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_004337	C	7	7	2229276	2229282	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10081	NC_004337	AAT	2	6	2229336	2229341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_004337	TC	3	6	2229344	2229349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10083	NC_004337	TGA	2	6	2229500	2229505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_004337	AT	3	6	2229623	2229628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_004337	AT	3	6	2229683	2229688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_004337	CTGT	2	8	2229708	2229715	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10087	NC_004337	GAT	2	6	2229798	2229803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_004337	TGA	2	6	2229872	2229877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_004337	TTAAG	2	10	2229905	2229914	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_004337	AAT	2	6	2229961	2229966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_004337	ACA	2	6	2229970	2229975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_004337	TC	3	6	2231192	2231197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10093	NC_004337	AAT	2	6	2231258	2231263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_004337	ACA	2	6	2231276	2231281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10095	NC_004337	ACA	2	6	2231336	2231341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10096	NC_004337	ACAA	2	8	2231395	2231402	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10097	NC_004337	CAG	2	6	2231571	2231576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10098	NC_004337	TGC	2	6	2231588	2231593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10099	NC_004337	CCT	2	6	2231654	2231659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10100	NC_004337	GCTCT	2	10	2231703	2231712	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10101	NC_004337	GGA	2	6	2231747	2231752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10102	NC_004337	GAAT	2	8	2231942	2231949	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_004337	GCAG	2	8	2232020	2232027	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10104	NC_004337	GATGCG	2	12	2232108	2232119	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10105	NC_004337	CAG	2	6	2232159	2232164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10106	NC_004337	CTGA	2	8	2232177	2232184	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10107	NC_004337	GACT	2	8	2232264	2232271	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10108	NC_004337	GCCC	2	8	2232286	2232293	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10109	NC_004337	TCT	2	6	2232386	2232391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10110	NC_004337	CTG	2	6	2234786	2234791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_004337	T	6	6	2234815	2234820	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_004337	AC	3	6	2234893	2234898	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10113	NC_004337	A	6	6	2235150	2235155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_004337	ATC	2	6	2235167	2235172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10115	NC_004337	CAA	2	6	2235184	2235189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_004337	TGGA	2	8	2235196	2235203	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_004337	TGC	2	6	2235239	2235244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10118	NC_004337	ATG	2	6	2235264	2235269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_004337	TAA	2	6	2236044	2236049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_004337	ATGC	2	8	2236167	2236174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10121	NC_004337	CA	3	6	2236226	2236231	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10122	NC_004337	ACA	2	6	2236275	2236280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10123	NC_004337	CTT	2	6	2236298	2236303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_004337	AGA	2	6	2236307	2236312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_004337	CATG	2	8	2236329	2236336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10126	NC_004337	TAAAA	2	10	2236355	2236364	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_004337	CG	3	6	2236408	2236413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10128	NC_004337	CGG	2	6	2236455	2236460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_004337	CTG	2	6	2237017	2237022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_004337	CAT	2	6	2237113	2237118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10131	NC_004337	GAA	2	6	2237160	2237165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_004337	GTT	2	6	2237225	2237230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10133	NC_004337	TTAC	2	8	2237413	2237420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10134	NC_004337	TCA	2	6	2237455	2237460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10135	NC_004337	GTAT	2	8	2237600	2237607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10136	NC_004337	AC	3	6	2237617	2237622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10137	NC_004337	GTGG	2	8	2237780	2237787	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10138	NC_004337	CGA	2	6	2237802	2237807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10140	NC_004337	TTA	2	6	2237855	2237860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10150	NC_004337	TCAA	2	8	2238256	2238263	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10151	NC_004337	TGGTG	2	10	2238298	2238307	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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10161	NC_004337	T	6	6	2244994	2244999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10169	NC_004337	ATGT	2	8	2248562	2248569	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10238	NC_004337	GCG	2	6	2258118	2258123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10239	NC_004337	CT	3	6	2258147	2258152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10240	NC_004337	TG	3	6	2258181	2258186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10241	NC_004337	GGTGT	2	10	2258213	2258222	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
10242	NC_004337	T	6	6	2258237	2258242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10243	NC_004337	CGC	2	6	2258259	2258264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10246	NC_004337	GAAG	2	8	2258371	2258378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10247	NC_004337	AGC	2	6	2258424	2258429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10248	NC_004337	AGC	2	6	2258436	2258441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10249	NC_004337	GGC	2	6	2258591	2258596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10250	NC_004337	GCG	3	9	2258602	2258610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10251	NC_004337	TTCA	2	8	2258751	2258758	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10252	NC_004337	CGG	2	6	2258807	2258812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10253	NC_004337	GCG	2	6	2258832	2258837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10254	NC_004337	GCA	2	6	2258856	2258861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10256	NC_004337	AGA	2	6	2258909	2258914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_004337	CGG	2	6	2259004	2259009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10261	NC_004337	GAAGT	2	10	2259219	2259228	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10262	NC_004337	TTG	2	6	2261860	2261865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10269	NC_004337	TGCT	2	8	2264262	2264269	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10290	NC_004337	CG	3	6	2267103	2267108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10333	NC_004337	ATTA	2	8	2272119	2272126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10379	NC_004337	TAT	2	6	2289275	2289280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10382	NC_004337	T	6	6	2290977	2290982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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