MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_004337	AACAG	2	10	2044171	2044180	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9002	NC_004337	GTA	2	6	2044187	2044192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_004337	ACA	2	6	2044193	2044198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_004337	TAAG	2	8	2044217	2044224	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_004337	T	6	6	2044259	2044264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_004337	A	7	7	2044278	2044284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_004337	AATA	2	8	2044302	2044309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_004337	T	6	6	2044413	2044418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_004337	A	6	6	2044446	2044451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9010	NC_004337	CAA	2	6	2044463	2044468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9011	NC_004337	T	6	6	2044522	2044527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_004337	ATT	2	6	2044534	2044539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_004337	AAT	2	6	2044612	2044617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_004337	GA	3	6	2044819	2044824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_004337	GAT	2	6	2044875	2044880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_004337	A	6	6	2044920	2044925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_004337	AGA	2	6	2044972	2044977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_004337	CTT	2	6	2044989	2044994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9019	NC_004337	CCA	2	6	2044999	2045004	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9020	NC_004337	T	6	6	2045058	2045063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_004337	TG	3	6	2045085	2045090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_004337	AAT	2	6	2045094	2045099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9023	NC_004337	TA	3	6	2045111	2045116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_004337	GCA	2	6	2045177	2045182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_004337	CGT	2	6	2045194	2045199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9026	NC_004337	TTTTTC	2	12	2045208	2045219	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9027	NC_004337	GCA	2	6	2046226	2046231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9028	NC_004337	TAAC	2	8	2046340	2046347	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9029	NC_004337	T	7	7	2046403	2046409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_004337	TTA	2	6	2046480	2046485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_004337	TTA	2	6	2046527	2046532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_004337	C	7	7	2046550	2046556	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9033	NC_004337	AAT	2	6	2046610	2046615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_004337	TC	3	6	2046618	2046623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9035	NC_004337	TGA	2	6	2046774	2046779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_004337	AT	3	6	2046897	2046902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9037	NC_004337	AT	3	6	2046957	2046962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_004337	CTGT	2	8	2046982	2046989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9039	NC_004337	GAT	2	6	2047072	2047077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_004337	TGA	2	6	2047146	2047151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_004337	TTAAG	2	10	2047179	2047188	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_004337	AAT	2	6	2047235	2047240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_004337	ACA	2	6	2047244	2047249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_004337	TC	3	6	2048466	2048471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9045	NC_004337	AAT	2	6	2048532	2048537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_004337	ACA	2	6	2048550	2048555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_004337	ACA	2	6	2048610	2048615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9048	NC_004337	ACAA	2	8	2048669	2048676	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9049	NC_004337	CAG	2	6	2048845	2048850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9050	NC_004337	TGC	2	6	2048862	2048867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9051	NC_004337	CCT	2	6	2048928	2048933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9052	NC_004337	GCTCT	2	10	2048977	2048986	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9053	NC_004337	GGA	2	6	2049021	2049026	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_004337	GAAT	2	8	2049216	2049223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_004337	GCAG	2	8	2049294	2049301	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9056	NC_004337	GATGCG	2	12	2049382	2049393	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9057	NC_004337	CAG	2	6	2049433	2049438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_004337	CTGA	2	8	2049451	2049458	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9059	NC_004337	GACT	2	8	2049538	2049545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9060	NC_004337	GCCC	2	8	2049560	2049567	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9061	NC_004337	TCT	2	6	2049660	2049665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9062	NC_004337	TTG	2	6	2051047	2051052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_004337	TGC	2	6	2051078	2051083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9064	NC_004337	ATG	2	6	2051103	2051108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_004337	TTCCAT	2	12	2051133	2051144	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_004337	TCCT	2	8	2051151	2051158	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9067	NC_004337	GTG	2	6	2051176	2051181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_004337	AAGA	2	8	2051841	2051848	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_004337	AAG	2	6	2051856	2051861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_004337	A	7	7	2051886	2051892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_004337	GGC	2	6	2051905	2051910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9072	NC_004337	TA	3	6	2051912	2051917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9073	NC_004337	AAAC	2	8	2052402	2052409	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9074	NC_004337	CAC	2	6	2052451	2052456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9075	NC_004337	A	7	7	2052457	2052463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_004337	T	6	6	2056692	2056697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9078	NC_004337	CGG	2	6	2056741	2056746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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9080	NC_004337	TTC	2	6	2056761	2056766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9081	NC_004337	ACCG	2	8	2056816	2056823	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9082	NC_004337	CAG	2	6	2056944	2056949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9084	NC_004337	CAG	2	6	2057061	2057066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9087	NC_004337	CAT	2	6	2057147	2057152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9089	NC_004337	TTG	2	6	2058075	2058080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9093	NC_004337	GAAAA	2	10	2060688	2060697	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9094	NC_004337	A	6	6	2060694	2060699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_004337	AT	3	6	2060720	2060725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_004337	CAA	2	6	2060748	2060753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9097	NC_004337	ATGA	2	8	2060791	2060798	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_004337	A	8	8	2060840	2060847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_004337	TCAT	2	8	2060852	2060859	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9100	NC_004337	CAT	2	6	2060894	2060899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9101	NC_004337	CAT	2	6	2060948	2060953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9102	NC_004337	CTAC	2	8	2061053	2061060	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9103	NC_004337	TGA	2	6	2061137	2061142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_004337	TGG	2	6	2061155	2061160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_004337	TCGC	2	8	2061200	2061207	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9106	NC_004337	CAC	2	6	2061211	2061216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9107	NC_004337	ATA	2	6	2061240	2061245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_004337	TCC	2	6	2061291	2061296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9109	NC_004337	A	6	6	2061336	2061341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_004337	TTTG	2	8	2061359	2061366	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_004337	AT	3	6	2061413	2061418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_004337	ACC	2	6	2063484	2063489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9113	NC_004337	CCG	2	6	2063969	2063974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9114	NC_004337	A	6	6	2064652	2064657	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_004337	CTT	2	6	2065168	2065173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9116	NC_004337	TGC	2	6	2065225	2065230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9117	NC_004337	ACC	2	6	2065332	2065337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9118	NC_004337	AAAT	2	8	2065427	2065434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_004337	TATG	2	8	2065440	2065447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9120	NC_004337	GCT	2	6	2065500	2065505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9121	NC_004337	AAT	2	6	2065533	2065538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_004337	ATG	2	6	2066426	2066431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_004337	GA	3	6	2066454	2066459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_004337	TC	3	6	2066532	2066537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9125	NC_004337	ATG	2	6	2066554	2066559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_004337	ATTA	2	8	2067445	2067452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_004337	GACA	2	8	2067485	2067492	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9128	NC_004337	TGG	2	6	2067717	2067722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_004337	AT	3	6	2067765	2067770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_004337	CTG	2	6	2067848	2067853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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