MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_004337	GCA	2	6	1700844	1700849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_004337	TGC	2	6	1700887	1700892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_004337	CG	3	6	1700936	1700941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7004	NC_004337	CCA	2	6	1700957	1700962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7005	NC_004337	TAT	2	6	1701107	1701112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_004337	GCC	2	6	1701184	1701189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7007	NC_004337	AGT	2	6	1701201	1701206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_004337	GAT	2	6	1701237	1701242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_004337	TGA	3	9	1701331	1701339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_004337	GCA	2	6	1701396	1701401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_004337	TACTC	2	10	1701412	1701421	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7012	NC_004337	GCA	2	6	1701429	1701434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_004337	CTG	2	6	1701453	1701458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_004337	CTG	2	6	1701561	1701566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_004337	CTT	2	6	1701579	1701584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_004337	TGGCT	2	10	1701727	1701736	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7017	NC_004337	GCC	3	9	1701778	1701786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7018	NC_004337	CG	3	6	1701792	1701797	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7019	NC_004337	GCC	2	6	1701826	1701831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7020	NC_004337	ATC	2	6	1701871	1701876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_004337	GTCA	2	8	1701879	1701886	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7022	NC_004337	TTA	2	6	1701924	1701929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_004337	TGC	2	6	1701943	1701948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_004337	TGT	2	6	1701962	1701967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_004337	TGA	2	6	1702048	1702053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_004337	GGC	2	6	1702082	1702087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_004337	GAA	2	6	1702095	1702100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_004337	TCA	3	9	1702130	1702138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_004337	GCC	2	6	1702143	1702148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7030	NC_004337	GGC	2	6	1702157	1702162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_004337	GGC	2	6	1702171	1702176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_004337	AGCA	2	8	1702201	1702208	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7033	NC_004337	CGG	2	6	1702816	1702821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_004337	GAG	2	6	1703760	1703765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_004337	T	6	6	1704731	1704736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_004337	GAC	2	6	1704744	1704749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_004337	GCG	2	6	1705872	1705877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_004337	GCC	2	6	1705882	1705887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7039	NC_004337	ACA	2	6	1705899	1705904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_004337	GC	3	6	1706415	1706420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7041	NC_004337	TGA	2	6	1707110	1707115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7042	NC_004337	TTC	2	6	1707256	1707261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_004337	GGC	2	6	1707308	1707313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_004337	GCA	2	6	1707366	1707371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_004337	GGC	2	6	1707405	1707410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7046	NC_004337	CGG	3	9	1707534	1707542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_004337	ATT	2	6	1707558	1707563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_004337	GTG	2	6	1707595	1707600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_004337	GCT	2	6	1707635	1707640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_004337	CAGC	2	8	1707685	1707692	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7051	NC_004337	GCA	2	6	1707699	1707704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_004337	TGG	2	6	1707710	1707715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_004337	CCCG	2	8	1707740	1707747	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7054	NC_004337	GAT	2	6	1707795	1707800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_004337	GCCG	2	8	1707840	1707847	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7056	NC_004337	AT	3	6	1707866	1707871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_004337	TGA	2	6	1707887	1707892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_004337	CGC	2	6	1707977	1707982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7059	NC_004337	CAC	2	6	1708092	1708097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7060	NC_004337	AAC	2	6	1708114	1708119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_004337	CGC	2	6	1708234	1708239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7062	NC_004337	GCAG	2	8	1708371	1708378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7063	NC_004337	ACC	2	6	1708394	1708399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7064	NC_004337	GCA	2	6	1708424	1708429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_004337	GCC	2	6	1708437	1708442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7066	NC_004337	GCG	2	6	1708443	1708448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_004337	TTG	2	6	1708647	1708652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_004337	GCG	2	6	1708663	1708668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7069	NC_004337	TTA	2	6	1708701	1708706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7071	NC_004337	CGG	2	6	1708734	1708739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_004337	GAG	2	6	1708755	1708760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_004337	GTG	2	6	1708891	1708896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_004337	GAT	2	6	1708928	1708933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7078	NC_004337	TTGA	2	8	1709031	1709038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_004337	GCAAC	2	10	1709042	1709051	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7080	NC_004337	TGA	2	6	1709102	1709107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_004337	TAT	2	6	1709123	1709128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7082	NC_004337	TGA	2	6	1709231	1709236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7083	NC_004337	TTG	2	6	1709242	1709247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7089	NC_004337	ATT	2	6	1709390	1709395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7091	NC_004337	GC	3	6	1709447	1709452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7092	NC_004337	CAGT	2	8	1709453	1709460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7093	NC_004337	GAA	2	6	1709796	1709801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_004337	AGA	2	6	1709826	1709831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7099	NC_004337	TCT	2	6	1709948	1709953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7102	NC_004337	GCC	2	6	1710018	1710023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7103	NC_004337	ATTT	2	8	1710072	1710079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_004337	AAC	2	6	1710151	1710156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7110	NC_004337	TGC	2	6	1710349	1710354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7111	NC_004337	CCTG	2	8	1710509	1710516	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7112	NC_004337	A	8	8	1710589	1710596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_004337	TGG	2	6	1710617	1710622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7115	NC_004337	GCA	2	6	1710696	1710701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7120	NC_004337	ACGC	2	8	1710893	1710900	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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7124	NC_004337	ACA	2	6	1710977	1710982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_004337	CTGG	2	8	1710991	1710998	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7126	NC_004337	GCTGGC	2	12	1711047	1711058	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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