MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 chromosome

Total Repeats: 19958

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_004337	CGT	2	6	1594500	1594505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_004337	TCA	2	6	1594657	1594662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_004337	T	6	6	1596168	1596173	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_004337	AAT	2	6	1596575	1596580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_004337	ATGA	2	8	1596674	1596681	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_004337	AAC	2	6	1596811	1596816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_004337	TTC	2	6	1597524	1597529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_004337	GCG	2	6	1597545	1597550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_004337	GCA	2	6	1597576	1597581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_004337	ATC	2	6	1597609	1597614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_004337	TACC	2	8	1597643	1597650	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6512	NC_004337	GCCAGC	2	12	1597723	1597734	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6513	NC_004337	GAT	2	6	1597758	1597763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_004337	CAT	2	6	1597764	1597769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_004337	CGC	2	6	1597818	1597823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6516	NC_004337	AGC	2	6	1597828	1597833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_004337	AC	3	6	1597842	1597847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6518	NC_004337	AAT	2	6	1597923	1597928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_004337	CAC	2	6	1597934	1597939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6520	NC_004337	TAA	2	6	1597944	1597949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_004337	ACC	2	6	1598041	1598046	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6522	NC_004337	AAAT	2	8	1598056	1598063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_004337	TCA	2	6	1598066	1598071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_004337	GCG	2	6	1598079	1598084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_004337	GAA	2	6	1598190	1598195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_004337	CCGG	2	8	1598305	1598312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6527	NC_004337	TGGC	2	8	1598428	1598435	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6528	NC_004337	CTA	2	6	1598519	1598524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_004337	ATG	2	6	1598545	1598550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6530	NC_004337	AG	3	6	1598592	1598597	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_004337	GGT	2	6	1598619	1598624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_004337	GGC	2	6	1598637	1598642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_004337	GCCAC	2	10	1598666	1598675	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6534	NC_004337	TGT	2	6	1598694	1598699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_004337	TGA	2	6	1598732	1598737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_004337	ATG	2	6	1598757	1598762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_004337	AG	3	6	1598830	1598835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_004337	TA	3	6	1600005	1600010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_004337	CAT	2	6	1600064	1600069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_004337	TACT	2	8	1600086	1600093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6541	NC_004337	GCTCA	2	10	1600122	1600131	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6542	NC_004337	TGGC	2	8	1600175	1600182	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6543	NC_004337	ACG	2	6	1600195	1600200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_004337	GTCA	2	8	1600203	1600210	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6545	NC_004337	GAT	2	6	1600211	1600216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_004337	TGC	2	6	1600232	1600237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_004337	A	6	6	1600278	1600283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_004337	GCG	2	6	1600356	1600361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_004337	TAT	2	6	1600415	1600420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_004337	TGA	2	6	1600496	1600501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_004337	TGA	2	6	1600541	1600546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_004337	CAT	2	6	1600551	1600556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_004337	ACT	2	6	1600627	1600632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_004337	GAA	2	6	1600683	1600688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_004337	TGC	2	6	1600703	1600708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_004337	ACC	2	6	1600788	1600793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6557	NC_004337	CAGA	2	8	1600808	1600815	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6558	NC_004337	GGC	2	6	1600817	1600822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_004337	CG	3	6	1600871	1600876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6560	NC_004337	TGG	2	6	1600886	1600891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_004337	TC	3	6	1601978	1601983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6562	NC_004337	CG	3	6	1601995	1602000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6563	NC_004337	GC	3	6	1602072	1602077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6564	NC_004337	AAC	2	6	1602087	1602092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_004337	GCG	2	6	1602095	1602100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_004337	CTG	2	6	1602205	1602210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_004337	GAA	2	6	1602263	1602268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_004337	CAA	2	6	1602269	1602274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_004337	CTGG	2	8	1602301	1602308	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6570	NC_004337	GCC	2	6	1602378	1602383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6571	NC_004337	TAAT	2	8	1602464	1602471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_004337	ATG	2	6	1602708	1602713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6573	NC_004337	ACC	2	6	1602719	1602724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6574	NC_004337	ATG	2	6	1602764	1602769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_004337	ATT	2	6	1602877	1602882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_004337	ATTC	2	8	1603896	1603903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6577	NC_004337	CG	3	6	1603904	1603909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6578	NC_004337	ATC	2	6	1604013	1604018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_004337	GTTA	2	8	1605618	1605625	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_004337	TGT	2	6	1605679	1605684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_004337	TC	4	8	1605781	1605788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6582	NC_004337	T	6	6	1605821	1605826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_004337	CAG	2	6	1605881	1605886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_004337	CG	3	6	1605897	1605902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6585	NC_004337	TTC	2	6	1605906	1605911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_004337	CGG	2	6	1605942	1605947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_004337	GCC	2	6	1605959	1605964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6588	NC_004337	ATCC	2	8	1606048	1606055	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6589	NC_004337	CA	3	6	1606089	1606094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6590	NC_004337	A	6	6	1606132	1606137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_004337	CGG	2	6	1606282	1606287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_004337	CTT	2	6	1606288	1606293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6593	NC_004337	GC	3	6	1606312	1606317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6594	NC_004337	TCC	2	6	1606323	1606328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6595	NC_004337	GCCG	2	8	1606330	1606337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6596	NC_004337	T	7	7	1606338	1606344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_004337	TCC	2	6	1606369	1606374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6598	NC_004337	CGT	2	6	1606408	1606413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6599	NC_004337	GAC	2	6	1606596	1606601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_004337	AGA	2	6	1606623	1606628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_004337	GGC	2	6	1606654	1606659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_004337	CAG	2	6	1606663	1606668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_004337	CAG	2	6	1606699	1606704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_004337	T	6	6	1606820	1606825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_004337	GGCA	2	8	1606836	1606843	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6606	NC_004337	CCGC	2	8	1606979	1606986	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6607	NC_004337	AGGA	2	8	1606991	1606998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_004337	TGGT	2	8	1607009	1607016	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_004337	ACA	2	6	1607055	1607060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6610	NC_004337	TAA	2	6	1607275	1607280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_004337	CATA	2	8	1607296	1607303	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6612	NC_004337	TTC	2	6	1609469	1609474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_004337	GACA	2	8	1611429	1611436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6614	NC_004337	AGAGG	2	10	1611501	1611510	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_004337	ATA	2	6	1611583	1611588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6616	NC_004337	GTA	2	6	1611599	1611604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6617	NC_004337	GTA	2	6	1611610	1611615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_004337	CAC	2	6	1611669	1611674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6619	NC_004337	ACGGA	2	10	1611715	1611724	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6620	NC_004337	TTA	2	6	1611767	1611772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_004337	GCC	2	6	1611784	1611789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6622	NC_004337	CCT	2	6	1611851	1611856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6623	NC_004337	ACC	2	6	1611863	1611868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6624	NC_004337	CCG	2	6	1611897	1611902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6625	NC_004337	GCCA	2	8	1611970	1611977	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6626	NC_004337	GGT	2	6	1612006	1612011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_004337	AAG	2	6	1612018	1612023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_004337	GTG	2	6	1612028	1612033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_004337	CGC	2	6	1612062	1612067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6631	NC_004337	GCCA	2	8	1612142	1612149	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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