MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus N315 plasmid pN315

Total Repeats: 153

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003140	TAA	2	6	14	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003140	ACT	2	6	42	47	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_003140	TAA	2	6	67	72	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003140	TTTA	2	8	88	95	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003140	TA	3	6	94	99	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003140	TAT	2	6	114	119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003140	AAT	2	6	126	131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003140	TAAA	2	8	157	164	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003140	TAAA	2	8	173	180	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003140	TTA	2	6	187	192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003140	T	6	6	223	228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003140	T	7	7	1539	1545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003140	A	6	6	1559	1564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003140	TGTA	2	8	1592	1599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_003140	TTAAA	2	10	1740	1749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003140	A	6	6	1859	1864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003140	TTTG	2	8	1889	1896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003140	AT	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003140	TAA	2	6	2034	2039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_003140	GA	3	6	2061	2066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003140	AC	3	6	2167	2172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_003140	TA	3	6	2183	2188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003140	T	6	6	2201	2206	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003140	ATAA	2	8	2213	2220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_003140	A	6	6	2241	2246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003140	GAA	2	6	2261	2266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003140	ATA	2	6	3095	3100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003140	TAAG	2	8	3117	3124	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003140	ATTT	2	8	3142	3149	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003140	AT	3	6	3152	3157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003140	AAT	2	6	3392	3397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003140	TAGAT	2	10	3447	3456	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003140	T	7	7	3463	3469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_003140	TCT	2	6	3490	3495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_003140	TTTTTG	2	12	3628	3639	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003140	AT	3	6	3648	3653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_003140	AT	3	6	3684	3689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003140	A	6	6	3765	3770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_003140	TTTC	2	8	3803	3810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_003140	TATT	2	8	3819	3826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_003140	TTTC	2	8	3827	3834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_003140	TCG	2	6	3844	3849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_003140	A	6	6	3859	3864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003140	GTA	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_003140	AATT	2	8	3923	3930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_003140	A	7	7	3978	3984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003140	CGA	2	6	3986	3991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_003140	ACG	2	6	4067	4072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_003140	TTAT	2	8	4146	4153	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_003140	TAA	2	6	4183	4188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003140	GAA	2	6	4309	4314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003140	ATT	2	6	4444	4449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_003140	TCT	2	6	5493	5498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_003140	A	6	6	5513	5518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_003140	TA	3	6	5525	5530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003140	GAC	2	6	5537	5542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_003140	A	6	6	5763	5768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_003140	ACT	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_003140	TA	3	6	5826	5831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_003140	TAG	2	6	5847	5852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003140	CTT	2	6	6885	6890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_003140	TTG	2	6	6918	6923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_003140	ATGAT	2	10	6951	6960	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003140	AG	3	6	6985	6990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_003140	TTA	2	6	7428	7433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003140	TAGCT	2	10	7475	7484	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_003140	TA	3	6	7489	7494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003140	CTA	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_003140	TAA	2	6	7563	7568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003140	TAT	2	6	7591	7596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003140	A	6	6	7621	7626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_003140	AT	3	6	7658	7663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_003140	ATT	2	6	7668	7673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003140	A	6	6	7690	7695	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003140	TGA	2	6	7733	7738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003140	TAT	2	6	7763	7768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003140	T	6	6	7775	7780	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003140	TA	3	6	7782	7787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003140	AAAT	2	8	7820	7827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003140	ATA	2	6	7835	7840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003140	ATA	2	6	7884	7889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_003140	ATA	2	6	7896	7901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003140	TATT	2	8	7923	7930	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003140	AAT	2	6	8831	8836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_003140	TAT	2	6	8867	8872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003140	AAG	2	6	8883	8888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003140	ATA	2	6	11044	11049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_003140	TTA	2	6	11073	11078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_003140	AT	3	6	11105	11110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003140	CTT	2	6	11156	11161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_003140	TAAG	2	8	11173	11180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_003140	CAA	2	6	11210	11215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_003140	A	6	6	11214	11219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003140	TA	3	6	11269	11274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003140	AAT	2	6	14059	14064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_003140	TA	3	6	14066	14071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_003140	AGG	2	6	14094	14099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_003140	TAA	2	6	16146	16151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003140	CT	3	6	16202	16207	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_003140	AACG	2	8	16218	16225	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_003140	ATG	2	6	16240	16245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003140	ATT	2	6	16264	16269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_003140	TATT	2	8	16317	16324	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003140	GTT	2	6	16340	16345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003140	ATA	2	6	16366	16371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_003140	TA	4	8	16382	16389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_003140	AACAA	2	10	16394	16403	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_003140	A	7	7	16414	16420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003140	ATT	2	6	16430	16435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_003140	TATTT	2	10	16449	16458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003140	TAA	2	6	16469	16474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003140	ATAA	3	12	16471	16482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003140	AT	3	6	16801	16806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003140	CATA	2	8	19779	19786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_003140	A	6	6	19790	19795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003140	T	7	7	19829	19835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003140	T	6	6	19861	19866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003140	TGA	2	6	19868	19873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003140	A	6	6	19875	19880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003140	TAA	2	6	19924	19929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003140	AGA	2	6	21221	21226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003140	AGA	2	6	21230	21235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003140	TTTG	2	8	21271	21278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003140	ATT	2	6	21285	21290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_003140	T	6	6	21289	21294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003140	C	6	6	21313	21318	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
127	NC_003140	TAA	2	6	21550	21555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003140	G	6	6	21557	21562	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003140	ATT	2	6	22480	22485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003140	TGG	2	6	22794	22799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003140	TTTC	2	8	22802	22809	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_003140	CATT	2	8	22835	22842	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_003140	AGA	2	6	22941	22946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003140	AT	3	6	22968	22973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003140	T	6	6	23040	23045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003140	TAT	2	6	23069	23074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003140	T	6	6	23074	23079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_003140	TAACG	2	10	23107	23116	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_003140	ATG	2	6	23141	23146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003140	TCAT	2	8	23159	23166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_003140	CCT	2	6	23175	23180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_003140	CT	3	6	23179	23184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_003140	GA	3	6	23202	23207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003140	GAC	2	6	23210	23215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_003140	TCT	2	6	23235	23240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_003140	TTTG	2	8	23624	23631	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003140	GAT	2	6	23644	23649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003140	TA	3	6	23666	23671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_003140	ATT	2	6	23710	23715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003140	ATC	2	6	24460	24465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_003140	TAA	3	9	24522	24530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003140	TAA	2	6	24537	24542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_003140	CATC	2	8	24554	24561	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.