MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 11481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_003106	GGA	2	6	2436820	2436825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_003106	AGA	2	6	2436838	2436843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_003106	A	6	6	2436854	2436859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_003106	T	7	7	2439696	2439702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_003106	A	6	6	2441487	2441492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_003106	AAT	2	6	2441497	2441502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10007	NC_003106	GAA	2	6	2441505	2441510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10008	NC_003106	GAAA	2	8	2443844	2443851	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_003106	ATA	2	6	2443863	2443868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_003106	CCT	2	6	2443887	2443892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10011	NC_003106	ATAA	2	8	2443899	2443906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_003106	CTC	2	6	2443936	2443941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10013	NC_003106	GAT	2	6	2443944	2443949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_003106	TAA	2	6	2443960	2443965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_003106	AAC	2	6	2444000	2444005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_003106	CTA	2	6	2445762	2445767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10017	NC_003106	CTTATT	2	12	2445779	2445790	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10018	NC_003106	AT	3	6	2445986	2445991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_003106	TAA	2	6	2446020	2446025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_003106	GAT	2	6	2446040	2446045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_003106	ATA	2	6	2447598	2447603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10022	NC_003106	TA	3	6	2449164	2449169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_003106	A	6	6	2450085	2450090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_003106	ATG	2	6	2450125	2450130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_003106	TCATA	2	10	2450136	2450145	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10026	NC_003106	AAG	2	6	2450158	2450163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_003106	TA	3	6	2450200	2450205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_003106	TAG	2	6	2450248	2450253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_003106	ATTT	2	8	2450259	2450266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_003106	ACTT	2	8	2450325	2450332	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10031	NC_003106	GATT	2	8	2450343	2450350	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_003106	AGT	2	6	2450438	2450443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_003106	AT	4	8	2450463	2450470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_003106	TAA	2	6	2450505	2450510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_003106	TGAC	2	8	2450592	2450599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10036	NC_003106	TA	3	6	2450624	2450629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_003106	AGT	2	6	2450644	2450649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_003106	A	7	7	2451582	2451588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_003106	TCT	2	6	2451591	2451596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10040	NC_003106	TTA	2	6	2451650	2451655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_003106	TAA	2	6	2451698	2451703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_003106	GCTA	2	8	2451732	2451739	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10043	NC_003106	ACT	2	6	2451767	2451772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_003106	ATT	2	6	2451779	2451784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_003106	AAAT	2	8	2451866	2451873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_003106	CAC	2	6	2452892	2452897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10047	NC_003106	ATA	2	6	2452900	2452905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10048	NC_003106	TA	3	6	2452904	2452909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_003106	TA	3	6	2452923	2452928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_003106	TAA	2	6	2452936	2452941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_003106	ATT	2	6	2452960	2452965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_003106	A	6	6	2452981	2452986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_003106	A	6	6	2452992	2452997	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_003106	TTAAAT	2	12	2453020	2453031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_003106	AT	3	6	2453059	2453064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_003106	CT	3	6	2453082	2453087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10057	NC_003106	AT	3	6	2453142	2453147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_003106	CATA	2	8	2453211	2453218	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10059	NC_003106	AGG	2	6	2453221	2453226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_003106	ATA	2	6	2453257	2453262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_003106	TAA	2	6	2454371	2454376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_003106	TA	3	6	2454434	2454439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_003106	T	6	6	2455904	2455909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_003106	TCA	2	6	2455963	2455968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10065	NC_003106	GGAA	2	8	2455974	2455981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_003106	ATA	2	6	2455990	2455995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10067	NC_003106	TTC	2	6	2456013	2456018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10068	NC_003106	ATT	2	6	2456019	2456024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_003106	ATT	2	6	2456040	2456045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_003106	TAA	2	6	2456060	2456065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_003106	TAATT	2	10	2457436	2457445	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_003106	T	7	7	2457444	2457450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_003106	T	6	6	2457649	2457654	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_003106	TAT	2	6	2457664	2457669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_003106	TAAATT	2	12	2457678	2457689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_003106	TAA	2	6	2457699	2457704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10077	NC_003106	TGA	2	6	2457713	2457718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10078	NC_003106	ATA	2	6	2457742	2457747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_003106	TAA	2	6	2457755	2457760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_003106	TAT	2	6	2457762	2457767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_003106	AT	3	6	2457791	2457796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_003106	ATT	2	6	2457858	2457863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10083	NC_003106	GTA	2	6	2457874	2457879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10084	NC_003106	TTTA	2	8	2457901	2457908	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_003106	TAA	2	6	2457916	2457921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_003106	AAG	2	6	2458932	2458937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_003106	TTTTA	2	10	2458947	2458956	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_003106	GAT	2	6	2458966	2458971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_003106	TG	3	6	2459704	2459709	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_003106	CAG	2	6	2459716	2459721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10091	NC_003106	AGGA	2	8	2459742	2459749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10092	NC_003106	AAGAT	2	10	2459812	2459821	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10093	NC_003106	TAA	2	6	2459854	2459859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10094	NC_003106	AGT	2	6	2460967	2460972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10096	NC_003106	TCT	2	6	2463608	2463613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10097	NC_003106	AGA	2	6	2463636	2463641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_003106	ATA	2	6	2463679	2463684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10099	NC_003106	TA	3	6	2464287	2464292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_003106	T	6	6	2464328	2464333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10101	NC_003106	ATCTTT	2	12	2464357	2464368	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10102	NC_003106	AATT	2	8	2464385	2464392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_003106	GTTA	2	8	2466459	2466466	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_003106	TTA	2	6	2466519	2466524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_003106	TAT	2	6	2466573	2466578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_003106	AT	3	6	2466577	2466582	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_003106	TAA	2	6	2466713	2466718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_003106	ATA	2	6	2466786	2466791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_003106	CATC	2	8	2466988	2466995	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10110	NC_003106	AAC	2	6	2467003	2467008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10111	NC_003106	ACA	2	6	2467064	2467069	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_003106	CTT	2	6	2467104	2467109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_003106	TAT	2	6	2467140	2467145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_003106	GAA	2	6	2469024	2469029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_003106	ACT	2	6	2469039	2469044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10116	NC_003106	A	6	6	2472578	2472583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_003106	ATTAA	2	10	2472632	2472641	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_003106	ATG	2	6	2472657	2472662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_003106	TA	3	6	2473615	2473620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_003106	AAT	2	6	2476608	2476613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_003106	TATCTA	2	12	2476684	2476695	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10122	NC_003106	TC	4	8	2476698	2476705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10123	NC_003106	ATAAA	2	10	2476714	2476723	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_003106	TAAT	2	8	2476754	2476761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_003106	AT	3	6	2476818	2476823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_003106	ATAA	2	8	2476873	2476880	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_003106	T	6	6	2476891	2476896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_003106	ACT	2	6	2476917	2476922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10129	NC_003106	TATT	2	8	2476944	2476951	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10131	NC_003106	ATG	2	6	2476993	2476998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10166	NC_003106	TAA	2	6	2492029	2492034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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