MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 11481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_003106	TA	3	6	2094923	2094928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9002	NC_003106	AGAA	2	8	2094937	2094944	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_003106	TACT	2	8	2094985	2094992	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9004	NC_003106	CTAG	2	8	2095017	2095024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9005	NC_003106	AAT	2	6	2095046	2095051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_003106	AAC	2	6	2095174	2095179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_003106	TAA	3	9	2095197	2095205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_003106	TAT	2	6	2095222	2095227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_003106	TCT	2	6	2095237	2095242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9010	NC_003106	ATT	2	6	2095252	2095257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_003106	AT	3	6	2095929	2095934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9012	NC_003106	A	7	7	2095935	2095941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9013	NC_003106	TATT	2	8	2095942	2095949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9014	NC_003106	AGT	2	6	2095979	2095984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9015	NC_003106	TA	3	6	2095988	2095993	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9016	NC_003106	AAT	2	6	2096041	2096046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9017	NC_003106	ATT	3	9	2096057	2096065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9018	NC_003106	TAA	2	6	2096069	2096074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9019	NC_003106	ATC	2	6	2096365	2096370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_003106	ATAA	2	8	2096819	2096826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9021	NC_003106	TTA	2	6	2096912	2096917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9022	NC_003106	CTTT	2	8	2096923	2096930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9023	NC_003106	AT	3	6	2096955	2096960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_003106	GAC	2	6	2097002	2097007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_003106	AGTG	2	8	2097024	2097031	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
9026	NC_003106	TAA	2	6	2097036	2097041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9027	NC_003106	TAAA	2	8	2097046	2097053	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_003106	AGT	2	6	2097073	2097078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_003106	ATT	2	6	2097093	2097098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_003106	ATT	2	6	2097209	2097214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9031	NC_003106	AT	3	6	2097259	2097264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_003106	GAT	2	6	2097289	2097294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_003106	TTCA	2	8	2097420	2097427	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9034	NC_003106	AGA	2	6	2097444	2097449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_003106	AGA	2	6	2097456	2097461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_003106	CAATTT	2	12	2097543	2097554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9037	NC_003106	ATA	2	6	2097572	2097577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9038	NC_003106	TTA	2	6	2097722	2097727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_003106	ATT	2	6	2097745	2097750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_003106	AT	3	6	2097769	2097774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9041	NC_003106	T	6	6	2097777	2097782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9042	NC_003106	TAA	2	6	2098764	2098769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9043	NC_003106	T	6	6	2100485	2100490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9044	NC_003106	TA	3	6	2100507	2100512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9045	NC_003106	ATG	2	6	2100564	2100569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_003106	TTTA	2	8	2100574	2100581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9047	NC_003106	AT	5	10	2100592	2100601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_003106	TTA	2	6	2100603	2100608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9049	NC_003106	TAA	2	6	2100653	2100658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9050	NC_003106	TA	3	6	2100659	2100664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9051	NC_003106	AT	3	6	2100710	2100715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_003106	AT	5	10	2100724	2100733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_003106	ATA	2	6	2100744	2100749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9054	NC_003106	TAA	2	6	2100757	2100762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_003106	T	6	6	2100817	2100822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9056	NC_003106	TAA	2	6	2101263	2101268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9057	NC_003106	TAC	2	6	2101797	2101802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_003106	CAAA	2	8	2101817	2101824	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9059	NC_003106	TAA	2	6	2101835	2101840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_003106	T	6	6	2103038	2103043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_003106	ATAA	2	8	2104749	2104756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_003106	AAT	2	6	2104848	2104853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_003106	TAGA	2	8	2104910	2104917	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9064	NC_003106	ATA	2	6	2104921	2104926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9065	NC_003106	ATT	2	6	2104941	2104946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_003106	A	7	7	2105006	2105012	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_003106	AAT	2	6	2105071	2105076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9068	NC_003106	TAAA	2	8	2105090	2105097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9069	NC_003106	A	6	6	2105106	2105111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9070	NC_003106	CCG	2	6	2105186	2105191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9071	NC_003106	AT	3	6	2105208	2105213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9072	NC_003106	TTTC	2	8	2105234	2105241	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9073	NC_003106	ACA	2	6	2105260	2105265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9074	NC_003106	TA	3	6	2105280	2105285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_003106	ATA	2	6	2105326	2105331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_003106	TA	3	6	2105353	2105358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9077	NC_003106	ATT	2	6	2105365	2105370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9078	NC_003106	TAT	2	6	2105402	2105407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9079	NC_003106	TAA	2	6	2105418	2105423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9080	NC_003106	ATA	2	6	2105498	2105503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9081	NC_003106	ATT	2	6	2105506	2105511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9082	NC_003106	ATT	2	6	2105515	2105520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9083	NC_003106	TA	3	6	2105544	2105549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9084	NC_003106	TTA	2	6	2105562	2105567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9085	NC_003106	TATATT	2	12	2105571	2105582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9086	NC_003106	TA	3	6	2105625	2105630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9087	NC_003106	GAG	2	6	2106073	2106078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9088	NC_003106	TTAA	2	8	2106148	2106155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9089	NC_003106	AGG	2	6	2106247	2106252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9090	NC_003106	A	6	6	2108233	2108238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9091	NC_003106	TAAAC	2	10	2110654	2110663	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9092	NC_003106	CTT	2	6	2112684	2112689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9093	NC_003106	TCAT	2	8	2112708	2112715	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9094	NC_003106	TAT	2	6	2112747	2112752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9095	NC_003106	TA	3	6	2113233	2113238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9096	NC_003106	AGA	2	6	2113246	2113251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9097	NC_003106	T	6	6	2113661	2113666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9098	NC_003106	ATT	2	6	2113691	2113696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9099	NC_003106	TAT	2	6	2120765	2120770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9100	NC_003106	TAAAA	2	10	2120778	2120787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9101	NC_003106	ATA	2	6	2121916	2121921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9102	NC_003106	TAT	3	9	2123067	2123075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9103	NC_003106	T	6	6	2123075	2123080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9104	NC_003106	T	6	6	2123084	2123089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9105	NC_003106	A	6	6	2123096	2123101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9106	NC_003106	ACT	2	6	2123146	2123151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9107	NC_003106	ATT	2	6	2124491	2124496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9108	NC_003106	ATT	2	6	2124545	2124550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_003106	TA	4	8	2124580	2124587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_003106	AAAAAG	2	12	2124624	2124635	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_003106	A	6	6	2126695	2126700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_003106	TAA	2	6	2126755	2126760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_003106	CAAC	2	8	2126812	2126819	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9114	NC_003106	TAT	2	6	2126885	2126890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9115	NC_003106	AT	3	6	2126906	2126911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9116	NC_003106	TA	3	6	2126919	2126924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9117	NC_003106	ATT	2	6	2129724	2129729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9118	NC_003106	AGATA	2	10	2129736	2129745	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9119	NC_003106	TTC	2	6	2130196	2130201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9120	NC_003106	TATT	2	8	2130842	2130849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9121	NC_003106	AT	3	6	2130854	2130859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_003106	ATT	2	6	2131004	2131009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9123	NC_003106	TTA	2	6	2131047	2131052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9124	NC_003106	CTTT	2	8	2131062	2131069	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9125	NC_003106	TTA	2	6	2133268	2133273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9126	NC_003106	AGA	2	6	2133316	2133321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9127	NC_003106	GAA	2	6	2133324	2133329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9128	NC_003106	AAAT	2	8	2133334	2133341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9129	NC_003106	TTA	2	6	2133355	2133360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9130	NC_003106	ATA	2	6	2133435	2133440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9131	NC_003106	CAC	2	6	2133448	2133453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9132	NC_003106	CATT	2	8	2133494	2133501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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9134	NC_003106	AGC	2	6	2133545	2133550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9401	NC_003106	TACAT	2	10	2210500	2210509	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9402	NC_003106	AAT	2	6	2210537	2210542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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