MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Sulfolobus tokodaii str. 7 chromosome

Total Repeats: 11481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_003106	AAATAT	2	12	1879952	1879963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_003106	T	6	6	1880006	1880011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_003106	TA	3	6	1880027	1880032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_003106	TTA	2	6	1880070	1880075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_003106	TTAT	2	8	1880097	1880104	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_003106	TAA	2	6	1880119	1880124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_003106	ATAA	2	8	1880132	1880139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_003106	ATA	2	6	1880173	1880178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_003106	ATTA	2	8	1880179	1880186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_003106	AT	3	6	1880229	1880234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_003106	TTTCA	2	10	1880260	1880269	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8012	NC_003106	CAAC	2	8	1880299	1880306	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8013	NC_003106	GGTA	2	8	1880311	1880318	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_003106	GA	3	6	1880409	1880414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_003106	AAAT	2	8	1880436	1880443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_003106	ATGT	2	8	1880488	1880495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_003106	AAG	2	6	1880563	1880568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_003106	TTA	2	6	1880583	1880588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_003106	TAT	2	6	1880603	1880608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_003106	AAAT	2	8	1880610	1880617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_003106	AT	3	6	1881563	1881568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_003106	TATGA	2	10	1881574	1881583	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_003106	ATT	3	9	1881595	1881603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_003106	ATTA	2	8	1885518	1885525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_003106	A	6	6	1885540	1885545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_003106	TTTTA	2	10	1886919	1886928	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_003106	ATA	2	6	1886971	1886976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_003106	A	6	6	1886978	1886983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_003106	AACT	2	8	1887850	1887857	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8030	NC_003106	A	7	7	1887871	1887877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_003106	TATC	2	8	1888513	1888520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8032	NC_003106	AG	3	6	1888541	1888546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_003106	T	6	6	1888547	1888552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_003106	T	6	6	1888570	1888575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_003106	AAT	2	6	1888581	1888586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_003106	TA	3	6	1888603	1888608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_003106	A	7	7	1888631	1888637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_003106	TTTA	2	8	1888657	1888664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_003106	TAA	2	6	1888687	1888692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_003106	T	6	6	1888754	1888759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_003106	TTTG	2	8	1888782	1888789	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_003106	A	6	6	1888792	1888797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_003106	TAT	2	6	1888817	1888822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_003106	AGG	2	6	1888825	1888830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_003106	TA	3	6	1891744	1891749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_003106	AATA	2	8	1891750	1891757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_003106	TAA	2	6	1891761	1891766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_003106	TTATT	2	10	1897922	1897931	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_003106	GA	3	6	1897982	1897987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_003106	T	7	7	1898011	1898017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_003106	A	6	6	1898062	1898067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_003106	GTT	2	6	1898711	1898716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_003106	GT	3	6	1898723	1898728	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8054	NC_003106	GA	3	6	1898824	1898829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_003106	A	7	7	1899271	1899277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_003106	T	6	6	1899279	1899284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_003106	ATA	2	6	1900774	1900779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_003106	TAA	2	6	1900785	1900790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_003106	TAT	2	6	1901259	1901264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_003106	TAG	2	6	1901277	1901282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_003106	AG	3	6	1901284	1901289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_003106	TCT	2	6	1903595	1903600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_003106	TTTC	2	8	1903659	1903666	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8064	NC_003106	TGT	2	6	1903667	1903672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8065	NC_003106	CAT	2	6	1903681	1903686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_003106	A	6	6	1903714	1903719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_003106	A	7	7	1903721	1903727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_003106	A	6	6	1904608	1904613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_003106	T	6	6	1904960	1904965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_003106	TTCTT	2	10	1904967	1904976	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8071	NC_003106	TTTTA	2	10	1904978	1904987	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_003106	CTA	2	6	1904998	1905003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8074	NC_003106	TTA	2	6	1905044	1905049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_003106	AT	3	6	1905060	1905065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_003106	A	6	6	1907368	1907373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8078	NC_003106	TA	3	6	1907469	1907474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_003106	GA	3	6	1907504	1907509	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_003106	ATT	3	9	1907551	1907559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_003106	TAA	2	6	1907567	1907572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8082	NC_003106	TA	3	6	1907647	1907652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_003106	CATTAC	2	12	1907681	1907692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8090	NC_003106	TGG	2	6	1909646	1909651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8091	NC_003106	TTCT	2	8	1909656	1909663	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8092	NC_003106	GCA	2	6	1909695	1909700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8093	NC_003106	TAT	2	6	1909747	1909752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_003106	GAC	2	6	1910500	1910505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8096	NC_003106	GCC	2	6	1910605	1910610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8097	NC_003106	AGT	2	6	1911644	1911649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8099	NC_003106	CTATAT	2	12	1911765	1911776	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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8101	NC_003106	TAA	2	6	1911832	1911837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_003106	ACT	2	6	1911838	1911843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8103	NC_003106	TAA	2	6	1911845	1911850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_003106	AGAA	2	8	1911882	1911889	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_003106	TGA	2	6	1911907	1911912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_003106	AAG	2	6	1911922	1911927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_003106	AGA	2	6	1911953	1911958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_003106	T	7	7	1911987	1911993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_003106	T	6	6	1911995	1912000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8110	NC_003106	AT	3	6	1918927	1918932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_003106	TAA	2	6	1918939	1918944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_003106	AGACA	2	10	1921529	1921538	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8113	NC_003106	ATT	2	6	1921629	1921634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_003106	AAT	2	6	1921644	1921649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_003106	TA	3	6	1921681	1921686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8116	NC_003106	ATT	2	6	1921692	1921697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_003106	ATA	3	9	1922815	1922823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_003106	TC	3	6	1923878	1923883	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8119	NC_003106	ATT	2	6	1923909	1923914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_003106	TAA	2	6	1923927	1923932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_003106	TAT	2	6	1923943	1923948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8122	NC_003106	GTA	2	6	1923956	1923961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8123	NC_003106	TTTA	2	8	1924008	1924015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_003106	CTT	2	6	1924076	1924081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8125	NC_003106	AGG	2	6	1924198	1924203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8127	NC_003106	CTC	2	6	1924226	1924231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8128	NC_003106	TTA	2	6	1924238	1924243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_003106	TA	3	6	1924269	1924274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8130	NC_003106	TAA	2	6	1924343	1924348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8131	NC_003106	CAA	2	6	1924410	1924415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8132	NC_003106	AATG	2	8	1924422	1924429	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_003106	T	7	7	1924479	1924485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8135	NC_003106	TTC	2	6	1924578	1924583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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