MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 chromosome

Total Repeats: 13110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002953	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002953	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_002953	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002953	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002953	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002953	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002953	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002953	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002953	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002953	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002953	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002953	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002953	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_002953	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_002953	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_002953	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_002953	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_002953	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002953	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002953	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002953	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002953	GCA	2	6	3385	3390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_002953	AT	3	6	3433	3438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002953	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002953	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002953	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002953	A	6	6	3563	3568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002953	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002953	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002953	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002953	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_002953	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_002953	A	6	6	9670	9675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_002953	AT	3	6	10621	10626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002953	TAT	2	6	10646	10651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002953	ATT	3	9	10666	10674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002953	ATT	2	6	10732	10737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002953	ACA	2	6	10748	10753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_002953	ATA	2	6	10791	10796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002953	AAG	2	6	10851	10856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_002953	TAA	2	6	12477	12482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002953	AT	3	6	12505	12510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002953	AG	3	6	12524	12529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002953	AT	4	8	12558	12565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002953	CTAC	2	8	12570	12577	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_002953	T	7	7	12709	12715	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002953	A	6	6	12723	12728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002953	ACGT	2	8	12734	12741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_002953	ATA	2	6	12748	12753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002953	ATT	2	6	12761	12766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_002953	TA	3	6	14099	14104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002953	ATA	2	6	14141	14146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002953	GTG	2	6	14156	14161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002953	T	7	7	14178	14184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002953	TAG	2	6	14199	14204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002953	AAC	2	6	14220	14225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_002953	TGT	2	6	14239	14244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_002953	CAA	2	6	14273	14278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_002953	ATG	2	6	14291	14296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002953	TAT	2	6	14336	14341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002953	GTA	2	6	14377	14382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002953	GTAGG	2	10	14400	14409	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002953	GAT	3	9	14417	14425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002953	TCA	2	6	14461	14466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_002953	AAC	2	6	14501	14506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_002953	TAAA	2	8	14537	14544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002953	A	6	6	14542	14547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_002953	A	7	7	14559	14565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002953	TAT	2	6	14671	14676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002953	T	7	7	14676	14682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002953	TA	3	6	14689	14694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002953	AGG	2	6	14710	14715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002953	AAC	2	6	15884	15889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_002953	TCA	2	6	15910	15915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_002953	CTT	2	6	16054	16059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_002953	T	8	8	16081	16088	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002953	AGG	2	6	16094	16099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_002953	A	6	6	16100	16105	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_002953	AT	5	10	17079	17088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002953	TAAATC	2	12	17166	17177	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_002953	AAT	2	6	17205	17210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002953	CA	3	6	17228	17233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_002953	TTA	2	6	17279	17284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002953	AAT	2	6	22182	22187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002953	GAT	2	6	22194	22199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002953	AT	3	6	22237	22242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002953	TA	3	6	23732	23737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002953	AGG	2	6	23786	23791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_002953	TGCT	2	8	23801	23808	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_002953	TCGAT	2	10	23815	23824	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_002953	A	6	6	23834	23839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002953	AGA	2	6	23876	23881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002953	GAT	2	6	23885	23890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002953	AAG	2	6	23925	23930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_002953	ATT	2	6	24017	24022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002953	ATA	2	6	24023	24028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002953	TTC	2	6	24068	24073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_002953	A	6	6	24074	24079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_002953	A	6	6	24097	24102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002953	ATCT	2	8	24135	24142	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_002953	CGG	2	6	24193	24198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_002953	T	6	6	24231	24236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002953	GCCT	2	8	24263	24270	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_002953	T	7	7	24339	24345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002953	ATATT	2	10	24353	24362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_002953	AT	3	6	24371	24376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_002953	TTA	2	6	24488	24493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_002953	TTC	2	6	24525	24530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_002953	CCA	2	6	24542	24547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_002953	TCC	2	6	24549	24554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_002953	AAT	2	6	24586	24591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_002953	ATTT	2	8	24595	24602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_002953	TAT	2	6	24647	24652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002953	TCA	2	6	24666	24671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_002953	CCG	2	6	24697	24702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_002953	TAA	2	6	24711	24716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002953	A	6	6	24715	24720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002953	AT	3	6	24726	24731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002953	TA	3	6	24777	24782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002953	T	6	6	24851	24856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002953	A	6	6	24881	24886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_002953	ATA	2	6	24894	24899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002953	TAA	2	6	29596	29601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002953	TCA	2	6	29617	29622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_002953	TAT	2	6	29661	29666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_002953	AGT	2	6	29713	29718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_002953	TAA	2	6	29783	29788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002953	CATT	2	8	29795	29802	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_002953	ATA	2	6	29857	29862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002953	AG	3	6	29947	29952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002953	CTG	2	6	30803	30808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_002953	GAC	2	6	30812	30817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_002953	T	6	6	30830	30835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002953	TGG	2	6	30843	30848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002953	TGT	2	6	30857	30862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_002953	TTGA	2	8	30877	30884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002953	AAT	2	6	30894	30899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002953	AAT	2	6	30922	30927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002953	ATCA	2	8	30937	30944	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_002953	AT	3	6	33323	33328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002953	TAC	2	6	33338	33343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_002953	T	7	7	33374	33380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002953	A	6	6	33385	33390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002953	TAA	2	6	33434	33439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002953	A	7	7	33595	33601	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_002953	TAA	2	6	33609	33614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002953	TAA	2	6	33636	33641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_002953	GGA	2	6	33674	33679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002953	T	6	6	34174	34179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002953	ATTT	2	8	34214	34221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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