MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 chromosome

Total Repeats: 13110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_002953	GGT	2	6	2772963	2772968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_002953	TGTA	2	8	2772971	2772978	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_002953	A	6	6	2772989	2772994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_002953	AT	5	10	2773574	2773583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_002953	ATC	2	6	2773600	2773605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_002953	T	6	6	2773623	2773628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_002953	AAC	2	6	2773826	2773831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13008	NC_002953	TTA	2	6	2773835	2773840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_002953	AAT	2	6	2773863	2773868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_002953	TTC	2	6	2773877	2773882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13011	NC_002953	AGGT	2	8	2774017	2774024	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_002953	TTTCA	2	10	2775010	2775019	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13013	NC_002953	TCATTT	2	12	2775033	2775044	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13014	NC_002953	ATG	2	6	2775155	2775160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_002953	TTAA	2	8	2776200	2776207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_002953	T	6	6	2776262	2776267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_002953	CATA	2	8	2776273	2776280	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13018	NC_002953	TAAAT	2	10	2776315	2776324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_002953	AAC	2	6	2777026	2777031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_002953	G	6	6	2777074	2777079	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_002953	TTA	2	6	2777564	2777569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_002953	AAC	2	6	2777576	2777581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13023	NC_002953	T	7	7	2777592	2777598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_002953	TACA	2	8	2777629	2777636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13025	NC_002953	TAT	2	6	2777664	2777669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_002953	AAT	2	6	2777701	2777706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_002953	CCT	2	6	2781275	2781280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13028	NC_002953	TTA	2	6	2781352	2781357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_002953	ATT	3	9	2781367	2781375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_002953	TTA	2	6	2781376	2781381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_002953	AT	3	6	2781388	2781393	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_002953	AATT	2	8	2781434	2781441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_002953	TAA	2	6	2781480	2781485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13034	NC_002953	TTC	2	6	2781502	2781507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_002953	AAT	2	6	2781522	2781527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13036	NC_002953	TTAAT	2	10	2781544	2781553	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_002953	ATT	2	6	2781564	2781569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_002953	AGAA	2	8	2781625	2781632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_002953	TA	3	6	2783200	2783205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_002953	ATTT	2	8	2783352	2783359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_002953	CA	3	6	2783402	2783407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13042	NC_002953	CCT	2	6	2784392	2784397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13043	NC_002953	TAA	2	6	2784458	2784463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_002953	ACCA	2	8	2784510	2784517	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13045	NC_002953	AAT	2	6	2784539	2784544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_002953	ACA	2	6	2784584	2784589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_002953	GGAT	2	8	2784594	2784601	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_002953	TA	4	8	2785192	2785199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_002953	A	7	7	2785204	2785210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_002953	TA	3	6	2785236	2785241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_002953	AAT	2	6	2785245	2785250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_002953	TTA	2	6	2785280	2785285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_002953	AT	3	6	2785340	2785345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13054	NC_002953	TTG	2	6	2786392	2786397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13055	NC_002953	CTT	2	6	2786419	2786424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13056	NC_002953	AGT	2	6	2786443	2786448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_002953	AGG	2	6	2786590	2786595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_002953	CTTA	2	8	2787428	2787435	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13059	NC_002953	GTAG	2	8	2787438	2787445	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_002953	ACA	2	6	2787471	2787476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13061	NC_002953	CTT	2	6	2787509	2787514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_002953	CAAT	2	8	2788049	2788056	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13063	NC_002953	A	6	6	2788090	2788095	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13064	NC_002953	TAT	2	6	2788098	2788103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_002953	AAT	2	6	2788106	2788111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_002953	CAT	2	6	2788140	2788145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_002953	CTCA	2	8	2788197	2788204	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13068	NC_002953	CTA	2	6	2788210	2788215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13069	NC_002953	CTA	2	6	2788276	2788281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_002953	ATT	2	6	2788290	2788295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_002953	GATTTT	2	12	2790986	2790997	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_002953	A	6	6	2791030	2791035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_002953	GA	3	6	2791037	2791042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_002953	CAA	2	6	2791297	2791302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13075	NC_002953	GCT	2	6	2791315	2791320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13076	NC_002953	T	6	6	2791323	2791328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_002953	ATC	2	6	2791345	2791350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13078	NC_002953	T	7	7	2791405	2791411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_002953	T	6	6	2791460	2791465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_002953	ATTT	2	8	2791467	2791474	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_002953	A	6	6	2791477	2791482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13082	NC_002953	TAA	2	6	2791525	2791530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13083	NC_002953	T	6	6	2791575	2791580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_002953	CAA	2	6	2791881	2791886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13085	NC_002953	TTG	2	6	2791898	2791903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13086	NC_002953	T	7	7	2791907	2791913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13087	NC_002953	ATA	2	6	2791926	2791931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_002953	GAT	3	9	2791943	2791951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13089	NC_002953	ACA	2	6	2792623	2792628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13090	NC_002953	AGAC	2	8	2792651	2792658	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13091	NC_002953	ATG	2	6	2792714	2792719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_002953	TAA	2	6	2793205	2793210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_002953	TAAT	2	8	2793616	2793623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_002953	CA	3	6	2793644	2793649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13095	NC_002953	ATT	2	6	2793766	2793771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_002953	ATATAA	2	12	2793806	2793817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_002953	A	7	7	2793840	2793846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13098	NC_002953	TCA	2	6	2793889	2793894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_002953	CCT	2	6	2797401	2797406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13100	NC_002953	CTT	2	6	2797426	2797431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_002953	CCT	2	6	2798850	2798855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13102	NC_002953	TTA	2	6	2798885	2798890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_002953	TTCC	2	8	2798957	2798964	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13104	NC_002953	TTAT	2	8	2799338	2799345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13105	NC_002953	TATT	2	8	2799400	2799407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13106	NC_002953	A	8	8	2799421	2799428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_002953	TGA	2	6	2799435	2799440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_002953	ACT	2	6	2799728	2799733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_002953	TAC	2	6	2799775	2799780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_002953	T	7	7	2799788	2799794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.