MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus COL chromosome

Total Repeats: 12662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002951	CCT	2	6	407941	407946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_002951	TCC	2	6	410644	410649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_002951	TTGTAA	2	12	410653	410664	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_002951	AAAT	2	8	410765	410772	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_002951	TTAG	2	8	410813	410820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_002951	TGG	2	6	410834	410839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_002951	ATT	2	6	411344	411349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_002951	TCGG	2	8	412760	412767	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1509	NC_002951	A	7	7	412782	412788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_002951	AT	3	6	412792	412797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_002951	A	6	6	412810	412815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_002951	AT	3	6	413308	413313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_002951	GATAA	2	10	413322	413331	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_002951	T	6	6	413345	413350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_002951	TCC	2	6	414719	414724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_002951	A	6	6	414847	414852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_002951	ATT	2	6	414885	414890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_002951	T	6	6	414975	414980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_002951	AGG	2	6	415010	415015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_002951	AAGT	2	8	415927	415934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_002951	CCT	2	6	418667	418672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_002951	GAAT	2	8	418721	418728	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_002951	AGT	2	6	418734	418739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_002951	ATTAA	2	10	418741	418750	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_002951	TTA	2	6	419077	419082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_002951	ATGA	2	8	419112	419119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_002951	TGA	2	6	419699	419704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_002951	T	6	6	419735	419740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_002951	GTT	2	6	419751	419756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_002951	TAT	2	6	419762	419767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_002951	ATT	2	6	419794	419799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_002951	GAT	2	6	419808	419813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_002951	GGA	2	6	419821	419826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_002951	TAT	2	6	419857	419862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_002951	ATA	2	6	419886	419891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_002951	ATA	2	6	419915	419920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_002951	T	7	7	423738	423744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_002951	CTCA	2	8	424754	424761	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_002951	AGT	2	6	424764	424769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_002951	AAT	2	6	424823	424828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_002951	CAT	2	6	425283	425288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_002951	GTTT	2	8	425365	425372	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_002951	CATA	2	8	425381	425388	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_002951	T	6	6	425403	425408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_002951	TGA	2	6	427905	427910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_002951	ATA	2	6	427922	427927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_002951	ATTT	2	8	428022	428029	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_002951	GGT	2	6	428037	428042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_002951	TGT	2	6	428045	428050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_002951	ATT	2	6	428057	428062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_002951	AT	3	6	428089	428094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_002951	TTAT	2	8	428096	428103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_002951	TGA	2	6	428114	428119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_002951	TAAT	2	8	429417	429424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_002951	TATT	2	8	429438	429445	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_002951	T	6	6	429444	429449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_002951	ATC	2	6	429521	429526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_002951	TAA	2	6	429559	429564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_002951	A	6	6	429563	429568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_002951	TGA	2	6	429570	429575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_002951	GATA	2	8	429615	429622	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_002951	GAT	2	6	429703	429708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_002951	CAAA	2	8	429766	429773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_002951	CAT	2	6	429777	429782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_002951	TAA	2	6	429892	429897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_002951	TA	3	6	429903	429908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_002951	ATTA	2	8	431137	431144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_002951	TAT	2	6	431967	431972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_002951	TGC	2	6	431981	431986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1570	NC_002951	CCT	2	6	438293	438298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1571	NC_002951	A	6	6	438304	438309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_002951	A	7	7	438311	438317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_002951	GAAT	2	8	438337	438344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_002951	ACC	2	6	438379	438384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_002951	AGTA	2	8	438473	438480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_002951	TTA	2	6	438508	438513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_002951	A	6	6	438516	438521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_002951	TCT	2	6	438650	438655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_002951	CTA	2	6	438661	438666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_002951	CT	3	6	438671	438676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_002951	GT	3	6	438688	438693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_002951	ATTA	2	8	438743	438750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_002951	A	7	7	438762	438768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_002951	CAA	2	6	438776	438781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_002951	TTTG	2	8	438812	438819	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_002951	ATT	2	6	438856	438861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_002951	T	6	6	438860	438865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_002951	AT	3	6	438913	438918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_002951	TGT	2	6	438924	438929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_002951	TA	3	6	439805	439810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_002951	TAAA	2	8	439830	439837	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_002951	AT	3	6	439865	439870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_002951	TA	3	6	439893	439898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_002951	AT	3	6	439919	439924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_002951	TTAA	2	8	442188	442195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_002951	TA	3	6	442200	442205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_002951	AGA	2	6	442209	442214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_002951	ACC	2	6	442456	442461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_002951	TAT	2	6	442469	442474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_002951	AGT	2	6	442560	442565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_002951	ATT	3	9	442570	442578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_002951	ATT	2	6	442627	442632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_002951	AGG	2	6	442676	442681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_002951	A	6	6	443538	443543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_002951	AGG	2	6	443551	443556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_002951	CA	3	6	443557	443562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1607	NC_002951	A	6	6	443883	443888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_002951	GAT	2	6	443890	443895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_002951	ATA	2	6	443947	443952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_002951	A	7	7	443968	443974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_002951	TAAA	2	8	443988	443995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_002951	CTT	2	6	444006	444011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_002951	ATC	2	6	445034	445039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_002951	TCA	2	6	445077	445082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_002951	TG	3	6	445109	445114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_002951	T	8	8	445127	445134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_002951	AT	3	6	445200	445205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_002951	ATG	2	6	445210	445215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_002951	CGT	2	6	445225	445230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_002951	C	6	6	445262	445267	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1621	NC_002951	TAA	2	6	445270	445275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_002951	CT	3	6	445331	445336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1623	NC_002951	CTT	2	6	445421	445426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_002951	T	6	6	445460	445465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_002951	CT	3	6	445526	445531	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_002951	TCT	2	6	445680	445685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_002951	TTA	2	6	445692	445697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_002951	TTGC	2	8	445762	445769	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1629	NC_002951	TTA	2	6	445833	445838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_002951	TAT	2	6	445904	445909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_002951	AGG	2	6	445943	445948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_002951	TA	4	8	446586	446593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_002951	CTTT	2	8	446642	446649	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1634	NC_002951	CAT	2	6	446664	446669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_002951	AAT	2	6	446711	446716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_002951	CTT	2	6	446770	446775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_002951	ATA	2	6	446784	446789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1639	NC_002951	GTT	2	6	446891	446896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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