MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus COL chromosome

Total Repeats: 12662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002951	TGA	2	6	233475	233480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_002951	TATT	2	8	234080	234087	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_002951	TAA	2	6	234147	234152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_002951	AT	3	6	234185	234190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_002951	AT	3	6	235709	235714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_002951	CT	3	6	235860	235865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_002951	GAAA	2	8	235878	235885	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_002951	AAT	2	6	239267	239272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_002951	TGT	2	6	239348	239353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_002951	TTTG	2	8	239368	239375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_002951	TATTT	2	10	239414	239423	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_002951	TA	3	6	239432	239437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_002951	AT	3	6	239510	239515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_002951	CAA	2	6	239553	239558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_002951	T	6	6	239562	239567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_002951	AT	3	6	239576	239581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_002951	TGT	2	6	239629	239634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_002951	ACAT	2	8	239694	239701	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_002951	TGA	2	6	239703	239708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_002951	A	7	7	239730	239736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_002951	CAA	2	6	239740	239745	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_002951	AAAG	2	8	242865	242872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_002951	CTT	2	6	242905	242910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_002951	GTA	2	6	242941	242946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_002951	GAT	2	6	244976	244981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_002951	A	7	7	245486	245492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_002951	AT	3	6	245567	245572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_002951	GGA	2	6	245628	245633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_002951	A	6	6	245637	245642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_002951	ACA	2	6	247609	247614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_002951	ATG	2	6	247630	247635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_002951	ATT	2	6	247682	247687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_002951	AACAT	2	10	247705	247714	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1034	NC_002951	AT	3	6	247721	247726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_002951	AAT	3	9	247782	247790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_002951	AC	4	8	247837	247844	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_002951	ATT	2	6	247909	247914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_002951	ACC	2	6	247996	248001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_002951	ATC	2	6	249347	249352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_002951	CT	3	6	249353	249358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1041	NC_002951	TCC	2	6	251640	251645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_002951	GATAA	2	10	251658	251667	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_002951	ATTA	2	8	251706	251713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_002951	T	6	6	251777	251782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_002951	ATT	2	6	251807	251812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_002951	TCC	2	6	253037	253042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_002951	ATA	2	6	253048	253053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_002951	ACA	2	6	253087	253092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_002951	ATAAC	2	10	256305	256314	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1050	NC_002951	ATA	2	6	256352	256357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_002951	TGAAT	2	10	256416	256425	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_002951	TA	3	6	256440	256445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_002951	ATTAA	2	10	256557	256566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_002951	TAT	2	6	256575	256580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_002951	ATC	2	6	256617	256622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_002951	GAA	2	6	256623	256628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_002951	AGA	2	6	256639	256644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_002951	ACA	2	6	256646	256651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_002951	GGAATA	2	12	257902	257913	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_002951	A	6	6	257926	257931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_002951	TA	3	6	257967	257972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_002951	TAA	2	6	258000	258005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_002951	TCA	2	6	258021	258026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_002951	CT	3	6	259633	259638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1065	NC_002951	CAA	2	6	259660	259665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_002951	TGT	2	6	259701	259706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_002951	ATT	2	6	259719	259724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_002951	AATT	2	8	259732	259739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_002951	GTA	2	6	259740	259745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_002951	AAAT	2	8	259760	259767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_002951	AT	3	6	259812	259817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_002951	TGT	2	6	260224	260229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_002951	GAC	2	6	260235	260240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_002951	AAAT	2	8	260242	260249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_002951	ATC	2	6	260261	260266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_002951	A	6	6	260285	260290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_002951	AAAGT	2	10	260301	260310	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_002951	CTC	2	6	261682	261687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_002951	ATT	2	6	261707	261712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_002951	CTA	2	6	261713	261718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_002951	AATT	2	8	261734	261741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_002951	ATAA	2	8	261755	261762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_002951	T	6	6	261797	261802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_002951	CGA	2	6	261848	261853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_002951	ATTT	2	8	261862	261869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_002951	A	6	6	261879	261884	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_002951	TTG	2	6	261887	261892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_002951	A	6	6	261902	261907	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_002951	ATA	2	6	261917	261922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_002951	AAT	2	6	261939	261944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_002951	TAAAA	2	10	262014	262023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_002951	AAAT	2	8	262028	262035	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_002951	AAAT	2	8	262086	262093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_002951	AGC	2	6	262181	262186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_002951	ATGT	2	8	262212	262219	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_002951	A	6	6	263250	263255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_002951	GTT	2	6	263323	263328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_002951	AAATT	2	10	263330	263339	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_002951	ATT	2	6	265067	265072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_002951	AT	4	8	265104	265111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_002951	TTG	2	6	265182	265187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_002951	AGGT	2	8	265242	265249	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_002951	CAC	2	6	265354	265359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_002951	ATAA	2	8	265360	265367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_002951	AAC	2	6	265387	265392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_002951	AT	3	6	265406	265411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_002951	TTAA	2	8	266356	266363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_002951	ATGT	2	8	266459	266466	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_002951	A	7	7	266479	266485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_002951	AT	3	6	266500	266505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_002951	A	6	6	266547	266552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_002951	TGT	2	6	266570	266575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_002951	ATG	2	6	266588	266593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_002951	GT	3	6	266625	266630	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_002951	TGA	2	6	266647	266652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_002951	GGA	2	6	269246	269251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_002951	AT	3	6	269574	269579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_002951	AT	3	6	269740	269745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_002951	AGGG	2	8	269749	269756	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_002951	AAT	2	6	273393	273398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_002951	TG	3	6	273437	273442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_002951	GTT	2	6	273461	273466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_002951	TAA	2	6	273539	273544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_002951	TAT	2	6	273553	273558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_002951	AT	3	6	273560	273565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_002951	ATG	2	6	273572	273577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_002951	TAA	2	6	273582	273587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_002951	AAC	2	6	273664	273669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_002951	A	6	6	273703	273708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_002951	TAA	2	6	273741	273746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_002951	ATG	2	6	273811	273816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_002951	GGA	2	6	273829	273834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_002951	AT	3	6	277297	277302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_002951	AAG	2	6	277340	277345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_002951	ATG	2	6	277375	277380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_002951	TCAA	2	8	277436	277443	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1137	NC_002951	TAAAA	2	10	277477	277486	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_002951	ATG	2	6	277632	277637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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