MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus COL chromosome

Total Repeats: 12662

< Previous12...14151617181920212223242526Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_002951	ATATT	2	10	2769379	2769388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_002951	AAT	2	6	2769408	2769413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_002951	T	6	6	2769444	2769449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_002951	AT	3	6	2769452	2769457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_002951	T	6	6	2769459	2769464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_002951	ATG	2	6	2769501	2769506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_002951	TAT	2	6	2769507	2769512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_002951	T	7	7	2769512	2769518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_002951	TTA	2	6	2769556	2769561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_002951	ATC	2	6	2769595	2769600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_002951	AAT	2	6	2769609	2769614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_002951	CTAAA	2	10	2769644	2769653	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12513	NC_002951	TA	3	6	2769654	2769659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_002951	TTC	2	6	2769669	2769674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_002951	AGTA	2	8	2769681	2769688	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_002951	CTA	2	6	2769691	2769696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_002951	ATG	2	6	2769752	2769757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_002951	AGTT	2	8	2769783	2769790	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_002951	T	6	6	2769789	2769794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_002951	AT	3	6	2769876	2769881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_002951	ACC	2	6	2777189	2777194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12522	NC_002951	GTT	2	6	2777236	2777241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_002951	TAA	2	6	2777279	2777284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_002951	T	6	6	2777347	2777352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_002951	A	6	6	2777358	2777363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_002951	CTT	2	6	2777421	2777426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_002951	TTA	2	6	2777445	2777450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_002951	TTTC	2	8	2777462	2777469	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12529	NC_002951	TTA	2	6	2777477	2777482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_002951	TAT	2	6	2778635	2778640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_002951	TAT	2	6	2778659	2778664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_002951	ATTTTA	2	12	2778696	2778707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_002951	T	6	6	2778708	2778713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_002951	CTATTT	2	12	2779244	2779255	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12535	NC_002951	AT	3	6	2781820	2781825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_002951	CAA	2	6	2781860	2781865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12537	NC_002951	A	6	6	2782444	2782449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_002951	CCT	2	6	2783309	2783314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12539	NC_002951	T	7	7	2783314	2783320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_002951	A	7	7	2783329	2783335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_002951	TAT	2	6	2783336	2783341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_002951	TAG	2	6	2783418	2783423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_002951	ATA	3	9	2783438	2783446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_002951	CTT	2	6	2783490	2783495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12545	NC_002951	AATT	2	8	2783504	2783511	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_002951	GTG	2	6	2783532	2783537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_002951	ATTCGA	2	12	2783574	2783585	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12548	NC_002951	T	6	6	2783607	2783612	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_002951	GGT	2	6	2783614	2783619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_002951	TGTA	2	8	2783622	2783629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12551	NC_002951	A	6	6	2783640	2783645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_002951	AT	4	8	2784225	2784232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_002951	ATC	2	6	2784249	2784254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_002951	AGGT	2	8	2784337	2784344	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12555	NC_002951	TTTCA	2	10	2785330	2785339	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12556	NC_002951	ATTTT	2	10	2785356	2785365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_002951	ATCT	2	8	2785403	2785410	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12558	NC_002951	ATG	2	6	2785475	2785480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_002951	TTAA	2	8	2786520	2786527	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12560	NC_002951	T	6	6	2786582	2786587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_002951	CATA	2	8	2786593	2786600	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12562	NC_002951	TAAAT	2	10	2786635	2786644	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_002951	CAAA	2	8	2787319	2787326	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12564	NC_002951	GAT	2	6	2787372	2787377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_002951	ATG	2	6	2787398	2787403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_002951	CTA	2	6	2788531	2788536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12567	NC_002951	ATA	2	6	2788543	2788548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_002951	GTT	2	6	2788597	2788602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_002951	AAC	2	6	2788624	2788629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12570	NC_002951	TATTT	2	10	2788660	2788669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_002951	TTA	2	6	2789161	2789166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_002951	AAC	2	6	2789173	2789178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12573	NC_002951	T	6	6	2789190	2789195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_002951	T	6	6	2789214	2789219	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_002951	TAA	2	6	2789225	2789230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12576	NC_002951	TTC	2	6	2789247	2789252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12577	NC_002951	AAT	2	6	2789267	2789272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12578	NC_002951	TTAAT	2	10	2789289	2789298	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_002951	ATT	2	6	2789309	2789314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_002951	AGAA	2	8	2789370	2789377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_002951	ATC	2	6	2791037	2791042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12582	NC_002951	A	6	6	2791047	2791052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12583	NC_002951	CA	3	6	2791147	2791152	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12584	NC_002951	TCA	2	6	2791168	2791173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12585	NC_002951	CCT	2	6	2792137	2792142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12586	NC_002951	TAA	2	6	2792206	2792211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_002951	ACCA	2	8	2792258	2792265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12588	NC_002951	AAT	2	6	2792287	2792292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12589	NC_002951	ACA	2	6	2792332	2792337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12590	NC_002951	TA	4	8	2792940	2792947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12591	NC_002951	A	6	6	2792952	2792957	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_002951	TA	3	6	2792983	2792988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12593	NC_002951	AAT	2	6	2792992	2792997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12594	NC_002951	TTA	2	6	2793027	2793032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_002951	TTG	2	6	2794139	2794144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_002951	CTT	2	6	2794166	2794171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12597	NC_002951	AGT	2	6	2794190	2794195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12598	NC_002951	AGG	2	6	2794337	2794342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12599	NC_002951	CTTA	2	8	2795175	2795182	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12600	NC_002951	GTAG	2	8	2795185	2795192	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_002951	T	6	6	2795199	2795204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_002951	ACA	2	6	2795218	2795223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12603	NC_002951	CTT	2	6	2795256	2795261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12604	NC_002951	CAAT	2	8	2795796	2795803	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12605	NC_002951	A	6	6	2795837	2795842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12606	NC_002951	TAT	2	6	2795845	2795850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_002951	AAT	2	6	2795853	2795858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_002951	CAT	2	6	2795887	2795892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12609	NC_002951	CTCA	2	8	2795944	2795951	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12610	NC_002951	CTA	2	6	2795957	2795962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12611	NC_002951	TTCA	2	8	2795991	2795998	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12612	NC_002951	CTA	2	6	2796023	2796028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12613	NC_002951	ATT	2	6	2796037	2796042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_002951	GA	3	6	2798784	2798789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_002951	A	6	6	2799545	2799550	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_002951	CTT	2	6	2800135	2800140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12617	NC_002951	A	6	6	2800531	2800536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12618	NC_002951	GA	3	6	2800538	2800543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12619	NC_002951	CAA	2	6	2800798	2800803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12620	NC_002951	GCT	2	6	2800816	2800821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12621	NC_002951	T	6	6	2800824	2800829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_002951	ATC	2	6	2800846	2800851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12623	NC_002951	T	7	7	2800906	2800912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12624	NC_002951	T	6	6	2800961	2800966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12625	NC_002951	ATTT	2	8	2800968	2800975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12626	NC_002951	A	6	6	2800978	2800983	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12627	NC_002951	TAA	2	6	2801026	2801031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12628	NC_002951	T	6	6	2801076	2801081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12629	NC_002951	ACA	2	6	2801340	2801345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12630	NC_002951	CAA	2	6	2801382	2801387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12631	NC_002951	TTG	2	6	2801399	2801404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12632	NC_002951	T	7	7	2801408	2801414	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12633	NC_002951	ATA	2	6	2801427	2801432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12634	NC_002951	ATA	2	6	2801436	2801441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12635	NC_002951	GAT	2	6	2801456	2801461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12636	NC_002951	ACA	2	6	2802133	2802138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12637	NC_002951	AGAC	2	8	2802161	2802168	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12638	NC_002951	TTA	2	6	2802218	2802223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12639	NC_002951	ATG	2	6	2802224	2802229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12640	NC_002951	ATG	2	6	2802685	2802690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12641	NC_002951	AAT	2	6	2802701	2802706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12642	NC_002951	TTA	2	6	2802707	2802712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12643	NC_002951	TAA	2	6	2802715	2802720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12644	NC_002951	TAAT	2	8	2803126	2803133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12645	NC_002951	CA	3	6	2803154	2803159	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12646	NC_002951	ATTT	2	8	2803311	2803318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12647	NC_002951	CGT	2	6	2803319	2803324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12648	NC_002951	A	6	6	2803353	2803358	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12649	NC_002951	ACT	2	6	2803389	2803394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12650	NC_002951	ATATAA	2	12	2803450	2803461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12651	NC_002951	A	10	10	2803484	2803493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12652	NC_002951	TCA	2	6	2803536	2803541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12653	NC_002951	CCT	2	6	2807048	2807053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12654	NC_002951	CTT	2	6	2807073	2807078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12655	NC_002951	CCT	2	6	2808497	2808502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12656	NC_002951	TTA	2	6	2808532	2808537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12657	NC_002951	TTCC	2	8	2808604	2808611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12658	NC_002951	TTAT	2	8	2808985	2808992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12659	NC_002951	TATT	2	8	2809047	2809054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12660	NC_002951	A	8	8	2809068	2809075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12661	NC_002951	TGA	2	6	2809082	2809087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12662	NC_002951	ACT	2	6	2809375	2809380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

< Previous12...14151617181920212223242526Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.