MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus COL chromosome

Total Repeats: 12662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_002951	TAAAAA	2	12	2340275	2340286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_002951	CCTTT	2	10	2341345	2341354	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10503	NC_002951	TAC	2	6	2341374	2341379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10504	NC_002951	AT	3	6	2341426	2341431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_002951	CAA	2	6	2341534	2341539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_002951	AGG	2	6	2341899	2341904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_002951	TAA	2	6	2346677	2346682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_002951	CTTTAA	2	12	2346705	2346716	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10509	NC_002951	AATA	2	8	2346769	2346776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_002951	TAA	2	6	2346786	2346791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_002951	TTA	2	6	2346809	2346814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_002951	CTC	2	6	2347191	2347196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10513	NC_002951	TTG	2	6	2347208	2347213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_002951	TTA	2	6	2347234	2347239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_002951	TTA	2	6	2347308	2347313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_002951	ATTT	2	8	2347333	2347340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_002951	TAA	2	6	2347345	2347350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_002951	ATT	2	6	2347383	2347388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_002951	TTTGA	2	10	2347453	2347462	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10520	NC_002951	T	6	6	2347465	2347470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_002951	A	7	7	2347511	2347517	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_002951	CTT	2	6	2347581	2347586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10523	NC_002951	TACA	2	8	2347594	2347601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10524	NC_002951	TCCC	2	8	2347939	2347946	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10525	NC_002951	TTC	2	6	2347965	2347970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_002951	CT	3	6	2348751	2348756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10527	NC_002951	AT	3	6	2350744	2350749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10528	NC_002951	T	6	6	2350824	2350829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_002951	ATA	2	6	2350862	2350867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10530	NC_002951	TTA	2	6	2350871	2350876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_002951	T	7	7	2350882	2350888	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_002951	TCGT	2	8	2350968	2350975	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10533	NC_002951	TAT	2	6	2351012	2351017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10534	NC_002951	A	6	6	2351173	2351178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_002951	CA	3	6	2351198	2351203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10536	NC_002951	TCTT	2	8	2351226	2351233	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10537	NC_002951	GA	3	6	2351247	2351252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_002951	AGG	2	6	2351315	2351320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_002951	CAA	2	6	2352158	2352163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10540	NC_002951	TTG	2	6	2352177	2352182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10541	NC_002951	T	6	6	2352185	2352190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_002951	A	7	7	2352201	2352207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_002951	TAA	2	6	2352261	2352266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_002951	ACA	2	6	2352274	2352279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10545	NC_002951	AC	3	6	2352291	2352296	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10546	NC_002951	AATT	2	8	2352380	2352387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_002951	TTACA	2	10	2352415	2352424	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10548	NC_002951	TA	4	8	2352547	2352554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_002951	TGA	2	6	2353989	2353994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_002951	TTC	2	6	2354005	2354010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10551	NC_002951	CAT	2	6	2354057	2354062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10552	NC_002951	AAC	2	6	2355147	2355152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10553	NC_002951	TTAAAA	2	12	2355170	2355181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10554	NC_002951	ATG	2	6	2355209	2355214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_002951	CAT	2	6	2355228	2355233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_002951	TA	4	8	2355247	2355254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_002951	CCA	2	6	2355286	2355291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10558	NC_002951	ATT	2	6	2355292	2355297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_002951	TAA	2	6	2355306	2355311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_002951	TAA	2	6	2355317	2355322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_002951	ATA	2	6	2355361	2355366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_002951	AAAT	2	8	2355825	2355832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_002951	ATTA	2	8	2355840	2355847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_002951	TTA	2	6	2355880	2355885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_002951	T	7	7	2355901	2355907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_002951	AAG	2	6	2355938	2355943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_002951	TCA	2	6	2355970	2355975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10568	NC_002951	A	7	7	2356018	2356024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_002951	GGA	2	6	2356038	2356043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_002951	GAT	2	6	2356562	2356567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10571	NC_002951	TCA	2	6	2356603	2356608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10572	NC_002951	A	6	6	2356608	2356613	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_002951	T	7	7	2356643	2356649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_002951	TTAT	2	8	2356672	2356679	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_002951	TCC	2	6	2356683	2356688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10577	NC_002951	TAATT	2	10	2356743	2356752	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_002951	CAT	2	6	2356832	2356837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10580	NC_002951	TCT	2	6	2356878	2356883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10581	NC_002951	TAT	2	6	2357878	2357883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_002951	C	6	6	2357905	2357910	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10583	NC_002951	TTG	2	6	2357951	2357956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_002951	TAT	2	6	2359185	2359190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10585	NC_002951	CAT	2	6	2359239	2359244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10587	NC_002951	TA	3	6	2359287	2359292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10588	NC_002951	T	6	6	2359296	2359301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_002951	TAAC	2	8	2359320	2359327	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10590	NC_002951	AC	3	6	2359326	2359331	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10591	NC_002951	TTTA	2	8	2360452	2360459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10592	NC_002951	CATAAT	2	12	2360469	2360480	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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10595	NC_002951	T	7	7	2360533	2360539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_002951	ATT	2	6	2360550	2360555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_002951	A	7	7	2360600	2360606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10598	NC_002951	TA	4	8	2364096	2364103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_002951	TAA	2	6	2364122	2364127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_002951	CA	3	6	2364160	2364165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10601	NC_002951	AATT	2	8	2364178	2364185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_002951	GTT	2	6	2364209	2364214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_002951	ATC	2	6	2364280	2364285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10604	NC_002951	AAT	2	6	2364302	2364307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10605	NC_002951	ATT	2	6	2364312	2364317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_002951	TTA	2	6	2364366	2364371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10608	NC_002951	TCACC	2	10	2364389	2364398	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10609	NC_002951	TAA	2	6	2364442	2364447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_002951	CTA	2	6	2364466	2364471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10611	NC_002951	TAAAT	2	10	2364497	2364506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_002951	AAATC	2	10	2364528	2364537	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10613	NC_002951	TAAA	2	8	2364544	2364551	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_002951	TCTA	2	8	2364630	2364637	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10615	NC_002951	TATT	2	8	2365676	2365683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_002951	T	7	7	2365698	2365704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10617	NC_002951	T	6	6	2365731	2365736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10618	NC_002951	T	6	6	2365741	2365746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10619	NC_002951	CCA	2	6	2366565	2366570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10620	NC_002951	ATCATT	2	12	2366579	2366590	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10621	NC_002951	TTA	3	9	2366591	2366599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_002951	CAA	2	6	2366617	2366622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10623	NC_002951	CTT	2	6	2366635	2366640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10624	NC_002951	A	7	7	2366653	2366659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_002951	GAAAG	2	10	2366689	2366698	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10626	NC_002951	TAA	2	6	2366703	2366708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_002951	TGT	2	6	2366719	2366724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_002951	TA	3	6	2366756	2366761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10629	NC_002951	T	6	6	2366818	2366823	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10631	NC_002951	AT	3	6	2366916	2366921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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