MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus COL chromosome

Total Repeats: 12662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_002951	GCA	2	6	2232840	2232845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10002	NC_002951	TCC	2	6	2232985	2232990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10003	NC_002951	A	6	6	2233106	2233111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_002951	CG	3	6	2233119	2233124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_002951	AAT	2	6	2233135	2233140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_002951	GCT	2	6	2233175	2233180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_002951	TTAC	2	8	2233233	2233240	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10008	NC_002951	TTC	2	6	2233248	2233253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10009	NC_002951	TAA	2	6	2233256	2233261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_002951	TCA	2	6	2233286	2233291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_002951	CTG	2	6	2233343	2233348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10012	NC_002951	TTACC	2	10	2233437	2233446	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10013	NC_002951	TAGG	2	8	2233570	2233577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_002951	CCG	2	6	2233601	2233606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10015	NC_002951	AAGC	2	8	2233619	2233626	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10016	NC_002951	CGC	2	6	2233663	2233668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10017	NC_002951	ATG	2	6	2233711	2233716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_002951	AAT	2	6	2233739	2233744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_002951	ATTT	2	8	2233841	2233848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_002951	TTTA	2	8	2233879	2233886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_002951	TTC	2	6	2233938	2233943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10022	NC_002951	CGT	2	6	2233958	2233963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10023	NC_002951	GAC	2	6	2233968	2233973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10024	NC_002951	T	6	6	2234013	2234018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10025	NC_002951	CTT	2	6	2234044	2234049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10026	NC_002951	AT	3	6	2234152	2234157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10027	NC_002951	CAT	2	6	2235261	2235266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10028	NC_002951	TAAA	2	8	2235319	2235326	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_002951	A	7	7	2235324	2235330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10030	NC_002951	TAT	2	6	2235341	2235346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_002951	ACT	2	6	2235360	2235365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10032	NC_002951	ATT	2	6	2235369	2235374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10033	NC_002951	TCC	2	6	2236824	2236829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10034	NC_002951	AGT	2	6	2236887	2236892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_002951	ATA	2	6	2236899	2236904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_002951	AAG	2	6	2236905	2236910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_002951	ATA	2	6	2236917	2236922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_002951	ATT	2	6	2236927	2236932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_002951	TAA	2	6	2236997	2237002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_002951	TTTAT	2	10	2237003	2237012	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_002951	TAT	2	6	2237074	2237079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10042	NC_002951	TTC	2	6	2237083	2237088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_002951	AAG	2	6	2237100	2237105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_002951	CCT	2	6	2237616	2237621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10045	NC_002951	TAA	2	6	2237625	2237630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_002951	TAT	2	6	2237665	2237670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_002951	CCT	2	6	2239061	2239066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10048	NC_002951	TA	3	6	2239069	2239074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_002951	TTTA	2	8	2239075	2239082	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_002951	TTTA	2	8	2239089	2239096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_002951	AAT	2	6	2239099	2239104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_002951	TACAA	2	10	2239159	2239168	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10053	NC_002951	TAA	2	6	2239191	2239196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_002951	A	7	7	2239195	2239201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_002951	CCT	2	6	2241127	2241132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10056	NC_002951	TAA	2	6	2241150	2241155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_002951	A	6	6	2241773	2241778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_002951	ATG	2	6	2241817	2241822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_002951	A	7	7	2242125	2242131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_002951	TCAT	2	8	2242132	2242139	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10061	NC_002951	ATGA	2	8	2242152	2242159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_002951	T	7	7	2242160	2242166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_002951	AT	3	6	2242243	2242248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_002951	AATC	2	8	2243622	2243629	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10065	NC_002951	TA	3	6	2243655	2243660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10066	NC_002951	AACA	2	8	2243678	2243685	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10067	NC_002951	TATG	2	8	2243717	2243724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_002951	AAT	2	6	2243735	2243740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10069	NC_002951	TTA	2	6	2243746	2243751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_002951	A	6	6	2243790	2243795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_002951	T	6	6	2243829	2243834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_002951	TAT	2	6	2246878	2246883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_002951	T	6	6	2246924	2246929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_002951	TA	3	6	2246950	2246955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_002951	TAA	2	6	2246963	2246968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_002951	ATC	2	6	2247027	2247032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10077	NC_002951	CAA	2	6	2247143	2247148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10078	NC_002951	A	6	6	2247153	2247158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10079	NC_002951	GTA	2	6	2247199	2247204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10080	NC_002951	GTA	2	6	2248309	2248314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10081	NC_002951	ATA	2	6	2251277	2251282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10082	NC_002951	ATCATT	2	12	2251286	2251297	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10083	NC_002951	ATCT	2	8	2251314	2251321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10084	NC_002951	TTA	2	6	2253343	2253348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_002951	TTA	2	6	2253375	2253380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10086	NC_002951	GA	3	6	2253399	2253404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10087	NC_002951	ATA	2	6	2253405	2253410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_002951	ATT	2	6	2253427	2253432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_002951	A	6	6	2253442	2253447	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_002951	A	7	7	2253469	2253475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10091	NC_002951	CAG	2	6	2253476	2253481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10092	NC_002951	CTG	2	6	2253512	2253517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10093	NC_002951	TAC	2	6	2253624	2253629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10094	NC_002951	TTTTAC	2	12	2253644	2253655	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10095	NC_002951	A	6	6	2253664	2253669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10096	NC_002951	AAT	2	6	2253709	2253714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10097	NC_002951	TAA	2	6	2253749	2253754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10098	NC_002951	ACTAA	2	10	2253760	2253769	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10099	NC_002951	TTG	2	6	2253880	2253885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_002951	CAT	2	6	2253921	2253926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10101	NC_002951	ATC	2	6	2253943	2253948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_002951	ATG	2	6	2253954	2253959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10103	NC_002951	ATG	2	6	2254041	2254046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_002951	CTT	2	6	2254069	2254074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_002951	TTTA	2	8	2254130	2254137	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10106	NC_002951	TG	3	6	2254217	2254222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_002951	GAA	2	6	2254223	2254228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_002951	GAA	2	6	2254293	2254298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_002951	A	6	6	2254297	2254302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10110	NC_002951	AGA	2	6	2254319	2254324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_002951	AGA	2	6	2254346	2254351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_002951	A	6	6	2254449	2254454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_002951	AAG	2	6	2254466	2254471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_002951	TGA	2	6	2254486	2254491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_002951	GAAA	2	8	2254499	2254506	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_002951	AAAT	2	8	2254507	2254514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_002951	GAA	2	6	2254517	2254522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_002951	ATG	2	6	2254569	2254574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_002951	GAAG	2	8	2254591	2254598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_002951	TAT	2	6	2254807	2254812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_002951	GAT	2	6	2254814	2254819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_002951	TAA	2	6	2254822	2254827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_002951	TTA	2	6	2254836	2254841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_002951	TTA	2	6	2254854	2254859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10125	NC_002951	ATG	2	6	2254926	2254931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10126	NC_002951	TAA	2	6	2254945	2254950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10127	NC_002951	GATA	2	8	2254988	2254995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_002951	TGA	2	6	2255029	2255034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_002951	TCA	2	6	2255039	2255044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10130	NC_002951	GAA	2	6	2255101	2255106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_002951	A	7	7	2255165	2255171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_002951	AATA	2	8	2255257	2255264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10135	NC_002951	TAAT	2	8	2255376	2255383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10255	NC_002951	A	7	7	2282984	2282990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_002951	TA	4	8	2283019	2283026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10257	NC_002951	ACG	2	6	2283062	2283067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10258	NC_002951	GCT	2	6	2283069	2283074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10259	NC_002951	T	7	7	2283086	2283092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10261	NC_002951	TTC	2	6	2283159	2283164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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