MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus COL chromosome

Total Repeats: 12662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_002951	TGAA	2	8	1478013	1478020	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6502	NC_002951	AGTT	2	8	1478097	1478104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_002951	AGG	2	6	1478146	1478151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_002951	TAC	2	6	1478873	1478878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_002951	ATA	2	6	1478913	1478918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_002951	A	6	6	1479132	1479137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6507	NC_002951	ACT	2	6	1479168	1479173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_002951	GAT	2	6	1479225	1479230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_002951	T	7	7	1479230	1479236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_002951	TAC	2	6	1479253	1479258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_002951	ATC	2	6	1479269	1479274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_002951	T	6	6	1479326	1479331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_002951	TGATG	2	10	1479822	1479831	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_002951	CTC	2	6	1479842	1479847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6515	NC_002951	TTG	2	6	1511385	1511390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_002951	TGT	2	6	1511400	1511405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_002951	CATTC	2	10	1511450	1511459	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6518	NC_002951	ATTT	2	8	1511550	1511557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_002951	ATA	2	6	1511570	1511575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_002951	AT	3	6	1511583	1511588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_002951	TAA	2	6	1511619	1511624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_002951	TAAA	2	8	1511628	1511635	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_002951	TAA	2	6	1511650	1511655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6524	NC_002951	A	6	6	1511654	1511659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_002951	AAT	2	6	1511681	1511686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_002951	AAT	2	6	1513221	1513226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_002951	TAG	2	6	1513268	1513273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_002951	TCCA	2	8	1513274	1513281	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6529	NC_002951	CTC	2	6	1516924	1516929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6530	NC_002951	AAT	2	6	1516941	1516946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_002951	ATT	2	6	1516953	1516958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_002951	ATTA	3	12	1516989	1517000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_002951	TAA	2	6	1517024	1517029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6534	NC_002951	AT	3	6	1517037	1517042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_002951	TATTCT	2	12	1517043	1517054	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6536	NC_002951	TATT	2	8	1517082	1517089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_002951	TAAT	2	8	1517140	1517147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_002951	T	6	6	1517156	1517161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_002951	TAA	2	6	1517166	1517171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_002951	ATTT	2	8	1517205	1517212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_002951	TATC	2	8	1517257	1517264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6542	NC_002951	TTAT	2	8	1517275	1517282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_002951	CTT	2	6	1518280	1518285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_002951	GTTC	2	8	1521745	1521752	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6545	NC_002951	TGCT	2	8	1521762	1521769	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6546	NC_002951	TAT	2	6	1521835	1521840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_002951	GCT	2	6	1521858	1521863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_002951	AAT	2	6	1521878	1521883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_002951	TTC	2	6	1521889	1521894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_002951	ATC	2	6	1521936	1521941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6551	NC_002951	AAAT	2	8	1521958	1521965	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_002951	CA	4	8	1521982	1521989	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6553	NC_002951	GGGA	2	8	1522021	1522028	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_002951	TC	3	6	1523418	1523423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6555	NC_002951	TAA	2	6	1523446	1523451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_002951	T	6	6	1523491	1523496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_002951	A	6	6	1523509	1523514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_002951	AAG	2	6	1523530	1523535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6559	NC_002951	CTT	2	6	1523545	1523550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_002951	T	6	6	1523571	1523576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_002951	CTC	2	6	1523918	1523923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6562	NC_002951	TAT	2	6	1523941	1523946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_002951	ATT	2	6	1523959	1523964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_002951	T	6	6	1525183	1525188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_002951	CAA	2	6	1525198	1525203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_002951	A	6	6	1525303	1525308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_002951	CAT	2	6	1525315	1525320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_002951	TAG	2	6	1525336	1525341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_002951	TGTTC	2	10	1525360	1525369	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6570	NC_002951	TCA	2	6	1525378	1525383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_002951	GT	3	6	1525447	1525452	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_002951	TCA	2	6	1525646	1525651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6573	NC_002951	ATC	2	6	1525667	1525672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_002951	TG	3	6	1525679	1525684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_002951	TA	3	6	1525701	1525706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_002951	ATT	2	6	1525753	1525758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6577	NC_002951	CCT	2	6	1527062	1527067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6578	NC_002951	T	6	6	1527071	1527076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6579	NC_002951	TA	3	6	1527118	1527123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6580	NC_002951	T	6	6	1527138	1527143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6581	NC_002951	TA	3	6	1527186	1527191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_002951	TGT	2	6	1527213	1527218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6583	NC_002951	TAA	2	6	1527243	1527248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6584	NC_002951	CTG	2	6	1527272	1527277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_002951	AAC	2	6	1527281	1527286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6586	NC_002951	TACTTG	2	12	1527290	1527301	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6587	NC_002951	AAAAAT	2	12	1527306	1527317	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_002951	AATT	2	8	1527396	1527403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_002951	TG	3	6	1527409	1527414	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_002951	TAT	2	6	1527441	1527446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_002951	ATT	2	6	1527450	1527455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_002951	T	7	7	1530453	1530459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6593	NC_002951	TTC	2	6	1530463	1530468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_002951	TGG	2	6	1530477	1530482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6595	NC_002951	T	7	7	1530501	1530507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_002951	TAG	2	6	1530535	1530540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6597	NC_002951	ATT	2	6	1530619	1530624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_002951	GTT	2	6	1530640	1530645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_002951	AT	3	6	1530706	1530711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_002951	TTA	2	6	1530712	1530717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_002951	ATG	2	6	1530843	1530848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_002951	GACAC	2	10	1530883	1530892	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6603	NC_002951	TG	3	6	1530911	1530916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_002951	TA	3	6	1530930	1530935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_002951	AT	3	6	1532724	1532729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_002951	TAG	2	6	1532735	1532740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6608	NC_002951	T	6	6	1532764	1532769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_002951	TATT	2	8	1532814	1532821	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_002951	TAT	2	6	1532936	1532941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_002951	ATA	2	6	1532943	1532948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_002951	TA	3	6	1532947	1532952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_002951	TATT	2	8	1534279	1534286	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_002951	T	6	6	1534285	1534290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6615	NC_002951	TCAT	2	8	1534304	1534311	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6616	NC_002951	ACAAT	2	10	1534410	1534419	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6617	NC_002951	AT	3	6	1534437	1534442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_002951	ATT	2	6	1534457	1534462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_002951	T	6	6	1534476	1534481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_002951	GAC	2	6	1534520	1534525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6621	NC_002951	CAAA	2	8	1534526	1534533	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6622	NC_002951	CATGT	2	10	1534557	1534566	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6623	NC_002951	TC	3	6	1537288	1537293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6624	NC_002951	CTTT	2	8	1540627	1540634	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6625	NC_002951	TC	3	6	1540640	1540645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6626	NC_002951	TAT	2	6	1540646	1540651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6627	NC_002951	AT	3	6	1540712	1540717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6628	NC_002951	TA	4	8	1540734	1540741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6629	NC_002951	TCAT	2	8	1540743	1540750	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6630	NC_002951	TACT	2	8	1540758	1540765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6631	NC_002951	ATA	2	6	1540772	1540777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6632	NC_002951	GATG	2	8	1540802	1540809	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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