MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 chromosome

Total Repeats: 12238

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_002758	ATTTTT	2	12	2479515	2479526	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10502	NC_002758	GTTTT	2	10	2479560	2479569	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_002758	T	6	6	2479566	2479571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_002758	TCAAT	2	10	2479578	2479587	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10505	NC_002758	ATA	2	6	2479588	2479593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_002758	GAA	2	6	2479594	2479599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_002758	TA	3	6	2480833	2480838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_002758	TA	3	6	2480891	2480896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_002758	CAT	2	6	2480923	2480928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10510	NC_002758	T	6	6	2480978	2480983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_002758	A	6	6	2480987	2480992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_002758	TGT	2	6	2481040	2481045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10513	NC_002758	ATT	2	6	2482521	2482526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_002758	ATT	2	6	2482529	2482534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_002758	ATT	3	9	2482540	2482548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_002758	ACTTT	2	10	2482590	2482599	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10517	NC_002758	TTA	2	6	2482611	2482616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_002758	ATT	2	6	2482618	2482623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10519	NC_002758	CT	3	6	2482634	2482639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10520	NC_002758	AAG	2	6	2482654	2482659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10521	NC_002758	ATAC	2	8	2482667	2482674	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10522	NC_002758	ATT	2	6	2483166	2483171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_002758	A	6	6	2483228	2483233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10524	NC_002758	AT	3	6	2483251	2483256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10525	NC_002758	TGC	2	6	2483283	2483288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10526	NC_002758	TAA	2	6	2483302	2483307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10527	NC_002758	ATC	2	6	2483313	2483318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10528	NC_002758	TAT	2	6	2483338	2483343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10529	NC_002758	CAAA	2	8	2484332	2484339	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10530	NC_002758	TAT	3	9	2484341	2484349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10531	NC_002758	GTT	2	6	2484352	2484357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10532	NC_002758	ATAA	2	8	2484425	2484432	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10533	NC_002758	TCA	2	6	2484444	2484449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10534	NC_002758	TA	3	6	2484453	2484458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10535	NC_002758	T	6	6	2484471	2484476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10536	NC_002758	TAC	2	6	2484512	2484517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10537	NC_002758	TCT	2	6	2486300	2486305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10538	NC_002758	T	7	7	2486352	2486358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_002758	TAA	2	6	2486381	2486386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_002758	CCT	2	6	2488461	2488466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10541	NC_002758	A	6	6	2488468	2488473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_002758	AGG	2	6	2488492	2488497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_002758	CAA	2	6	2488553	2488558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10544	NC_002758	AT	3	6	2488566	2488571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10545	NC_002758	TAA	2	6	2488590	2488595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10546	NC_002758	AGG	2	6	2488602	2488607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10547	NC_002758	TTA	2	6	2489516	2489521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10548	NC_002758	A	6	6	2489528	2489533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10549	NC_002758	A	6	6	2489553	2489558	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10550	NC_002758	CGTTT	2	10	2489567	2489576	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10551	NC_002758	CTA	2	6	2491177	2491182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10552	NC_002758	TAA	2	6	2491200	2491205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10553	NC_002758	ACT	2	6	2491210	2491215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10554	NC_002758	TA	3	6	2491221	2491226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_002758	AATTT	2	10	2491280	2491289	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_002758	ATT	2	6	2491333	2491338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_002758	CTT	2	6	2491350	2491355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10558	NC_002758	A	8	8	2491371	2491378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_002758	TATATT	2	12	2491410	2491421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_002758	CTT	2	6	2493045	2493050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10561	NC_002758	AGT	3	9	2493058	2493066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_002758	T	7	7	2493148	2493154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_002758	T	6	6	2493173	2493178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_002758	TCA	2	6	2493238	2493243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10565	NC_002758	TAATG	2	10	2493258	2493267	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_002758	TAC	2	6	2493323	2493328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10567	NC_002758	A	6	6	2495102	2495107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_002758	T	7	7	2495147	2495153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_002758	CAT	2	6	2495160	2495165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10571	NC_002758	TAT	2	6	2495944	2495949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_002758	ATT	3	9	2495966	2495974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_002758	ATT	2	6	2496010	2496015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10574	NC_002758	TTA	2	6	2496066	2496071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10575	NC_002758	CTG	2	6	2496089	2496094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10577	NC_002758	ATTG	2	8	2496725	2496732	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_002758	TG	3	6	2496731	2496736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10579	NC_002758	AG	3	6	2496796	2496801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_002758	T	6	6	2497854	2497859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10582	NC_002758	CA	3	6	2498284	2498289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10583	NC_002758	AT	3	6	2498290	2498295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10584	NC_002758	CCA	2	6	2499309	2499314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10585	NC_002758	CCT	2	6	2499341	2499346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10586	NC_002758	CT	3	6	2499351	2499356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10587	NC_002758	TTTC	2	8	2499364	2499371	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10588	NC_002758	ATT	2	6	2499393	2499398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10589	NC_002758	AAAT	2	8	2499439	2499446	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10590	NC_002758	AC	3	6	2499496	2499501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10591	NC_002758	ACA	2	6	2499517	2499522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10592	NC_002758	T	6	6	2499547	2499552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10593	NC_002758	TCC	2	6	2500004	2500009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10594	NC_002758	TAT	2	6	2500039	2500044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_002758	A	6	6	2500054	2500059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10596	NC_002758	AAATA	2	10	2500136	2500145	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_002758	CGCT	2	8	2500158	2500165	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10598	NC_002758	TAT	2	6	2500184	2500189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10599	NC_002758	TATT	2	8	2500193	2500200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10600	NC_002758	ATTA	2	8	2501485	2501492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_002758	CCT	2	6	2501493	2501498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10602	NC_002758	TGT	2	6	2501527	2501532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_002758	TAT	2	6	2501534	2501539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_002758	TCA	2	6	2501573	2501578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10605	NC_002758	AGG	2	6	2501625	2501630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10606	NC_002758	ATTT	2	8	2501634	2501641	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10607	NC_002758	TA	3	6	2502303	2502308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10608	NC_002758	CCT	2	6	2504791	2504796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10609	NC_002758	TAT	2	6	2504861	2504866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10610	NC_002758	TA	3	6	2504872	2504877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_002758	CATT	2	8	2504903	2504910	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10612	NC_002758	CTATA	2	10	2504918	2504927	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10613	NC_002758	ATTA	2	8	2504943	2504950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10614	NC_002758	GTTTGG	2	12	2506687	2506698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10615	NC_002758	A	7	7	2506739	2506745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10616	NC_002758	CCA	2	6	2506764	2506769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10617	NC_002758	TAG	2	6	2506896	2506901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10619	NC_002758	ATG	2	6	2506996	2507001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10621	NC_002758	ATT	2	6	2507058	2507063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10622	NC_002758	TTG	2	6	2507110	2507115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10623	NC_002758	TAA	2	6	2507132	2507137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10624	NC_002758	TAA	2	6	2507172	2507177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10625	NC_002758	GAT	2	6	2507180	2507185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10626	NC_002758	TAAT	2	8	2507199	2507206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10627	NC_002758	AT	3	6	2507209	2507214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10628	NC_002758	TGA	2	6	2507244	2507249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10629	NC_002758	TGA	2	6	2507312	2507317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10631	NC_002758	TAATA	2	10	2507333	2507342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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