MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus Mu50 chromosome

Total Repeats: 12238

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002758	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_002758	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_002758	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_002758	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002758	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_002758	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_002758	TTA	2	6	415	420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_002758	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_002758	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_002758	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_002758	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_002758	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_002758	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002758	TA	3	6	1948	1953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_002758	AC	3	6	2007	2012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_002758	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_002758	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_002758	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_002758	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_002758	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_002758	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_002758	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_002758	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_002758	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_002758	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002758	TTTAAA	2	12	3469	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_002758	A	6	6	3537	3542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_002758	A	6	6	3563	3568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_002758	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_002758	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002758	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_002758	AC	3	6	3653	3658	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_002758	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_002758	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002758	A	7	7	9676	9682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_002758	AT	3	6	10628	10633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_002758	TAT	2	6	10653	10658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_002758	ATT	3	9	10673	10681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_002758	ATT	2	6	10739	10744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002758	ACA	2	6	10755	10760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_002758	ATA	2	6	10798	10803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_002758	AAG	2	6	10858	10863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002758	TAA	2	6	12484	12489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002758	AT	3	6	12512	12517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_002758	AG	3	6	12531	12536	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_002758	AT	4	8	12565	12572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_002758	CTAC	2	8	12577	12584	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_002758	T	7	7	12716	12722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002758	A	6	6	12730	12735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_002758	ACGT	2	8	12741	12748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002758	ATA	2	6	12755	12760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_002758	ATT	2	6	12768	12773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002758	TA	3	6	14106	14111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002758	ATA	2	6	14149	14154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_002758	GTG	2	6	14164	14169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_002758	T	7	7	14186	14192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002758	AAC	2	6	14228	14233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_002758	CAA	2	6	14281	14286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_002758	ATG	2	6	14299	14304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_002758	TAT	2	6	14344	14349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002758	A	6	6	14365	14370	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_002758	GTA	2	6	14385	14390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_002758	GTAGG	2	10	14408	14417	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_002758	GAT	3	9	14425	14433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_002758	TCA	2	6	14469	14474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_002758	A	6	6	14483	14488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_002758	AAC	2	6	14509	14514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_002758	TAAA	2	8	14546	14553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_002758	GAT	2	6	14590	14595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_002758	TAT	2	6	14678	14683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_002758	T	6	6	14683	14688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_002758	TA	3	6	14695	14700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_002758	AGG	2	6	14716	14721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_002758	TCA	2	6	15917	15922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_002758	CTT	2	6	16061	16066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_002758	TA	3	6	17089	17094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_002758	CTA	2	6	17111	17116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_002758	TAAATC	2	12	17173	17184	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_002758	AAT	2	6	17212	17217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_002758	CA	3	6	17235	17240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_002758	TTA	2	6	17286	17291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_002758	AAT	2	6	22188	22193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_002758	GAT	2	6	22200	22205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_002758	AT	3	6	22243	22248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_002758	TA	3	6	23738	23743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_002758	AGG	2	6	23792	23797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_002758	TTTG	2	8	23805	23812	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_002758	TCGAT	2	10	23821	23830	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_002758	GAT	2	6	23891	23896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_002758	AAG	2	6	23910	23915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_002758	TAA	2	6	23929	23934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_002758	ATT	2	6	24022	24027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_002758	ATA	2	6	24028	24033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_002758	TTC	2	6	24073	24078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_002758	A	6	6	24079	24084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_002758	A	6	6	24102	24107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_002758	ATCT	2	8	24140	24147	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_002758	CGG	2	6	24198	24203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_002758	T	6	6	24236	24241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_002758	GCCT	2	8	24268	24275	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_002758	T	7	7	24344	24350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_002758	ATATT	2	10	24358	24367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_002758	AT	3	6	24376	24381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_002758	TTA	2	6	24493	24498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002758	TTC	2	6	24530	24535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_002758	CCA	2	6	24547	24552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_002758	TCC	2	6	24554	24559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_002758	AAT	2	6	24591	24596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002758	ATTT	2	8	24600	24607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_002758	TAT	2	6	24652	24657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_002758	TCA	2	6	24671	24676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_002758	CCG	2	6	24702	24707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_002758	TAA	2	6	24716	24721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002758	A	6	6	24720	24725	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_002758	AT	3	6	24731	24736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_002758	TA	3	6	24782	24787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_002758	T	6	6	24856	24861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_002758	A	6	6	24886	24891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_002758	ATA	2	6	24899	24904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_002758	TAA	2	6	29601	29606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002758	TCA	2	6	29622	29627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_002758	TAA	2	6	29788	29793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_002758	ATA	2	6	29862	29867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_002758	AG	3	6	29952	29957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_002758	CTG	2	6	30808	30813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_002758	GAC	2	6	30817	30822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_002758	T	6	6	30835	30840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002758	TGG	2	6	30848	30853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_002758	TGT	2	6	30862	30867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_002758	A	6	6	30894	30899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_002758	AAT	2	6	30926	30931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_002758	ATCA	2	8	30941	30948	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_002758	ATA	2	6	30968	30973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_002758	AT	3	6	33327	33332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_002758	TAC	2	6	33342	33347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_002758	T	7	7	33378	33384	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_002758	A	6	6	33389	33394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_002758	TAA	2	6	33438	33443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002758	A	6	6	33599	33604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_002758	TAA	2	6	33613	33618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_002758	TAA	2	6	33640	33645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_002758	GGA	2	6	33678	33683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_002758	T	6	6	34178	34183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_002758	AAG	2	6	34255	34260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_002758	TTTCA	2	10	34314	34323	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_002758	ATA	2	6	34329	34334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_002758	TTCT	2	8	34393	34400	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_002758	ATAA	2	8	34431	34438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_002758	GAA	2	6	34448	34453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_002758	TAAAA	2	10	35767	35776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_002758	TAA	2	6	35785	35790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_002758	TAAA	2	8	35808	35815	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_002758	A	6	6	35839	35844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_002758	T	6	6	35896	35901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_002758	AGATA	2	10	35925	35934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_002758	TAA	2	6	35940	35945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_002758	A	6	6	35950	35955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_002758	TA	4	8	35994	36001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_002758	TAA	2	6	36012	36017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_002758	GTT	2	6	36019	36024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_002758	T	6	6	36060	36065	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_002758	ATG	2	6	36119	36124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_002758	AGA	2	6	37113	37118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_002758	CAA	2	6	37177	37182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_002758	TAAAA	2	10	38332	38341	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_002758	AAGA	2	8	38370	38377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
171	NC_002758	A	7	7	38395	38401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_002758	T	7	7	38419	38425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_002758	T	6	6	39964	39969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_002758	TTA	2	6	40683	40688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_002758	TAA	2	6	40772	40777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_002758	TAA	2	6	41699	41704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_002758	A	7	7	41739	41745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_002758	AGA	2	6	42459	42464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_002758	T	7	7	42986	42992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_002758	T	6	6	43515	43520	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_002758	ATGAG	2	10	43525	43534	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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