MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187149	ATC	2	6	693	698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995568
2	NT_187149	GCT	2	6	839	844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995568
3	NT_187149	ATC	2	6	1179	1184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995568
4	NT_187149	GA	3	6	1276	1281	50 %	0 %	50 %	0 %	399995568
5	NT_187149	CAAG	2	8	1297	1304	50 %	0 %	25 %	25 %	399995568
6	NT_187149	ACG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995568
7	NT_187149	CGGA	2	8	1528	1535	25 %	0 %	50 %	25 %	399995568
8	NT_187149	GC	3	6	1539	1544	0 %	0 %	50 %	50 %	399995568
9	NT_187149	GTC	2	6	1545	1550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995568
10	NT_187149	ACCG	2	8	1617	1624	25 %	0 %	25 %	50 %	399995568
11	NT_187149	TCA	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995568
12	NT_187149	CCG	2	6	1827	1832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995569
13	NT_187149	GAA	2	6	1878	1883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995569
14	NT_187149	TGA	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995569
15	NT_187149	T	6	6	1985	1990	0 %	100 %	0 %	0 %	399995569
16	NT_187149	GC	3	6	2032	2037	0 %	0 %	50 %	50 %	399995569
17	NT_187149	TCT	2	6	2101	2106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995569
18	NT_187149	CCTTT	2	10	2184	2193	0 %	60 %	0 %	40 %	399995570
19	NT_187149	CCG	2	6	2212	2217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995570
20	NT_187149	TCGTT	2	10	2219	2228	0 %	60 %	20 %	20 %	399995570
21	NT_187149	CGT	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995570
22	NT_187149	CGAT	2	8	2291	2298	25 %	25 %	25 %	25 %	399995570
23	NT_187149	CGA	2	6	2379	2384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995570
24	NT_187149	TCG	2	6	2521	2526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995570
25	NT_187149	TCT	2	6	2529	2534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995570
26	NT_187149	GAG	3	9	2635	2643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995570
27	NT_187149	ATC	2	6	2644	2649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995570
28	NT_187149	CGTC	2	8	2702	2709	0 %	25 %	25 %	50 %	399995570
29	NT_187149	TGT	2	6	2717	2722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995570
30	NT_187149	TCT	2	6	2802	2807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995570
31	NT_187149	CGA	2	6	2862	2867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995570
32	NT_187149	AGG	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995570
33	NT_187149	TCC	2	6	2956	2961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995570
34	NT_187149	CAT	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995570
35	NT_187149	CGAT	2	8	3000	3007	25 %	25 %	25 %	25 %	399995570
36	NT_187149	TCT	2	6	3042	3047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995570
37	NT_187149	T	7	7	3106	3112	0 %	100 %	0 %	0 %	399995570
38	NT_187149	AGG	2	6	3125	3130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995570
39	NT_187149	A	6	6	3230	3235	100 %	0 %	0 %	0 %	399995570
40	NT_187149	GAC	2	6	3258	3263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995570
41	NT_187149	CGC	2	6	3270	3275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995570
42	NT_187149	CAAT	2	8	3292	3299	50 %	25 %	0 %	25 %	399995570
43	NT_187149	AGA	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995570
44	NT_187149	G	6	6	3506	3511	0 %	0 %	100 %	0 %	399995570
45	NT_187149	CAA	2	6	3528	3533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995570
46	NT_187149	CTC	2	6	3782	3787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995570
47	NT_187149	CGAC	2	8	3882	3889	25 %	0 %	25 %	50 %	399995570
48	NT_187149	CAT	2	6	3894	3899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995570
49	NT_187149	CCG	2	6	3916	3921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995570
50	NT_187149	TGA	2	6	3969	3974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995570
51	NT_187149	CT	3	6	3995	4000	0 %	50 %	0 %	50 %	399995570
52	NT_187149	TGA	2	6	4164	4169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995571
53	NT_187149	GGC	2	6	4234	4239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995571
54	NT_187149	TCGC	2	8	4240	4247	0 %	25 %	25 %	50 %	399995571
55	NT_187149	GAT	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995571
56	NT_187149	GCAG	2	8	4296	4303	25 %	0 %	50 %	25 %	399995571
57	NT_187149	GCG	3	9	4310	4318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995571
58	NT_187149	CG	3	6	4354	4359	0 %	0 %	50 %	50 %	399995571
59	NT_187149	CG	3	6	4373	4378	0 %	0 %	50 %	50 %	399995571
60	NT_187149	CGT	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995571
61	NT_187149	CGC	2	6	4584	4589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995571
62	NT_187149	CATGC	2	10	4632	4641	20 %	20 %	20 %	40 %	399995571
63	NT_187149	CGC	2	6	4677	4682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995572
64	NT_187149	GC	3	6	4681	4686	0 %	0 %	50 %	50 %	399995572
65	NT_187149	GAT	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995572
66	NT_187149	GGCA	2	8	4875	4882	25 %	0 %	50 %	25 %	399995572
67	NT_187149	TCT	2	6	5027	5032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995573
68	NT_187149	GAA	2	6	5051	5056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995573
69	NT_187149	ATTG	2	8	5196	5203	25 %	50 %	25 %	0 %	399995573
70	NT_187149	CCAGC	2	10	5220	5229	20 %	0 %	20 %	60 %	399995573
71	NT_187149	CCG	2	6	5272	5277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995573
72	NT_187149	CCCG	2	8	5280	5287	0 %	0 %	25 %	75 %	399995573
73	NT_187149	GAC	2	6	5296	5301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995573
74	NT_187149	GAT	2	6	5349	5354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995573
75	NT_187149	CCT	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995573
76	NT_187149	GCCG	2	8	5474	5481	0 %	0 %	50 %	50 %	399995573
77	NT_187149	GC	4	8	5511	5518	0 %	0 %	50 %	50 %	399995573
78	NT_187149	CGG	3	9	5528	5536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995573
79	NT_187149	GATTT	2	10	5545	5554	20 %	60 %	20 %	0 %	399995573
80	NT_187149	CGT	2	6	5639	5644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995573
81	NT_187149	GC	3	6	5667	5672	0 %	0 %	50 %	50 %	399995573
82	NT_187149	GCC	2	6	5708	5713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995573
83	NT_187149	TTGAT	2	10	5726	5735	20 %	60 %	20 %	0 %	399995573
84	NT_187149	GC	3	6	5973	5978	0 %	0 %	50 %	50 %	399995574
85	NT_187149	CCA	2	6	6011	6016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995574
86	NT_187149	CGCTG	2	10	6078	6087	0 %	20 %	40 %	40 %	399995574
87	NT_187149	TCT	2	6	6141	6146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995574
88	NT_187149	AGT	2	6	6162	6167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995574
89	NT_187149	CAG	2	6	6229	6234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995574
90	NT_187149	GCG	2	6	6300	6305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
91	NT_187149	AC	3	6	6306	6311	50 %	0 %	0 %	50 %	399995574
92	NT_187149	GGC	2	6	6335	6340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
93	NT_187149	CGT	2	6	6470	6475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995574
94	NT_187149	ATT	2	6	6505	6510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	399995574
95	NT_187149	GGC	2	6	6559	6564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
96	NT_187149	GTG	2	6	6600	6605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995574
97	NT_187149	GCC	2	6	6647	6652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995574
98	NT_187149	CGG	2	6	6662	6667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995574
99	NT_187149	CTT	2	6	6727	6732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995574
100	NT_187149	CCA	2	6	6744	6749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995574
101	NT_187149	CA	3	6	6748	6753	50 %	0 %	0 %	50 %	399995574
102	NT_187149	TCG	2	6	6755	6760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995574
103	NT_187149	GAT	2	6	6865	6870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995574
104	NT_187149	CGA	2	6	6971	6976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995574
105	NT_187149	ATCA	2	8	7292	7299	50 %	25 %	0 %	25 %	399995575
106	NT_187149	AGGA	2	8	7365	7372	50 %	0 %	50 %	0 %	399995575
107	NT_187149	GTC	2	6	7433	7438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995576
108	NT_187149	CGG	2	6	7457	7462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995576
109	NT_187149	CAG	2	6	7473	7478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995576
110	NT_187149	ATC	2	6	7490	7495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995576
111	NT_187149	TCG	2	6	7530	7535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995576
112	NT_187149	CG	3	6	7534	7539	0 %	0 %	50 %	50 %	399995576
113	NT_187149	GTT	2	6	7564	7569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995576
114	NT_187149	GACGGC	2	12	7603	7614	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	399995576
115	NT_187149	AGG	2	6	7623	7628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995576
116	NT_187149	AAG	2	6	7694	7699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995576
117	NT_187149	GAAG	2	8	7720	7727	50 %	0 %	50 %	0 %	399995576
118	NT_187149	A	7	7	7750	7756	100 %	0 %	0 %	0 %	399995576
119	NT_187149	GCTC	2	8	7767	7774	0 %	25 %	25 %	50 %	399995576
120	NT_187149	TC	3	6	7773	7778	0 %	50 %	0 %	50 %	399995576
121	NT_187149	CCAGAG	2	12	7868	7879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995577
122	NT_187149	CGCC	2	8	7882	7889	0 %	0 %	25 %	75 %	399995577
123	NT_187149	TGG	2	6	7908	7913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995577
124	NT_187149	TGA	2	6	8037	8042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995577
125	NT_187149	CTG	3	9	8054	8062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995577
126	NT_187149	GAT	2	6	8084	8089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995577
127	NT_187149	ACG	2	6	8097	8102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995577
128	NT_187149	ACA	2	6	8166	8171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995577
129	NT_187149	CTG	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995577
130	NT_187149	CCA	2	6	8235	8240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995577
131	NT_187149	TGC	2	6	8385	8390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995577
132	NT_187149	ACG	2	6	8414	8419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995577
133	NT_187149	CCG	2	6	8432	8437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995577
134	NT_187149	ACA	2	6	8537	8542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995577
135	NT_187149	CGA	2	6	8956	8961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995578
136	NT_187149	GCA	2	6	8978	8983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995578
137	NT_187149	CGA	2	6	8989	8994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995578
138	NT_187149	GTC	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995578
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143	NT_187149	TCG	2	6	9393	9398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995579
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148	NT_187149	GTC	2	6	9566	9571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995579
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261	NT_187149	GTC	2	6	17354	17359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995587
262	NT_187149	ACG	2	6	17373	17378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995587
263	NT_187149	TCG	2	6	17394	17399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995587
264	NT_187149	ACG	2	6	17421	17426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995587
265	NT_187149	GAT	2	6	17483	17488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995587
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269	NT_187149	TGAT	2	8	18103	18110	25 %	50 %	25 %	0 %	399995588
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344	NT_187149	CTT	2	6	23227	23232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995591
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379	NT_187149	AG	3	6	25030	25035	50 %	0 %	50 %	0 %	399995594
380	NT_187149	GCC	2	6	25040	25045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995594
381	NT_187149	CGT	2	6	25052	25057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995594
382	NT_187149	ACA	2	6	25100	25105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995594
383	NT_187149	GAAA	2	8	25197	25204	75 %	0 %	25 %	0 %	399995594
384	NT_187149	CGT	2	6	25348	25353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995595
385	NT_187149	GCG	2	6	25432	25437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995595
386	NT_187149	CCG	2	6	25494	25499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995595
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388	NT_187149	GAT	2	6	25529	25534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995596
389	NT_187149	TCG	2	6	25555	25560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995596
390	NT_187149	CCG	2	6	25604	25609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995596
391	NT_187149	TCA	2	6	25888	25893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995597
392	NT_187149	GCT	2	6	25986	25991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995597
393	NT_187149	TTG	2	6	25998	26003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995597
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486	NT_187149	TTGGCG	2	12	30993	31004	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	399995606
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497	NT_187149	C	6	6	31253	31258	0 %	0 %	0 %	100 %	399995606
498	NT_187149	GAT	2	6	31289	31294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995606
499	NT_187149	GAT	2	6	31313	31318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995606
500	NT_187149	ACG	2	6	31326	31331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995606

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