MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 4644

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NT_187148	TCGA	2	8	237669	237676	25 %	25 %	25 %	25 %	399995553
4502	NT_187148	CTT	2	6	237820	237825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995554
4503	NT_187148	GAC	2	6	237907	237912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995554
4504	NT_187148	CGC	2	6	237921	237926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995554
4505	NT_187148	TCGGC	2	10	237969	237978	0 %	20 %	40 %	40 %	399995554
4506	NT_187148	GAT	2	6	238042	238047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995554
4507	NT_187148	GCC	2	6	238069	238074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995554
4508	NT_187148	CGG	2	6	238076	238081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995554
4509	NT_187148	GTC	2	6	238231	238236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995554
4510	NT_187148	CCG	2	6	238281	238286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995554
4511	NT_187148	TCT	2	6	238437	238442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995554
4512	NT_187148	GGC	2	6	238450	238455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995554
4513	NT_187148	GGC	2	6	238462	238467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995554
4514	NT_187148	CGG	2	6	238494	238499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995554
4515	NT_187148	ATC	2	6	238508	238513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995554
4516	NT_187148	TCT	2	6	238539	238544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995554
4517	NT_187148	GC	4	8	238551	238558	0 %	0 %	50 %	50 %	399995554
4518	NT_187148	TCA	2	6	238563	238568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995554
4519	NT_187148	GTC	2	6	238570	238575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995554
4520	NT_187148	TGG	2	6	238724	238729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995555
4521	NT_187148	AATG	2	8	239006	239013	50 %	25 %	25 %	0 %	399995556
4522	NT_187148	CGA	2	6	239061	239066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995556
4523	NT_187148	GCT	2	6	239129	239134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995556
4524	NT_187148	TCA	2	6	239176	239181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995556
4525	NT_187148	GGA	2	6	239196	239201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995556
4526	NT_187148	TGG	2	6	239215	239220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995556
4527	NT_187148	CGGC	2	8	239231	239238	0 %	0 %	50 %	50 %	399995556
4528	NT_187148	ACA	2	6	239260	239265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995556
4529	NT_187148	ATC	2	6	239277	239282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995556
4530	NT_187148	GCATCA	2	12	239284	239295	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	399995556
4531	NT_187148	GCC	2	6	239381	239386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995556
4532	NT_187148	GC	3	6	239435	239440	0 %	0 %	50 %	50 %	399995556
4533	NT_187148	ACG	2	6	239444	239449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995556
4534	NT_187148	ACA	2	6	239475	239480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995556
4535	NT_187148	GTC	2	6	239556	239561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995556
4536	NT_187148	GCCT	2	8	239575	239582	0 %	25 %	25 %	50 %	399995556
4537	NT_187148	TGCT	2	8	239685	239692	0 %	50 %	25 %	25 %	399995556
4538	NT_187148	ATC	2	6	239738	239743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995556
4539	NT_187148	TGG	2	6	239881	239886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995557
4540	NT_187148	TAC	2	6	239931	239936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995557
4541	NT_187148	GCC	2	6	240078	240083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995557
4542	NT_187148	CAAC	2	8	240191	240198	50 %	0 %	0 %	50 %	399995557
4543	NT_187148	GCT	2	6	240271	240276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995557
4544	NT_187148	GCG	2	6	240316	240321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995557
4545	NT_187148	GC	3	6	240398	240403	0 %	0 %	50 %	50 %	399995557
4546	NT_187148	CGA	2	6	240425	240430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995557
4547	NT_187148	AGC	2	6	240468	240473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995557
4548	NT_187148	TGG	2	6	240480	240485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995557
4549	NT_187148	GCC	2	6	240522	240527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995557
4550	NT_187148	TC	3	6	240642	240647	0 %	50 %	0 %	50 %	399995558
4551	NT_187148	CCT	2	6	240766	240771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995558
4552	NT_187148	ATC	2	6	240777	240782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995558
4553	NT_187148	GA	3	6	240947	240952	50 %	0 %	50 %	0 %	399995558
4554	NT_187148	CTC	2	6	240977	240982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995558
4555	NT_187148	CAC	2	6	240987	240992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995558
4556	NT_187148	CAT	2	6	241039	241044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995558
4557	NT_187148	CGA	2	6	241075	241080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995558
4558	NT_187148	TGG	2	6	241207	241212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995558
4559	NT_187148	GC	3	6	241226	241231	0 %	0 %	50 %	50 %	399995558
4560	NT_187148	GCG	2	6	241351	241356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995558
4561	NT_187148	AG	3	6	241439	241444	50 %	0 %	50 %	0 %	399995558
4562	NT_187148	AGC	2	6	241495	241500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995558
4563	NT_187148	CCAA	2	8	242405	242412	50 %	0 %	0 %	50 %	399995559
4564	NT_187148	AAG	2	6	242415	242420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995559
4565	NT_187148	TGATC	2	10	242469	242478	20 %	40 %	20 %	20 %	399995559
4566	NT_187148	AGG	2	6	242499	242504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995559
4567	NT_187148	GCC	2	6	242515	242520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995559
4568	NT_187148	ATC	2	6	242726	242731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995559
4569	NT_187148	TCG	3	9	242820	242828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995559
4570	NT_187148	GTT	2	6	242839	242844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995559
4571	NT_187148	GAG	2	6	242845	242850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995559
4572	NT_187148	ATC	2	6	242879	242884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995559
4573	NT_187148	CAG	2	6	242942	242947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995560
4574	NT_187148	CGT	2	6	243002	243007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995560
4575	NT_187148	CCAT	2	8	243019	243026	25 %	25 %	0 %	50 %	399995560
4576	NT_187148	CGAAC	2	10	243045	243054	40 %	0 %	20 %	40 %	399995560
4577	NT_187148	GCC	2	6	243055	243060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995560
4578	NT_187148	GAG	2	6	243189	243194	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995560
4579	NT_187148	TCG	2	6	243415	243420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995561
4580	NT_187148	CAT	2	6	243520	243525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995561
4581	NT_187148	CGA	2	6	243631	243636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995561
4582	NT_187148	TG	3	6	243638	243643	0 %	50 %	50 %	0 %	399995561
4583	NT_187148	AAG	2	6	243659	243664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995561
4584	NT_187148	GCC	2	6	243723	243728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995561
4585	NT_187148	GGC	2	6	243739	243744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995561
4586	NT_187148	ATG	2	6	243822	243827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995561
4587	NT_187148	AAT	2	6	243880	243885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	399995561
4588	NT_187148	CGC	2	6	244049	244054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995562
4589	NT_187148	GT	3	6	244079	244084	0 %	50 %	50 %	0 %	399995562
4590	NT_187148	CGC	2	6	244085	244090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995562
4591	NT_187148	GGA	2	6	244174	244179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995562
4592	NT_187148	AGC	2	6	244407	244412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995563
4593	NT_187148	CGA	2	6	244558	244563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995563
4594	NT_187148	CAT	2	6	244699	244704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995563
4595	NT_187148	GA	3	6	244717	244722	50 %	0 %	50 %	0 %	399995563
4596	NT_187148	CGT	2	6	244807	244812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995563
4597	NT_187148	GAG	2	6	244832	244837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995563
4598	NT_187148	CG	4	8	244852	244859	0 %	0 %	50 %	50 %	399995563
4599	NT_187148	TCG	2	6	244863	244868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995563
4600	NT_187148	CGC	2	6	244933	244938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995563
4601	NT_187148	GC	3	6	244958	244963	0 %	0 %	50 %	50 %	399995563
4602	NT_187148	A	6	6	245033	245038	100 %	0 %	0 %	0 %	399995563
4603	NT_187148	GCC	2	6	245061	245066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995563
4604	NT_187148	ATC	2	6	245078	245083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995563
4605	NT_187148	CT	3	6	245089	245094	0 %	50 %	0 %	50 %	399995563
4606	NT_187148	TGC	2	6	245184	245189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995563
4607	NT_187148	GTC	2	6	245210	245215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995563
4608	NT_187148	TGC	2	6	245250	245255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995563
4609	NT_187148	GCC	3	9	245277	245285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995563
4610	NT_187148	CGT	2	6	245299	245304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995563
4611	NT_187148	AAG	2	6	245381	245386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995563
4612	NT_187148	CAGG	2	8	245392	245399	25 %	0 %	50 %	25 %	399995563
4613	NT_187148	ATTG	2	8	245470	245477	25 %	50 %	25 %	0 %	399995563
4614	NT_187148	CTG	2	6	245478	245483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995563
4615	NT_187148	GGGA	2	8	245508	245515	25 %	0 %	75 %	0 %	399995563
4616	NT_187148	GGTC	2	8	245524	245531	0 %	25 %	50 %	25 %	399995563
4617	NT_187148	CGAG	2	8	245551	245558	25 %	0 %	50 %	25 %	399995563
4618	NT_187148	TAGT	2	8	245590	245597	25 %	50 %	25 %	0 %	399995563
4619	NT_187148	GA	3	6	245683	245688	50 %	0 %	50 %	0 %	399995563
4620	NT_187148	G	7	7	245756	245762	0 %	0 %	100 %	0 %	399995563
4621	NT_187148	GCT	2	6	245777	245782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995563
4622	NT_187148	GC	3	6	245799	245804	0 %	0 %	50 %	50 %	399995563
4623	NT_187148	GGC	2	6	245820	245825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995563
4624	NT_187148	GCG	2	6	245829	245834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995563
4625	NT_187148	AGGGAG	2	12	245847	245858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995563
4626	NT_187148	GC	5	10	245974	245983	0 %	0 %	50 %	50 %	399995563
4627	NT_187148	GAA	2	6	246090	246095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995563
4628	NT_187148	CTG	2	6	246104	246109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995563
4629	NT_187148	TCG	2	6	246506	246511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995564
4630	NT_187148	CAT	2	6	246611	246616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995564
4631	NT_187148	CGA	2	6	246722	246727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995564
4632	NT_187148	TG	3	6	246729	246734	0 %	50 %	50 %	0 %	399995564
4633	NT_187148	AAG	2	6	246750	246755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995564
4634	NT_187148	GCC	2	6	246814	246819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995564
4635	NT_187148	GGC	2	6	246830	246835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995564
4636	NT_187148	ATG	2	6	246912	246917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995565
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4638	NT_187148	CCGAC	2	10	246998	247007	20 %	0 %	20 %	60 %	399995565
4639	NT_187148	TCCA	2	8	247064	247071	25 %	25 %	0 %	50 %	399995565
4640	NT_187148	CGC	2	6	247144	247149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995565
4641	NT_187148	GT	3	6	247174	247179	0 %	50 %	50 %	0 %	399995565
4642	NT_187148	CGC	2	6	247180	247185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995565
4643	NT_187148	AT	3	6	247283	247288	50 %	50 %	0 %	0 %	399995566
4644	NT_187148	GACC	2	8	247358	247365	25 %	0 %	25 %	50 %	399995566

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