MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 4537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NT_187147	GCG	2	6	212068	212073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995238
3502	NT_187147	GAC	2	6	212097	212102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995238
3503	NT_187147	CAC	2	6	212108	212113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995238
3504	NT_187147	GC	3	6	212116	212121	0 %	0 %	50 %	50 %	399995238
3505	NT_187147	AAG	2	6	212122	212127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995238
3506	NT_187147	CGGC	2	8	212157	212164	0 %	0 %	50 %	50 %	399995238
3507	NT_187147	GAT	2	6	212231	212236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995238
3508	NT_187147	GCG	2	6	212248	212253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995239
3509	NT_187147	CTGG	2	8	212261	212268	0 %	25 %	50 %	25 %	399995239
3510	NT_187147	GGC	2	6	212382	212387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995239
3511	NT_187147	ACG	2	6	212407	212412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995239
3512	NT_187147	TGCC	2	8	212420	212427	0 %	25 %	25 %	50 %	399995239
3513	NT_187147	GAA	2	6	212435	212440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995239
3514	NT_187147	GGT	2	6	212486	212491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995239
3515	NT_187147	A	6	6	212548	212553	100 %	0 %	0 %	0 %	399995239
3516	NT_187147	CTG	2	6	212569	212574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995239
3517	NT_187147	CGA	2	6	212651	212656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3518	NT_187147	GC	3	6	212665	212670	0 %	0 %	50 %	50 %	399995240
3519	NT_187147	GAT	2	6	212675	212680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995240
3520	NT_187147	GC	3	6	212690	212695	0 %	0 %	50 %	50 %	399995240
3521	NT_187147	TGC	2	6	212720	212725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3522	NT_187147	CTT	2	6	212838	212843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995240
3523	NT_187147	GCCA	2	8	212883	212890	25 %	0 %	25 %	50 %	399995240
3524	NT_187147	GGC	2	6	212912	212917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995240
3525	NT_187147	CG	3	6	212986	212991	0 %	0 %	50 %	50 %	399995240
3526	NT_187147	CGT	2	6	212996	213001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3527	NT_187147	CAA	2	6	213013	213018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995240
3528	NT_187147	TGC	2	6	213027	213032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3529	NT_187147	CGC	2	6	213184	213189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995240
3530	NT_187147	CTG	2	6	213210	213215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3531	NT_187147	GAT	2	6	213218	213223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995240
3532	NT_187147	CCG	2	6	213385	213390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995240
3533	NT_187147	CGC	2	6	213499	213504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995240
3534	NT_187147	GCC	2	6	213507	213512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995240
3535	NT_187147	CTA	2	6	213515	213520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995240
3536	NT_187147	CGG	2	6	213534	213539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995240
3537	NT_187147	GGC	2	6	213600	213605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995240
3538	NT_187147	TTC	2	6	213684	213689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995240
3539	NT_187147	CCA	2	6	213706	213711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995240
3540	NT_187147	ACGCC	2	10	213730	213739	20 %	0 %	20 %	60 %	399995240
3541	NT_187147	CGT	2	6	213855	213860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3542	NT_187147	GCCGA	2	10	213927	213936	20 %	0 %	40 %	40 %	399995240
3543	NT_187147	TCCT	2	8	213972	213979	0 %	50 %	0 %	50 %	399995240
3544	NT_187147	CAA	2	6	214004	214009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995240
3545	NT_187147	GCC	2	6	214011	214016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995240
3546	NT_187147	GTG	2	6	214078	214083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995240
3547	NT_187147	CGC	2	6	214091	214096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995240
3548	NT_187147	CGA	2	6	214105	214110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3549	NT_187147	ACG	2	6	214132	214137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3550	NT_187147	GGCTT	2	10	214148	214157	0 %	40 %	40 %	20 %	399995240
3551	NT_187147	CG	3	6	214169	214174	0 %	0 %	50 %	50 %	399995240
3552	NT_187147	ACA	2	6	214191	214196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995240
3553	NT_187147	GCT	2	6	214208	214213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995240
3554	NT_187147	ATG	2	6	214242	214247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995240
3555	NT_187147	CAT	2	6	214255	214260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995240
3556	NT_187147	ATCGC	2	10	214269	214278	20 %	20 %	20 %	40 %	399995241
3557	NT_187147	CGA	2	6	214297	214302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995241
3558	NT_187147	ATC	2	6	214401	214406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995241
3559	NT_187147	GTTCGA	2	12	214408	214419	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	399995241
3560	NT_187147	TGG	2	6	214423	214428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995241
3561	NT_187147	AGA	2	6	214453	214458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995241
3562	NT_187147	TGC	2	6	214480	214485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995241
3563	NT_187147	GGC	2	6	214563	214568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995241
3564	NT_187147	GGA	2	6	214591	214596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995241
3565	NT_187147	GCC	2	6	214648	214653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995241
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3567	NT_187147	GCA	2	6	214720	214725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995241
3568	NT_187147	TGG	2	6	214747	214752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995241
3569	NT_187147	AGA	2	6	214765	214770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995241
3570	NT_187147	CCG	2	6	214813	214818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995241
3571	NT_187147	CAG	2	6	214859	214864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995241
3572	NT_187147	CAT	2	6	214896	214901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995242
3573	NT_187147	CGC	2	6	214941	214946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995242
3574	NT_187147	TGA	2	6	214953	214958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995242
3575	NT_187147	CTT	2	6	214968	214973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	399995242
3576	NT_187147	GCT	2	6	215009	215014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995242
3577	NT_187147	ATG	2	6	215024	215029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995242
3578	NT_187147	CAT	2	6	215058	215063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995242
3579	NT_187147	AGAA	2	8	215151	215158	75 %	0 %	25 %	0 %	399995242
3580	NT_187147	GAT	2	6	215237	215242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995243
3581	NT_187147	AAG	2	6	215277	215282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995243
3582	NT_187147	CG	3	6	215296	215301	0 %	0 %	50 %	50 %	399995243
3583	NT_187147	TGC	2	6	215371	215376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995243
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3586	NT_187147	GAC	2	6	216315	216320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995244
3587	NT_187147	CGA	2	6	216330	216335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995244
3588	NT_187147	CAA	2	6	216389	216394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	399995244
3589	NT_187147	GTC	2	6	216418	216423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995244
3590	NT_187147	GAA	2	6	216432	216437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995244
3591	NT_187147	GAG	2	6	216492	216497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995244
3592	NT_187147	CTA	2	6	216513	216518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995244
3593	NT_187147	TGG	2	6	216627	216632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995244
3594	NT_187147	CATA	2	8	216651	216658	50 %	25 %	0 %	25 %	399995244
3595	NT_187147	GGT	2	6	216663	216668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995244
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3598	NT_187147	GCGA	2	8	216722	216729	25 %	0 %	50 %	25 %	399995244
3599	NT_187147	GAA	2	6	216738	216743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995244
3600	NT_187147	A	6	6	216772	216777	100 %	0 %	0 %	0 %	399995244
3601	NT_187147	GAC	2	6	216820	216825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995244
3602	NT_187147	AAACA	2	10	216863	216872	80 %	0 %	0 %	20 %	399995244
3603	NT_187147	GCG	2	6	216920	216925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995245
3604	NT_187147	TCG	2	6	216934	216939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995245
3605	NT_187147	GGC	2	6	217000	217005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995245
3606	NT_187147	TGG	2	6	217067	217072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995245
3607	NT_187147	GCG	2	6	217169	217174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995246
3608	NT_187147	GGCGC	2	10	217175	217184	0 %	0 %	60 %	40 %	399995246
3609	NT_187147	GAA	2	6	217196	217201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995246
3610	NT_187147	GCCG	2	8	217224	217231	0 %	0 %	50 %	50 %	399995246
3611	NT_187147	CGA	2	6	217265	217270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995246
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3613	NT_187147	CG	3	6	217614	217619	0 %	0 %	50 %	50 %	399995247
3614	NT_187147	CGG	2	6	217726	217731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995247
3615	NT_187147	CGA	3	9	217738	217746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995247
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3619	NT_187147	GGC	2	6	217841	217846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995247
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3621	NT_187147	GGC	2	6	217889	217894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995247
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3983	NT_187147	ACC	2	6	241265	241270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995274
3984	NT_187147	CAGCG	2	10	241318	241327	20 %	0 %	40 %	40 %	399995274
3985	NT_187147	TCC	2	6	241337	241342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995274
3986	NT_187147	GC	3	6	241356	241361	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
3987	NT_187147	GC	3	6	241376	241381	0 %	0 %	50 %	50 %	399995274
3988	NT_187147	CGG	2	6	241485	241490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995274
3989	NT_187147	CCGC	2	8	241494	241501	0 %	0 %	25 %	75 %	399995274
3990	NT_187147	CGT	3	9	241653	241661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995274
3991	NT_187147	GTC	2	6	241675	241680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995274
3992	NT_187147	CAT	2	6	241702	241707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995274
3993	NT_187147	CGT	2	6	241725	241730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995274
3994	NT_187147	CAGA	2	8	241771	241778	50 %	0 %	25 %	25 %	399995274
3995	NT_187147	CGC	2	6	241825	241830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995274
3996	NT_187147	CGT	2	6	241848	241853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995274
3997	NT_187147	AGA	2	6	241865	241870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995274
3998	NT_187147	GCA	2	6	241923	241928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995274
3999	NT_187147	GCC	3	9	241942	241950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995274
4000	NT_187147	GTC	2	6	241972	241977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995274

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