MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sinorhizobium fredii HH103 plasmid pSfHH103d partial sequence

Total Repeats: 4537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NT_187147	GCC	2	6	273796	273801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995309
4502	NT_187147	CGC	2	6	273817	273822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995309
4503	NT_187147	TGTT	2	8	273903	273910	0 %	75 %	25 %	0 %	399995309
4504	NT_187147	GGA	2	6	273933	273938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	399995309
4505	NT_187147	TCG	2	6	273945	273950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995309
4506	NT_187147	CCT	2	6	274017	274022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995309
4507	NT_187147	GCG	2	6	274135	274140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995309
4508	NT_187147	TGCC	2	8	274473	274480	0 %	25 %	25 %	50 %	399995310
4509	NT_187147	CGG	2	6	274488	274493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995310
4510	NT_187147	GCA	2	6	274507	274512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995310
4511	NT_187147	ACG	2	6	274554	274559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995310
4512	NT_187147	GAT	2	6	274574	274579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995310
4513	NT_187147	GCGA	2	8	274631	274638	25 %	0 %	50 %	25 %	399995310
4514	NT_187147	CAT	2	6	274662	274667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	399995310
4515	NT_187147	GC	3	6	274680	274685	0 %	0 %	50 %	50 %	399995310
4516	NT_187147	CTG	2	6	274714	274719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995310
4517	NT_187147	GCG	2	6	274756	274761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995310
4518	NT_187147	AAG	2	6	274785	274790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	399995310
4519	NT_187147	TCG	3	9	274813	274821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	399995310
4520	NT_187147	GGT	2	6	274947	274952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	399995310
4521	NT_187147	CGA	2	6	275100	275105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995310
4522	NT_187147	ACG	2	6	275180	275185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995310
4523	NT_187147	TTG	2	6	275204	275209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	399995310
4524	NT_187147	ATCC	2	8	275460	275467	25 %	25 %	0 %	50 %	399995311
4525	NT_187147	GATG	2	8	275472	275479	25 %	25 %	50 %	0 %	399995311
4526	NT_187147	CTC	2	6	275487	275492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	399995311
4527	NT_187147	ATG	2	6	275725	275730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995312
4528	NT_187147	AGGC	2	8	275784	275791	25 %	0 %	50 %	25 %	399995312
4529	NT_187147	TGA	2	6	275795	275800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995312
4530	NT_187147	GCC	2	6	275908	275913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995312
4531	NT_187147	CGA	2	6	276054	276059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	399995312
4532	NT_187147	ATG	2	6	276080	276085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	399995312
4533	NT_187147	ACC	2	6	276157	276162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	399995312
4534	NT_187147	CGC	2	6	276297	276302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	399995313
4535	NT_187147	GCG	2	6	276399	276404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995313
4536	NT_187147	AC	3	6	276405	276410	50 %	0 %	0 %	50 %	399995313
4537	NT_187147	GGC	2	6	276434	276439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	399995313

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.