MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2745

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187130	CTG	2	6	164	169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248217
2	NT_187130	A	6	6	191	196	100 %	0 %	0 %	0 %	409248217
3	NT_187130	GGC	2	6	260	265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248217
4	NT_187130	GC	3	6	334	339	0 %	0 %	50 %	50 %	409248217
5	NT_187130	CAA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248217
6	NT_187130	GA	3	6	440	445	50 %	0 %	50 %	0 %	409248217
7	NT_187130	GCC	2	6	513	518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248217
8	NT_187130	CAGC	2	8	521	528	25 %	0 %	25 %	50 %	409248217
9	NT_187130	AGC	2	6	532	537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248217
10	NT_187130	ATG	2	6	633	638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248217
11	NT_187130	ACA	2	6	661	666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248217
12	NT_187130	CCA	2	6	677	682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248217
13	NT_187130	GGC	2	6	720	725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248217
14	NT_187130	G	7	7	739	745	0 %	0 %	100 %	0 %	409248217
15	NT_187130	GCG	2	6	891	896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248217
16	NT_187130	ATG	2	6	917	922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248217
17	NT_187130	ATC	3	9	945	953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248217
18	NT_187130	GAC	2	6	992	997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248217
19	NT_187130	AGAATA	2	12	1026	1037	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	409248217
20	NT_187130	CCG	2	6	1048	1053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248217
21	NT_187130	CAG	2	6	1058	1063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248217
22	NT_187130	GCT	2	6	1177	1182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248217
23	NT_187130	GCA	2	6	1201	1206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248217
24	NT_187130	CAT	2	6	1253	1258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248217
25	NT_187130	CTT	2	6	1531	1536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248218
26	NT_187130	GCC	2	6	1592	1597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248218
27	NT_187130	CTG	2	6	1655	1660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248218
28	NT_187130	CG	3	6	1669	1674	0 %	0 %	50 %	50 %	409248218
29	NT_187130	GGC	2	6	1718	1723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248218
30	NT_187130	CGT	2	6	1786	1791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248218
31	NT_187130	GCT	2	6	1837	1842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248218
32	NT_187130	CTTC	2	8	1933	1940	0 %	50 %	0 %	50 %	409248218
33	NT_187130	CG	3	6	2015	2020	0 %	0 %	50 %	50 %	409248218
34	NT_187130	GC	3	6	2044	2049	0 %	0 %	50 %	50 %	409248218
35	NT_187130	ATC	2	6	2063	2068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248218
36	NT_187130	CAG	2	6	2069	2074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248218
37	NT_187130	TCGG	2	8	2124	2131	0 %	25 %	50 %	25 %	409248218
38	NT_187130	CCAG	2	8	2164	2171	25 %	0 %	25 %	50 %	409248218
39	NT_187130	TCTG	2	8	2179	2186	0 %	50 %	25 %	25 %	409248218
40	NT_187130	CGCT	2	8	2342	2349	0 %	25 %	25 %	50 %	409248218
41	NT_187130	AGC	2	6	2352	2357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248218
42	NT_187130	GCA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248218
43	NT_187130	TGC	2	6	2415	2420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248218
44	NT_187130	GGCT	2	8	2442	2449	0 %	25 %	50 %	25 %	409248218
45	NT_187130	AGC	2	6	2466	2471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248218
46	NT_187130	GGC	2	6	2482	2487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248218
47	NT_187130	TTA	2	6	2565	2570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248218
48	NT_187130	AAT	2	6	2576	2581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248218
49	NT_187130	GGAATG	2	12	2604	2615	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	409248218
50	NT_187130	CCA	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248218
51	NT_187130	GC	3	6	2653	2658	0 %	0 %	50 %	50 %	409248218
52	NT_187130	CGC	2	6	2666	2671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248218
53	NT_187130	GGC	2	6	2709	2714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248218
54	NT_187130	CGG	2	6	2740	2745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248218
55	NT_187130	GCC	2	6	2915	2920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248219
56	NT_187130	TAA	2	6	2941	2946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248219
57	NT_187130	CAG	2	6	2989	2994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248219
58	NT_187130	CCG	2	6	3011	3016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248219
59	NT_187130	CAGC	2	8	3025	3032	25 %	0 %	25 %	50 %	409248219
60	NT_187130	CGAC	2	8	3042	3049	25 %	0 %	25 %	50 %	409248219
61	NT_187130	GTT	2	6	3109	3114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248219
62	NT_187130	A	6	6	3117	3122	100 %	0 %	0 %	0 %	409248219
63	NT_187130	AGA	3	9	3212	3220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248219
64	NT_187130	GAG	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248219
65	NT_187130	GC	3	6	3266	3271	0 %	0 %	50 %	50 %	409248219
66	NT_187130	CCG	2	6	3386	3391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248219
67	NT_187130	TCA	2	6	3429	3434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248219
68	NT_187130	CGC	2	6	3460	3465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248219
69	NT_187130	CCGCG	2	10	3537	3546	0 %	0 %	40 %	60 %	409248219
70	NT_187130	CAG	3	9	3568	3576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248219
71	NT_187130	AAT	2	6	3607	3612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248219
72	NT_187130	GCG	2	6	3650	3655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248219
73	NT_187130	TAA	2	6	3699	3704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248219
74	NT_187130	CCT	2	6	3741	3746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248219
75	NT_187130	GTC	2	6	3830	3835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248219
76	NT_187130	CGG	2	6	3893	3898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248219
77	NT_187130	ACG	2	6	4007	4012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248219
78	NT_187130	ATG	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248219
79	NT_187130	CGT	2	6	4039	4044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248219
80	NT_187130	GGC	2	6	4051	4056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248219
81	NT_187130	AAT	2	6	4120	4125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248219
82	NT_187130	A	6	6	4616	4621	100 %	0 %	0 %	0 %	409248220
83	NT_187130	CGA	2	6	4623	4628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248220
84	NT_187130	ATG	2	6	4641	4646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248220
85	NT_187130	CCGC	2	8	4680	4687	0 %	0 %	25 %	75 %	409248220
86	NT_187130	A	7	7	4773	4779	100 %	0 %	0 %	0 %	409248220
87	NT_187130	TAT	2	6	4790	4795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248220
88	NT_187130	CGT	2	6	4846	4851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248220
89	NT_187130	GGC	2	6	4912	4917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248220
90	NT_187130	TGG	2	6	4959	4964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248220
91	NT_187130	GCTG	2	8	5016	5023	0 %	25 %	50 %	25 %	409248220
92	NT_187130	AAG	2	6	5050	5055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248220
93	NT_187130	GGT	2	6	5092	5097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248220
94	NT_187130	GAT	2	6	5102	5107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248220
95	NT_187130	GCA	2	6	5116	5121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248220
96	NT_187130	CCG	2	6	5122	5127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248220
97	NT_187130	GCT	2	6	5134	5139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248220
98	NT_187130	CTG	2	6	5174	5179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248220
99	NT_187130	GTTA	2	8	5206	5213	25 %	50 %	25 %	0 %	409248220
100	NT_187130	CAC	2	6	5290	5295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248220
101	NT_187130	GA	3	6	5336	5341	50 %	0 %	50 %	0 %	409248220
102	NT_187130	TGA	2	6	5343	5348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248220
103	NT_187130	AG	3	6	5356	5361	50 %	0 %	50 %	0 %	409248220
104	NT_187130	GGA	2	6	5416	5421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248220
105	NT_187130	CAGA	2	8	5488	5495	50 %	0 %	25 %	25 %	409248220
106	NT_187130	CGGA	2	8	5502	5509	25 %	0 %	50 %	25 %	409248220
107	NT_187130	AAT	2	6	5786	5791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248221
108	NT_187130	GA	3	6	5886	5891	50 %	0 %	50 %	0 %	409248221
109	NT_187130	GCTG	2	8	5920	5927	0 %	25 %	50 %	25 %	409248221
110	NT_187130	GAA	2	6	5948	5953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248221
111	NT_187130	GCCA	2	8	5966	5973	25 %	0 %	25 %	50 %	409248221
112	NT_187130	TG	3	6	6018	6023	0 %	50 %	50 %	0 %	409248221
113	NT_187130	TCGC	2	8	6030	6037	0 %	25 %	25 %	50 %	409248221
114	NT_187130	TAT	2	6	6038	6043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248221
115	NT_187130	CAT	2	6	6113	6118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248221
116	NT_187130	TCA	2	6	6129	6134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248221
117	NT_187130	GC	3	6	6282	6287	0 %	0 %	50 %	50 %	409248221
118	NT_187130	TCC	2	6	6317	6322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248221
119	NT_187130	ATC	2	6	6338	6343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248221
120	NT_187130	CG	3	6	6351	6356	0 %	0 %	50 %	50 %	409248221
121	NT_187130	GCG	2	6	6365	6370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248221
122	NT_187130	GGC	2	6	6403	6408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248221
123	NT_187130	GGC	2	6	6412	6417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248221
124	NT_187130	A	6	6	6428	6433	100 %	0 %	0 %	0 %	409248221
125	NT_187130	TCG	2	6	6465	6470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248221
126	NT_187130	CGG	2	6	6549	6554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248221
127	NT_187130	GAAGGT	2	12	6622	6633	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	409248221
128	NT_187130	GGC	2	6	6749	6754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248221
129	NT_187130	CTT	2	6	6778	6783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248221
130	NT_187130	CGA	2	6	6789	6794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248221
131	NT_187130	TTC	2	6	6839	6844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248221
132	NT_187130	ATGT	2	8	6860	6867	25 %	50 %	25 %	0 %	409248221
133	NT_187130	GCG	2	6	6924	6929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248221
134	NT_187130	CGG	2	6	7036	7041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248221
135	NT_187130	GTG	2	6	7115	7120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248221
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138	NT_187130	CGA	2	6	7439	7444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248222
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142	NT_187130	T	6	6	7689	7694	0 %	100 %	0 %	0 %	409248223
143	NT_187130	T	6	6	7696	7701	0 %	100 %	0 %	0 %	409248223
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151	NT_187130	T	7	7	8932	8938	0 %	100 %	0 %	0 %	409248225
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161	NT_187130	GTT	2	6	9172	9177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248225
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249	NT_187130	T	6	6	13414	13419	0 %	100 %	0 %	0 %	409248227
250	NT_187130	CGC	2	6	13453	13458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248227
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252	NT_187130	TCG	2	6	13524	13529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248227
253	NT_187130	GATC	2	8	13645	13652	25 %	25 %	25 %	25 %	409248227
254	NT_187130	CCG	2	6	13669	13674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248227
255	NT_187130	TGGCG	2	10	13730	13739	0 %	20 %	60 %	20 %	409248227
256	NT_187130	GCG	2	6	13778	13783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248227
257	NT_187130	TCA	2	6	13869	13874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248227
258	NT_187130	ACG	2	6	13875	13880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248227
259	NT_187130	GT	3	6	14041	14046	0 %	50 %	50 %	0 %	409248227
260	NT_187130	CGAG	2	8	14074	14081	25 %	0 %	50 %	25 %	409248227
261	NT_187130	CGA	2	6	14082	14087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248227
262	NT_187130	TACCGG	2	12	14164	14175	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409248227
263	NT_187130	CAG	2	6	14186	14191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248227
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265	NT_187130	GCTC	2	8	14266	14273	0 %	25 %	25 %	50 %	409248227
266	NT_187130	CAG	2	6	14333	14338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248227
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383	NT_187130	TTC	2	6	21486	21491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248234
384	NT_187130	GAA	2	6	21500	21505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248234
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386	NT_187130	CG	3	6	21606	21611	0 %	0 %	50 %	50 %	409248234
387	NT_187130	GAT	2	6	21623	21628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248234
388	NT_187130	A	7	7	21706	21712	100 %	0 %	0 %	0 %	409248234
389	NT_187130	CG	3	6	21736	21741	0 %	0 %	50 %	50 %	409248234
390	NT_187130	CTT	2	6	21825	21830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248234
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392	NT_187130	GCA	2	6	21914	21919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248234
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422	NT_187130	GA	3	6	23313	23318	50 %	0 %	50 %	0 %	409248235
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