MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 6474

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NT_187127	GCC	2	6	270958	270963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248115
5002	NT_187127	CCAT	2	8	271007	271014	25 %	25 %	0 %	50 %	409248115
5003	NT_187127	TGA	2	6	271070	271075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248115
5004	NT_187127	AAC	2	6	271084	271089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248115
5005	NT_187127	CATTT	2	10	271096	271105	20 %	60 %	0 %	20 %	409248115
5006	NT_187127	CCG	2	6	271182	271187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248115
5007	NT_187127	GGC	2	6	271318	271323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248115
5008	NT_187127	GGT	2	6	271360	271365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248115
5009	NT_187127	CGG	2	6	271383	271388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248115
5010	NT_187127	GCC	2	6	271442	271447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248115
5011	NT_187127	AAC	2	6	271462	271467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409248115
5012	NT_187127	CCT	2	6	271494	271499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409248115
5013	NT_187127	GCGG	2	8	271541	271548	0 %	0 %	75 %	25 %	409248115
5014	NT_187127	TGCC	2	8	271632	271639	0 %	25 %	25 %	50 %	409248115
5015	NT_187127	CG	3	6	271755	271760	0 %	0 %	50 %	50 %	409248115
5016	NT_187127	GCC	2	6	271814	271819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248115
5017	NT_187127	GCC	2	6	271931	271936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248115
5018	NT_187127	CGC	2	6	272013	272018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248115
5019	NT_187127	TGC	2	6	272019	272024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248115
5020	NT_187127	GA	3	6	272486	272491	50 %	0 %	50 %	0 %	409248116
5021	NT_187127	GTCAG	2	10	272522	272531	20 %	20 %	40 %	20 %	409248116
5022	NT_187127	GGT	2	6	272679	272684	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248116
5023	NT_187127	ATG	2	6	272687	272692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248116
5024	NT_187127	TGT	2	6	272728	272733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248116
5025	NT_187127	GAT	2	6	272785	272790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248116
5026	NT_187127	TGA	2	6	272840	272845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248116
5027	NT_187127	TTA	2	6	272861	272866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248116
5028	NT_187127	GTA	2	6	272914	272919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248116
5029	NT_187127	TTA	2	6	272944	272949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248116
5030	NT_187127	CGA	2	6	273053	273058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248116
5031	NT_187127	TTA	2	6	273075	273080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248116
5032	NT_187127	CGC	2	6	273100	273105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248116
5033	NT_187127	GGCG	2	8	273181	273188	0 %	0 %	75 %	25 %	409248116
5034	NT_187127	ATT	2	6	273311	273316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248116
5035	NT_187127	TAT	2	6	273317	273322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248116
5036	NT_187127	A	6	6	273618	273623	100 %	0 %	0 %	0 %	409248117
5037	NT_187127	ATG	2	6	273662	273667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248117
5038	NT_187127	GTT	2	6	273755	273760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248117
5039	NT_187127	CTG	2	6	273773	273778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248117
5040	NT_187127	TAAA	2	8	273782	273789	75 %	25 %	0 %	0 %	409248117
5041	NT_187127	TTC	2	6	273831	273836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248117
5042	NT_187127	TAT	2	6	273840	273845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248117
5043	NT_187127	GTT	2	6	273925	273930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248117
5044	NT_187127	TAT	2	6	273957	273962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409248117
5045	NT_187127	CAGCGA	2	12	273996	274007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248117
5046	NT_187127	CAT	3	9	274081	274089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248117
5047	NT_187127	CTG	2	6	274162	274167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248117
5048	NT_187127	AT	4	8	274181	274188	50 %	50 %	0 %	0 %	409248117
5049	NT_187127	GAA	2	6	274296	274301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248117
5050	NT_187127	GT	3	6	274328	274333	0 %	50 %	50 %	0 %	409248117
5051	NT_187127	CTGG	2	8	274403	274410	0 %	25 %	50 %	25 %	409248117
5052	NT_187127	TTG	3	9	274412	274420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248117
5053	NT_187127	TGA	2	6	274485	274490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248117
5054	NT_187127	GTT	2	6	274618	274623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248118
5055	NT_187127	TCG	2	6	274637	274642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248118
5056	NT_187127	GGC	2	6	274656	274661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248118
5057	NT_187127	TCA	2	6	274739	274744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248118
5058	NT_187127	AGCAG	2	10	274863	274872	40 %	0 %	40 %	20 %	409248118
5059	NT_187127	GCG	2	6	274955	274960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248118
5060	NT_187127	CTAT	2	8	275036	275043	25 %	50 %	0 %	25 %	409248118
5061	NT_187127	GCT	2	6	275079	275084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248118
5062	NT_187127	ACC	2	6	275176	275181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248118
5063	NT_187127	GCG	2	6	275308	275313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248118
5064	NT_187127	TTC	2	6	275386	275391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248118
5065	NT_187127	GCC	2	6	275412	275417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248118
5066	NT_187127	TTG	2	6	275504	275509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248118
5067	NT_187127	TTG	2	6	275685	275690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248119
5068	NT_187127	CAG	2	6	275765	275770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248119
5069	NT_187127	CGG	2	6	275782	275787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248119
5070	NT_187127	TTTC	2	8	275849	275856	0 %	75 %	0 %	25 %	409248119
5071	NT_187127	GCA	2	6	275965	275970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248119
5072	NT_187127	CA	3	6	276042	276047	50 %	0 %	0 %	50 %	409248119
5073	NT_187127	CCG	2	6	276074	276079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248119
5074	NT_187127	TAA	2	6	276094	276099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409248119
5075	NT_187127	GGC	2	6	276113	276118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248119
5076	NT_187127	GCG	2	6	276124	276129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248119
5077	NT_187127	CTG	2	6	276170	276175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248119
5078	NT_187127	CCG	2	6	276181	276186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248119
5079	NT_187127	CTGT	2	8	276253	276260	0 %	50 %	25 %	25 %	409248119
5080	NT_187127	TGCC	2	8	276488	276495	0 %	25 %	25 %	50 %	409248119
5081	NT_187127	A	6	6	276500	276505	100 %	0 %	0 %	0 %	409248119
5082	NT_187127	TG	3	6	276524	276529	0 %	50 %	50 %	0 %	409248119
5083	NT_187127	CATGA	2	10	276581	276590	40 %	20 %	20 %	20 %	409248119
5084	NT_187127	CTG	2	6	276635	276640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248119
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5086	NT_187127	TG	3	6	276678	276683	0 %	50 %	50 %	0 %	409248119
5087	NT_187127	ACG	2	6	276711	276716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248119
5088	NT_187127	TGC	2	6	276717	276722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248119
5089	NT_187127	TGGTA	2	10	276737	276746	20 %	40 %	40 %	0 %	409248119
5090	NT_187127	TTC	2	6	276793	276798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248119
5091	NT_187127	TCT	2	6	276811	276816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248119
5092	NT_187127	TGG	2	6	276858	276863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248119
5093	NT_187127	GCC	2	6	276934	276939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248119
5094	NT_187127	GGC	2	6	276963	276968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248119
5095	NT_187127	ATG	2	6	276983	276988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248120
5096	NT_187127	TGT	2	6	277042	277047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409248120
5097	NT_187127	CGG	2	6	277229	277234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248120
5098	NT_187127	GTG	2	6	277265	277270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248120
5099	NT_187127	G	6	6	277270	277275	0 %	0 %	100 %	0 %	409248120
5100	NT_187127	GTG	2	6	277289	277294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409248120
5101	NT_187127	CCA	2	6	277296	277301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409248120
5102	NT_187127	G	6	6	277309	277314	0 %	0 %	100 %	0 %	409248120
5103	NT_187127	GGC	2	6	277369	277374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248120
5104	NT_187127	GAA	2	6	277382	277387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248120
5105	NT_187127	TG	3	6	277433	277438	0 %	50 %	50 %	0 %	409248120
5106	NT_187127	GTC	2	6	277499	277504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248120
5107	NT_187127	TGA	2	6	277594	277599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248120
5108	NT_187127	CTT	2	6	277801	277806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248120
5109	NT_187127	GCA	2	6	277824	277829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248121
5110	NT_187127	CCG	2	6	277842	277847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248121
5111	NT_187127	CAG	2	6	277852	277857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248121
5112	NT_187127	AGA	2	6	277874	277879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409248121
5113	NT_187127	CTG	2	6	277885	277890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248121
5114	NT_187127	CAG	2	6	277909	277914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248121
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5117	NT_187127	CAGCG	2	10	278074	278083	20 %	0 %	40 %	40 %	409248121
5118	NT_187127	CTG	2	6	278085	278090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248121
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5121	NT_187127	GCC	2	6	278331	278336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248121
5122	NT_187127	GAT	2	6	278422	278427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248121
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5232	NT_187127	ATGA	2	8	283812	283819	50 %	25 %	25 %	0 %	409248126
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5242	NT_187127	CAT	2	6	284415	284420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248126
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5244	NT_187127	GCA	2	6	284480	284485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248126
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5246	NT_187127	TA	3	6	284646	284651	50 %	50 %	0 %	0 %	409248127
5247	NT_187127	TTTA	2	8	284690	284697	25 %	75 %	0 %	0 %	409248127
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5251	NT_187127	TCT	2	6	284885	284890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409248127
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5255	NT_187127	CAT	2	6	285086	285091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248127
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5325	NT_187127	CTG	2	6	288797	288802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248131
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5359	NT_187127	A	6	6	290911	290916	100 %	0 %	0 %	0 %	409248134
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5364	NT_187127	GTC	2	6	291003	291008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248134
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5473	NT_187127	CAAC	2	8	296094	296101	50 %	0 %	0 %	50 %	409248141
5474	NT_187127	TGC	2	6	296123	296128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409248141
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5481	NT_187127	CCAG	2	8	296348	296355	25 %	0 %	25 %	50 %	409248141
5482	NT_187127	T	6	6	296382	296387	0 %	100 %	0 %	0 %	409248141
5483	NT_187127	GGA	2	6	296412	296417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248141
5484	NT_187127	ATC	2	6	296495	296500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248141
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5486	NT_187127	GA	3	6	296546	296551	50 %	0 %	50 %	0 %	409248141
5487	NT_187127	GACC	2	8	296571	296578	25 %	0 %	25 %	50 %	409248141
5488	NT_187127	GCA	2	6	296595	296600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409248141
5489	NT_187127	TC	3	6	296684	296689	0 %	50 %	0 %	50 %	409248141
5490	NT_187127	AGG	2	6	296798	296803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409248141
5491	NT_187127	GCG	2	6	296824	296829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409248141
5492	NT_187127	CTA	2	6	296845	296850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409248141
5493	NT_187127	GCTG	2	8	296891	296898	0 %	25 %	50 %	25 %	409248141
5494	NT_187127	GCC	2	6	296911	296916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409248141
5495	NT_187127	GAT	2	6	296956	296961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409248141
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