MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187126	GAG	2	6	365	370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247807
2	NT_187126	TCA	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247807
3	NT_187126	GCG	2	6	410	415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247807
4	NT_187126	TAA	2	6	428	433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247807
5	NT_187126	AGCGAT	2	12	448	459	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409247807
6	NT_187126	T	6	6	469	474	0 %	100 %	0 %	0 %	409247807
7	NT_187126	ATG	2	6	546	551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247808
8	NT_187126	GAA	2	6	561	566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247808
9	NT_187126	TTTAT	2	10	582	591	20 %	80 %	0 %	0 %	409247808
10	NT_187126	CAGGT	2	10	603	612	20 %	20 %	40 %	20 %	409247808
11	NT_187126	TAAT	2	8	816	823	50 %	50 %	0 %	0 %	409247809
12	NT_187126	AATTT	2	10	836	845	40 %	60 %	0 %	0 %	409247809
13	NT_187126	GAC	2	6	936	941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
14	NT_187126	CGC	2	6	1100	1105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
15	NT_187126	AGC	2	6	1184	1189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
16	NT_187126	CGC	3	9	1259	1267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
17	NT_187126	CGC	2	6	1286	1291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
18	NT_187126	GCA	2	6	1331	1336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
19	NT_187126	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247809
20	NT_187126	CG	3	6	1377	1382	0 %	0 %	50 %	50 %	409247809
21	NT_187126	GTC	2	6	1431	1436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247809
22	NT_187126	TGT	2	6	1480	1485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247809
23	NT_187126	CAG	2	6	1500	1505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
24	NT_187126	GCCCG	2	10	1515	1524	0 %	0 %	40 %	60 %	409247809
25	NT_187126	CGA	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
26	NT_187126	GC	3	6	1725	1730	0 %	0 %	50 %	50 %	409247809
27	NT_187126	TGC	2	6	1744	1749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247809
28	NT_187126	GCA	2	6	1751	1756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
29	NT_187126	GCA	2	6	1775	1780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
30	NT_187126	GCC	2	6	1803	1808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
31	NT_187126	GAG	2	6	1810	1815	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247809
32	NT_187126	GCG	2	6	1829	1834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247809
33	NT_187126	AAT	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247809
34	NT_187126	GGC	2	6	1866	1871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247809
35	NT_187126	CCA	2	6	1883	1888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247809
36	NT_187126	CCG	2	6	1913	1918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
37	NT_187126	TCG	2	6	1945	1950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247809
38	NT_187126	GCCA	2	8	1966	1973	25 %	0 %	25 %	50 %	409247809
39	NT_187126	TCG	2	6	1993	1998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247809
40	NT_187126	CAG	2	6	2097	2102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247809
41	NT_187126	CCG	2	6	2134	2139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247809
42	NT_187126	GTCGCG	2	12	2151	2162	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409247809
43	NT_187126	TGGT	2	8	2229	2236	0 %	50 %	50 %	0 %	409247810
44	NT_187126	T	6	6	2236	2241	0 %	100 %	0 %	0 %	409247810
45	NT_187126	ACG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247810
46	NT_187126	TGA	2	6	2376	2381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247810
47	NT_187126	CAG	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247810
48	NT_187126	ACC	2	6	2458	2463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247810
49	NT_187126	CCAG	2	8	2524	2531	25 %	0 %	25 %	50 %	409247810
50	NT_187126	GC	3	6	2539	2544	0 %	0 %	50 %	50 %	409247810
51	NT_187126	GAA	2	6	2549	2554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247810
52	NT_187126	GGCG	2	8	2564	2571	0 %	0 %	75 %	25 %	409247810
53	NT_187126	GGT	2	6	2573	2578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247810
54	NT_187126	CAA	2	6	2621	2626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247810
55	NT_187126	GCC	3	9	2630	2638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247810
56	NT_187126	AACC	2	8	2668	2675	50 %	0 %	0 %	50 %	409247810
57	NT_187126	GAT	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247810
58	NT_187126	AAT	2	6	2885	2890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247810
59	NT_187126	ATT	2	6	2945	2950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247810
60	NT_187126	GC	3	6	2969	2974	0 %	0 %	50 %	50 %	409247810
61	NT_187126	TTA	2	6	2991	2996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247810
62	NT_187126	AAT	2	6	3190	3195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247811
63	NT_187126	CAC	2	6	3210	3215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247811
64	NT_187126	CG	3	6	3229	3234	0 %	0 %	50 %	50 %	409247811
65	NT_187126	T	6	6	3300	3305	0 %	100 %	0 %	0 %	409247811
66	NT_187126	CGC	2	6	3446	3451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247811
67	NT_187126	GC	3	6	3458	3463	0 %	0 %	50 %	50 %	409247811
68	NT_187126	TCC	2	6	3528	3533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247812
69	NT_187126	TGT	2	6	3576	3581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247812
70	NT_187126	TCT	2	6	3717	3722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247812
71	NT_187126	GTTC	2	8	3730	3737	0 %	50 %	25 %	25 %	409247812
72	NT_187126	GTC	2	6	3749	3754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
73	NT_187126	GAT	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247812
74	NT_187126	GCC	2	6	3782	3787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
75	NT_187126	CAT	2	6	3848	3853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247812
76	NT_187126	AGC	2	6	3873	3878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
77	NT_187126	CAG	2	6	3902	3907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
78	NT_187126	GCC	2	6	3929	3934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
79	NT_187126	GAT	2	6	3974	3979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247812
80	NT_187126	TGC	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
81	NT_187126	GC	3	6	4237	4242	0 %	0 %	50 %	50 %	409247812
82	NT_187126	CCA	2	6	4315	4320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247812
83	NT_187126	CCGC	2	8	4341	4348	0 %	0 %	25 %	75 %	409247812
84	NT_187126	GCG	2	6	4420	4425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247812
85	NT_187126	TGC	2	6	4428	4433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
86	NT_187126	ACG	2	6	4459	4464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
87	NT_187126	CAG	2	6	4466	4471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
88	NT_187126	AC	3	6	4490	4495	50 %	0 %	0 %	50 %	409247812
89	NT_187126	CAG	2	6	4526	4531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
90	NT_187126	TTC	2	6	4532	4537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247812
91	NT_187126	GTT	3	9	4610	4618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247812
92	NT_187126	GCC	2	6	4679	4684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
93	NT_187126	GCC	2	6	4719	4724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
94	NT_187126	GCG	2	6	4749	4754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247812
95	NT_187126	GC	3	6	4795	4800	0 %	0 %	50 %	50 %	409247812
96	NT_187126	GCA	2	6	4909	4914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
97	NT_187126	AGC	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
98	NT_187126	CTT	2	6	4999	5004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247812
99	NT_187126	CG	3	6	5031	5036	0 %	0 %	50 %	50 %	409247812
100	NT_187126	GCC	2	6	5066	5071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
101	NT_187126	CAG	2	6	5084	5089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
102	NT_187126	CGC	2	6	5278	5283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
103	NT_187126	AGA	2	6	5344	5349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247812
104	NT_187126	CTG	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
105	NT_187126	GT	3	6	5445	5450	0 %	50 %	50 %	0 %	409247812
106	NT_187126	ACGC	2	8	5453	5460	25 %	0 %	25 %	50 %	409247812
107	NT_187126	GCT	2	6	5485	5490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
108	NT_187126	CGC	2	6	5491	5496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
109	NT_187126	GC	3	6	5572	5577	0 %	0 %	50 %	50 %	409247812
110	NT_187126	CAG	2	6	5594	5599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247812
111	NT_187126	CCG	3	9	5601	5609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247812
112	NT_187126	ACC	2	6	5610	5615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247812
113	NT_187126	TGC	2	6	5626	5631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247812
114	NT_187126	CGG	2	6	5711	5716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247812
115	NT_187126	ATA	2	6	5756	5761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247812
116	NT_187126	AG	4	8	5874	5881	50 %	0 %	50 %	0 %	409247812
117	NT_187126	GTG	2	6	5894	5899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247812
118	NT_187126	TTC	2	6	5945	5950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247812
119	NT_187126	ACCAT	2	10	6021	6030	40 %	20 %	0 %	40 %	409247812
120	NT_187126	ATA	2	6	6036	6041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247812
121	NT_187126	TTTCT	2	10	6073	6082	0 %	80 %	0 %	20 %	409247813
122	NT_187126	TA	3	6	6143	6148	50 %	50 %	0 %	0 %	409247813
123	NT_187126	TA	3	6	6161	6166	50 %	50 %	0 %	0 %	409247813
124	NT_187126	GC	3	6	6393	6398	0 %	0 %	50 %	50 %	409247814
125	NT_187126	ACC	2	6	6449	6454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247814
126	NT_187126	CGC	2	6	6481	6486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247814
127	NT_187126	GAC	2	6	6520	6525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247814
128	NT_187126	TGC	2	6	6599	6604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247814
129	NT_187126	ATG	2	6	6617	6622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247814
130	NT_187126	GAA	2	6	6643	6648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247814
131	NT_187126	TAA	2	6	6693	6698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247814
132	NT_187126	CCG	2	6	6714	6719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247814
133	NT_187126	TCAC	2	8	6815	6822	25 %	25 %	0 %	50 %	409247814
134	NT_187126	GCG	2	6	6917	6922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247814
135	NT_187126	GAC	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247814
136	NT_187126	TGC	2	6	6980	6985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247814
137	NT_187126	TAC	2	6	7083	7088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247814
138	NT_187126	CAG	2	6	7093	7098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247814
139	NT_187126	GGC	2	6	7102	7107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247814
140	NT_187126	ATC	2	6	7121	7126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247814
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142	NT_187126	CAG	2	6	7156	7161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247814
143	NT_187126	CGC	2	6	7255	7260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247814
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145	NT_187126	GAT	2	6	7351	7356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247814
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147	NT_187126	GGC	2	6	7854	7859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247815
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149	NT_187126	ACC	2	6	7936	7941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247815
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157	NT_187126	GC	3	6	8179	8184	0 %	0 %	50 %	50 %	409247815
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160	NT_187126	GCC	2	6	8431	8436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247816
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167	NT_187126	GCC	2	6	8804	8809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247817
168	NT_187126	GGGCA	2	10	8892	8901	20 %	0 %	60 %	20 %	409247817
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170	NT_187126	GGTC	2	8	9010	9017	0 %	25 %	50 %	25 %	409247817
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224	NT_187126	CG	3	6	12081	12086	0 %	0 %	50 %	50 %	409247820
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232	NT_187126	CAG	2	6	12715	12720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247820
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245	NT_187126	CAGG	2	8	13233	13240	25 %	0 %	50 %	25 %	409247820
246	NT_187126	TAAT	2	8	13268	13275	50 %	50 %	0 %	0 %	409247820
247	NT_187126	GAC	2	6	13369	13374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247821
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250	NT_187126	CATCC	2	10	13495	13504	20 %	20 %	0 %	60 %	409247821
251	NT_187126	CAG	2	6	13540	13545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247821
252	NT_187126	AAGG	2	8	13573	13580	50 %	0 %	50 %	0 %	409247821
253	NT_187126	CGA	2	6	13616	13621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247821
254	NT_187126	AG	3	6	13633	13638	50 %	0 %	50 %	0 %	409247821
255	NT_187126	T	6	6	13681	13686	0 %	100 %	0 %	0 %	409247821
256	NT_187126	CTT	2	6	13749	13754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247821
257	NT_187126	TTTC	2	8	13809	13816	0 %	75 %	0 %	25 %	409247821
258	NT_187126	CTT	2	6	13818	13823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247821
259	NT_187126	GTA	2	6	13861	13866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247821
260	NT_187126	TCC	3	9	14342	14350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247822
261	NT_187126	CCA	2	6	14353	14358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247822
262	NT_187126	ATGG	2	8	14366	14373	25 %	25 %	50 %	0 %	409247822
263	NT_187126	GGC	2	6	14419	14424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247822
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373	NT_187126	T	7	7	20202	20208	0 %	100 %	0 %	0 %	409247830
374	NT_187126	ACG	2	6	20246	20251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247830
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382	NT_187126	GCG	2	6	20959	20964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247831
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387	NT_187126	GCC	2	6	21298	21303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247831
388	NT_187126	TTAT	2	8	21304	21311	25 %	75 %	0 %	0 %	409247831
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390	NT_187126	GGC	2	6	21498	21503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247831
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500	NT_187126	AAGC	2	8	27255	27262	50 %	0 %	25 %	25 %	409247840

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