MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187123	GCT	2	6	512	517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247581
2	NT_187123	GTT	2	6	541	546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247581
3	NT_187123	CTG	2	6	563	568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247581
4	NT_187123	GCT	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247581
5	NT_187123	AAGTG	2	10	671	680	40 %	20 %	40 %	0 %	409247581
6	NT_187123	CTG	2	6	694	699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247581
7	NT_187123	GTA	2	6	724	729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247581
8	NT_187123	GAG	2	6	732	737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247581
9	NT_187123	CCAG	2	8	842	849	25 %	0 %	25 %	50 %	409247581
10	NT_187123	GCC	2	6	934	939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247581
11	NT_187123	TCA	2	6	950	955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247581
12	NT_187123	GCCC	2	8	1105	1112	0 %	0 %	25 %	75 %	409247581
13	NT_187123	ACG	2	6	1300	1305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247582
14	NT_187123	TC	3	6	1346	1351	0 %	50 %	0 %	50 %	409247582
15	NT_187123	GTCATG	2	12	1394	1405	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409247582
16	NT_187123	GAA	2	6	1447	1452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247582
17	NT_187123	GGC	2	6	1570	1575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247582
18	NT_187123	AGA	2	6	1596	1601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247582
19	NT_187123	TGA	2	6	1614	1619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247582
20	NT_187123	TAA	2	6	1621	1626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247582
21	NT_187123	T	7	7	1643	1649	0 %	100 %	0 %	0 %	409247583
22	NT_187123	CAG	2	6	1654	1659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247583
23	NT_187123	AAC	2	6	1676	1681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247583
24	NT_187123	CCT	2	6	1707	1712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247583
25	NT_187123	AGCG	2	8	1833	1840	25 %	0 %	50 %	25 %	409247583
26	NT_187123	CG	3	6	1889	1894	0 %	0 %	50 %	50 %	409247583
27	NT_187123	CTT	2	6	1900	1905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247583
28	NT_187123	GCG	2	6	1931	1936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247583
29	NT_187123	T	6	6	1946	1951	0 %	100 %	0 %	0 %	409247583
30	NT_187123	GCT	2	6	1960	1965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247583
31	NT_187123	GGA	2	6	2003	2008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247583
32	NT_187123	GCG	2	6	2141	2146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247583
33	NT_187123	CGT	2	6	2243	2248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247583
34	NT_187123	TCA	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247583
35	NT_187123	TC	3	6	2301	2306	0 %	50 %	0 %	50 %	409247583
36	NT_187123	GCC	3	9	2323	2331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247583
37	NT_187123	ATG	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247583
38	NT_187123	TGC	2	6	2381	2386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247583
39	NT_187123	TGG	2	6	2461	2466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247583
40	NT_187123	TACCCG	2	12	2502	2513	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409247583
41	NT_187123	GAT	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247583
42	NT_187123	CTT	2	6	2712	2717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247583
43	NT_187123	CCG	2	6	2736	2741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247583
44	NT_187123	CGA	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247583
45	NT_187123	CGC	2	6	2814	2819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247583
46	NT_187123	CACC	2	8	2844	2851	25 %	0 %	0 %	75 %	409247583
47	NT_187123	GCT	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247583
48	NT_187123	T	7	7	2976	2982	0 %	100 %	0 %	0 %	409247583
49	NT_187123	TAA	2	6	3006	3011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247583
50	NT_187123	GGC	2	6	3116	3121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247583
51	NT_187123	GCG	2	6	3137	3142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247583
52	NT_187123	GTGG	2	8	3772	3779	0 %	25 %	75 %	0 %	409247584
53	NT_187123	ACG	2	6	3849	3854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247584
54	NT_187123	GGT	2	6	3866	3871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247584
55	NT_187123	TGT	2	6	3882	3887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247584
56	NT_187123	GGC	2	6	3913	3918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247584
57	NT_187123	CTGGC	2	10	3996	4005	0 %	20 %	40 %	40 %	409247584
58	NT_187123	GTT	2	6	4012	4017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247584
59	NT_187123	CGT	2	6	4030	4035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247584
60	NT_187123	AGG	2	6	4086	4091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247584
61	NT_187123	TGG	2	6	4218	4223	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247584
62	NT_187123	TAC	2	6	4273	4278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247584
63	NT_187123	GC	3	6	4322	4327	0 %	0 %	50 %	50 %	409247584
64	NT_187123	A	6	6	4346	4351	100 %	0 %	0 %	0 %	409247584
65	NT_187123	CGG	2	6	4366	4371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247584
66	NT_187123	TGA	2	6	4576	4581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247584
67	NT_187123	CGG	2	6	4647	4652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247584
68	NT_187123	GC	3	6	4768	4773	0 %	0 %	50 %	50 %	409247584
69	NT_187123	CTAT	2	8	4809	4816	25 %	50 %	0 %	25 %	409247584
70	NT_187123	GTT	3	9	4822	4830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247584
71	NT_187123	GTG	2	6	4865	4870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247584
72	NT_187123	ACG	2	6	4871	4876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247584
73	NT_187123	GCA	2	6	4885	4890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247584
74	NT_187123	CCCG	2	8	4923	4930	0 %	0 %	25 %	75 %	409247584
75	NT_187123	TCA	2	6	4938	4943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247584
76	NT_187123	CGG	2	6	4980	4985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247584
77	NT_187123	GC	3	6	4992	4997	0 %	0 %	50 %	50 %	409247584
78	NT_187123	ATG	2	6	5051	5056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247584
79	NT_187123	GCA	2	6	5149	5154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247584
80	NT_187123	ACC	2	6	5183	5188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247584
81	NT_187123	CGA	2	6	5329	5334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247584
82	NT_187123	GCC	2	6	5359	5364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247584
83	NT_187123	ATG	2	6	5401	5406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247584
84	NT_187123	GTG	2	6	5467	5472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247585
85	NT_187123	ATTGA	2	10	5539	5548	40 %	40 %	20 %	0 %	409247585
86	NT_187123	CGGT	2	8	5563	5570	0 %	25 %	50 %	25 %	409247585
87	NT_187123	CAA	2	6	5647	5652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247585
88	NT_187123	GAC	2	6	5684	5689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247586
89	NT_187123	A	6	6	5691	5696	100 %	0 %	0 %	0 %	409247586
90	NT_187123	TGA	2	6	5909	5914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247586
91	NT_187123	AAC	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247586
92	NT_187123	TCCG	2	8	5971	5978	0 %	25 %	25 %	50 %	409247586
93	NT_187123	TCA	2	6	6040	6045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247586
94	NT_187123	CGC	2	6	6047	6052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247586
95	NT_187123	G	6	6	6061	6066	0 %	0 %	100 %	0 %	409247586
96	NT_187123	CGATG	2	10	6101	6110	20 %	20 %	40 %	20 %	409247586
97	NT_187123	TTC	2	6	6113	6118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247586
98	NT_187123	GCGG	2	8	6162	6169	0 %	0 %	75 %	25 %	409247586
99	NT_187123	CTC	2	6	6179	6184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247586
100	NT_187123	CTG	2	6	6186	6191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247586
101	NT_187123	GC	3	6	6204	6209	0 %	0 %	50 %	50 %	409247586
102	NT_187123	CCG	2	6	6312	6317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247586
103	NT_187123	CGCGA	2	10	6348	6357	20 %	0 %	40 %	40 %	409247586
104	NT_187123	TCA	2	6	6358	6363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247586
105	NT_187123	CGA	2	6	6431	6436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247586
106	NT_187123	AGGT	2	8	6496	6503	25 %	25 %	50 %	0 %	409247586
107	NT_187123	CAA	2	6	6537	6542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247586
108	NT_187123	CTT	2	6	6545	6550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247586
109	NT_187123	ATA	2	6	6608	6613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247586
110	NT_187123	CCA	3	9	6790	6798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247587
111	NT_187123	CG	3	6	6825	6830	0 %	0 %	50 %	50 %	409247587
112	NT_187123	GC	3	6	6836	6841	0 %	0 %	50 %	50 %	409247587
113	NT_187123	GTG	2	6	6885	6890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247587
114	NT_187123	CGG	2	6	6971	6976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247587
115	NT_187123	CG	3	6	7057	7062	0 %	0 %	50 %	50 %	409247587
116	NT_187123	GT	3	6	7119	7124	0 %	50 %	50 %	0 %	409247587
117	NT_187123	GCT	2	6	7430	7435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247587
118	NT_187123	GTT	2	6	7460	7465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247587
119	NT_187123	TTG	2	6	7486	7491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247587
120	NT_187123	ACG	2	6	7519	7524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247587
121	NT_187123	TTC	2	6	7615	7620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247587
122	NT_187123	CTG	2	6	7623	7628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247587
123	NT_187123	GCG	3	9	7629	7637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247587
124	NT_187123	CGG	2	6	7757	7762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247587
125	NT_187123	GCT	2	6	7799	7804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247587
126	NT_187123	A	7	7	7893	7899	100 %	0 %	0 %	0 %	409247587
127	NT_187123	TAC	2	6	7928	7933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247587
128	NT_187123	GAC	2	6	7974	7979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247587
129	NT_187123	CGCT	2	8	7998	8005	0 %	25 %	25 %	50 %	409247587
130	NT_187123	CGG	2	6	8027	8032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247587
131	NT_187123	CCGGC	2	10	8116	8125	0 %	0 %	40 %	60 %	409247587
132	NT_187123	GAC	2	6	8145	8150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247587
133	NT_187123	CGG	2	6	8168	8173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247587
134	NT_187123	AGT	2	6	8177	8182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247587
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139	NT_187123	GCA	2	6	8431	8436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247587
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141	NT_187123	CGC	2	6	8465	8470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247587
142	NT_187123	CGC	2	6	8472	8477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247587
143	NT_187123	CGTCAG	2	12	8523	8534	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409247587
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155	NT_187123	CGG	2	6	8961	8966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247588
156	NT_187123	GGC	2	6	8996	9001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247588
157	NT_187123	TGA	2	6	9028	9033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247588
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159	NT_187123	GCA	3	9	9061	9069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247588
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161	NT_187123	GGGCA	2	10	9116	9125	20 %	0 %	60 %	20 %	409247588
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169	NT_187123	CG	3	6	9321	9326	0 %	0 %	50 %	50 %	409247588
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248	NT_187123	TGA	2	6	12975	12980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247592
249	NT_187123	GTCT	2	8	12987	12994	0 %	50 %	25 %	25 %	409247592
250	NT_187123	CAT	2	6	13078	13083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247592
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253	NT_187123	CTG	2	6	13139	13144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247592
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255	NT_187123	TGA	2	6	13239	13244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247592
256	NT_187123	CAT	2	6	13300	13305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247592
257	NT_187123	TAC	2	6	13319	13324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247592
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259	NT_187123	ACG	2	6	13545	13550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247592
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261	NT_187123	TTTA	2	8	13727	13734	25 %	75 %	0 %	0 %	409247593
262	NT_187123	ATG	2	6	13750	13755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247593
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265	NT_187123	CTT	2	6	13899	13904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247593
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384	NT_187123	TCC	2	6	20558	20563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247599
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388	NT_187123	AAG	2	6	20681	20686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247599
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390	NT_187123	CGC	2	6	20900	20905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247599
391	NT_187123	TGC	3	9	20924	20932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247599
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