MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 794

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187118	TTTA	2	8	236	243	25 %	75 %	0 %	0 %	409247065
2	NT_187118	TCA	2	6	268	273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247065
3	NT_187118	CGA	2	6	275	280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247065
4	NT_187118	TGTTC	2	10	308	317	0 %	60 %	20 %	20 %	409247065
5	NT_187118	ATT	2	6	324	329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247065
6	NT_187118	TTC	2	6	432	437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247065
7	NT_187118	CGG	2	6	446	451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247065
8	NT_187118	AATT	2	8	546	553	50 %	50 %	0 %	0 %	409247065
9	NT_187118	TGG	2	6	605	610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247065
10	NT_187118	GCC	2	6	690	695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247065
11	NT_187118	ACC	2	6	720	725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247065
12	NT_187118	ATAA	2	8	780	787	75 %	25 %	0 %	0 %	409247065
13	NT_187118	T	7	7	842	848	0 %	100 %	0 %	0 %	409247065
14	NT_187118	TCA	2	6	851	856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247065
15	NT_187118	CAG	2	6	933	938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247066
16	NT_187118	CG	3	6	975	980	0 %	0 %	50 %	50 %	409247066
17	NT_187118	T	6	6	1069	1074	0 %	100 %	0 %	0 %	409247066
18	NT_187118	T	6	6	1130	1135	0 %	100 %	0 %	0 %	409247066
19	NT_187118	GCC	2	6	1146	1151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247066
20	NT_187118	CAG	2	6	1184	1189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247066
21	NT_187118	CGG	2	6	1190	1195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247066
22	NT_187118	TCA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247066
23	NT_187118	AAC	2	6	1297	1302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247066
24	NT_187118	CGC	2	6	1303	1308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247066
25	NT_187118	TGC	2	6	1327	1332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247066
26	NT_187118	AGA	2	6	1360	1365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247066
27	NT_187118	TCA	2	6	1407	1412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247066
28	NT_187118	TGT	2	6	1426	1431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247066
29	NT_187118	CAA	2	6	1475	1480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247066
30	NT_187118	CCA	2	6	1522	1527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247066
31	NT_187118	GTA	2	6	1602	1607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247066
32	NT_187118	TCTT	2	8	1635	1642	0 %	75 %	0 %	25 %	409247066
33	NT_187118	CAT	2	6	1669	1674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247066
34	NT_187118	GCA	2	6	1812	1817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247067
35	NT_187118	CAT	2	6	1906	1911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247067
36	NT_187118	GGCA	2	8	1915	1922	25 %	0 %	50 %	25 %	409247067
37	NT_187118	TCA	2	6	2067	2072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247067
38	NT_187118	GAG	2	6	2114	2119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247067
39	NT_187118	TGCC	2	8	2160	2167	0 %	25 %	25 %	50 %	409247067
40	NT_187118	GCC	2	6	2203	2208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247067
41	NT_187118	CGC	2	6	2265	2270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247067
42	NT_187118	TCT	3	9	2325	2333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247067
43	NT_187118	GTT	2	6	2382	2387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247067
44	NT_187118	CCG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247067
45	NT_187118	ATT	2	6	2452	2457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247067
46	NT_187118	A	6	6	2536	2541	100 %	0 %	0 %	0 %	409247067
47	NT_187118	GCC	3	9	2548	2556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247067
48	NT_187118	GC	3	6	2595	2600	0 %	0 %	50 %	50 %	409247067
49	NT_187118	GCG	2	6	2630	2635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247067
50	NT_187118	GCC	2	6	2681	2686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247067
51	NT_187118	CAC	2	6	2695	2700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247067
52	NT_187118	AG	3	6	2731	2736	50 %	0 %	50 %	0 %	409247067
53	NT_187118	CAC	3	9	2755	2763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247067
54	NT_187118	TGA	2	6	2808	2813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247067
55	NT_187118	CGC	2	6	2814	2819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247067
56	NT_187118	TTTG	2	8	2824	2831	0 %	75 %	25 %	0 %	409247067
57	NT_187118	AAC	2	6	2846	2851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247067
58	NT_187118	TAAGG	2	10	3031	3040	40 %	20 %	40 %	0 %	409247067
59	NT_187118	AAT	2	6	3316	3321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247068
60	NT_187118	TCA	2	6	3353	3358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247068
61	NT_187118	CTT	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247068
62	NT_187118	CATTTT	2	12	3472	3483	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	409247068
63	NT_187118	T	6	6	3480	3485	0 %	100 %	0 %	0 %	409247068
64	NT_187118	CCG	2	6	3543	3548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247068
65	NT_187118	GC	3	6	3654	3659	0 %	0 %	50 %	50 %	409247068
66	NT_187118	ACC	2	6	3704	3709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247068
67	NT_187118	TTA	2	6	3716	3721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247068
68	NT_187118	CCG	2	6	3744	3749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247068
69	NT_187118	GCA	2	6	3864	3869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247068
70	NT_187118	AAG	2	6	3895	3900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247068
71	NT_187118	ATT	2	6	3957	3962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247069
72	NT_187118	AG	3	6	3971	3976	50 %	0 %	50 %	0 %	409247069
73	NT_187118	TCA	2	6	4005	4010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247069
74	NT_187118	CGC	2	6	4011	4016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247069
75	NT_187118	T	6	6	4073	4078	0 %	100 %	0 %	0 %	409247069
76	NT_187118	CTG	2	6	4118	4123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247069
77	NT_187118	TCT	2	6	4197	4202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247069
78	NT_187118	CAGC	2	8	4207	4214	25 %	0 %	25 %	50 %	409247069
79	NT_187118	AGG	2	6	4230	4235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409247069
80	NT_187118	CGG	2	6	4273	4278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247069
81	NT_187118	A	6	6	4365	4370	100 %	0 %	0 %	0 %	409247069
82	NT_187118	GCT	2	6	4426	4431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247069
83	NT_187118	TTC	2	6	4454	4459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247069
84	NT_187118	ACG	2	6	4545	4550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247069
85	NT_187118	TTAT	2	8	4666	4673	25 %	75 %	0 %	0 %	409247070
86	NT_187118	TAA	2	6	4674	4679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247070
87	NT_187118	T	6	6	4702	4707	0 %	100 %	0 %	0 %	409247070
88	NT_187118	CAG	3	9	4795	4803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247070
89	NT_187118	GA	3	6	4809	4814	50 %	0 %	50 %	0 %	409247070
90	NT_187118	CCA	2	6	4857	4862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247070
91	NT_187118	CG	3	6	4907	4912	0 %	0 %	50 %	50 %	409247070
92	NT_187118	AG	3	6	4927	4932	50 %	0 %	50 %	0 %	409247070
93	NT_187118	CCG	3	9	4943	4951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247070
94	NT_187118	CGA	2	6	4962	4967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247070
95	NT_187118	CTT	2	6	5010	5015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247070
96	NT_187118	CAG	2	6	5047	5052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247070
97	NT_187118	AACTTC	2	12	5092	5103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247070
98	NT_187118	GAT	2	6	5149	5154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247070
99	NT_187118	GTTT	2	8	5178	5185	0 %	75 %	25 %	0 %	409247070
100	NT_187118	T	6	6	5203	5208	0 %	100 %	0 %	0 %	409247070
101	NT_187118	CCG	2	6	5217	5222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247070
102	NT_187118	GGT	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247070
103	NT_187118	CACG	2	8	5263	5270	25 %	0 %	25 %	50 %	409247070
104	NT_187118	CTG	2	6	5293	5298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247070
105	NT_187118	CGTTAA	2	12	5322	5333	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	409247070
106	NT_187118	TAC	2	6	5386	5391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247070
107	NT_187118	T	6	6	5540	5545	0 %	100 %	0 %	0 %	409247070
108	NT_187118	ACC	2	6	5572	5577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247070
109	NT_187118	AGC	2	6	5578	5583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247070
110	NT_187118	AAG	2	6	6038	6043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247071
111	NT_187118	CTC	2	6	6067	6072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409247071
112	NT_187118	AGA	2	6	6075	6080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247071
113	NT_187118	ATCA	2	8	6139	6146	50 %	25 %	0 %	25 %	409247071
114	NT_187118	AAATGG	2	12	6203	6214	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409247071
115	NT_187118	CAA	2	6	6245	6250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247071
116	NT_187118	ACG	2	6	6293	6298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247071
117	NT_187118	GTG	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409247071
118	NT_187118	CTG	2	6	6349	6354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247071
119	NT_187118	CGA	2	6	6399	6404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247071
120	NT_187118	ATGA	2	8	6598	6605	50 %	25 %	25 %	0 %	409247072
121	NT_187118	A	7	7	6612	6618	100 %	0 %	0 %	0 %	409247072
122	NT_187118	T	6	6	6635	6640	0 %	100 %	0 %	0 %	409247072
123	NT_187118	GATT	2	8	6645	6652	25 %	50 %	25 %	0 %	409247072
124	NT_187118	T	6	6	6661	6666	0 %	100 %	0 %	0 %	409247072
125	NT_187118	GCG	2	6	6675	6680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247072
126	NT_187118	TC	3	6	6898	6903	0 %	50 %	0 %	50 %	409247073
127	NT_187118	CGC	2	6	6916	6921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247073
128	NT_187118	ATCGG	2	10	6962	6971	20 %	20 %	40 %	20 %	409247073
129	NT_187118	TCAG	2	8	6974	6981	25 %	25 %	25 %	25 %	409247073
130	NT_187118	A	6	6	7025	7030	100 %	0 %	0 %	0 %	409247073
131	NT_187118	GCA	2	6	7080	7085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247073
132	NT_187118	CT	3	6	7266	7271	0 %	50 %	0 %	50 %	409247074
133	NT_187118	TCG	2	6	7390	7395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247074
134	NT_187118	CAT	2	6	7430	7435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247074
135	NT_187118	AAG	2	6	7444	7449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409247074
136	NT_187118	CCG	2	6	7468	7473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247074
137	NT_187118	GCC	2	6	7570	7575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247075
138	NT_187118	CTT	2	6	7585	7590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409247075
139	NT_187118	TCA	2	6	7596	7601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247075
140	NT_187118	CAGG	2	8	7642	7649	25 %	0 %	50 %	25 %	409247075
141	NT_187118	GAAC	2	8	7651	7658	50 %	0 %	25 %	25 %	409247075
142	NT_187118	A	7	7	7955	7961	100 %	0 %	0 %	0 %	409247076
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145	NT_187118	ATC	2	6	8144	8149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247077
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149	NT_187118	ATC	2	6	8259	8264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247077
150	NT_187118	TCA	2	6	8308	8313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409247077
151	NT_187118	GCAG	2	8	8337	8344	25 %	0 %	50 %	25 %	409247077
152	NT_187118	ACG	2	6	8357	8362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247077
153	NT_187118	GTC	2	6	8373	8378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247077
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163	NT_187118	CAC	2	6	8789	8794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247077
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250	NT_187118	CCG	4	12	13170	13181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247081
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260	NT_187118	CGC	2	6	13567	13572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247081
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264	NT_187118	CGC	2	6	13748	13753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247081
265	NT_187118	GTT	2	6	13844	13849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247081
266	NT_187118	CTTT	2	8	13941	13948	0 %	75 %	0 %	25 %	409247082
267	NT_187118	GCG	2	6	13978	13983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247082
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269	NT_187118	GGC	2	6	14054	14059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247082
270	NT_187118	CCG	2	6	14065	14070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247082
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273	NT_187118	GCA	2	6	14326	14331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409247082
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287	NT_187118	GC	3	6	15088	15093	0 %	0 %	50 %	50 %	409247082
288	NT_187118	TTG	2	6	15125	15130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409247082
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298	NT_187118	TTA	2	6	15675	15680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409247082
299	NT_187118	GCG	2	6	15805	15810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409247082
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373	NT_187118	CGC	2	6	19471	19476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409247084
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380	NT_187118	CG	3	6	19642	19647	0 %	0 %	50 %	50 %	409247084
381	NT_187118	CG	3	6	19744	19749	0 %	0 %	50 %	50 %	409247084
382	NT_187118	AAC	2	6	19757	19762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409247084
383	NT_187118	CTG	2	6	19766	19771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247084
384	NT_187118	AAT	2	6	19845	19850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247084
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386	NT_187118	ACTAC	2	10	19973	19982	40 %	20 %	0 %	40 %	409247085
387	NT_187118	AAT	2	6	20041	20046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409247085
388	NT_187118	ACC	2	6	20072	20077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409247085
389	NT_187118	CTG	2	6	20083	20088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409247085
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391	NT_187118	TGA	2	6	20184	20189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409247085
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