MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 4744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187117	CCAA	2	8	98	105	50 %	0 %	0 %	50 %	409246808
2	NT_187117	TCT	2	6	119	124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246808
3	NT_187117	CTG	2	6	160	165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246808
4	NT_187117	ACC	2	6	214	219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246808
5	NT_187117	GCC	3	9	250	258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246808
6	NT_187117	CTG	2	6	331	336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246808
7	NT_187117	GCAC	2	8	344	351	25 %	0 %	25 %	50 %	409246808
8	NT_187117	CCGT	2	8	383	390	0 %	25 %	25 %	50 %	409246808
9	NT_187117	TGC	2	6	462	467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246808
10	NT_187117	GAT	2	6	487	492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246808
11	NT_187117	CG	3	6	522	527	0 %	0 %	50 %	50 %	409246808
12	NT_187117	TCA	2	6	539	544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246808
13	NT_187117	GC	3	6	555	560	0 %	0 %	50 %	50 %	409246808
14	NT_187117	GCG	2	6	602	607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246808
15	NT_187117	GCC	2	6	779	784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246808
16	NT_187117	AGC	2	6	785	790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246808
17	NT_187117	CAT	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246808
18	NT_187117	TTA	2	6	851	856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246809
19	NT_187117	CCA	2	6	860	865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246809
20	NT_187117	CTT	2	6	892	897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246809
21	NT_187117	GC	3	6	905	910	0 %	0 %	50 %	50 %	409246809
22	NT_187117	TTC	2	6	941	946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246809
23	NT_187117	CCAGG	2	10	986	995	20 %	0 %	40 %	40 %	409246809
24	NT_187117	TTA	2	6	1020	1025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246809
25	NT_187117	TAA	2	6	1042	1047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246809
26	NT_187117	T	7	7	1144	1150	0 %	100 %	0 %	0 %	409246809
27	NT_187117	GAC	3	9	1156	1164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246809
28	NT_187117	ATT	2	6	1179	1184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246809
29	NT_187117	GTT	2	6	1236	1241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246810
30	NT_187117	CT	3	6	1289	1294	0 %	50 %	0 %	50 %	409246810
31	NT_187117	AGA	2	6	1318	1323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246810
32	NT_187117	GTCG	2	8	1360	1367	0 %	25 %	50 %	25 %	409246810
33	NT_187117	CGC	2	6	1380	1385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246810
34	NT_187117	TAT	2	6	1443	1448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246810
35	NT_187117	CGT	2	6	1536	1541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246810
36	NT_187117	GC	3	6	1645	1650	0 %	0 %	50 %	50 %	409246810
37	NT_187117	TCGCCA	2	12	1653	1664	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409246810
38	NT_187117	GA	3	6	1666	1671	50 %	0 %	50 %	0 %	409246810
39	NT_187117	AAC	2	6	1721	1726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246810
40	NT_187117	AGT	2	6	1776	1781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246810
41	NT_187117	CGA	2	6	1823	1828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246810
42	NT_187117	TCA	2	6	1865	1870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246810
43	NT_187117	CGT	2	6	1887	1892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246810
44	NT_187117	CAA	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246811
45	NT_187117	GAC	2	6	2188	2193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246811
46	NT_187117	GC	3	6	2222	2227	0 %	0 %	50 %	50 %	409246811
47	NT_187117	CG	4	8	2306	2313	0 %	0 %	50 %	50 %	409246811
48	NT_187117	GCG	2	6	2327	2332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246811
49	NT_187117	CGC	2	6	2386	2391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246811
50	NT_187117	CCG	2	6	2415	2420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246811
51	NT_187117	TC	3	6	2428	2433	0 %	50 %	0 %	50 %	409246811
52	NT_187117	A	7	7	2521	2527	100 %	0 %	0 %	0 %	409246811
53	NT_187117	GAGC	2	8	2554	2561	25 %	0 %	50 %	25 %	409246811
54	NT_187117	GAT	2	6	2602	2607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246811
55	NT_187117	CGC	2	6	2680	2685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246811
56	NT_187117	TGGC	2	8	2870	2877	0 %	25 %	50 %	25 %	409246811
57	NT_187117	CA	3	6	2927	2932	50 %	0 %	0 %	50 %	409246811
58	NT_187117	GTC	2	6	2977	2982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246811
59	NT_187117	GC	3	6	3009	3014	0 %	0 %	50 %	50 %	409246811
60	NT_187117	CCG	2	6	3035	3040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246811
61	NT_187117	GGC	2	6	3052	3057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246811
62	NT_187117	CAG	2	6	3077	3082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246811
63	NT_187117	T	6	6	3147	3152	0 %	100 %	0 %	0 %	409246812
64	NT_187117	GCA	2	6	3259	3264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246812
65	NT_187117	ATG	2	6	3302	3307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246812
66	NT_187117	CTG	2	6	3326	3331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246812
67	NT_187117	A	6	6	3401	3406	100 %	0 %	0 %	0 %	409246812
68	NT_187117	ATG	2	6	3522	3527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246813
69	NT_187117	A	6	6	3528	3533	100 %	0 %	0 %	0 %	409246813
70	NT_187117	A	6	6	3588	3593	100 %	0 %	0 %	0 %	409246813
71	NT_187117	CAA	2	6	3662	3667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246813
72	NT_187117	TGA	2	6	3767	3772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246813
73	NT_187117	ATT	2	6	3834	3839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246813
74	NT_187117	GAC	2	6	3858	3863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246813
75	NT_187117	TAT	2	6	4040	4045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246813
76	NT_187117	ACC	2	6	4075	4080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246813
77	NT_187117	CG	3	6	4089	4094	0 %	0 %	50 %	50 %	409246813
78	NT_187117	GGT	2	6	4232	4237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246813
79	NT_187117	AAT	2	6	4359	4364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246813
80	NT_187117	GGC	2	6	4428	4433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246813
81	NT_187117	GCAG	2	8	4434	4441	25 %	0 %	50 %	25 %	409246813
82	NT_187117	ACC	2	6	4527	4532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246813
83	NT_187117	CATC	2	8	4536	4543	25 %	25 %	0 %	50 %	409246813
84	NT_187117	CGC	2	6	4554	4559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246813
85	NT_187117	CGC	2	6	4596	4601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246813
86	NT_187117	CT	3	6	4851	4856	0 %	50 %	0 %	50 %	409246814
87	NT_187117	TCTG	2	8	4867	4874	0 %	50 %	25 %	25 %	409246814
88	NT_187117	GCC	2	6	4971	4976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246814
89	NT_187117	GTC	2	6	5052	5057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246814
90	NT_187117	TGAC	2	8	5209	5216	25 %	25 %	25 %	25 %	409246814
91	NT_187117	CTG	2	6	5334	5339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246814
92	NT_187117	TTTACC	2	12	5346	5357	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	409246814
93	NT_187117	TCT	2	6	5467	5472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246814
94	NT_187117	ATG	2	6	5475	5480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246814
95	NT_187117	GCA	2	6	5573	5578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246814
96	NT_187117	TGA	2	6	5587	5592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246814
97	NT_187117	TTC	2	6	5640	5645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246814
98	NT_187117	TGC	2	6	5698	5703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246814
99	NT_187117	CTG	2	6	5751	5756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246814
100	NT_187117	GAT	2	6	5765	5770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246814
101	NT_187117	CTT	2	6	5792	5797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246814
102	NT_187117	AAG	2	6	5827	5832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246814
103	NT_187117	GC	3	6	5854	5859	0 %	0 %	50 %	50 %	409246814
104	NT_187117	TGA	3	9	5872	5880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246814
105	NT_187117	GGC	2	6	5904	5909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246814
106	NT_187117	GTG	2	6	5925	5930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246814
107	NT_187117	CGG	2	6	6052	6057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246814
108	NT_187117	CATCGG	2	12	6177	6188	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	409246815
109	NT_187117	TA	3	6	6195	6200	50 %	50 %	0 %	0 %	409246815
110	NT_187117	A	6	6	6257	6262	100 %	0 %	0 %	0 %	409246815
111	NT_187117	GCGCC	2	10	6270	6279	0 %	0 %	40 %	60 %	409246815
112	NT_187117	CAC	2	6	6298	6303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246815
113	NT_187117	CGG	2	6	6316	6321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246815
114	NT_187117	GCA	2	6	6341	6346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246815
115	NT_187117	CGC	2	6	6387	6392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246815
116	NT_187117	CTTT	2	8	6443	6450	0 %	75 %	0 %	25 %	409246815
117	NT_187117	GCG	2	6	6588	6593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246815
118	NT_187117	CGG	2	6	6663	6668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246815
119	NT_187117	GCCAT	2	10	6862	6871	20 %	20 %	20 %	40 %	409246815
120	NT_187117	GAA	2	6	6892	6897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246815
121	NT_187117	ACG	2	6	6898	6903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246815
122	NT_187117	TGCC	2	8	6931	6938	0 %	25 %	25 %	50 %	409246815
123	NT_187117	ACC	2	6	6953	6958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246815
124	NT_187117	CG	3	6	7007	7012	0 %	0 %	50 %	50 %	409246815
125	NT_187117	GGC	2	6	7044	7049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246815
126	NT_187117	GTT	2	6	7141	7146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246815
127	NT_187117	T	6	6	7195	7200	0 %	100 %	0 %	0 %	409246815
128	NT_187117	CAT	2	6	7312	7317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246815
129	NT_187117	CCA	2	6	7389	7394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246815
130	NT_187117	ACGGA	2	10	7450	7459	40 %	0 %	40 %	20 %	409246815
131	NT_187117	TCACG	2	10	7485	7494	20 %	20 %	20 %	40 %	409246815
132	NT_187117	TCA	2	6	7517	7522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246815
133	NT_187117	CGC	2	6	7567	7572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246815
134	NT_187117	GTG	2	6	7615	7620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246815
135	NT_187117	ATT	2	6	7633	7638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246815
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266	NT_187117	GCA	2	6	15243	15248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246828
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268	NT_187117	CGA	2	6	15481	15486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246828
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273	NT_187117	GGT	2	6	15798	15803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246828
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277	NT_187117	TGT	2	6	15938	15943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246828
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382	NT_187117	CTGG	2	8	22318	22325	0 %	25 %	50 %	25 %	409246834
383	NT_187117	CGGCA	2	10	22417	22426	20 %	0 %	40 %	40 %	409246834
384	NT_187117	TCA	2	6	22427	22432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246834
385	NT_187117	C	6	6	22448	22453	0 %	0 %	0 %	100 %	409246834
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388	NT_187117	CCTT	2	8	22607	22614	0 %	50 %	0 %	50 %	409246834
389	NT_187117	ACC	2	6	22632	22637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246834
390	NT_187117	CGGG	2	8	22691	22698	0 %	0 %	75 %	25 %	409246834
391	NT_187117	ATC	2	6	22813	22818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246834
392	NT_187117	ATA	2	6	22832	22837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246834
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394	NT_187117	TG	3	6	22860	22865	0 %	50 %	50 %	0 %	409246834
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