MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 5500

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NT_187115	AAG	2	6	188257	188262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246685
3502	NT_187115	GAT	2	6	188301	188306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246685
3503	NT_187115	CTT	2	6	188366	188371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246685
3504	NT_187115	GCG	2	6	188384	188389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246685
3505	NT_187115	CTG	2	6	188415	188420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246685
3506	NT_187115	GGC	2	6	188661	188666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246685
3507	NT_187115	TCG	2	6	188677	188682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246685
3508	NT_187115	ACC	2	6	188767	188772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246685
3509	NT_187115	CGC	2	6	188805	188810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246685
3510	NT_187115	AG	3	6	188836	188841	50 %	0 %	50 %	0 %	409246685
3511	NT_187115	GCA	2	6	188945	188950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246685
3512	NT_187115	TCA	2	6	188962	188967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246685
3513	NT_187115	ATC	2	6	188992	188997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246685
3514	NT_187115	CAT	2	6	189048	189053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246685
3515	NT_187115	TCC	2	6	189088	189093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246685
3516	NT_187115	CGT	2	6	189098	189103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246685
3517	NT_187115	CAG	2	6	189120	189125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246685
3518	NT_187115	TTG	2	6	189184	189189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246685
3519	NT_187115	GCC	2	6	189210	189215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246685
3520	NT_187115	GCC	2	6	189220	189225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246685
3521	NT_187115	GCTGA	2	10	189231	189240	20 %	20 %	40 %	20 %	409246685
3522	NT_187115	ATC	2	6	189453	189458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246685
3523	NT_187115	TGC	2	6	189511	189516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246685
3524	NT_187115	TTA	2	6	189583	189588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246685
3525	NT_187115	GC	3	6	189618	189623	0 %	0 %	50 %	50 %	409246685
3526	NT_187115	GCG	2	6	189629	189634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246685
3527	NT_187115	TCA	2	6	189635	189640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246685
3528	NT_187115	CGC	2	6	189690	189695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246685
3529	NT_187115	GCCA	2	8	189736	189743	25 %	0 %	25 %	50 %	409246685
3530	NT_187115	ACGTA	2	10	189843	189852	40 %	20 %	20 %	20 %	409246685
3531	NT_187115	TCA	2	6	189883	189888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246685
3532	NT_187115	TCAG	2	8	189907	189914	25 %	25 %	25 %	25 %	409246685
3533	NT_187115	CGC	2	6	189935	189940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246685
3534	NT_187115	ATCGG	2	10	189955	189964	20 %	20 %	40 %	20 %	409246685
3535	NT_187115	AG	3	6	190011	190016	50 %	0 %	50 %	0 %	409246685
3536	NT_187115	TGC	2	6	190067	190072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246685
3537	NT_187115	GC	3	6	190079	190084	0 %	0 %	50 %	50 %	409246685
3538	NT_187115	GCA	2	6	190112	190117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246685
3539	NT_187115	AAT	2	6	190146	190151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246685
3540	NT_187115	TGA	2	6	190172	190177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246685
3541	NT_187115	T	6	6	190197	190202	0 %	100 %	0 %	0 %	409246685
3542	NT_187115	GCG	2	6	190234	190239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246685
3543	NT_187115	TTA	2	6	190267	190272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246685
3544	NT_187115	TCA	2	6	190289	190294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246685
3545	NT_187115	GCC	2	6	190380	190385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246685
3546	NT_187115	GC	3	6	190461	190466	0 %	0 %	50 %	50 %	409246685
3547	NT_187115	CGTTCG	2	12	190495	190506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246685
3548	NT_187115	T	6	6	190512	190517	0 %	100 %	0 %	0 %	409246685
3549	NT_187115	CGT	2	6	190574	190579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246685
3550	NT_187115	T	7	7	190684	190690	0 %	100 %	0 %	0 %	409246686
3551	NT_187115	TGA	2	6	190733	190738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246686
3552	NT_187115	CAC	2	6	190768	190773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246686
3553	NT_187115	CGGAT	2	10	190801	190810	20 %	20 %	40 %	20 %	409246686
3554	NT_187115	ACC	2	6	190820	190825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246686
3555	NT_187115	CAATAA	2	12	190945	190956	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	409246686
3556	NT_187115	TGC	2	6	190971	190976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246686
3557	NT_187115	TCA	2	6	190993	190998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246686
3558	NT_187115	CTTCGC	2	12	191274	191285	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	409246687
3559	NT_187115	CAT	2	6	191293	191298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246687
3560	NT_187115	ATC	2	6	191347	191352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246687
3561	NT_187115	GTC	2	6	191353	191358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3562	NT_187115	CAT	2	6	191367	191372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246687
3563	NT_187115	GCC	2	6	191404	191409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246687
3564	NT_187115	CGC	2	6	191559	191564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246687
3565	NT_187115	AAT	2	6	191639	191644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246687
3566	NT_187115	TCC	2	6	191648	191653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246687
3567	NT_187115	AGCC	2	8	191666	191673	25 %	0 %	25 %	50 %	409246687
3568	NT_187115	TGC	2	6	191756	191761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3569	NT_187115	CGG	2	6	191834	191839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246687
3570	NT_187115	CGT	2	6	191853	191858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3571	NT_187115	CT	3	6	191948	191953	0 %	50 %	0 %	50 %	409246687
3572	NT_187115	A	6	6	191986	191991	100 %	0 %	0 %	0 %	409246687
3573	NT_187115	GACT	2	8	192095	192102	25 %	25 %	25 %	25 %	409246687
3574	NT_187115	CGC	2	6	192103	192108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246687
3575	NT_187115	CT	3	6	192118	192123	0 %	50 %	0 %	50 %	409246687
3576	NT_187115	TCA	2	6	192221	192226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246687
3577	NT_187115	TCG	2	6	192239	192244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3578	NT_187115	CCA	2	6	192276	192281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246687
3579	NT_187115	TAT	2	6	192315	192320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246687
3580	NT_187115	TGGA	2	8	192323	192330	25 %	25 %	50 %	0 %	409246687
3581	NT_187115	CTG	2	6	192358	192363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3582	NT_187115	TCG	2	6	192401	192406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3583	NT_187115	TCA	2	6	192441	192446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246687
3584	NT_187115	CGT	2	6	192486	192491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3585	NT_187115	CAG	2	6	192499	192504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3586	NT_187115	CCG	2	6	192654	192659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246687
3587	NT_187115	CTG	2	6	192688	192693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3588	NT_187115	TCAA	2	8	192695	192702	50 %	25 %	0 %	25 %	409246687
3589	NT_187115	GAA	2	6	192736	192741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246687
3590	NT_187115	CGC	2	6	192806	192811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246687
3591	NT_187115	CAG	2	6	192829	192834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3592	NT_187115	CAG	2	6	192934	192939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3593	NT_187115	TGC	2	6	192968	192973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3594	NT_187115	CTT	2	6	193068	193073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246687
3595	NT_187115	AAC	2	6	193112	193117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246687
3596	NT_187115	TGAC	2	8	193192	193199	25 %	25 %	25 %	25 %	409246687
3597	NT_187115	CCG	2	6	193204	193209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246687
3598	NT_187115	GC	3	6	193245	193250	0 %	0 %	50 %	50 %	409246687
3599	NT_187115	CCA	2	6	193296	193301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246687
3600	NT_187115	CG	3	6	193314	193319	0 %	0 %	50 %	50 %	409246687
3601	NT_187115	CAG	2	6	193351	193356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3602	NT_187115	AG	3	6	193408	193413	50 %	0 %	50 %	0 %	409246687
3603	NT_187115	CTC	2	6	193462	193467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246687
3604	NT_187115	CGCC	2	8	193476	193483	0 %	0 %	25 %	75 %	409246687
3605	NT_187115	CAA	2	6	193551	193556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246687
3606	NT_187115	AAC	2	6	193703	193708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246687
3607	NT_187115	GAC	2	6	193734	193739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3608	NT_187115	GCCA	2	8	193760	193767	25 %	0 %	25 %	50 %	409246687
3609	NT_187115	C	6	6	193785	193790	0 %	0 %	0 %	100 %	409246687
3610	NT_187115	GGT	2	6	193927	193932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246687
3611	NT_187115	GCG	2	6	194000	194005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246687
3612	NT_187115	CCA	2	6	194013	194018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246687
3613	NT_187115	GCG	2	6	194031	194036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246687
3614	NT_187115	CGG	2	6	194136	194141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246687
3615	NT_187115	CG	4	8	194142	194149	0 %	0 %	50 %	50 %	409246687
3616	NT_187115	GTC	2	6	194179	194184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3617	NT_187115	GCA	2	6	194199	194204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3618	NT_187115	GCA	2	6	194235	194240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246687
3619	NT_187115	TCA	2	6	194244	194249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246687
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3621	NT_187115	CTTT	2	8	194282	194289	0 %	75 %	0 %	25 %	409246687
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3742	NT_187115	CG	3	6	200278	200283	0 %	0 %	50 %	50 %	409246695
3743	NT_187115	CTC	2	6	200290	200295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246695
3744	NT_187115	CCA	2	6	200370	200375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246695
3745	NT_187115	CGA	2	6	200379	200384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246695
3746	NT_187115	TCA	2	6	200390	200395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246695
3747	NT_187115	T	6	6	200425	200430	0 %	100 %	0 %	0 %	409246695
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3751	NT_187115	CTG	2	6	200798	200803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246696
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3754	NT_187115	CTT	2	6	200976	200981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246696
3755	NT_187115	TCA	2	6	201137	201142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246696
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3763	NT_187115	GCG	2	6	202140	202145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246698
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3766	NT_187115	CGC	2	6	202248	202253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246698
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3771	NT_187115	GCT	2	6	202489	202494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246698
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3773	NT_187115	CTGG	2	8	202739	202746	0 %	25 %	50 %	25 %	409246699
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3778	NT_187115	GGC	3	9	202865	202873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246699
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3842	NT_187115	GCT	2	6	206401	206406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246703
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3864	NT_187115	CCG	2	6	207577	207582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246703
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3973	NT_187115	GCT	2	6	214050	214055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246708
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3977	NT_187115	GAT	2	6	214436	214441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246709
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3980	NT_187115	CAT	2	6	214568	214573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246709
3981	NT_187115	GA	3	6	214596	214601	50 %	0 %	50 %	0 %	409246709
3982	NT_187115	AGTC	2	8	214751	214758	25 %	25 %	25 %	25 %	409246709
3983	NT_187115	ACC	2	6	214761	214766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246709
3984	NT_187115	GTG	2	6	214791	214796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246709
3985	NT_187115	GCG	2	6	214822	214827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246709
3986	NT_187115	ATG	2	6	214839	214844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246709
3987	NT_187115	CTG	2	6	214859	214864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246709
3988	NT_187115	AGC	2	6	214875	214880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246709
3989	NT_187115	CGGCG	2	10	214894	214903	0 %	0 %	60 %	40 %	409246709
3990	NT_187115	AAT	2	6	214923	214928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246709
3991	NT_187115	CCCT	2	8	214934	214941	0 %	25 %	0 %	75 %	409246709
3992	NT_187115	TCA	2	6	214977	214982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246709
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3994	NT_187115	GCA	2	6	215014	215019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246709
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3997	NT_187115	GCAG	2	8	215106	215113	25 %	0 %	50 %	25 %	409246709
3998	NT_187115	CG	3	6	215132	215137	0 %	0 %	50 %	50 %	409246709
3999	NT_187115	A	6	6	215172	215177	100 %	0 %	0 %	0 %	409246709
4000	NT_187115	ATAC	2	8	215210	215217	50 %	25 %	0 %	25 %	409246709

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