MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 5500

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NT_187115	CCA	2	6	271976	271981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246772
5002	NT_187115	GCA	2	6	271992	271997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246772
5003	NT_187115	CGCCAT	2	12	272140	272151	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	409246772
5004	NT_187115	CGG	2	6	272166	272171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246772
5005	NT_187115	GC	3	6	272198	272203	0 %	0 %	50 %	50 %	409246772
5006	NT_187115	TGA	2	6	272232	272237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246772
5007	NT_187115	CTG	2	6	272275	272280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246772
5008	NT_187115	ACA	2	6	272289	272294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246772
5009	NT_187115	TC	3	6	272314	272319	0 %	50 %	0 %	50 %	409246772
5010	NT_187115	TGGC	2	8	272496	272503	0 %	25 %	50 %	25 %	409246773
5011	NT_187115	GGCC	2	8	272552	272559	0 %	0 %	50 %	50 %	409246773
5012	NT_187115	CGC	3	9	272630	272638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246773
5013	NT_187115	CGG	2	6	272731	272736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246773
5014	NT_187115	CGC	2	6	272819	272824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246773
5015	NT_187115	TGG	2	6	272836	272841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246773
5016	NT_187115	GCC	2	6	272867	272872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246773
5017	NT_187115	CTGG	2	8	272936	272943	0 %	25 %	50 %	25 %	409246773
5018	NT_187115	CGT	2	6	272969	272974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246773
5019	NT_187115	GGT	2	6	273020	273025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246773
5020	NT_187115	CAT	2	6	273059	273064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246773
5021	NT_187115	TCCGCC	2	12	273182	273193	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	409246774
5022	NT_187115	TCC	2	6	273202	273207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246774
5023	NT_187115	CCG	2	6	273246	273251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246774
5024	NT_187115	AATA	2	8	273259	273266	75 %	25 %	0 %	0 %	409246774
5025	NT_187115	CG	3	6	273292	273297	0 %	0 %	50 %	50 %	409246774
5026	NT_187115	TC	3	6	273301	273306	0 %	50 %	0 %	50 %	409246774
5027	NT_187115	TTCC	2	8	273327	273334	0 %	50 %	0 %	50 %	409246774
5028	NT_187115	GTCG	2	8	273390	273397	0 %	25 %	50 %	25 %	409246774
5029	NT_187115	GC	3	6	273474	273479	0 %	0 %	50 %	50 %	409246774
5030	NT_187115	ATG	2	6	273496	273501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246774
5031	NT_187115	CCAG	2	8	273507	273514	25 %	0 %	25 %	50 %	409246774
5032	NT_187115	CCAT	2	8	273533	273540	25 %	25 %	0 %	50 %	409246774
5033	NT_187115	GA	4	8	273579	273586	50 %	0 %	50 %	0 %	409246774
5034	NT_187115	GGT	2	6	273598	273603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409246774
5035	NT_187115	GCG	2	6	273627	273632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246774
5036	NT_187115	GTT	2	6	273687	273692	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246774
5037	NT_187115	TCA	3	9	273722	273730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246774
5038	NT_187115	GC	3	6	273893	273898	0 %	0 %	50 %	50 %	409246775
5039	NT_187115	GTC	2	6	273957	273962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246775
5040	NT_187115	TCA	2	6	274147	274152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246775
5041	NT_187115	CGT	2	6	274212	274217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246775
5042	NT_187115	ATT	2	6	274233	274238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409246775
5043	NT_187115	TCT	2	6	274267	274272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246775
5044	NT_187115	CGT	2	6	274278	274283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246775
5045	NT_187115	AG	3	6	274513	274518	50 %	0 %	50 %	0 %	409246776
5046	NT_187115	TGCG	2	8	274564	274571	0 %	25 %	50 %	25 %	409246776
5047	NT_187115	CGC	2	6	274610	274615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246776
5048	NT_187115	CAGC	2	8	274655	274662	25 %	0 %	25 %	50 %	409246776
5049	NT_187115	TTC	2	6	274701	274706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246776
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5051	NT_187115	AGC	2	6	274777	274782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246776
5052	NT_187115	GC	3	6	274841	274846	0 %	0 %	50 %	50 %	409246776
5053	NT_187115	GCC	2	6	274903	274908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246776
5054	NT_187115	TCC	2	6	275008	275013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246776
5055	NT_187115	TTTA	2	8	275019	275026	25 %	75 %	0 %	0 %	409246776
5056	NT_187115	CCT	2	6	275261	275266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246776
5057	NT_187115	CAGC	2	8	275366	275373	25 %	0 %	25 %	50 %	409246776
5058	NT_187115	CGC	2	6	275393	275398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246776
5059	NT_187115	TGC	2	6	275424	275429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246776
5060	NT_187115	CAT	2	6	275466	275471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246776
5061	NT_187115	GCC	2	6	275472	275477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246776
5062	NT_187115	CAG	2	6	275504	275509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246777
5063	NT_187115	AAC	2	6	275574	275579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246777
5064	NT_187115	CTT	2	6	275651	275656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246777
5065	NT_187115	CCG	2	6	275658	275663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246777
5066	NT_187115	CCA	2	6	275709	275714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246777
5067	NT_187115	ATGA	2	8	275727	275734	50 %	25 %	25 %	0 %	409246777
5068	NT_187115	ATC	2	6	275780	275785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246777
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5070	NT_187115	TGT	2	6	275821	275826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409246777
5071	NT_187115	ACG	2	6	275931	275936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246777
5072	NT_187115	CGG	2	6	275944	275949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246777
5073	NT_187115	CAT	2	6	275962	275967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246777
5074	NT_187115	GCA	2	6	276003	276008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246777
5075	NT_187115	CGG	2	6	276058	276063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246777
5076	NT_187115	GCA	2	6	276076	276081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246777
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5078	NT_187115	ACC	2	6	276120	276125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246777
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5080	NT_187115	AATC	2	8	276163	276170	50 %	25 %	0 %	25 %	409246777
5081	NT_187115	CCG	2	6	276216	276221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246777
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5084	NT_187115	CAG	2	6	276427	276432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246777
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5086	NT_187115	T	6	6	276482	276487	0 %	100 %	0 %	0 %	409246777
5087	NT_187115	TCAG	2	8	276495	276502	25 %	25 %	25 %	25 %	409246777
5088	NT_187115	T	6	6	276504	276509	0 %	100 %	0 %	0 %	409246777
5089	NT_187115	AAT	2	6	276521	276526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246777
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5092	NT_187115	AG	3	6	276620	276625	50 %	0 %	50 %	0 %	409246777
5093	NT_187115	AT	3	6	276716	276721	50 %	50 %	0 %	0 %	409246777
5094	NT_187115	AGC	2	6	276722	276727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246777
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5096	NT_187115	TCA	2	6	276794	276799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246778
5097	NT_187115	TAA	2	6	276825	276830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246778
5098	NT_187115	ATA	2	6	276890	276895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246778
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5100	NT_187115	CGG	2	6	276968	276973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246778
5101	NT_187115	CTT	2	6	277059	277064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409246778
5102	NT_187115	T	6	6	277128	277133	0 %	100 %	0 %	0 %	409246778
5103	NT_187115	ATA	2	6	277157	277162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246778
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5105	NT_187115	GCC	2	6	277273	277278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246778
5106	NT_187115	CAG	2	6	277282	277287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246778
5107	NT_187115	CCG	2	6	277313	277318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246778
5108	NT_187115	TCA	2	6	277347	277352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409246778
5109	NT_187115	AGC	2	6	277457	277462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246778
5110	NT_187115	CCA	2	6	277491	277496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246778
5111	NT_187115	ATA	2	6	277546	277551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409246778
5112	NT_187115	CAG	2	6	277612	277617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246778
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5117	NT_187115	CGG	2	6	277770	277775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246778
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5119	NT_187115	CCG	2	6	277820	277825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409246778
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5122	NT_187115	AATA	2	8	278029	278036	75 %	25 %	0 %	0 %	409246778
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5242	NT_187115	AGT	2	6	285040	285045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246785
5243	NT_187115	CCA	2	6	285053	285058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409246785
5244	NT_187115	GCA	2	6	285076	285081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246785
5245	NT_187115	CCT	2	6	285112	285117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409246785
5246	NT_187115	GTA	2	6	285127	285132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409246785
5247	NT_187115	CTG	2	6	285145	285150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246785
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5253	NT_187115	CGT	2	6	285652	285657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246787
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5255	NT_187115	A	7	7	285704	285710	100 %	0 %	0 %	0 %	409246787
5256	NT_187115	A	7	7	285790	285796	100 %	0 %	0 %	0 %	409246787
5257	NT_187115	GAA	2	6	285811	285816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409246787
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5262	NT_187115	GCA	2	6	286537	286542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246788
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5272	NT_187115	GGC	2	6	286834	286839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246788
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5274	NT_187115	CTG	2	6	286938	286943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246788
5275	NT_187115	CTG	2	6	286955	286960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246788
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5342	NT_187115	ATCG	2	8	290764	290771	25 %	25 %	25 %	25 %	409246792
5343	NT_187115	CAG	2	6	290855	290860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409246792
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5347	NT_187115	CG	3	6	290988	290993	0 %	0 %	50 %	50 %	409246792
5348	NT_187115	CTGCCG	2	12	291014	291025	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409246792
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5352	NT_187115	CA	3	6	291256	291261	50 %	0 %	0 %	50 %	409246793
5353	NT_187115	AAGA	2	8	291270	291277	75 %	0 %	25 %	0 %	409246793
5354	NT_187115	TGC	2	6	291292	291297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246793
5355	NT_187115	CGT	2	6	291309	291314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246793
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5358	NT_187115	TTTA	2	8	291504	291511	25 %	75 %	0 %	0 %	409246793
5359	NT_187115	CAA	2	6	291560	291565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409246793
5360	NT_187115	GCG	2	6	291718	291723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409246793
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5362	NT_187115	GTC	2	6	291858	291863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409246793
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