MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187110	TCT	3	9	498	506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251171
2	NT_187110	GCA	2	6	541	546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251171
3	NT_187110	A	6	6	557	562	100 %	0 %	0 %	0 %	409251171
4	NT_187110	CAA	2	6	569	574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251171
5	NT_187110	CAC	2	6	589	594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251171
6	NT_187110	TGA	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251172
7	NT_187110	A	9	9	859	867	100 %	0 %	0 %	0 %	409251172
8	NT_187110	TTTG	2	8	883	890	0 %	75 %	25 %	0 %	409251172
9	NT_187110	CGC	2	6	934	939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251172
10	NT_187110	A	7	7	1043	1049	100 %	0 %	0 %	0 %	409251172
11	NT_187110	GCGG	2	8	1085	1092	0 %	0 %	75 %	25 %	409251172
12	NT_187110	TAC	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251172
13	NT_187110	GGC	2	6	1151	1156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251172
14	NT_187110	GCG	2	6	1172	1177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251172
15	NT_187110	AAG	2	6	1230	1235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251172
16	NT_187110	ACC	2	6	1283	1288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251172
17	NT_187110	GAA	2	6	1384	1389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251173
18	NT_187110	TCT	3	9	1436	1444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251173
19	NT_187110	GCG	2	6	1460	1465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251173
20	NT_187110	A	6	6	1489	1494	100 %	0 %	0 %	0 %	409251173
21	NT_187110	GAA	2	6	1496	1501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251173
22	NT_187110	ACAG	2	8	1503	1510	50 %	0 %	25 %	25 %	409251173
23	NT_187110	AGC	2	6	1590	1595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251173
24	NT_187110	GCAA	2	8	1630	1637	50 %	0 %	25 %	25 %	409251173
25	NT_187110	GC	3	6	1667	1672	0 %	0 %	50 %	50 %	409251173
26	NT_187110	TCG	2	6	1696	1701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251173
27	NT_187110	CAGA	2	8	1802	1809	50 %	0 %	25 %	25 %	409251173
28	NT_187110	ATCT	2	8	1842	1849	25 %	50 %	0 %	25 %	409251173
29	NT_187110	CTG	2	6	1865	1870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251173
30	NT_187110	AAG	2	6	2234	2239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251174
31	NT_187110	TA	3	6	2246	2251	50 %	50 %	0 %	0 %	409251174
32	NT_187110	ATG	2	6	2295	2300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251174
33	NT_187110	ATC	2	6	2325	2330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251174
34	NT_187110	TAC	2	6	2361	2366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251174
35	NT_187110	CATGG	2	10	2369	2378	20 %	20 %	40 %	20 %	409251174
36	NT_187110	TTG	2	6	2397	2402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251174
37	NT_187110	CAA	2	6	2443	2448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251174
38	NT_187110	AGC	2	6	2459	2464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251174
39	NT_187110	ATC	2	6	2499	2504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251174
40	NT_187110	TTC	2	6	2505	2510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251174
41	NT_187110	T	6	6	2554	2559	0 %	100 %	0 %	0 %	409251174
42	NT_187110	CGG	2	6	2674	2679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251174
43	NT_187110	AGGC	2	8	2718	2725	25 %	0 %	50 %	25 %	409251174
44	NT_187110	C	7	7	2758	2764	0 %	0 %	0 %	100 %	409251174
45	NT_187110	AACC	2	8	2767	2774	50 %	0 %	0 %	50 %	409251174
46	NT_187110	TTG	2	6	2784	2789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251174
47	NT_187110	A	6	6	2840	2845	100 %	0 %	0 %	0 %	409251174
48	NT_187110	GGT	2	6	3182	3187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251175
49	NT_187110	TGA	2	6	3234	3239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251175
50	NT_187110	AG	3	6	3323	3328	50 %	0 %	50 %	0 %	409251175
51	NT_187110	AACGG	2	10	3367	3376	40 %	0 %	40 %	20 %	409251175
52	NT_187110	CTGA	2	8	3400	3407	25 %	25 %	25 %	25 %	409251175
53	NT_187110	CG	3	6	3457	3462	0 %	0 %	50 %	50 %	409251175
54	NT_187110	GCA	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251175
55	NT_187110	TTC	2	6	3485	3490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251175
56	NT_187110	GGCCC	2	10	3516	3525	0 %	0 %	40 %	60 %	409251175
57	NT_187110	GCC	2	6	3649	3654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251175
58	NT_187110	TGA	2	6	3672	3677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251175
59	NT_187110	CGC	2	6	3700	3705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251175
60	NT_187110	GCCA	2	8	3740	3747	25 %	0 %	25 %	50 %	409251175
61	NT_187110	CTT	2	6	3771	3776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251175
62	NT_187110	GAT	2	6	3805	3810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251175
63	NT_187110	CCAG	2	8	3839	3846	25 %	0 %	25 %	50 %	409251175
64	NT_187110	TCT	2	6	3863	3868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251175
65	NT_187110	CGA	2	6	3957	3962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251175
66	NT_187110	GCA	3	9	3996	4004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251175
67	NT_187110	GAA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251175
68	NT_187110	CGC	2	6	4026	4031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251175
69	NT_187110	GA	3	6	4034	4039	50 %	0 %	50 %	0 %	409251175
70	NT_187110	TCG	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251175
71	NT_187110	GC	3	6	4078	4083	0 %	0 %	50 %	50 %	409251175
72	NT_187110	CGT	2	6	4089	4094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251175
73	NT_187110	TTC	2	6	4222	4227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251175
74	NT_187110	CGGA	2	8	4281	4288	25 %	0 %	50 %	25 %	409251175
75	NT_187110	CAG	2	6	4327	4332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251175
76	NT_187110	GC	3	6	4377	4382	0 %	0 %	50 %	50 %	409251175
77	NT_187110	GCG	2	6	4521	4526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251175
78	NT_187110	CG	4	8	4525	4532	0 %	0 %	50 %	50 %	409251175
79	NT_187110	GGT	2	6	4546	4551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251175
80	NT_187110	GCC	2	6	4561	4566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251175
81	NT_187110	AAT	2	6	4573	4578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251175
82	NT_187110	CACG	2	8	4653	4660	25 %	0 %	25 %	50 %	409251175
83	NT_187110	GC	3	6	4663	4668	0 %	0 %	50 %	50 %	409251175
84	NT_187110	GATGC	2	10	4708	4717	20 %	20 %	40 %	20 %	409251175
85	NT_187110	CGT	2	6	4851	4856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251176
86	NT_187110	TCG	2	6	4919	4924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251176
87	NT_187110	GCC	2	6	4963	4968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
88	NT_187110	CTG	2	6	4972	4977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251176
89	NT_187110	CGG	2	6	5046	5051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251176
90	NT_187110	GGA	2	6	5077	5082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251176
91	NT_187110	TTC	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251176
92	NT_187110	CCA	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251176
93	NT_187110	GCG	2	6	5216	5221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251176
94	NT_187110	CCG	2	6	5255	5260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
95	NT_187110	GGT	2	6	5353	5358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251176
96	NT_187110	GCC	2	6	5446	5451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
97	NT_187110	GAT	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251176
98	NT_187110	GAG	2	6	5525	5530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251176
99	NT_187110	CAG	2	6	5536	5541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251176
100	NT_187110	GCC	2	6	5555	5560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
101	NT_187110	CCG	2	6	5604	5609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
102	NT_187110	ATC	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251176
103	NT_187110	GTCA	2	8	5842	5849	25 %	25 %	25 %	25 %	409251176
104	NT_187110	TGA	2	6	5871	5876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251176
105	NT_187110	CCA	2	6	5880	5885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251176
106	NT_187110	CAC	2	6	5902	5907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251176
107	NT_187110	GTG	2	6	5960	5965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251176
108	NT_187110	GGTC	2	8	5985	5992	0 %	25 %	50 %	25 %	409251176
109	NT_187110	TTC	2	6	6011	6016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251176
110	NT_187110	CTT	2	6	6027	6032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251176
111	NT_187110	GCC	2	6	6076	6081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
112	NT_187110	GC	3	6	6106	6111	0 %	0 %	50 %	50 %	409251176
113	NT_187110	CGC	2	6	6130	6135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251176
114	NT_187110	AGG	2	6	6227	6232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251176
115	NT_187110	CGT	2	6	6234	6239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251176
116	NT_187110	CTT	2	6	6252	6257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251176
117	NT_187110	GCC	2	6	6471	6476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251177
118	NT_187110	CTG	2	6	6494	6499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251177
119	NT_187110	GCG	2	6	6531	6536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251177
120	NT_187110	CCG	2	6	6634	6639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251177
121	NT_187110	CCGC	2	8	6649	6656	0 %	0 %	25 %	75 %	409251177
122	NT_187110	GCA	2	6	6664	6669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
123	NT_187110	CG	3	6	6705	6710	0 %	0 %	50 %	50 %	409251177
124	NT_187110	ATC	2	6	6722	6727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251177
125	NT_187110	TTG	2	6	6758	6763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251177
126	NT_187110	CAG	2	6	6764	6769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
127	NT_187110	AGC	2	6	6777	6782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
128	NT_187110	CAG	2	6	6818	6823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
129	NT_187110	TG	3	6	6854	6859	0 %	50 %	50 %	0 %	409251177
130	NT_187110	CGT	2	6	6917	6922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251177
131	NT_187110	CGG	2	6	6954	6959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251177
132	NT_187110	CGA	2	6	6967	6972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
133	NT_187110	TCGT	2	8	6987	6994	0 %	50 %	25 %	25 %	409251177
134	NT_187110	CG	4	8	7012	7019	0 %	0 %	50 %	50 %	409251177
135	NT_187110	TCG	2	6	7038	7043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251177
136	NT_187110	CGG	3	9	7048	7056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251177
137	NT_187110	ACG	2	6	7083	7088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
138	NT_187110	GGT	2	6	7126	7131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251177
139	NT_187110	GC	4	8	7186	7193	0 %	0 %	50 %	50 %	409251177
140	NT_187110	CAG	2	6	7203	7208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
141	NT_187110	CAG	2	6	7232	7237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
142	NT_187110	GTT	2	6	7240	7245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251177
143	NT_187110	CAG	2	6	7265	7270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
144	NT_187110	ACT	2	6	7290	7295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251177
145	NT_187110	GCC	2	6	7311	7316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251177
146	NT_187110	GCAACA	2	12	7342	7353	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409251177
147	NT_187110	CG	3	6	7508	7513	0 %	0 %	50 %	50 %	409251177
148	NT_187110	GC	3	6	7640	7645	0 %	0 %	50 %	50 %	409251177
149	NT_187110	CGA	2	6	7659	7664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251177
150	NT_187110	ACGG	2	8	7667	7674	25 %	0 %	50 %	25 %	409251177
151	NT_187110	GGA	2	6	7732	7737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409251177
152	NT_187110	GGCT	2	8	7739	7746	0 %	25 %	50 %	25 %	409251177
153	NT_187110	TGC	2	6	7995	8000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
154	NT_187110	CTGC	2	8	8049	8056	0 %	25 %	25 %	50 %	409251178
155	NT_187110	CAT	2	6	8109	8114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251178
156	NT_187110	CAT	2	6	8130	8135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251178
157	NT_187110	CCTGCG	2	12	8313	8324	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409251178
158	NT_187110	CT	3	6	8435	8440	0 %	50 %	0 %	50 %	409251178
159	NT_187110	TGT	3	9	8445	8453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251178
160	NT_187110	CGC	2	6	8487	8492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
161	NT_187110	CTG	2	6	8650	8655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
162	NT_187110	CGC	2	6	8679	8684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
163	NT_187110	AACTGG	2	12	8687	8698	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	409251178
164	NT_187110	AGT	2	6	8700	8705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251178
165	NT_187110	GC	3	6	8764	8769	0 %	0 %	50 %	50 %	409251178
166	NT_187110	GC	3	6	8839	8844	0 %	0 %	50 %	50 %	409251178
167	NT_187110	CGC	2	6	8901	8906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
168	NT_187110	CGC	2	6	8928	8933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
169	NT_187110	CGC	2	6	8937	8942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
170	NT_187110	CGT	2	6	8943	8948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
171	NT_187110	TCA	2	6	8996	9001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251178
172	NT_187110	CCG	2	6	9002	9007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
173	NT_187110	GTC	2	6	9010	9015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
174	NT_187110	ATC	2	6	9016	9021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251178
175	NT_187110	GGTA	2	8	9078	9085	25 %	25 %	50 %	0 %	409251178
176	NT_187110	T	6	6	9107	9112	0 %	100 %	0 %	0 %	409251178
177	NT_187110	CGC	2	6	9138	9143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
178	NT_187110	CCA	2	6	9150	9155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251178
179	NT_187110	GGT	2	6	9211	9216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251178
180	NT_187110	ATC	2	6	9259	9264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251178
181	NT_187110	GCC	2	6	9295	9300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
182	NT_187110	TGC	2	6	9354	9359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
183	NT_187110	TGC	2	6	9483	9488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
184	NT_187110	CTG	2	6	9523	9528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
185	NT_187110	GCCA	2	8	9560	9567	25 %	0 %	25 %	50 %	409251178
186	NT_187110	CGC	2	6	9612	9617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
187	NT_187110	GATT	2	8	9819	9826	25 %	50 %	25 %	0 %	409251178
188	NT_187110	CGC	2	6	9888	9893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
189	NT_187110	GC	4	8	9947	9954	0 %	0 %	50 %	50 %	409251178
190	NT_187110	GAC	2	6	9973	9978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251178
191	NT_187110	CGC	2	6	9984	9989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
192	NT_187110	GCC	2	6	10003	10008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
193	NT_187110	GTC	2	6	10121	10126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
194	NT_187110	GTG	2	6	10139	10144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251178
195	NT_187110	GCC	2	6	10147	10152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
196	NT_187110	AGCGT	2	10	10187	10196	20 %	20 %	40 %	20 %	409251178
197	NT_187110	CGT	2	6	10225	10230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
198	NT_187110	GGC	2	6	10234	10239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251178
199	NT_187110	TGG	2	6	10260	10265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251178
200	NT_187110	GCC	2	6	10267	10272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
201	NT_187110	CTT	2	6	10314	10319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251178
202	NT_187110	TCA	2	6	10364	10369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251178
203	NT_187110	GAGG	2	8	10474	10481	25 %	0 %	75 %	0 %	409251178
204	NT_187110	TCG	2	6	10577	10582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
205	NT_187110	GCTGTC	2	12	10600	10611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
206	NT_187110	CTGT	2	8	10646	10653	0 %	50 %	25 %	25 %	409251178
207	NT_187110	GCC	2	6	10684	10689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
208	NT_187110	CGG	2	6	10704	10709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251178
209	NT_187110	CGT	2	6	10719	10724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
210	NT_187110	TGAG	2	8	10769	10776	25 %	25 %	50 %	0 %	409251178
211	NT_187110	TGC	2	6	10794	10799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251178
212	NT_187110	CCG	2	6	10800	10805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
213	NT_187110	GTG	2	6	10832	10837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251178
214	NT_187110	TGT	2	6	10887	10892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409251178
215	NT_187110	GCC	3	9	10900	10908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
216	NT_187110	GGC	2	6	10924	10929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251178
217	NT_187110	GTG	3	9	10952	10960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251178
218	NT_187110	CGC	2	6	10977	10982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178
219	NT_187110	CTCGCC	2	12	11047	11058	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	409251178
220	NT_187110	CGC	2	6	11070	11075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251178

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.