MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NT_187109	ATA	2	6	101764	101769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251167
2002	NT_187109	TTC	2	6	101805	101810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251167
2003	NT_187109	AGC	2	6	101920	101925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251167
2004	NT_187109	CGC	2	6	101972	101977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251167
2005	NT_187109	TGC	2	6	101989	101994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251167
2006	NT_187109	CGG	2	6	102035	102040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251167
2007	NT_187109	TTA	2	6	102064	102069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251167
2008	NT_187109	TGC	2	6	102187	102192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251167
2009	NT_187109	TAT	2	6	102195	102200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251167
2010	NT_187109	CTG	2	6	102231	102236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251167
2011	NT_187109	CGT	2	6	102244	102249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251167
2012	NT_187109	ATT	2	6	102309	102314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251167
2013	NT_187109	GAT	2	6	102320	102325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251167
2014	NT_187109	GCC	2	6	102330	102335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251167
2015	NT_187109	A	6	6	102345	102350	100 %	0 %	0 %	0 %	409251167
2016	NT_187109	GTG	3	9	102357	102365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251167
2017	NT_187109	GC	3	6	102375	102380	0 %	0 %	50 %	50 %	409251167
2018	NT_187109	TCTCA	2	10	102482	102491	20 %	40 %	0 %	40 %	409251167
2019	NT_187109	GTG	2	6	102510	102515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409251167
2020	NT_187109	A	6	6	102550	102555	100 %	0 %	0 %	0 %	409251167
2021	NT_187109	ATT	2	6	102574	102579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251167
2022	NT_187109	GCT	2	6	102581	102586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251167
2023	NT_187109	CCG	2	6	102589	102594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251167
2024	NT_187109	GC	3	6	102597	102602	0 %	0 %	50 %	50 %	409251167
2025	NT_187109	ATT	2	6	102667	102672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251167
2026	NT_187109	CTG	2	6	102702	102707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251167
2027	NT_187109	GAT	2	6	102713	102718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251167
2028	NT_187109	AAC	2	6	102777	102782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251167
2029	NT_187109	CGC	2	6	102815	102820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251167
2030	NT_187109	CTG	2	6	102846	102851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251167
2031	NT_187109	CT	3	6	102866	102871	0 %	50 %	0 %	50 %	409251167
2032	NT_187109	ATA	2	6	102898	102903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251167
2033	NT_187109	CG	3	6	102906	102911	0 %	0 %	50 %	50 %	409251167
2034	NT_187109	CGG	2	6	102965	102970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251167
2035	NT_187109	CT	3	6	102987	102992	0 %	50 %	0 %	50 %	409251167
2036	NT_187109	CG	3	6	103156	103161	0 %	0 %	50 %	50 %	409251167
2037	NT_187109	C	6	6	103256	103261	0 %	0 %	0 %	100 %	409251168
2038	NT_187109	GAA	2	6	103411	103416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251168
2039	NT_187109	CTGT	2	8	103437	103444	0 %	50 %	25 %	25 %	409251168
2040	NT_187109	TACGT	2	10	103506	103515	20 %	40 %	20 %	20 %	409251168
2041	NT_187109	CG	3	6	103546	103551	0 %	0 %	50 %	50 %	409251168
2042	NT_187109	ATT	2	6	103579	103584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251168
2043	NT_187109	GAA	2	6	103594	103599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251168
2044	NT_187109	GC	3	6	103600	103605	0 %	0 %	50 %	50 %	409251168
2045	NT_187109	CGG	3	9	103668	103676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251168
2046	NT_187109	CGT	2	6	103729	103734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251168
2047	NT_187109	CGG	2	6	103770	103775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251168
2048	NT_187109	GC	3	6	103800	103805	0 %	0 %	50 %	50 %	409251168
2049	NT_187109	GGC	3	9	103812	103820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251168
2050	NT_187109	GTCT	2	8	104021	104028	0 %	50 %	25 %	25 %	409251168
2051	NT_187109	GAA	2	6	104029	104034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251168
2052	NT_187109	GCG	2	6	104072	104077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251168
2053	NT_187109	CAAT	2	8	104205	104212	50 %	25 %	0 %	25 %	409251168
2054	NT_187109	ACA	2	6	104213	104218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251168
2055	NT_187109	ACC	2	6	104251	104256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251168
2056	NT_187109	CAG	2	6	104284	104289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251168
2057	NT_187109	TGC	2	6	104339	104344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251168
2058	NT_187109	AGC	2	6	104435	104440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251168
2059	NT_187109	ATG	3	9	104443	104451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251168
2060	NT_187109	ATC	2	6	104468	104473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251168
2061	NT_187109	GAT	2	6	104491	104496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251168
2062	NT_187109	A	6	6	104521	104526	100 %	0 %	0 %	0 %	409251168
2063	NT_187109	AAC	2	6	104572	104577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251168
2064	NT_187109	ACC	2	6	104590	104595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251168
2065	NT_187109	CGC	2	6	104597	104602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251168
2066	NT_187109	CAG	2	6	104704	104709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251168
2067	NT_187109	CTGG	2	8	104726	104733	0 %	25 %	50 %	25 %	409251168
2068	NT_187109	GAA	2	6	104749	104754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251168
2069	NT_187109	CGC	2	6	104769	104774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251168
2070	NT_187109	ATA	2	6	104833	104838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251169
2071	NT_187109	ACG	2	6	104892	104897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251169
2072	NT_187109	TTC	2	6	104906	104911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409251169
2073	NT_187109	CGA	2	6	104929	104934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251169
2074	NT_187109	ATC	2	6	105092	105097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251169
2075	NT_187109	CTG	2	6	105119	105124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251169
2076	NT_187109	GA	3	6	105164	105169	50 %	0 %	50 %	0 %	409251169
2077	NT_187109	AGC	2	6	105225	105230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251169
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2079	NT_187109	GCC	2	6	105321	105326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251169
2080	NT_187109	CAAAC	2	10	105374	105383	60 %	0 %	0 %	40 %	409251169
2081	NT_187109	A	6	6	105399	105404	100 %	0 %	0 %	0 %	409251169
2082	NT_187109	A	6	6	105504	105509	100 %	0 %	0 %	0 %	409251169
2083	NT_187109	TCA	2	6	105541	105546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409251169
2084	NT_187109	GCGCC	2	10	105585	105594	0 %	0 %	40 %	60 %	409251169
2085	NT_187109	TCC	2	6	105603	105608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409251169
2086	NT_187109	GTC	2	6	105618	105623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251169
2087	NT_187109	CAG	2	6	105659	105664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251169
2088	NT_187109	ACGC	2	8	105686	105693	25 %	0 %	25 %	50 %	409251169
2089	NT_187109	GGC	2	6	105714	105719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409251169
2090	NT_187109	GCT	2	6	105784	105789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251169
2091	NT_187109	GCA	2	6	105811	105816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251169
2092	NT_187109	GA	3	6	105880	105885	50 %	0 %	50 %	0 %	409251169
2093	NT_187109	A	6	6	105957	105962	100 %	0 %	0 %	0 %	409251169
2094	NT_187109	GC	3	6	105991	105996	0 %	0 %	50 %	50 %	409251169
2095	NT_187109	GCC	2	6	106048	106053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251169
2096	NT_187109	CACT	2	8	106063	106070	25 %	25 %	0 %	50 %	409251169
2097	NT_187109	A	6	6	106117	106122	100 %	0 %	0 %	0 %	409251169
2098	NT_187109	ATA	2	6	106190	106195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251169
2099	NT_187109	ACG	2	6	106215	106220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409251169
2100	NT_187109	AAT	2	6	106281	106286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251169
2101	NT_187109	TAT	2	6	106321	106326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409251169
2102	NT_187109	GCCA	2	8	106371	106378	25 %	0 %	25 %	50 %	409251169
2103	NT_187109	T	6	6	106391	106396	0 %	100 %	0 %	0 %	409251169
2104	NT_187109	ATA	2	6	106433	106438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251169
2105	NT_187109	AAT	2	6	106472	106477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251169
2106	NT_187109	TAAT	2	8	106527	106534	50 %	50 %	0 %	0 %	409251169
2107	NT_187109	GGCT	2	8	106570	106577	0 %	25 %	50 %	25 %	409251169
2108	NT_187109	CAA	2	6	106594	106599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251169
2109	NT_187109	AAT	2	6	106626	106631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409251169
2110	NT_187109	ACA	2	6	106669	106674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409251169
2111	NT_187109	G	6	6	106708	106713	0 %	0 %	100 %	0 %	409251169
2112	NT_187109	GCC	2	6	106727	106732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409251169
2113	NT_187109	AGA	2	6	106813	106818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409251169
2114	NT_187109	AGCA	2	8	106820	106827	50 %	0 %	25 %	25 %	409251169
2115	NT_187109	TGC	2	6	106841	106846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409251169
2116	NT_187109	A	6	6	106894	106899	100 %	0 %	0 %	0 %	409251169
2117	NT_187109	GTA	2	6	106954	106959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409251169
2118	NT_187109	GAAG	2	8	106965	106972	50 %	0 %	50 %	0 %	409251169
2119	NT_187109	CCA	2	6	106988	106993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409251169
2120	NT_187109	TA	3	6	107009	107014	50 %	50 %	0 %	0 %	409251169
2121	NT_187109	TTTA	2	8	107018	107025	25 %	75 %	0 %	0 %	409251169

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.