MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187106	CGT	2	6	103	108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250881
2	NT_187106	TTC	2	6	176	181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
3	NT_187106	CAC	2	6	215	220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
4	NT_187106	CCG	2	6	232	237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250881
5	NT_187106	GGATAA	2	12	241	252	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	409250881
6	NT_187106	AC	3	6	289	294	50 %	0 %	0 %	50 %	409250881
7	NT_187106	ATC	2	6	324	329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250881
8	NT_187106	CGC	2	6	496	501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250881
9	NT_187106	GAT	2	6	506	511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250881
10	NT_187106	AG	3	6	513	518	50 %	0 %	50 %	0 %	409250881
11	NT_187106	ACGG	2	8	581	588	25 %	0 %	50 %	25 %	409250881
12	NT_187106	TCT	2	6	591	596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
13	NT_187106	CAC	2	6	605	610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
14	NT_187106	TCG	2	6	675	680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250881
15	NT_187106	CGT	2	6	682	687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250881
16	NT_187106	ATA	2	6	702	707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250881
17	NT_187106	CGG	2	6	709	714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250881
18	NT_187106	TTC	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
19	NT_187106	CTT	2	6	790	795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
20	NT_187106	CGTT	2	8	828	835	0 %	50 %	25 %	25 %	409250881
21	NT_187106	GCA	2	6	847	852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
22	NT_187106	GAC	2	6	865	870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
23	NT_187106	CG	4	8	871	878	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
24	NT_187106	CCA	2	6	967	972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
25	NT_187106	TCT	3	9	990	998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
26	NT_187106	CG	3	6	1005	1010	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
27	NT_187106	CAC	2	6	1027	1032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
28	NT_187106	ACA	2	6	1098	1103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250881
29	NT_187106	ACG	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
30	NT_187106	GCA	2	6	1249	1254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
31	NT_187106	TCG	2	6	1287	1292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250881
32	NT_187106	CGCCTG	2	12	1346	1357	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250881
33	NT_187106	TCAG	2	8	1362	1369	25 %	25 %	25 %	25 %	409250881
34	NT_187106	CACG	2	8	1384	1391	25 %	0 %	25 %	50 %	409250881
35	NT_187106	TCA	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250881
36	NT_187106	GC	3	6	1437	1442	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
37	NT_187106	GCA	2	6	1452	1457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
38	NT_187106	GC	3	6	1516	1521	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
39	NT_187106	GC	3	6	1585	1590	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
40	NT_187106	ACG	2	6	1622	1627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
41	NT_187106	CAC	2	6	1631	1636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
42	NT_187106	CGG	2	6	1641	1646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250881
43	NT_187106	ATG	2	6	1665	1670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250881
44	NT_187106	CCA	2	6	1711	1716	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
45	NT_187106	ATT	2	6	1760	1765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250881
46	NT_187106	CAC	2	6	1769	1774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
47	NT_187106	GC	3	6	1843	1848	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
48	NT_187106	GC	3	6	1901	1906	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
49	NT_187106	GAT	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250881
50	NT_187106	CG	3	6	1979	1984	0 %	0 %	50 %	50 %	409250881
51	NT_187106	CGGTA	2	10	2011	2020	20 %	20 %	40 %	20 %	409250881
52	NT_187106	CTT	2	6	2023	2028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250881
53	NT_187106	ACG	2	6	2036	2041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
54	NT_187106	TGA	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250881
55	NT_187106	CGG	2	6	2056	2061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250881
56	NT_187106	GCG	2	6	2164	2169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250881
57	NT_187106	TCG	2	6	2176	2181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250881
58	NT_187106	GAA	2	6	2202	2207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250881
59	NT_187106	CAG	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250881
60	NT_187106	T	6	6	2254	2259	0 %	100 %	0 %	0 %	409250881
61	NT_187106	GCC	2	6	2361	2366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250881
62	NT_187106	CCA	2	6	2407	2412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250881
63	NT_187106	ACGA	2	8	2444	2451	50 %	0 %	25 %	25 %	409250881
64	NT_187106	T	6	6	2522	2527	0 %	100 %	0 %	0 %	409250881
65	NT_187106	CAA	2	6	2626	2631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250881
66	NT_187106	TC	3	6	2697	2702	0 %	50 %	0 %	50 %	409250881
67	NT_187106	ATA	2	6	3207	3212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250882
68	NT_187106	ATG	2	6	3276	3281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250882
69	NT_187106	AAT	2	6	3288	3293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250882
70	NT_187106	CCG	2	6	3346	3351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250882
71	NT_187106	GTG	2	6	3370	3375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250882
72	NT_187106	TTTC	2	8	3402	3409	0 %	75 %	0 %	25 %	409250882
73	NT_187106	CCG	2	6	3421	3426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250882
74	NT_187106	GTT	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250882
75	NT_187106	TTC	2	6	3582	3587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250882
76	NT_187106	AAAG	2	8	3590	3597	75 %	0 %	25 %	0 %	409250882
77	NT_187106	ATA	2	6	3670	3675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250882
78	NT_187106	CAT	2	6	3680	3685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250882
79	NT_187106	CGAT	2	8	3802	3809	25 %	25 %	25 %	25 %	409250882
80	NT_187106	CAT	2	6	3833	3838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250882
81	NT_187106	CGC	2	6	3861	3866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250882
82	NT_187106	TCA	2	6	3877	3882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250882
83	NT_187106	C	6	6	3908	3913	0 %	0 %	0 %	100 %	409250882
84	NT_187106	A	6	6	4049	4054	100 %	0 %	0 %	0 %	409250882
85	NT_187106	T	6	6	4106	4111	0 %	100 %	0 %	0 %	409250882
86	NT_187106	CAAT	2	8	4136	4143	50 %	25 %	0 %	25 %	409250882
87	NT_187106	TGA	2	6	4157	4162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250882
88	NT_187106	AGG	2	6	4262	4267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250882
89	NT_187106	T	8	8	4283	4290	0 %	100 %	0 %	0 %	409250882
90	NT_187106	TTTG	2	8	4362	4369	0 %	75 %	25 %	0 %	409250883
91	NT_187106	T	6	6	4375	4380	0 %	100 %	0 %	0 %	409250883
92	NT_187106	T	6	6	4382	4387	0 %	100 %	0 %	0 %	409250883
93	NT_187106	AATA	2	8	4448	4455	75 %	25 %	0 %	0 %	409250883
94	NT_187106	TTA	2	6	4497	4502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250883
95	NT_187106	TAA	2	6	4534	4539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250883
96	NT_187106	AAT	2	6	4572	4577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250883
97	NT_187106	ATC	2	6	4677	4682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250883
98	NT_187106	GCA	2	6	4716	4721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250883
99	NT_187106	CCA	2	6	4760	4765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250883
100	NT_187106	AGT	2	6	4867	4872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250883
101	NT_187106	GCC	2	6	4875	4880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250883
102	NT_187106	AGC	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250883
103	NT_187106	GAAA	2	8	4910	4917	75 %	0 %	25 %	0 %	409250883
104	NT_187106	GAAA	2	8	4947	4954	75 %	0 %	25 %	0 %	409250883
105	NT_187106	TTTA	2	8	4970	4977	25 %	75 %	0 %	0 %	409250883
106	NT_187106	TTA	2	6	5010	5015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250883
107	NT_187106	CTG	2	6	5030	5035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250883
108	NT_187106	TAAA	2	8	5075	5082	75 %	25 %	0 %	0 %	409250883
109	NT_187106	GCCAGC	2	12	5131	5142	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250883
110	NT_187106	GAT	2	6	5171	5176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250883
111	NT_187106	GAA	2	6	5228	5233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250883
112	NT_187106	ATA	2	6	5279	5284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250883
113	NT_187106	A	7	7	5322	5328	100 %	0 %	0 %	0 %	409250883
114	NT_187106	A	8	8	5363	5370	100 %	0 %	0 %	0 %	409250883
115	NT_187106	ATA	2	6	5397	5402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250883
116	NT_187106	ATATG	2	10	5471	5480	40 %	40 %	20 %	0 %	409250883
117	NT_187106	AGA	2	6	5489	5494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250883
118	NT_187106	GA	3	6	5525	5530	50 %	0 %	50 %	0 %	409250883
119	NT_187106	TTCA	2	8	5531	5538	25 %	50 %	0 %	25 %	409250883
120	NT_187106	GCA	2	6	5547	5552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250883
121	NT_187106	A	6	6	5582	5587	100 %	0 %	0 %	0 %	409250883
122	NT_187106	ACT	2	6	5660	5665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250883
123	NT_187106	GAT	2	6	5996	6001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250884
124	NT_187106	GTAA	2	8	6066	6073	50 %	25 %	25 %	0 %	409250884
125	NT_187106	CAT	2	6	6128	6133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250884
126	NT_187106	T	6	6	6154	6159	0 %	100 %	0 %	0 %	409250884
127	NT_187106	CGA	2	6	6167	6172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250884
128	NT_187106	TCA	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250884
129	NT_187106	ATA	2	6	6373	6378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250884
130	NT_187106	AT	3	6	6455	6460	50 %	50 %	0 %	0 %	409250884
131	NT_187106	A	6	6	6503	6508	100 %	0 %	0 %	0 %	409250884
132	NT_187106	CAA	2	6	6509	6514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250884
133	NT_187106	CAC	2	6	6543	6548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250884
134	NT_187106	CTT	2	6	6582	6587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250884
135	NT_187106	TAA	2	6	6600	6605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250884
136	NT_187106	CGTCG	2	10	6750	6759	0 %	20 %	40 %	40 %	409250885
137	NT_187106	TGG	2	6	6763	6768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250885
138	NT_187106	GCATC	2	10	6795	6804	20 %	20 %	20 %	40 %	409250885
139	NT_187106	GGC	2	6	6841	6846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250885
140	NT_187106	GCG	3	9	6878	6886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250885
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145	NT_187106	GTC	2	6	7195	7200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250885
146	NT_187106	GCAC	2	8	7235	7242	25 %	0 %	25 %	50 %	409250885
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150	NT_187106	CTG	2	6	7781	7786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250886
151	NT_187106	GGC	2	6	7852	7857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250886
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246	NT_187106	ATA	2	6	12685	12690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250889
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254	NT_187106	CG	3	6	13112	13117	0 %	0 %	50 %	50 %	409250890
255	NT_187106	A	7	7	13161	13167	100 %	0 %	0 %	0 %	409250890
256	NT_187106	GCGCCT	2	12	13206	13217	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	409250890
257	NT_187106	CAT	2	6	13253	13258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250890
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259	NT_187106	GTAT	2	8	13362	13369	25 %	50 %	25 %	0 %	409250890
260	NT_187106	GTG	2	6	13403	13408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250890
261	NT_187106	ATC	2	6	13416	13421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250890
262	NT_187106	ACAGT	2	10	13434	13443	40 %	20 %	20 %	20 %	409250890
263	NT_187106	GAA	2	6	13451	13456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250890
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265	NT_187106	CCG	2	6	13709	13714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250890
266	NT_187106	GAAG	2	8	13718	13725	50 %	0 %	50 %	0 %	409250890
267	NT_187106	TTA	2	6	13736	13741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250890
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269	NT_187106	CGCC	2	8	13961	13968	0 %	0 %	25 %	75 %	409250891
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391	NT_187106	CCCT	2	8	19324	19331	0 %	25 %	0 %	75 %	409250894
392	NT_187106	GCG	4	12	19406	19417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250894
393	NT_187106	AC	3	6	19486	19491	50 %	0 %	0 %	50 %	409250895
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395	NT_187106	CCGGA	2	10	19579	19588	20 %	0 %	40 %	40 %	409250895
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