MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 2130

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NT_187106	TGCCGT	2	12	25882	25893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250901
502	NT_187106	CGA	2	6	25951	25956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250901
503	NT_187106	GTCGAT	2	12	26030	26041	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	409250901
504	NT_187106	GC	3	6	26127	26132	0 %	0 %	50 %	50 %	409250901
505	NT_187106	CCG	2	6	26133	26138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250901
506	NT_187106	TCG	2	6	26304	26309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250901
507	NT_187106	GGA	2	6	26393	26398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250901
508	NT_187106	CG	3	6	26399	26404	0 %	0 %	50 %	50 %	409250901
509	NT_187106	CGC	2	6	26458	26463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250901
510	NT_187106	CGC	2	6	26507	26512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250901
511	NT_187106	GCC	2	6	26513	26518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250901
512	NT_187106	CGCAG	2	10	26521	26530	20 %	0 %	40 %	40 %	409250901
513	NT_187106	ACC	2	6	26532	26537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250901
514	NT_187106	CGT	2	6	26577	26582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250901
515	NT_187106	CCGCG	2	10	26704	26713	0 %	0 %	40 %	60 %	409250901
516	NT_187106	AGCG	2	8	26777	26784	25 %	0 %	50 %	25 %	409250901
517	NT_187106	TCA	2	6	26851	26856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250901
518	NT_187106	CGC	2	6	26883	26888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250902
519	NT_187106	A	7	7	26895	26901	100 %	0 %	0 %	0 %	409250902
520	NT_187106	GGT	2	6	26907	26912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250902
521	NT_187106	CAC	3	9	26961	26969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250902
522	NT_187106	GAT	2	6	27013	27018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250902
523	NT_187106	AGC	2	6	27022	27027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250902
524	NT_187106	CGG	2	6	27035	27040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250902
525	NT_187106	AGG	2	6	27062	27067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409250902
526	NT_187106	ATC	2	6	27079	27084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250902
527	NT_187106	GCA	2	6	27118	27123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250902
528	NT_187106	GCG	2	6	27149	27154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250902
529	NT_187106	TCA	2	6	27158	27163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250902
530	NT_187106	CCG	2	6	27190	27195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250902
531	NT_187106	TGG	2	6	27212	27217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250902
532	NT_187106	GACAG	2	10	27266	27275	40 %	0 %	40 %	20 %	409250902
533	NT_187106	CTG	2	6	27310	27315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250902
534	NT_187106	CGC	2	6	27373	27378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250902
535	NT_187106	TAT	2	6	27381	27386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250902
536	NT_187106	GCA	2	6	27413	27418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250902
537	NT_187106	TCG	2	6	27450	27455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250902
538	NT_187106	CCTG	2	8	27551	27558	0 %	25 %	25 %	50 %	409250902
539	NT_187106	ACG	3	9	27559	27567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250902
540	NT_187106	CTG	2	6	27586	27591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250902
541	NT_187106	CGG	2	6	27609	27614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250902
542	NT_187106	GCG	2	6	27670	27675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250902
543	NT_187106	GC	3	6	27719	27724	0 %	0 %	50 %	50 %	409250902
544	NT_187106	GCT	2	6	27741	27746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250902
545	NT_187106	CGCC	2	8	27783	27790	0 %	0 %	25 %	75 %	409250902
546	NT_187106	CAA	2	6	27805	27810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250902
547	NT_187106	T	6	6	27975	27980	0 %	100 %	0 %	0 %	409250903
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550	NT_187106	T	6	6	28090	28095	0 %	100 %	0 %	0 %	409250903
551	NT_187106	GAA	2	6	28122	28127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250903
552	NT_187106	TGCC	2	8	28177	28184	0 %	25 %	25 %	50 %	409250903
553	NT_187106	GCGAAA	2	12	28225	28236	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409250903
554	NT_187106	GA	3	6	28279	28284	50 %	0 %	50 %	0 %	409250903
555	NT_187106	CAT	2	6	28338	28343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250903
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557	NT_187106	CCA	2	6	28387	28392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250903
558	NT_187106	GCG	2	6	28399	28404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250903
559	NT_187106	CGC	2	6	28452	28457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250903
560	NT_187106	GCGG	2	8	28517	28524	0 %	0 %	75 %	25 %	409250903
561	NT_187106	GCC	2	6	28527	28532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250903
562	NT_187106	GC	3	6	28612	28617	0 %	0 %	50 %	50 %	409250903
563	NT_187106	TC	3	6	28639	28644	0 %	50 %	0 %	50 %	409250903
564	NT_187106	GC	3	6	28669	28674	0 %	0 %	50 %	50 %	409250903
565	NT_187106	ATT	2	6	28680	28685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250903
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568	NT_187106	CCA	2	6	28773	28778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250903
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570	NT_187106	GCA	2	6	28900	28905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250903
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572	NT_187106	A	6	6	28995	29000	100 %	0 %	0 %	0 %	409250903
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579	NT_187106	ATT	2	6	29502	29507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250903
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584	NT_187106	CTGGG	2	10	29742	29751	0 %	20 %	60 %	20 %	409250903
585	NT_187106	GAA	2	6	29781	29786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250903
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588	NT_187106	GCT	2	6	29899	29904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250904
589	NT_187106	TTC	2	6	29942	29947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250904
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592	NT_187106	A	6	6	30082	30087	100 %	0 %	0 %	0 %	409250904
593	NT_187106	ATT	2	6	30110	30115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250904
594	NT_187106	GAA	2	6	30209	30214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250904
595	NT_187106	GC	3	6	30221	30226	0 %	0 %	50 %	50 %	409250904
596	NT_187106	CGGC	2	8	30279	30286	0 %	0 %	50 %	50 %	409250904
597	NT_187106	GTT	2	6	30305	30310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250904
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599	NT_187106	TCCG	2	8	30369	30376	0 %	25 %	25 %	50 %	409250904
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601	NT_187106	TA	3	6	30519	30524	50 %	50 %	0 %	0 %	409250904
602	NT_187106	CCAT	2	8	30525	30532	25 %	25 %	0 %	50 %	409250904
603	NT_187106	TCGT	2	8	30579	30586	0 %	50 %	25 %	25 %	409250904
604	NT_187106	ACGCG	2	10	30589	30598	20 %	0 %	40 %	40 %	409250904
605	NT_187106	CTG	2	6	30626	30631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250904
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609	NT_187106	CTA	2	6	30780	30785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250905
610	NT_187106	GCC	2	6	30803	30808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250905
611	NT_187106	TGG	2	6	31022	31027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250905
612	NT_187106	TC	3	6	31089	31094	0 %	50 %	0 %	50 %	409250905
613	NT_187106	GAT	2	6	31140	31145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250905
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615	NT_187106	GGT	2	6	31293	31298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250905
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620	NT_187106	GCGA	2	8	31583	31590	25 %	0 %	50 %	25 %	409250905
621	NT_187106	GC	3	6	31708	31713	0 %	0 %	50 %	50 %	409250905
622	NT_187106	AAG	2	6	31733	31738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250905
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626	NT_187106	T	6	6	31871	31876	0 %	100 %	0 %	0 %	409250905
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628	NT_187106	T	6	6	32032	32037	0 %	100 %	0 %	0 %	409250905
629	NT_187106	CGC	2	6	32100	32105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250905
630	NT_187106	CGA	2	6	32214	32219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250905
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754	NT_187106	GTA	2	6	37693	37698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250913
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756	NT_187106	TGGCGC	2	12	37759	37770	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	409250913
757	NT_187106	CGCC	2	8	37777	37784	0 %	0 %	25 %	75 %	409250913
758	NT_187106	AGCC	2	8	37840	37847	25 %	0 %	25 %	50 %	409250913
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760	NT_187106	ACC	2	6	37977	37982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250913
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764	NT_187106	GAC	2	6	38113	38118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250913
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775	NT_187106	TCAT	2	8	38520	38527	25 %	50 %	0 %	25 %	409250913
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777	NT_187106	AGCG	2	8	38588	38595	25 %	0 %	50 %	25 %	409250913
778	NT_187106	CCAG	2	8	38614	38621	25 %	0 %	25 %	50 %	409250913
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781	NT_187106	CGG	2	6	38812	38817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250913
782	NT_187106	GCT	2	6	38845	38850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250913
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786	NT_187106	CCG	2	6	39022	39027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250913
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789	NT_187106	CAC	2	6	39255	39260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250914
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