MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 6874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NT_187102	GGC	2	6	329194	329199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250395
6002	NT_187102	TCA	2	6	329262	329267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250395
6003	NT_187102	GGC	2	6	329283	329288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250395
6004	NT_187102	CGG	2	6	329385	329390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250396
6005	NT_187102	CCAT	2	8	329501	329508	25 %	25 %	0 %	50 %	409250396
6006	NT_187102	TCA	2	6	329530	329535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250396
6007	NT_187102	GCA	2	6	329556	329561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250396
6008	NT_187102	CT	3	6	329653	329658	0 %	50 %	0 %	50 %	409250396
6009	NT_187102	GCTG	2	8	329712	329719	0 %	25 %	50 %	25 %	409250396
6010	NT_187102	AATT	2	8	329739	329746	50 %	50 %	0 %	0 %	409250396
6011	NT_187102	CGC	2	6	329766	329771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250396
6012	NT_187102	T	6	6	329800	329805	0 %	100 %	0 %	0 %	409250396
6013	NT_187102	AAT	2	6	329806	329811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250396
6014	NT_187102	GCC	2	6	329883	329888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250396
6015	NT_187102	CGC	2	6	329975	329980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250396
6016	NT_187102	CCG	2	6	330017	330022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250396
6017	NT_187102	GTA	2	6	330025	330030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250396
6018	NT_187102	CGC	2	6	330092	330097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250396
6019	NT_187102	CG	3	6	330137	330142	0 %	0 %	50 %	50 %	409250396
6020	NT_187102	GTG	2	6	330148	330153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250396
6021	NT_187102	ATT	2	6	330281	330286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250396
6022	NT_187102	GTG	2	6	330344	330349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409250396
6023	NT_187102	GAT	2	6	330361	330366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250396
6024	NT_187102	A	6	6	330368	330373	100 %	0 %	0 %	0 %	409250396
6025	NT_187102	CGA	2	6	330377	330382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250396
6026	NT_187102	CGG	2	6	330446	330451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250397
6027	NT_187102	GCTG	2	8	330455	330462	0 %	25 %	50 %	25 %	409250397
6028	NT_187102	GCA	2	6	330563	330568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250397
6029	NT_187102	GCCA	2	8	330579	330586	25 %	0 %	25 %	50 %	409250397
6030	NT_187102	CGGCG	2	10	330671	330680	0 %	0 %	60 %	40 %	409250397
6031	NT_187102	TGAT	2	8	330742	330749	25 %	50 %	25 %	0 %	409250397
6032	NT_187102	T	6	6	330762	330767	0 %	100 %	0 %	0 %	409250397
6033	NT_187102	GAA	2	6	331020	331025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250397
6034	NT_187102	GTATC	2	10	331061	331070	20 %	40 %	20 %	20 %	409250397
6035	NT_187102	CAAAA	2	10	331205	331214	80 %	0 %	0 %	20 %	409250398
6036	NT_187102	GC	3	6	331223	331228	0 %	0 %	50 %	50 %	409250398
6037	NT_187102	CGC	2	6	331230	331235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250398
6038	NT_187102	CAG	2	6	331236	331241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250398
6039	NT_187102	CAA	2	6	331253	331258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250398
6040	NT_187102	CGA	2	6	331319	331324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250398
6041	NT_187102	CCG	2	6	331397	331402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250398
6042	NT_187102	CTA	2	6	331496	331501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250398
6043	NT_187102	AAT	2	6	331554	331559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250398
6044	NT_187102	GCG	2	6	331564	331569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250398
6045	NT_187102	GC	3	6	331586	331591	0 %	0 %	50 %	50 %	409250398
6046	NT_187102	ATG	2	6	331600	331605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250398
6047	NT_187102	CAAT	2	8	331700	331707	50 %	25 %	0 %	25 %	409250398
6048	NT_187102	GCA	2	6	331733	331738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250398
6049	NT_187102	GCG	2	6	331811	331816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250398
6050	NT_187102	T	6	6	331829	331834	0 %	100 %	0 %	0 %	409250398
6051	NT_187102	GCT	2	6	331865	331870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250398
6052	NT_187102	GCC	2	6	331886	331891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250398
6053	NT_187102	ACC	2	6	331904	331909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250398
6054	NT_187102	CAG	2	6	331950	331955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250398
6055	NT_187102	AAG	2	6	331971	331976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250398
6056	NT_187102	CAT	2	6	331980	331985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250398
6057	NT_187102	ACT	2	6	332008	332013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250398
6058	NT_187102	AG	3	6	332058	332063	50 %	0 %	50 %	0 %	409250398
6059	NT_187102	CG	3	6	332065	332070	0 %	0 %	50 %	50 %	409250398
6060	NT_187102	GGGA	2	8	332091	332098	25 %	0 %	75 %	0 %	409250398
6061	NT_187102	AAG	2	6	332111	332116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250398
6062	NT_187102	GAAA	2	8	332165	332172	75 %	0 %	25 %	0 %	409250398
6063	NT_187102	CAA	2	6	332229	332234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409250398
6064	NT_187102	CCG	2	6	332281	332286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250398
6065	NT_187102	ATT	2	6	332346	332351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250398
6066	NT_187102	ATT	2	6	332434	332439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250398
6067	NT_187102	GCA	2	6	332530	332535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250398
6068	NT_187102	ATA	2	6	332538	332543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250398
6069	NT_187102	TCA	2	6	332695	332700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250399
6070	NT_187102	CCA	2	6	332786	332791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250399
6071	NT_187102	ATC	2	6	332818	332823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250399
6072	NT_187102	T	7	7	332825	332831	0 %	100 %	0 %	0 %	409250399
6073	NT_187102	ATA	2	6	332902	332907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250399
6074	NT_187102	ATT	2	6	332926	332931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409250399
6075	NT_187102	TTTA	2	8	332967	332974	25 %	75 %	0 %	0 %	409250399
6076	NT_187102	CTG	2	6	333100	333105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250399
6077	NT_187102	CGG	2	6	333110	333115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250399
6078	NT_187102	GTT	2	6	333121	333126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409250399
6079	NT_187102	TAA	2	6	333134	333139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250399
6080	NT_187102	CAGC	2	8	333215	333222	25 %	0 %	25 %	50 %	409250399
6081	NT_187102	CCG	2	6	333224	333229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250399
6082	NT_187102	ACCGC	2	10	333238	333247	20 %	0 %	20 %	60 %	409250399
6083	NT_187102	T	6	6	333351	333356	0 %	100 %	0 %	0 %	409250399
6084	NT_187102	TTTG	2	8	333371	333378	0 %	75 %	25 %	0 %	409250399
6085	NT_187102	CGC	2	6	333399	333404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250399
6086	NT_187102	TCA	2	6	333569	333574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250400
6087	NT_187102	CAGCG	2	10	333606	333615	20 %	0 %	40 %	40 %	409250400
6088	NT_187102	TC	3	6	333620	333625	0 %	50 %	0 %	50 %	409250400
6089	NT_187102	CGCCAG	2	12	333690	333701	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	409250400
6090	NT_187102	CCG	2	6	333811	333816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250400
6091	NT_187102	GCA	2	6	333908	333913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250400
6092	NT_187102	ATG	2	6	333958	333963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250400
6093	NT_187102	CGC	2	6	334014	334019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250400
6094	NT_187102	A	6	6	334089	334094	100 %	0 %	0 %	0 %	409250400
6095	NT_187102	CGG	2	6	334095	334100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250400
6096	NT_187102	AATC	2	8	334136	334143	50 %	25 %	0 %	25 %	409250400
6097	NT_187102	CTT	2	6	334169	334174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250400
6098	NT_187102	CCA	3	9	334274	334282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250400
6099	NT_187102	T	6	6	334299	334304	0 %	100 %	0 %	0 %	409250400
6100	NT_187102	ATCA	2	8	334359	334366	50 %	25 %	0 %	25 %	409250400
6101	NT_187102	CCG	3	9	334444	334452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250400
6102	NT_187102	ATTC	2	8	334541	334548	25 %	50 %	0 %	25 %	409250400
6103	NT_187102	CAG	2	6	334665	334670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250401
6104	NT_187102	TGCC	2	8	334730	334737	0 %	25 %	25 %	50 %	409250401
6105	NT_187102	AGC	2	6	334778	334783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409250401
6106	NT_187102	CAC	2	6	334803	334808	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409250401
6107	NT_187102	A	6	6	334828	334833	100 %	0 %	0 %	0 %	409250401
6108	NT_187102	ATC	2	6	334845	334850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250401
6109	NT_187102	T	6	6	334872	334877	0 %	100 %	0 %	0 %	409250401
6110	NT_187102	TCA	2	6	334882	334887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250401
6111	NT_187102	TTCA	2	8	334944	334951	25 %	50 %	0 %	25 %	409250401
6112	NT_187102	CCTGA	2	10	335073	335082	20 %	20 %	20 %	40 %	409250401
6113	NT_187102	CAT	2	6	335162	335167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250401
6114	NT_187102	TCG	2	6	335278	335283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250401
6115	NT_187102	AAT	2	6	335325	335330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250401
6116	NT_187102	C	7	7	335351	335357	0 %	0 %	0 %	100 %	409250401
6117	NT_187102	GCC	2	6	335443	335448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250401
6118	NT_187102	ATC	2	6	335478	335483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250401
6119	NT_187102	T	6	6	335517	335522	0 %	100 %	0 %	0 %	409250401
6120	NT_187102	T	6	6	335665	335670	0 %	100 %	0 %	0 %	409250402
6121	NT_187102	GC	3	6	335827	335832	0 %	0 %	50 %	50 %	409250402
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6123	NT_187102	GAAA	2	8	335949	335956	75 %	0 %	25 %	0 %	409250402
6124	NT_187102	CTT	2	6	335964	335969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409250402
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6157	NT_187102	TTAA	2	8	337920	337927	50 %	50 %	0 %	0 %	409250404
6158	NT_187102	TACGG	2	10	338013	338022	20 %	20 %	40 %	20 %	409250404
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6222	NT_187102	CAT	2	6	342452	342457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250411
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6227	NT_187102	GCT	2	6	342615	342620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250411
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6232	NT_187102	TGA	2	6	343242	343247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250412
6233	NT_187102	TCG	2	6	343259	343264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250412
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6236	NT_187102	TAA	2	6	343359	343364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250412
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6238	NT_187102	CTG	2	6	343410	343415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250412
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6240	NT_187102	GAT	2	6	343504	343509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250412
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6243	NT_187102	AAG	2	6	343748	343753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409250412
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6245	NT_187102	CGT	2	6	343887	343892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250412
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6332	NT_187102	GCGCTT	2	12	349719	349730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250418
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6334	NT_187102	GAT	2	6	349994	349999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250419
6335	NT_187102	TCA	2	6	350017	350022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409250419
6336	NT_187102	GCG	2	6	350028	350033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409250419
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6359	NT_187102	CCCG	2	8	351118	351125	0 %	0 %	25 %	75 %	409250419
6360	NT_187102	CGGG	2	8	351135	351142	0 %	0 %	75 %	25 %	409250419
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6362	NT_187102	AATG	2	8	351852	351859	50 %	25 %	25 %	0 %	409250420
6363	NT_187102	GA	3	6	351880	351885	50 %	0 %	50 %	0 %	409250420
6364	NT_187102	TCG	2	6	351892	351897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409250420
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6368	NT_187102	TGA	2	6	352113	352118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409250420
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6489	NT_187102	GCCAAA	2	12	358235	358246	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	409250431
6490	NT_187102	ATCC	2	8	358257	358264	25 %	25 %	0 %	50 %	409250431
6491	NT_187102	CCG	2	6	358311	358316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409250431
6492	NT_187102	AAT	2	6	358370	358375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409250431
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6497	NT_187102	TCAA	2	8	358825	358832	50 %	25 %	0 %	25 %	409250433
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