MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187097	TCAT	2	8	905	912	25 %	50 %	0 %	25 %	409249770
2	NT_187097	GACCA	2	10	992	1001	40 %	0 %	20 %	40 %	409249770
3	NT_187097	GAT	2	6	1025	1030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249770
4	NT_187097	TCG	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249770
5	NT_187097	CCT	2	6	1233	1238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249770
6	NT_187097	ACC	2	6	1383	1388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249771
7	NT_187097	GTGG	2	8	1433	1440	0 %	25 %	75 %	0 %	409249771
8	NT_187097	CAC	2	6	1536	1541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249771
9	NT_187097	CGG	2	6	1585	1590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249771
10	NT_187097	ACC	2	6	1609	1614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249771
11	NT_187097	TTC	2	6	1619	1624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249771
12	NT_187097	CAA	2	6	1694	1699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249772
13	NT_187097	TGG	2	6	1710	1715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249772
14	NT_187097	TGGC	2	8	1800	1807	0 %	25 %	50 %	25 %	409249772
15	NT_187097	TAT	2	6	1828	1833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249772
16	NT_187097	GCT	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249772
17	NT_187097	CGA	2	6	1918	1923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249772
18	NT_187097	TCT	2	6	1986	1991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249772
19	NT_187097	GTCA	2	8	1993	2000	25 %	25 %	25 %	25 %	409249772
20	NT_187097	GCC	2	6	2002	2007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249772
21	NT_187097	AAT	2	6	2032	2037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249772
22	NT_187097	TGCGC	2	10	2059	2068	0 %	20 %	40 %	40 %	409249772
23	NT_187097	A	6	6	2072	2077	100 %	0 %	0 %	0 %	409249772
24	NT_187097	GC	3	6	2118	2123	0 %	0 %	50 %	50 %	409249772
25	NT_187097	GGC	2	6	3030	3035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249773
26	NT_187097	TCA	2	6	3081	3086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249773
27	NT_187097	AAG	2	6	3110	3115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249773
28	NT_187097	CAT	2	6	3134	3139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249773
29	NT_187097	TTA	2	6	3147	3152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249773
30	NT_187097	GGA	2	6	3166	3171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249773
31	NT_187097	AGA	2	6	3190	3195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249773
32	NT_187097	TAA	2	6	3216	3221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249773
33	NT_187097	CAT	2	6	3286	3291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249773
34	NT_187097	ACC	2	6	3353	3358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249773
35	NT_187097	AAC	2	6	3365	3370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249773
36	NT_187097	GAA	2	6	3468	3473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249773
37	NT_187097	TCT	2	6	3488	3493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249773
38	NT_187097	TCCC	2	8	3511	3518	0 %	25 %	0 %	75 %	409249773
39	NT_187097	CTG	2	6	3538	3543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249773
40	NT_187097	ATATCA	2	12	3624	3635	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	409249773
41	NT_187097	ATTT	2	8	3646	3653	25 %	75 %	0 %	0 %	409249773
42	NT_187097	TGTT	2	8	3654	3661	0 %	75 %	25 %	0 %	409249773
43	NT_187097	CTTT	2	8	3714	3721	0 %	75 %	0 %	25 %	409249773
44	NT_187097	GAAT	2	8	3750	3757	50 %	25 %	25 %	0 %	409249773
45	NT_187097	ACA	2	6	3769	3774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249773
46	NT_187097	AACA	2	8	3779	3786	75 %	0 %	0 %	25 %	409249773
47	NT_187097	T	6	6	3797	3802	0 %	100 %	0 %	0 %	409249773
48	NT_187097	TA	3	6	4454	4459	50 %	50 %	0 %	0 %	409249774
49	NT_187097	TCA	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249774
50	NT_187097	TA	3	6	4503	4508	50 %	50 %	0 %	0 %	409249774
51	NT_187097	TA	3	6	4537	4542	50 %	50 %	0 %	0 %	409249774
52	NT_187097	AT	3	6	4604	4609	50 %	50 %	0 %	0 %	409249774
53	NT_187097	GC	3	6	4660	4665	0 %	0 %	50 %	50 %	409249774
54	NT_187097	TA	3	6	4684	4689	50 %	50 %	0 %	0 %	409249774
55	NT_187097	A	7	7	4721	4727	100 %	0 %	0 %	0 %	409249774
56	NT_187097	CCT	2	6	4742	4747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249774
57	NT_187097	TAT	2	6	4755	4760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249774
58	NT_187097	ATT	2	6	4795	4800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249774
59	NT_187097	TA	3	6	4834	4839	50 %	50 %	0 %	0 %	409249774
60	NT_187097	AAT	2	6	4846	4851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249774
61	NT_187097	GAA	2	6	4913	4918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249774
62	NT_187097	CGT	2	6	5034	5039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249774
63	NT_187097	CAT	2	6	5082	5087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249774
64	NT_187097	TAT	2	6	5104	5109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249774
65	NT_187097	AGC	2	6	5137	5142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249774
66	NT_187097	TAA	2	6	5145	5150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249774
67	NT_187097	AGG	2	6	5154	5159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249774
68	NT_187097	GTTG	2	8	5181	5188	0 %	50 %	50 %	0 %	409249774

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.