MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187091	CTG	2	6	205	210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249555
2	NT_187091	T	6	6	235	240	0 %	100 %	0 %	0 %	409249555
3	NT_187091	T	6	6	395	400	0 %	100 %	0 %	0 %	409249555
4	NT_187091	AGCGC	2	10	480	489	20 %	0 %	40 %	40 %	409249555
5	NT_187091	TGTC	2	8	572	579	0 %	50 %	25 %	25 %	409249555
6	NT_187091	CTG	2	6	625	630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249555
7	NT_187091	ATA	2	6	632	637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249555
8	NT_187091	TCT	3	9	728	736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249555
9	NT_187091	ACTG	2	8	783	790	25 %	25 %	25 %	25 %	409249555
10	NT_187091	CA	3	6	859	864	50 %	0 %	0 %	50 %	409249555
11	NT_187091	ATAA	2	8	891	898	75 %	25 %	0 %	0 %	409249555
12	NT_187091	A	6	6	1263	1268	100 %	0 %	0 %	0 %	409249556
13	NT_187091	GAG	2	6	1279	1284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249556
14	NT_187091	CGG	2	6	1366	1371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249556
15	NT_187091	A	6	6	1383	1388	100 %	0 %	0 %	0 %	409249556
16	NT_187091	GAT	2	6	1414	1419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249556
17	NT_187091	TC	3	6	1501	1506	0 %	50 %	0 %	50 %	409249557
18	NT_187091	TGC	2	6	1555	1560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249557
19	NT_187091	AG	3	6	1598	1603	50 %	0 %	50 %	0 %	409249557
20	NT_187091	CAG	2	6	1698	1703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249557
21	NT_187091	AATT	2	8	1708	1715	50 %	50 %	0 %	0 %	409249557
22	NT_187091	AAGC	2	8	1726	1733	50 %	0 %	25 %	25 %	409249557
23	NT_187091	AAAG	2	8	1775	1782	75 %	0 %	25 %	0 %	409249557
24	NT_187091	GAC	2	6	2380	2385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249558
25	NT_187091	GCA	2	6	2454	2459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249558
26	NT_187091	TGAA	2	8	2511	2518	50 %	25 %	25 %	0 %	409249558
27	NT_187091	TAA	2	6	2606	2611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249559
28	NT_187091	T	6	6	2704	2709	0 %	100 %	0 %	0 %	409249559
29	NT_187091	AAT	2	6	2785	2790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249559
30	NT_187091	AGACC	2	10	3059	3068	40 %	0 %	20 %	40 %	409249560
31	NT_187091	ATC	2	6	3081	3086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249560
32	NT_187091	GTT	2	6	3099	3104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249560
33	NT_187091	TCA	2	6	3115	3120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249560
34	NT_187091	CAG	2	6	3129	3134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249560
35	NT_187091	AGT	2	6	3176	3181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249560
36	NT_187091	GCC	2	6	3258	3263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249560
37	NT_187091	GGAC	2	8	3297	3304	25 %	0 %	50 %	25 %	409249560
38	NT_187091	CCG	2	6	3367	3372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249560
39	NT_187091	CGC	2	6	3447	3452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249560
40	NT_187091	CCG	2	6	3511	3516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249560
41	NT_187091	CAT	2	6	3518	3523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249560
42	NT_187091	AGC	2	6	3597	3602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249560
43	NT_187091	AAGTCA	2	12	3619	3630	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	409249560
44	NT_187091	AG	3	6	3639	3644	50 %	0 %	50 %	0 %	409249560
45	NT_187091	TTA	2	6	3733	3738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249560
46	NT_187091	CCA	2	6	3770	3775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249560
47	NT_187091	GAA	2	6	3780	3785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249560
48	NT_187091	AT	3	6	3829	3834	50 %	50 %	0 %	0 %	409249560
49	NT_187091	TCTG	2	8	3838	3845	0 %	50 %	25 %	25 %	409249560
50	NT_187091	CGC	2	6	3857	3862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249560
51	NT_187091	GCA	2	6	3872	3877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249560
52	NT_187091	CGT	2	6	3896	3901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249560
53	NT_187091	TGT	2	6	4019	4024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249560
54	NT_187091	CTGC	2	8	4111	4118	0 %	25 %	25 %	50 %	409249560
55	NT_187091	TTG	2	6	4168	4173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249560
56	NT_187091	TAT	2	6	4181	4186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249560
57	NT_187091	TGC	2	6	4203	4208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249560
58	NT_187091	TAA	2	6	4218	4223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249560
59	NT_187091	GGA	2	6	4920	4925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249561
60	NT_187091	GGC	2	6	4945	4950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249561
61	NT_187091	T	6	6	4967	4972	0 %	100 %	0 %	0 %	409249561
62	NT_187091	GCA	2	6	5072	5077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249561
63	NT_187091	CGT	2	6	5112	5117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249561
64	NT_187091	CCG	2	6	5177	5182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249561
65	NT_187091	TCACCA	2	12	5344	5355	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	409249562
66	NT_187091	GCC	2	6	5366	5371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249562
67	NT_187091	TCG	2	6	5389	5394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249562
68	NT_187091	CTGG	2	8	5440	5447	0 %	25 %	50 %	25 %	409249562
69	NT_187091	ATC	2	6	5496	5501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249562
70	NT_187091	TTC	2	6	5515	5520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249562
71	NT_187091	GGC	3	9	5527	5535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249562
72	NT_187091	CAC	2	6	5644	5649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249562
73	NT_187091	GC	3	6	5733	5738	0 %	0 %	50 %	50 %	409249562
74	NT_187091	CGA	2	6	5761	5766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249562
75	NT_187091	CAAAC	2	10	5822	5831	60 %	0 %	0 %	40 %	409249562
76	NT_187091	GCTGA	2	10	5927	5936	20 %	20 %	40 %	20 %	409249562
77	NT_187091	AC	3	6	6090	6095	50 %	0 %	0 %	50 %	409249563
78	NT_187091	CGA	2	6	6113	6118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249563
79	NT_187091	TGG	2	6	6181	6186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249563
80	NT_187091	ATG	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249563
81	NT_187091	GGCAT	2	10	6254	6263	20 %	20 %	40 %	20 %	409249563
82	NT_187091	CGC	2	6	6310	6315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249563
83	NT_187091	CAT	2	6	6321	6326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249563
84	NT_187091	CGG	2	6	6368	6373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249563
85	NT_187091	CGC	2	6	6378	6383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249563
86	NT_187091	GAT	2	6	6540	6545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249563
87	NT_187091	GGC	2	6	6548	6553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249563
88	NT_187091	ATG	2	6	6583	6588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249563
89	NT_187091	CTG	2	6	6591	6596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249563
90	NT_187091	GGCG	2	8	6626	6633	0 %	0 %	75 %	25 %	409249563
91	NT_187091	T	6	6	6696	6701	0 %	100 %	0 %	0 %	409249563
92	NT_187091	CGC	2	6	6726	6731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249563
93	NT_187091	ATT	2	6	6798	6803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249563
94	NT_187091	GCA	2	6	6884	6889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249563
95	NT_187091	TTC	2	6	6892	6897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249563
96	NT_187091	TGG	2	6	6922	6927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249563
97	NT_187091	TTACG	2	10	6961	6970	20 %	40 %	20 %	20 %	409249563
98	NT_187091	CTG	2	6	7017	7022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249563
99	NT_187091	CGT	2	6	7028	7033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249563
100	NT_187091	AT	3	6	7043	7048	50 %	50 %	0 %	0 %	409249563
101	NT_187091	GC	3	6	7158	7163	0 %	0 %	50 %	50 %	409249563
102	NT_187091	CTA	2	6	7178	7183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249563
103	NT_187091	GATC	2	8	7205	7212	25 %	25 %	25 %	25 %	409249563
104	NT_187091	CGA	2	6	7247	7252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249563
105	NT_187091	CAAC	2	8	7259	7266	50 %	0 %	0 %	50 %	409249563
106	NT_187091	CCG	2	6	7277	7282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249563
107	NT_187091	GA	3	6	7292	7297	50 %	0 %	50 %	0 %	409249563
108	NT_187091	GC	3	6	7300	7305	0 %	0 %	50 %	50 %	409249563
109	NT_187091	GTG	3	9	7392	7400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249563
110	NT_187091	GCT	2	6	7424	7429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249563
111	NT_187091	AG	4	8	7465	7472	50 %	0 %	50 %	0 %	409249563
112	NT_187091	GC	3	6	7521	7526	0 %	0 %	50 %	50 %	409249564
113	NT_187091	GC	3	6	7577	7582	0 %	0 %	50 %	50 %	409249564
114	NT_187091	TG	3	6	7654	7659	0 %	50 %	50 %	0 %	409249564
115	NT_187091	GCT	2	6	7673	7678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249564
116	NT_187091	CAT	2	6	7684	7689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249564
117	NT_187091	CAC	2	6	7690	7695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249564
118	NT_187091	CTGG	2	8	7734	7741	0 %	25 %	50 %	25 %	409249564
119	NT_187091	A	6	6	7742	7747	100 %	0 %	0 %	0 %	409249564
120	NT_187091	TGGC	2	8	7800	7807	0 %	25 %	50 %	25 %	409249564
121	NT_187091	GCGA	2	8	7842	7849	25 %	0 %	50 %	25 %	409249564
122	NT_187091	GCG	4	12	7895	7906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249564
123	NT_187091	GC	3	6	7910	7915	0 %	0 %	50 %	50 %	409249564
124	NT_187091	ACC	2	6	7973	7978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249565
125	NT_187091	ATA	2	6	8186	8191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249565
126	NT_187091	AAC	2	6	8198	8203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249565
127	NT_187091	GAAA	2	8	8264	8271	75 %	0 %	25 %	0 %	409249565
128	NT_187091	CGCC	2	8	8292	8299	0 %	0 %	25 %	75 %	409249565
129	NT_187091	CGCC	2	8	8316	8323	0 %	0 %	25 %	75 %	409249565
130	NT_187091	AGGG	2	8	8335	8342	25 %	0 %	75 %	0 %	409249565
131	NT_187091	GCC	2	6	8431	8436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249565
132	NT_187091	CAG	2	6	8443	8448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249565
133	NT_187091	AAT	2	6	8449	8454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249565
134	NT_187091	CCCA	2	8	8477	8484	25 %	0 %	0 %	75 %	409249565
135	NT_187091	A	6	6	8509	8514	100 %	0 %	0 %	0 %	409249565
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264	NT_187091	ATC	2	6	15473	15478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249573
265	NT_187091	GAT	2	6	15492	15497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249573
266	NT_187091	CGTA	2	8	15523	15530	25 %	25 %	25 %	25 %	409249573
267	NT_187091	CAG	3	9	15534	15542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249573
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276	NT_187091	AAC	2	6	16219	16224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249574
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285	NT_187091	GCA	2	6	16606	16611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249575
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289	NT_187091	GCC	3	9	16770	16778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249575
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296	NT_187091	ACG	2	6	16952	16957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249576
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387	NT_187091	GCG	2	6	21216	21221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249581
388	NT_187091	CAC	2	6	21224	21229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249581
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