MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 1824

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NT_187091	TG	3	6	78891	78896	0 %	50 %	50 %	0 %	409249646
1502	NT_187091	TGC	2	6	78982	78987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249646
1503	NT_187091	GTT	2	6	79025	79030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249646
1504	NT_187091	GGC	2	6	79190	79195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249646
1505	NT_187091	TGT	2	6	79240	79245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249647
1506	NT_187091	GC	3	6	79259	79264	0 %	0 %	50 %	50 %	409249647
1507	NT_187091	TG	3	6	79301	79306	0 %	50 %	50 %	0 %	409249647
1508	NT_187091	AAG	2	6	79316	79321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249647
1509	NT_187091	ATT	2	6	79390	79395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249647
1510	NT_187091	CGG	2	6	79404	79409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249647
1511	NT_187091	TTA	2	6	79416	79421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249647
1512	NT_187091	GCC	2	6	79438	79443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249647
1513	NT_187091	AG	3	6	79468	79473	50 %	0 %	50 %	0 %	409249647
1514	NT_187091	A	6	6	79541	79546	100 %	0 %	0 %	0 %	409249647
1515	NT_187091	GGC	3	9	79551	79559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249647
1516	NT_187091	GCG	2	6	79681	79686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249647
1517	NT_187091	AAT	2	6	79698	79703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249647
1518	NT_187091	CCG	2	6	79814	79819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249647
1519	NT_187091	TAGAG	2	10	79905	79914	40 %	20 %	40 %	0 %	409249647
1520	NT_187091	GCG	2	6	79918	79923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249647
1521	NT_187091	TGAAA	2	10	79929	79938	60 %	20 %	20 %	0 %	409249647
1522	NT_187091	CG	3	6	80228	80233	0 %	0 %	50 %	50 %	409249648
1523	NT_187091	GCGGG	2	10	80236	80245	0 %	0 %	80 %	20 %	409249648
1524	NT_187091	TGC	2	6	80263	80268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249648
1525	NT_187091	CCAT	2	8	80308	80315	25 %	25 %	0 %	50 %	409249648
1526	NT_187091	GCT	2	6	80326	80331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249648
1527	NT_187091	GGT	2	6	80336	80341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249648
1528	NT_187091	CAA	2	6	80371	80376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249648
1529	NT_187091	T	7	7	80396	80402	0 %	100 %	0 %	0 %	409249648
1530	NT_187091	GGAA	2	8	80414	80421	50 %	0 %	50 %	0 %	409249648
1531	NT_187091	TCG	2	6	80478	80483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249648
1532	NT_187091	GCG	2	6	80560	80565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249648
1533	NT_187091	GTT	2	6	80626	80631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249648
1534	NT_187091	GCA	2	6	80644	80649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249648
1535	NT_187091	GC	4	8	80653	80660	0 %	0 %	50 %	50 %	409249648
1536	NT_187091	ATC	2	6	80754	80759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249648
1537	NT_187091	CCGG	2	8	80804	80811	0 %	0 %	50 %	50 %	409249648
1538	NT_187091	GCA	2	6	80926	80931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249648
1539	NT_187091	GCG	2	6	80965	80970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249648
1540	NT_187091	CCG	2	6	80980	80985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249648
1541	NT_187091	GCC	2	6	81007	81012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249648
1542	NT_187091	TGC	3	9	81069	81077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249648
1543	NT_187091	GGC	2	6	81089	81094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249648
1544	NT_187091	CCAG	2	8	81115	81122	25 %	0 %	25 %	50 %	409249648
1545	NT_187091	GA	3	6	81126	81131	50 %	0 %	50 %	0 %	409249648
1546	NT_187091	GC	3	6	81265	81270	0 %	0 %	50 %	50 %	409249649
1547	NT_187091	GTG	2	6	81370	81375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249649
1548	NT_187091	GC	3	6	81438	81443	0 %	0 %	50 %	50 %	409249649
1549	NT_187091	CAC	2	6	81526	81531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249649
1550	NT_187091	CAA	2	6	81573	81578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249649
1551	NT_187091	GGC	3	9	81615	81623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249649
1552	NT_187091	ACAG	2	8	81695	81702	50 %	0 %	25 %	25 %	409249649
1553	NT_187091	AGC	2	6	81720	81725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249649
1554	NT_187091	GAT	2	6	81787	81792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249649
1555	NT_187091	TCA	2	6	81851	81856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249649
1556	NT_187091	A	6	6	81891	81896	100 %	0 %	0 %	0 %	409249649
1557	NT_187091	CAA	2	6	82016	82021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249650
1558	NT_187091	CGCC	2	8	82046	82053	0 %	0 %	25 %	75 %	409249650
1559	NT_187091	GGT	2	6	82069	82074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249650
1560	NT_187091	TAA	2	6	82083	82088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249650
1561	NT_187091	ATG	2	6	82113	82118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249650
1562	NT_187091	CAG	3	9	82166	82174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249650
1563	NT_187091	AT	3	6	82191	82196	50 %	50 %	0 %	0 %	409249650
1564	NT_187091	CCG	2	6	82245	82250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249650
1565	NT_187091	TAA	3	9	82310	82318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249650
1566	NT_187091	GC	3	6	82339	82344	0 %	0 %	50 %	50 %	409249650
1567	NT_187091	AGA	2	6	82413	82418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249651
1568	NT_187091	GTG	2	6	82540	82545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249651
1569	NT_187091	GCC	2	6	82550	82555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249651
1570	NT_187091	GGC	2	6	82578	82583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249651
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1572	NT_187091	T	7	7	82677	82683	0 %	100 %	0 %	0 %	409249651
1573	NT_187091	GGC	2	6	82719	82724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249651
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1576	NT_187091	GC	3	6	82764	82769	0 %	0 %	50 %	50 %	409249651
1577	NT_187091	A	7	7	82812	82818	100 %	0 %	0 %	0 %	409249651
1578	NT_187091	CG	3	6	82895	82900	0 %	0 %	50 %	50 %	409249651
1579	NT_187091	GGC	2	6	82908	82913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249651
1580	NT_187091	GCG	2	6	82952	82957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249651
1581	NT_187091	A	6	6	82968	82973	100 %	0 %	0 %	0 %	409249651
1582	NT_187091	TCG	2	6	82987	82992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249651
1583	NT_187091	TGG	2	6	83021	83026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249651
1584	NT_187091	GTG	2	6	83113	83118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249651
1585	NT_187091	TGC	2	6	83295	83300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249652
1586	NT_187091	CTG	2	6	83304	83309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249652
1587	NT_187091	GCG	2	6	83310	83315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249652
1588	NT_187091	AAT	2	6	83333	83338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249652
1589	NT_187091	GC	3	6	83366	83371	0 %	0 %	50 %	50 %	409249652
1590	NT_187091	ATG	2	6	83412	83417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249652
1591	NT_187091	CGG	2	6	83430	83435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249652
1592	NT_187091	CCA	2	6	83534	83539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249652
1593	NT_187091	ATC	2	6	83603	83608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249652
1594	NT_187091	CG	3	6	83670	83675	0 %	0 %	50 %	50 %	409249652
1595	NT_187091	ACC	2	6	83685	83690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249652
1596	NT_187091	GCC	2	6	83708	83713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249652
1597	NT_187091	GAA	2	6	83722	83727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249652
1598	NT_187091	TTCC	2	8	83728	83735	0 %	50 %	0 %	50 %	409249652
1599	NT_187091	ACC	2	6	83748	83753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249652
1600	NT_187091	GCA	2	6	84154	84159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249653
1601	NT_187091	TG	3	6	84168	84173	0 %	50 %	50 %	0 %	409249653
1602	NT_187091	CGT	3	9	84185	84193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249653
1603	NT_187091	TTC	2	6	84251	84256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249653
1604	NT_187091	CGTG	2	8	84331	84338	0 %	25 %	50 %	25 %	409249653
1605	NT_187091	CT	3	6	84400	84405	0 %	50 %	0 %	50 %	409249653
1606	NT_187091	ATC	2	6	84410	84415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249653
1607	NT_187091	CGT	2	6	84497	84502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249653
1608	NT_187091	CGT	2	6	84554	84559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249653
1609	NT_187091	GC	4	8	84624	84631	0 %	0 %	50 %	50 %	409249653
1610	NT_187091	CG	3	6	84648	84653	0 %	0 %	50 %	50 %	409249653
1611	NT_187091	CGC	2	6	84687	84692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249653
1612	NT_187091	TGA	2	6	84711	84716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249653
1613	NT_187091	TGA	2	6	84760	84765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249653
1614	NT_187091	CCT	2	6	84816	84821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249653
1615	NT_187091	CTG	2	6	85001	85006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249653
1616	NT_187091	GGC	2	6	85082	85087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249653
1617	NT_187091	CGA	2	6	85111	85116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249653
1618	NT_187091	GC	3	6	85177	85182	0 %	0 %	50 %	50 %	409249653
1619	NT_187091	CCG	2	6	85227	85232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249653
1620	NT_187091	TCG	2	6	85236	85241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249653
1621	NT_187091	GC	3	6	85263	85268	0 %	0 %	50 %	50 %	409249653
1622	NT_187091	TCT	2	6	85284	85289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249653
1623	NT_187091	A	6	6	85304	85309	100 %	0 %	0 %	0 %	409249653
1624	NT_187091	GC	3	6	85329	85334	0 %	0 %	50 %	50 %	409249653
1625	NT_187091	CGA	2	6	85369	85374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249653
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.