MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187087	TTG	2	6	502	507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249442
2	NT_187087	TTGAC	2	10	1159	1168	20 %	40 %	20 %	20 %	409249443
3	NT_187087	A	6	6	1186	1191	100 %	0 %	0 %	0 %	409249443
4	NT_187087	GC	3	6	1228	1233	0 %	0 %	50 %	50 %	409249443
5	NT_187087	TATC	2	8	1276	1283	25 %	50 %	0 %	25 %	409249443
6	NT_187087	AGA	3	9	1316	1324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249443
7	NT_187087	GC	3	6	1327	1332	0 %	0 %	50 %	50 %	409249443
8	NT_187087	ATC	2	6	1335	1340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249443
9	NT_187087	TTACG	2	10	1360	1369	20 %	40 %	20 %	20 %	409249443
10	NT_187087	CGG	2	6	1390	1395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
11	NT_187087	ACC	2	6	1515	1520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249443
12	NT_187087	ATT	2	6	1524	1529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249443
13	NT_187087	TGG	2	6	1657	1662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249443
14	NT_187087	TGC	2	6	1678	1683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249443
15	NT_187087	ACC	2	6	1695	1700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249443
16	NT_187087	CG	3	6	1755	1760	0 %	0 %	50 %	50 %	409249443
17	NT_187087	CG	3	6	2100	2105	0 %	0 %	50 %	50 %	409249443
18	NT_187087	TGA	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249443
19	NT_187087	CCG	2	6	2399	2404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249443
20	NT_187087	CAGT	2	8	2411	2418	25 %	25 %	25 %	25 %	409249443
21	NT_187087	GAT	2	6	2445	2450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249443
22	NT_187087	CAGC	2	8	2486	2493	25 %	0 %	25 %	50 %	409249443
23	NT_187087	CGG	2	6	2506	2511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
24	NT_187087	AGC	2	6	2524	2529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249443
25	NT_187087	CAG	2	6	2736	2741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249443
26	NT_187087	GC	3	6	2763	2768	0 %	0 %	50 %	50 %	409249443
27	NT_187087	GCG	2	6	2790	2795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
28	NT_187087	CTG	2	6	2802	2807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249443
29	NT_187087	TCA	2	6	2837	2842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249443
30	NT_187087	GGC	2	6	3035	3040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
31	NT_187087	CTAT	2	8	3064	3071	25 %	50 %	0 %	25 %	409249443
32	NT_187087	ATC	2	6	3079	3084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249443
33	NT_187087	AAT	2	6	3213	3218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249443
34	NT_187087	GGC	2	6	3233	3238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
35	NT_187087	CTG	2	6	3244	3249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249443
36	NT_187087	GGC	2	6	3254	3259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
37	NT_187087	TGCCG	2	10	3265	3274	0 %	20 %	40 %	40 %	409249443
38	NT_187087	CGG	2	6	3361	3366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
39	NT_187087	GCA	2	6	3463	3468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249443
40	NT_187087	CGG	2	6	3472	3477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249443
41	NT_187087	ATG	2	6	3598	3603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249443
42	NT_187087	TGCG	2	8	3622	3629	0 %	25 %	50 %	25 %	409249443
43	NT_187087	TTCG	2	8	3924	3931	0 %	50 %	25 %	25 %	409249444
44	NT_187087	GC	3	6	3959	3964	0 %	0 %	50 %	50 %	409249444
45	NT_187087	CAA	2	6	3981	3986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249444
46	NT_187087	CGC	2	6	3990	3995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249444
47	NT_187087	CGC	2	6	4006	4011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249444
48	NT_187087	GCTG	2	8	4088	4095	0 %	25 %	50 %	25 %	409249444
49	NT_187087	CGC	2	6	4174	4179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249444
50	NT_187087	TGG	2	6	4219	4224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249444
51	NT_187087	TAA	2	6	4256	4261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249444
52	NT_187087	A	6	6	4293	4298	100 %	0 %	0 %	0 %	409249444
53	NT_187087	TTC	2	6	4430	4435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249444
54	NT_187087	TACG	2	8	4453	4460	25 %	25 %	25 %	25 %	409249444
55	NT_187087	CCA	2	6	4532	4537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249444
56	NT_187087	ATA	2	6	4621	4626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249444
57	NT_187087	ACC	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249444
58	NT_187087	G	6	6	4700	4705	0 %	0 %	100 %	0 %	409249444
59	NT_187087	GGCC	2	8	4713	4720	0 %	0 %	50 %	50 %	409249444
60	NT_187087	ATT	2	6	4743	4748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249444
61	NT_187087	TAT	2	6	4784	4789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249444
62	NT_187087	CGG	2	6	4796	4801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249444
63	NT_187087	CGC	2	6	4817	4822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249444
64	NT_187087	GC	3	6	4821	4826	0 %	0 %	50 %	50 %	409249444
65	NT_187087	TAT	2	6	5121	5126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249445
66	NT_187087	ATG	2	6	5145	5150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249445
67	NT_187087	TCGC	2	8	5177	5184	0 %	25 %	25 %	50 %	409249445
68	NT_187087	TC	3	6	5188	5193	0 %	50 %	0 %	50 %	409249445
69	NT_187087	TG	3	6	5235	5240	0 %	50 %	50 %	0 %	409249445
70	NT_187087	GAT	2	6	5241	5246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249445
71	NT_187087	GAA	2	6	5268	5273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249445
72	NT_187087	CG	3	6	5307	5312	0 %	0 %	50 %	50 %	409249445
73	NT_187087	TGG	2	6	5332	5337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249445
74	NT_187087	CGG	2	6	5446	5451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249445
75	NT_187087	CTG	2	6	5502	5507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249445
76	NT_187087	GTG	2	6	5520	5525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249445
77	NT_187087	T	6	6	5702	5707	0 %	100 %	0 %	0 %	409249446
78	NT_187087	ACTT	2	8	5714	5721	25 %	50 %	0 %	25 %	409249446
79	NT_187087	GCA	2	6	5744	5749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249446
80	NT_187087	AGT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249446
81	NT_187087	ATT	2	6	5825	5830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249446
82	NT_187087	GTC	2	6	5900	5905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249446
83	NT_187087	CGC	2	6	5977	5982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249446
84	NT_187087	ACG	2	6	6135	6140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249446
85	NT_187087	TCC	2	6	6183	6188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249446
86	NT_187087	AATA	2	8	6291	6298	75 %	25 %	0 %	0 %	409249446
87	NT_187087	TCGG	2	8	6465	6472	0 %	25 %	50 %	25 %	409249446
88	NT_187087	GC	3	6	6508	6513	0 %	0 %	50 %	50 %	409249446
89	NT_187087	CGT	2	6	6544	6549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249446
90	NT_187087	GGCG	2	8	6589	6596	0 %	0 %	75 %	25 %	409249446
91	NT_187087	TAA	2	6	6598	6603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249446
92	NT_187087	TGAG	2	8	6672	6679	25 %	25 %	50 %	0 %	409249446
93	NT_187087	AACTG	2	10	6885	6894	40 %	20 %	20 %	20 %	409249447
94	NT_187087	GTT	2	6	6922	6927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249447
95	NT_187087	GCC	2	6	6986	6991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249447
96	NT_187087	TAT	2	6	7002	7007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249447
97	NT_187087	CGATCT	2	12	7038	7049	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	409249447
98	NT_187087	GTG	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249447
99	NT_187087	GGC	2	6	7365	7370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249447
100	NT_187087	CGC	2	6	7406	7411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249447
101	NT_187087	TG	3	6	7424	7429	0 %	50 %	50 %	0 %	409249447
102	NT_187087	TTGA	2	8	7444	7451	25 %	50 %	25 %	0 %	409249447
103	NT_187087	CG	3	6	7474	7479	0 %	0 %	50 %	50 %	409249447
104	NT_187087	GCA	2	6	7521	7526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249447
105	NT_187087	GC	3	6	7627	7632	0 %	0 %	50 %	50 %	409249447
106	NT_187087	GC	3	6	7645	7650	0 %	0 %	50 %	50 %	409249447
107	NT_187087	CTG	2	6	7816	7821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249447
108	NT_187087	GGC	2	6	7846	7851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249447
109	NT_187087	CTG	2	6	7885	7890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249447
110	NT_187087	CGG	2	6	7982	7987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249447
111	NT_187087	GC	3	6	8062	8067	0 %	0 %	50 %	50 %	409249447
112	NT_187087	ATG	2	6	8096	8101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249447
113	NT_187087	GCC	2	6	8169	8174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249447
114	NT_187087	ATT	2	6	8218	8223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249447
115	NT_187087	CCG	2	6	8251	8256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249447
116	NT_187087	A	6	6	8295	8300	100 %	0 %	0 %	0 %	409249447
117	NT_187087	GC	3	6	8356	8361	0 %	0 %	50 %	50 %	409249447
118	NT_187087	GCAAAG	2	12	8444	8455	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	409249447
119	NT_187087	GCG	2	6	8510	8515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249447
120	NT_187087	CG	3	6	8514	8519	0 %	0 %	50 %	50 %	409249447
121	NT_187087	CAC	2	6	8523	8528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249447
122	NT_187087	CG	3	6	8599	8604	0 %	0 %	50 %	50 %	409249447
123	NT_187087	GCTG	2	8	8633	8640	0 %	25 %	50 %	25 %	409249447
124	NT_187087	CCG	2	6	8680	8685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249447
125	NT_187087	CTG	2	6	8767	8772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249447
126	NT_187087	GGC	2	6	8779	8784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249447
127	NT_187087	CAT	2	6	8787	8792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249447
128	NT_187087	ATA	2	6	8801	8806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409249447
129	NT_187087	GCTG	2	8	8835	8842	0 %	25 %	50 %	25 %	409249447
130	NT_187087	A	6	6	8873	8878	100 %	0 %	0 %	0 %	409249447
131	NT_187087	CTG	2	6	8919	8924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249447
132	NT_187087	CGC	2	6	8934	8939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249447
133	NT_187087	CGC	2	6	9002	9007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409249448
134	NT_187087	AACG	2	8	9040	9047	50 %	0 %	25 %	25 %	409249448
135	NT_187087	GTCT	2	8	9049	9056	0 %	50 %	25 %	25 %	409249448
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264	NT_187087	ACG	2	6	15256	15261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249453
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271	NT_187087	CTTCT	2	10	15635	15644	0 %	60 %	0 %	40 %	409249454
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278	NT_187087	GC	3	6	15790	15795	0 %	0 %	50 %	50 %	409249454
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287	NT_187087	TGA	2	6	16764	16769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249454
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290	NT_187087	GCGCG	2	10	16894	16903	0 %	0 %	60 %	40 %	409249454
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390	NT_187087	CG	3	6	22831	22836	0 %	0 %	50 %	50 %	409249460
391	NT_187087	CG	3	6	22846	22851	0 %	0 %	50 %	50 %	409249460
392	NT_187087	GAC	2	6	22872	22877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249460
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499	NT_187087	CTT	2	6	28392	28397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249467
500	NT_187087	T	6	6	28396	28401	0 %	100 %	0 %	0 %	409249467

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